MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014152	CTTA	2	8	982431	982438	25 %	50 %	0 %	25 %	296132480
16002	NC_014152	GGTCC	2	10	982521	982530	0 %	20 %	40 %	40 %	296132480
16003	NC_014152	GAT	2	6	982548	982553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132480
16004	NC_014152	CTC	2	6	982602	982607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132480
16005	NC_014152	TTA	2	6	982666	982671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132481
16006	NC_014152	GC	3	6	982687	982692	0 %	0 %	50 %	50 %	296132481
16007	NC_014152	GGT	2	6	982695	982700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132481
16008	NC_014152	TCC	2	6	982820	982825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132481
16009	NC_014152	TTG	2	6	982835	982840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132481
16010	NC_014152	TTC	2	6	982852	982857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132481
16011	NC_014152	TAA	2	6	982879	982884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132481
16012	NC_014152	ATA	2	6	982893	982898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132481
16013	NC_014152	GATT	2	8	982900	982907	25 %	50 %	25 %	0 %	296132481
16014	NC_014152	TGT	2	6	982926	982931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132481
16015	NC_014152	T	6	6	983139	983144	0 %	100 %	0 %	0 %	296132481
16016	NC_014152	CTT	2	6	983209	983214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132482
16017	NC_014152	AAC	2	6	983349	983354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132482
16018	NC_014152	GAA	2	6	983378	983383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132482
16019	NC_014152	CAG	2	6	983401	983406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132482
16020	NC_014152	CTT	2	6	983418	983423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132482
16021	NC_014152	GTC	2	6	983553	983558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132482
16022	NC_014152	GCA	2	6	983635	983640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132482
16023	NC_014152	GCA	2	6	983698	983703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132482
16024	NC_014152	GCA	2	6	983761	983766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132482
16025	NC_014152	GCA	2	6	983824	983829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132482
16026	NC_014152	GCA	2	6	983887	983892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132482
16027	NC_014152	GCA	2	6	983950	983955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132482
16028	NC_014152	ATG	2	6	984024	984029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132482
16029	NC_014152	CCAAA	2	10	984055	984064	60 %	0 %	0 %	40 %	296132482
16030	NC_014152	AGAAT	2	10	984087	984096	60 %	20 %	20 %	0 %	296132482
16031	NC_014152	TAA	2	6	984139	984144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132482
16032	NC_014152	T	6	6	984150	984155	0 %	100 %	0 %	0 %	296132482
16033	NC_014152	TTC	2	6	984158	984163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132482
16034	NC_014152	TTTC	2	8	984220	984227	0 %	75 %	0 %	25 %	296132482
16035	NC_014152	CCT	3	9	984327	984335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132482
16036	NC_014152	T	6	6	984357	984362	0 %	100 %	0 %	0 %	296132482
16037	NC_014152	TCT	2	6	984411	984416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132482
16038	NC_014152	ATC	2	6	984458	984463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132482
16039	NC_014152	TAT	3	9	984797	984805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132483
16040	NC_014152	TGA	2	6	984907	984912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132483
16041	NC_014152	GAA	2	6	984924	984929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132483
16042	NC_014152	GCCT	2	8	984936	984943	0 %	25 %	25 %	50 %	296132483
16043	NC_014152	ACT	2	6	984969	984974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132483
16044	NC_014152	GAAA	2	8	985055	985062	75 %	0 %	25 %	0 %	296132483
16045	NC_014152	GC	3	6	985067	985072	0 %	0 %	50 %	50 %	296132483
16046	NC_014152	TGA	2	6	985112	985117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132483
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16049	NC_014152	ACG	2	6	985261	985266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132483
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16051	NC_014152	ATA	2	6	985345	985350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132483
16052	NC_014152	A	6	6	985375	985380	100 %	0 %	0 %	0 %	296132483
16053	NC_014152	GCC	2	6	985383	985388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132483
16054	NC_014152	GAA	2	6	985416	985421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132483
16055	NC_014152	CTG	2	6	985422	985427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132483
16056	NC_014152	A	6	6	985500	985505	100 %	0 %	0 %	0 %	296132483
16057	NC_014152	AGAT	2	8	985537	985544	50 %	25 %	25 %	0 %	296132483
16058	NC_014152	GT	3	6	985553	985558	0 %	50 %	50 %	0 %	296132483
16059	NC_014152	GAA	2	6	985563	985568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132483
16060	NC_014152	TGA	2	6	985679	985684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132483
16061	NC_014152	ACAG	2	8	985714	985721	50 %	0 %	25 %	25 %	296132483
