MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014152	CAT	2	6	682289	682294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132213
11002	NC_014152	AAGG	2	8	682305	682312	50 %	0 %	50 %	0 %	296132213
11003	NC_014152	TCC	2	6	682339	682344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132213
11004	NC_014152	GAA	2	6	682386	682391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132213
11005	NC_014152	AGAA	2	8	682445	682452	75 %	0 %	25 %	0 %	296132214
11006	NC_014152	CCAG	2	8	682516	682523	25 %	0 %	25 %	50 %	296132214
11007	NC_014152	GTG	2	6	682608	682613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132214
11008	NC_014152	CTA	2	6	682667	682672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132214
11009	NC_014152	TAC	2	6	682742	682747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132214
11010	NC_014152	GGC	2	6	682776	682781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132214
11011	NC_014152	A	6	6	682785	682790	100 %	0 %	0 %	0 %	296132214
11012	NC_014152	GTG	2	6	682812	682817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132214
11013	NC_014152	AGC	2	6	682901	682906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132214
11014	NC_014152	CGGC	2	8	682972	682979	0 %	0 %	50 %	50 %	296132214
11015	NC_014152	CAA	2	6	682991	682996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132214
11016	NC_014152	GA	3	6	683026	683031	50 %	0 %	50 %	0 %	296132214
11017	NC_014152	CGG	2	6	683084	683089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132214
11018	NC_014152	TTAA	2	8	683352	683359	50 %	50 %	0 %	0 %	296132214
11019	NC_014152	TCG	2	6	683455	683460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132214
11020	NC_014152	T	6	6	683640	683645	0 %	100 %	0 %	0 %	296132214
11021	NC_014152	GAA	2	6	683673	683678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132214
11022	NC_014152	GAA	2	6	683681	683686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132214
11023	NC_014152	A	7	7	683685	683691	100 %	0 %	0 %	0 %	296132214
11024	NC_014152	TAT	2	6	683703	683708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132214
11025	NC_014152	GGAC	2	8	683732	683739	25 %	0 %	50 %	25 %	296132214
11026	NC_014152	ATT	2	6	683745	683750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132214
11027	NC_014152	GAC	2	6	683751	683756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132214
11028	NC_014152	GAG	2	6	683775	683780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132214
11029	NC_014152	TTCC	2	8	683854	683861	0 %	50 %	0 %	50 %	296132214
11030	NC_014152	AGC	2	6	683863	683868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132214
11031	NC_014152	CTC	2	6	683974	683979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132214
11032	NC_014152	ATA	2	6	684020	684025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132214
11033	NC_014152	AAAAT	2	10	684103	684112	80 %	20 %	0 %	0 %	296132215
11034	NC_014152	AATC	2	8	684161	684168	50 %	25 %	0 %	25 %	296132215
11035	NC_014152	ACC	2	6	684265	684270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132215
11036	NC_014152	GGC	2	6	684351	684356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132215
11037	NC_014152	TGA	2	6	684449	684454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132215
11038	NC_014152	CCA	2	6	684592	684597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132215
11039	NC_014152	TAC	2	6	684773	684778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132215
11040	NC_014152	GAA	2	6	684783	684788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132215
11041	NC_014152	GCC	2	6	684849	684854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132215
11042	NC_014152	GAA	3	9	684981	684989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132215
11043	NC_014152	TGG	2	6	685000	685005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132215
11044	NC_014152	A	6	6	685041	685046	100 %	0 %	0 %	0 %	296132215
11045	NC_014152	GAAG	2	8	685157	685164	50 %	0 %	50 %	0 %	296132215
11046	NC_014152	TGC	2	6	685174	685179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132215
11047	NC_014152	CCA	2	6	685232	685237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132215
11048	NC_014152	ATC	2	6	685266	685271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132215
11049	NC_014152	CCT	2	6	685421	685426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132215
11050	NC_014152	CAGG	2	8	685430	685437	25 %	0 %	50 %	25 %	296132215
11051	NC_014152	TGA	2	6	685451	685456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132215
11052	NC_014152	CAGC	2	8	685600	685607	25 %	0 %	25 %	50 %	296132216
11053	NC_014152	AGC	2	6	685724	685729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132216
