MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014152	GGC	2	6	922855	922860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132429
15002	NC_014152	TCC	2	6	922899	922904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132429
15003	NC_014152	AGC	2	6	922931	922936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132429
15004	NC_014152	GCT	2	6	922947	922952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132429
15005	NC_014152	GCT	2	6	922976	922981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132429
15006	NC_014152	GGC	2	6	923010	923015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132429
15007	NC_014152	AT	3	6	923048	923053	50 %	50 %	0 %	0 %	296132429
15008	NC_014152	A	6	6	923103	923108	100 %	0 %	0 %	0 %	296132429
15009	NC_014152	TAGGA	2	10	923116	923125	40 %	20 %	40 %	0 %	296132429
15010	NC_014152	GCCA	2	8	923141	923148	25 %	0 %	25 %	50 %	296132429
15011	NC_014152	ATG	3	9	923201	923209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132429
15012	NC_014152	GAG	2	6	923219	923224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132429
15013	NC_014152	ATA	2	6	923238	923243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132429
15014	NC_014152	T	6	6	923244	923249	0 %	100 %	0 %	0 %	296132429
15015	NC_014152	GTTTG	2	10	923614	923623	0 %	60 %	40 %	0 %	296132430
15016	NC_014152	AGA	2	6	923633	923638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132430
15017	NC_014152	CGG	2	6	923731	923736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132430
15018	NC_014152	TGT	2	6	923776	923781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132430
15019	NC_014152	GAA	2	6	923803	923808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132430
15020	NC_014152	TGAA	2	8	923829	923836	50 %	25 %	25 %	0 %	296132430
15021	NC_014152	GAAA	2	8	923858	923865	75 %	0 %	25 %	0 %	296132430
15022	NC_014152	AGA	2	6	923866	923871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132430
15023	NC_014152	AGAA	2	8	923883	923890	75 %	0 %	25 %	0 %	296132430
15024	NC_014152	AAAG	2	8	923903	923910	75 %	0 %	25 %	0 %	296132430
15025	NC_014152	AG	3	6	924012	924017	50 %	0 %	50 %	0 %	296132430
15026	NC_014152	AAG	2	6	924458	924463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132431
15027	NC_014152	CCGG	2	8	924538	924545	0 %	0 %	50 %	50 %	296132431
15028	NC_014152	GAAG	2	8	924555	924562	50 %	0 %	50 %	0 %	296132431
15029	NC_014152	GCA	2	6	924593	924598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132431
15030	NC_014152	CTG	2	6	924625	924630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132431
15031	NC_014152	TCA	2	6	924654	924659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132431
15032	NC_014152	AATC	2	8	924705	924712	50 %	25 %	0 %	25 %	296132432
15033	NC_014152	AAAC	2	8	924807	924814	75 %	0 %	0 %	25 %	296132432
15034	NC_014152	TCCAGT	2	12	924887	924898	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296132432
15035	NC_014152	GCC	2	6	924971	924976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132432
15036	NC_014152	CCG	2	6	925038	925043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132432
15037	NC_014152	CCT	2	6	925229	925234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132432
15038	NC_014152	ACA	2	6	925278	925283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132432
15039	NC_014152	GGC	2	6	925369	925374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132432
15040	NC_014152	CCTT	2	8	925394	925401	0 %	50 %	0 %	50 %	296132432
15041	NC_014152	AATT	2	8	925461	925468	50 %	50 %	0 %	0 %	296132432
15042	NC_014152	ATAA	2	8	925554	925561	75 %	25 %	0 %	0 %	296132432
15043	NC_014152	GCTG	2	8	925564	925571	0 %	25 %	50 %	25 %	296132432
15044	NC_014152	T	7	7	925641	925647	0 %	100 %	0 %	0 %	296132432
15045	NC_014152	ATG	2	6	925664	925669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132432
15046	NC_014152	T	6	6	925687	925692	0 %	100 %	0 %	0 %	296132432
15047	NC_014152	CTG	2	6	925697	925702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132432
15048	NC_014152	T	7	7	925707	925713	0 %	100 %	0 %	0 %	296132432
15049	NC_014152	AAT	2	6	925718	925723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132432
15050	NC_014152	CAG	2	6	925737	925742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132432
15051	NC_014152	GAAC	2	8	925743	925750	50 %	0 %	25 %	25 %	296132432
15052	NC_014152	T	7	7	925823	925829	0 %	100 %	0 %	0 %	296132432
15053	NC_014152	TTC	2	6	925870	925875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132432
15054	NC_014152	GCA	2	6	926352	926357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132433
15055	NC_014152	TA	3	6	926432	926437	50 %	50 %	0 %	0 %	296132433
15056	NC_014152	GAA	2	6	926509	926514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132433
15057	NC_014152	TTAA	2	8	926530	926537	50 %	50 %	0 %	0 %	296132433
15058	NC_014152	G	6	6	926625	926630	0 %	0 %	100 %	0 %	296132433
15059	NC_014152	GTT	2	6	926635	926640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132433
15060	NC_014152	GGTT	2	8	926662	926669	0 %	50 %	50 %	0 %	296132433
15061	NC_014152	AAGC	2	8	926690	926697	50 %	0 %	25 %	25 %	296132433
15062	NC_014152	CGA	2	6	926724	926729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132433
15063	NC_014152	CCG	2	6	926770	926775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132433
15064	NC_014152	GAA	2	6	926920	926925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132433
15065	NC_014152	TGT	2	6	926951	926956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132433
15066	NC_014152	A	6	6	926975	926980	100 %	0 %	0 %	0 %	296132433
15067	NC_014152	A	7	7	926982	926988	100 %	0 %	0 %	0 %	296132433