16062	NC_014152	A	6	6	985770	985775	100 %	0 %	0 %	0 %	296132483
16063	NC_014152	GCG	2	6	985861	985866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132483
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16069	NC_014152	CCT	2	6	986237	986242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132483
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16093	NC_014152	CTG	2	6	987864	987869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132484
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16101	NC_014152	AAAT	2	8	988513	988520	75 %	25 %	0 %	0 %	296132485
16102	NC_014152	ATA	2	6	988542	988547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132485
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16104	NC_014152	GGC	2	6	988662	988667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132485
16105	NC_014152	ACCAG	2	10	988678	988687	40 %	0 %	20 %	40 %	296132485
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16107	NC_014152	A	6	6	988741	988746	100 %	0 %	0 %	0 %	296132485
16108	NC_014152	GA	3	6	988847	988852	50 %	0 %	50 %	0 %	296132485
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16243	NC_014152	TGT	2	6	996494	996499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132493
16244	NC_014152	TTA	2	6	996500	996505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132493
16245	NC_014152	ATC	2	6	996538	996543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132493
16246	NC_014152	GGC	2	6	996608	996613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132493
16247	NC_014152	GCC	2	6	996649	996654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132493
16248	NC_014152	ATG	2	6	996670	996675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132493
16249	NC_014152	TTCA	2	8	996769	996776	25 %	50 %	0 %	25 %	296132494
16250	NC_014152	CGGC	2	8	996783	996790	0 %	0 %	50 %	50 %	296132494
16251	NC_014152	TA	3	6	996914	996919	50 %	50 %	0 %	0 %	296132494
16252	NC_014152	CGA	2	6	996979	996984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132494
16253	NC_014152	GGC	2	6	997395	997400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132495
16254	NC_014152	T	6	6	997414	997419	0 %	100 %	0 %	0 %	296132495
16255	NC_014152	TTC	2	6	997472	997477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132495
16256	NC_014152	GGT	3	9	997695	997703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132495
16257	NC_014152	CAG	2	6	997794	997799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132495
16258	NC_014152	CTG	2	6	997925	997930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132495
16259	NC_014152	CAGAG	2	10	997950	997959	40 %	0 %	40 %	20 %	296132495
16260	NC_014152	CGGTG	2	10	998094	998103	0 %	20 %	60 %	20 %	296132495
16261	NC_014152	CGG	2	6	998121	998126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132495
16262	NC_014152	AGC	3	9	998207	998215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132495
16263	NC_014152	ACAA	2	8	998241	998248	75 %	0 %	0 %	25 %	296132495
16264	NC_014152	GCT	2	6	998413	998418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132495
16265	NC_014152	TAA	2	6	998546	998551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132495
16266	NC_014152	AAT	2	6	998611	998616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132496
16267	NC_014152	GCT	2	6	998669	998674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132496
16268	NC_014152	A	6	6	998688	998693	100 %	0 %	0 %	0 %	296132496
16269	NC_014152	TTCG	2	8	998766	998773	0 %	50 %	25 %	25 %	296132496
16270	NC_014152	TG	3	6	998831	998836	0 %	50 %	50 %	0 %	296132496
16271	NC_014152	GAT	2	6	998855	998860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132496
16272	NC_014152	TTA	2	6	998861	998866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132496
16273	NC_014152	TTGG	2	8	998912	998919	0 %	50 %	50 %	0 %	296132496
16274	NC_014152	GAA	2	6	998944	998949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132496
16275	NC_014152	AGT	2	6	999115	999120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132497
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16277	NC_014152	GCG	2	6	999298	999303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132497
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16279	NC_014152	GCA	2	6	999453	999458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132497
16280	NC_014152	A	8	8	999481	999488	100 %	0 %	0 %	0 %	296132497
16281	NC_014152	GAACT	2	10	999546	999555	40 %	20 %	20 %	20 %	296132497
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16285	NC_014152	TTAC	2	8	999699	999706	25 %	50 %	0 %	25 %	296132497
16286	NC_014152	TA	3	6	999738	999743	50 %	50 %	0 %	0 %	296132497
16287	NC_014152	C	6	6	999752	999757	0 %	0 %	0 %	100 %	296132497
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16289	NC_014152	GCCG	2	8	999843	999850	0 %	0 %	50 %	50 %	296132497
16290	NC_014152	TAC	2	6	999873	999878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132497
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16294	NC_014152	TTC	2	6	1000479	1000484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132498
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16311	NC_014152	G	8	8	1001595	1001602	0 %	0 %	100 %	0 %	296132499