11054	NC_014152	GAA	2	6	685772	685777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132216
11055	NC_014152	TGA	2	6	685819	685824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132216
11056	NC_014152	GGTA	2	8	685828	685835	25 %	25 %	50 %	0 %	296132216
11057	NC_014152	GAC	2	6	685892	685897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132216
11058	NC_014152	GGC	2	6	685915	685920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132216
11059	NC_014152	ACA	2	6	685932	685937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132216
11060	NC_014152	GAA	2	6	686044	686049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132216
11061	NC_014152	A	6	6	686186	686191	100 %	0 %	0 %	0 %	296132216
11062	NC_014152	CTT	2	6	686202	686207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132216
11063	NC_014152	T	6	6	686342	686347	0 %	100 %	0 %	0 %	296132216
11064	NC_014152	ATG	2	6	686352	686357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132216
11065	NC_014152	GAA	2	6	686431	686436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132216
11066	NC_014152	A	6	6	686447	686452	100 %	0 %	0 %	0 %	296132216
11067	NC_014152	TTAA	2	8	686492	686499	50 %	50 %	0 %	0 %	296132216
11068	NC_014152	TGT	2	6	686524	686529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132216
11069	NC_014152	TGGT	2	8	686532	686539	0 %	50 %	50 %	0 %	296132216
11070	NC_014152	AGT	2	6	686599	686604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132216
11071	NC_014152	CTG	2	6	686663	686668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132216
11072	NC_014152	G	6	6	686671	686676	0 %	0 %	100 %	0 %	296132216
11073	NC_014152	TCTAC	2	10	686790	686799	20 %	40 %	0 %	40 %	296132216
11074	NC_014152	GAA	2	6	686927	686932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132217
11075	NC_014152	TCC	2	6	687034	687039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132217
11076	NC_014152	GAG	2	6	687068	687073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132217
11077	NC_014152	TCT	2	6	687114	687119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132217
11078	NC_014152	ATA	2	6	687178	687183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132217
11079	NC_014152	CCTG	2	8	687226	687233	0 %	25 %	25 %	50 %	296132217
11080	NC_014152	AGAA	2	8	687257	687264	75 %	0 %	25 %	0 %	296132217
11081	NC_014152	TGT	2	6	687308	687313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132217
11082	NC_014152	CCG	2	6	687448	687453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132217
11083	NC_014152	CTG	2	6	687474	687479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132217
11084	NC_014152	AT	3	6	687497	687502	50 %	50 %	0 %	0 %	296132217
11085	NC_014152	CGAC	2	8	687530	687537	25 %	0 %	25 %	50 %	296132217
11086	NC_014152	AGG	2	6	687569	687574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132217
11087	NC_014152	AGA	2	6	687641	687646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132217
11088	NC_014152	ATG	2	6	687682	687687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132217
11089	NC_014152	TA	3	6	687694	687699	50 %	50 %	0 %	0 %	296132217
11090	NC_014152	T	6	6	687738	687743	0 %	100 %	0 %	0 %	296132217
11091	NC_014152	GAAA	2	8	687767	687774	75 %	0 %	25 %	0 %	296132217
11092	NC_014152	GTG	2	6	687930	687935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132217
11093	NC_014152	GCA	2	6	687943	687948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132217
11094	NC_014152	AAG	2	6	688111	688116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132217
11095	NC_014152	CCAT	2	8	688144	688151	25 %	25 %	0 %	50 %	296132217
11096	NC_014152	G	6	6	688161	688166	0 %	0 %	100 %	0 %	296132217
11097	NC_014152	TGT	2	6	688174	688179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132217
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11100	NC_014152	ACTA	2	8	688248	688255	50 %	25 %	0 %	25 %	296132217
11101	NC_014152	TAC	2	6	688278	688283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132217
11102	NC_014152	TAA	2	6	688406	688411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296132218
11103	NC_014152	ACC	2	6	688421	688426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296132218
11104	NC_014152	TCA	2	6	688475	688480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132218
11105	NC_014152	ACT	2	6	688534	688539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132218
11106	NC_014152	CTGC	2	8	688556	688563	0 %	25 %	25 %	50 %	296132218
11107	NC_014152	CAG	2	6	688609	688614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132218
11108	NC_014152	ACA	2	6	688704	688709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132218