15068	NC_014152	TAA	2	6	927006	927011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132433
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15070	NC_014152	ACA	2	6	927045	927050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132433
15071	NC_014152	GAAT	2	8	927173	927180	50 %	25 %	25 %	0 %	296132434
15072	NC_014152	CAAA	2	8	927203	927210	75 %	0 %	0 %	25 %	296132434
15073	NC_014152	GACT	2	8	927266	927273	25 %	25 %	25 %	25 %	296132434
15074	NC_014152	AAAC	2	8	927316	927323	75 %	0 %	0 %	25 %	296132434
15075	NC_014152	TGA	2	6	927373	927378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132435
15076	NC_014152	ATA	3	9	927408	927416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132435
15077	NC_014152	TC	3	6	927432	927437	0 %	50 %	0 %	50 %	296132435
15078	NC_014152	T	6	6	927456	927461	0 %	100 %	0 %	0 %	296132435
15079	NC_014152	A	6	6	927470	927475	100 %	0 %	0 %	0 %	296132435
15080	NC_014152	AGT	2	6	927494	927499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132435
15081	NC_014152	CTT	2	6	927518	927523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132435
15082	NC_014152	T	7	7	927522	927528	0 %	100 %	0 %	0 %	296132435
15083	NC_014152	ATG	2	6	927603	927608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132435
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15087	NC_014152	T	6	6	927994	927999	0 %	100 %	0 %	0 %	296132436
15088	NC_014152	GGC	2	6	928019	928024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132436
15089	NC_014152	TTA	2	6	928064	928069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132436
15090	NC_014152	CAC	2	6	928073	928078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132436
15091	NC_014152	GGA	2	6	928079	928084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132436
15092	NC_014152	AGA	2	6	928154	928159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132436
15093	NC_014152	CAG	2	6	928194	928199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132436
15094	NC_014152	CCTG	2	8	928211	928218	0 %	25 %	25 %	50 %	296132436
15095	NC_014152	A	6	6	928272	928277	100 %	0 %	0 %	0 %	296132436
15096	NC_014152	GGT	2	6	928295	928300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132436
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15098	NC_014152	TGA	2	6	928418	928423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132436
15099	NC_014152	GTT	2	6	928452	928457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132436
15100	NC_014152	CGT	2	6	928498	928503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132436
15101	NC_014152	AGG	2	6	928508	928513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132436
15102	NC_014152	ATG	2	6	928567	928572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132436
15103	NC_014152	TAGG	2	8	928616	928623	25 %	25 %	50 %	0 %	296132436
15104	NC_014152	TCA	2	6	928665	928670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132437
15105	NC_014152	TGGC	2	8	928687	928694	0 %	25 %	50 %	25 %	296132437
15106	NC_014152	GTT	2	6	928702	928707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132437
15107	NC_014152	GTC	2	6	928708	928713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132437
15108	NC_014152	GAT	2	6	928767	928772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132437
15109	NC_014152	TCA	2	6	928811	928816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132437
15110	NC_014152	CG	3	6	928971	928976	0 %	0 %	50 %	50 %	296132437
15111	NC_014152	ATC	2	6	929026	929031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132437
15112	NC_014152	AGC	2	6	929085	929090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132437
15113	NC_014152	TA	3	6	929128	929133	50 %	50 %	0 %	0 %	296132437
15114	NC_014152	TAT	2	6	929184	929189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132437
15115	NC_014152	CGC	2	6	929225	929230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132437
15116	NC_014152	ATC	2	6	929268	929273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132437
15117	NC_014152	CTG	2	6	929353	929358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132437
15118	NC_014152	CGA	2	6	929409	929414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132437
15119	NC_014152	CTG	2	6	929419	929424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132437
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15121	NC_014152	T	6	6	929524	929529	0 %	100 %	0 %	0 %	296132437
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15244	NC_014152	GCG	2	6	937238	937243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132445
15245	NC_014152	CGC	2	6	937285	937290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132445
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15351	NC_014152	A	7	7	943312	943318	100 %	0 %	0 %	0 %	296132450
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15486	NC_014152	GAA	3	9	950618	950626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132454
15487	NC_014152	A	6	6	950657	950662	100 %	0 %	0 %	0 %	296132454
15488	NC_014152	TGC	2	6	950782	950787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132454
15489	NC_014152	A	6	6	950906	950911	100 %	0 %	0 %	0 %	296132454
15490	NC_014152	GGC	2	6	950932	950937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132454
15491	NC_014152	GAA	2	6	950942	950947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132454
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15499	NC_014152	ATAA	2	8	951238	951245	75 %	25 %	0 %	0 %	296132455
15500	NC_014152	GTA	2	6	951247	951252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132455

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