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16313	NC_014152	GCA	2	6	1001824	1001829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132499
16314	NC_014152	A	6	6	1001839	1001844	100 %	0 %	0 %	0 %	296132499
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16320	NC_014152	A	6	6	1002186	1002191	100 %	0 %	0 %	0 %	296132499
16321	NC_014152	CTG	2	6	1002280	1002285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132500
16322	NC_014152	GC	3	6	1002329	1002334	0 %	0 %	50 %	50 %	296132500
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16330	NC_014152	TGA	2	6	1002651	1002656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132500
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16332	NC_014152	CAC	3	9	1002858	1002866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132500
16333	NC_014152	AGC	2	6	1002870	1002875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132500
16334	NC_014152	TG	3	6	1002881	1002886	0 %	50 %	50 %	0 %	296132500
16335	NC_014152	GGATG	2	10	1002915	1002924	20 %	20 %	60 %	0 %	296132500
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16337	NC_014152	TTGC	2	8	1003125	1003132	0 %	50 %	25 %	25 %	296132500
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16342	NC_014152	TC	3	6	1003395	1003400	0 %	50 %	0 %	50 %	296132500
16343	NC_014152	GCGG	2	8	1003455	1003462	0 %	0 %	75 %	25 %	296132500
16344	NC_014152	ATC	2	6	1003591	1003596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132500
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16346	NC_014152	TGA	2	6	1003683	1003688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132500
16347	NC_014152	AT	3	6	1003704	1003709	50 %	50 %	0 %	0 %	296132500
16348	NC_014152	GCT	2	6	1003792	1003797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132500
16349	NC_014152	TAA	2	6	1003887	1003892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132500
16350	NC_014152	TGC	2	6	1003959	1003964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132500
16351	NC_014152	GCT	2	6	1003981	1003986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132500
16352	NC_014152	CTG	2	6	1003987	1003992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132500
16353	NC_014152	TGC	2	6	1004025	1004030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132500
16354	NC_014152	AGAA	2	8	1004158	1004165	75 %	0 %	25 %	0 %	296132500
16355	NC_014152	GAA	2	6	1004388	1004393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132501
16356	NC_014152	TGG	2	6	1004431	1004436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132501
16357	NC_014152	GATGA	2	10	1004448	1004457	40 %	20 %	40 %	0 %	296132501
16358	NC_014152	T	7	7	1004471	1004477	0 %	100 %	0 %	0 %	296132501
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16360	NC_014152	CAA	2	6	1004717	1004722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132501
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16476	NC_014152	TGC	2	6	1011713	1011718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132507
16477	NC_014152	GGA	2	6	1011720	1011725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132507
16478	NC_014152	CAGG	2	8	1011785	1011792	25 %	0 %	50 %	25 %	296132507
16479	NC_014152	A	7	7	1011855	1011861	100 %	0 %	0 %	0 %	296132507
16480	NC_014152	CGG	2	6	1011896	1011901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132507
16481	NC_014152	CGG	2	6	1011944	1011949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132507
16482	NC_014152	TGC	2	6	1011980	1011985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132507
16483	NC_014152	TTG	2	6	1012018	1012023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132507
16484	NC_014152	GGAA	2	8	1012112	1012119	50 %	0 %	50 %	0 %	296132507
16485	NC_014152	TGC	2	6	1012163	1012168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132507
16486	NC_014152	CTG	2	6	1012169	1012174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132507
16487	NC_014152	AAC	2	6	1012223	1012228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132507
16488	NC_014152	ATG	2	6	1012258	1012263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132507
16489	NC_014152	TGA	2	6	1012270	1012275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132507
16490	NC_014152	ATG	2	6	1012317	1012322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132507
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16492	NC_014152	ACA	2	6	1012408	1012413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132507
16493	NC_014152	CG	3	6	1012434	1012439	0 %	0 %	50 %	50 %	296132507
16494	NC_014152	AGA	3	9	1012553	1012561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132507
16495	NC_014152	TCA	2	6	1012564	1012569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132507
16496	NC_014152	ATT	2	6	1012719	1012724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132508
16497	NC_014152	CAG	2	6	1012783	1012788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132508
16498	NC_014152	CGC	2	6	1012795	1012800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132508
16499	NC_014152	GT	3	6	1012819	1012824	0 %	50 %	50 %	0 %	296132508
16500	NC_014152	GTGACA	2	12	1012833	1012844	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296132508

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