11109	NC_014152	CTG	2	6	688776	688781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132218
11110	NC_014152	GAC	2	6	689238	689243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132218
11111	NC_014152	GCC	2	6	689259	689264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132218
11112	NC_014152	CAG	2	6	689269	689274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132218
11113	NC_014152	TTAT	2	8	689389	689396	25 %	75 %	0 %	0 %	296132218
11114	NC_014152	GAA	2	6	689478	689483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132218
11115	NC_014152	A	6	6	689487	689492	100 %	0 %	0 %	0 %	296132218
11116	NC_014152	GCT	2	6	689567	689572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132218
11117	NC_014152	A	6	6	689574	689579	100 %	0 %	0 %	0 %	296132218
11118	NC_014152	AGG	2	6	689653	689658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132218
11119	NC_014152	CAG	2	6	689722	689727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132219
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11121	NC_014152	GAA	2	6	689779	689784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132219
11122	NC_014152	GAA	2	6	689788	689793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132219
11123	NC_014152	GAC	2	6	689908	689913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132219
11124	NC_014152	GAA	2	6	689917	689922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132219
11125	NC_014152	GGA	2	6	689928	689933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132219
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11130	NC_014152	GCA	2	6	690316	690321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132220
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11135	NC_014152	T	6	6	690524	690529	0 %	100 %	0 %	0 %	296132220
11136	NC_014152	TA	3	6	690598	690603	50 %	50 %	0 %	0 %	296132220
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11222	NC_014152	A	6	6	695778	695783	100 %	0 %	0 %	0 %	296132226
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11227	NC_014152	CAA	2	6	696367	696372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296132227
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11229	NC_014152	A	6	6	696475	696480	100 %	0 %	0 %	0 %	296132227
11230	NC_014152	GAA	2	6	696483	696488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132227
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11232	NC_014152	TAT	2	6	696562	696567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132228
11233	NC_014152	TTA	2	6	696572	696577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132228
11234	NC_014152	TAC	2	6	696604	696609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132228
11235	NC_014152	GGC	2	6	696610	696615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132228
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11237	NC_014152	TTTG	2	8	696740	696747	0 %	75 %	25 %	0 %	296132228
11238	NC_014152	TGG	2	6	696798	696803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132228
11239	NC_014152	GGTA	2	8	696868	696875	25 %	25 %	50 %	0 %	296132228
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11241	NC_014152	TCGGT	2	10	696921	696930	0 %	40 %	40 %	20 %	296132228
11242	NC_014152	GGT	2	6	696941	696946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132228
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11363	NC_014152	GGC	2	6	704348	704353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132235
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11484	NC_014152	ACG	2	6	713532	713537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132243
11485	NC_014152	AGG	2	6	713626	713631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296132243
11486	NC_014152	ACT	2	6	713636	713641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132243
11487	NC_014152	GTT	2	6	713642	713647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132243
11488	NC_014152	GGT	2	6	713710	713715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132243
11489	NC_014152	A	6	6	713731	713736	100 %	0 %	0 %	0 %	296132243
11490	NC_014152	CTG	2	6	713823	713828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132243
11491	NC_014152	A	6	6	713892	713897	100 %	0 %	0 %	0 %	296132243
11492	NC_014152	GAA	2	6	713900	713905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132243
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11498	NC_014152	CTT	2	6	714121	714126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132243
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11500	NC_014152	TGAC	2	8	714213	714220	25 %	25 %	25 %	25 %	296132243

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