MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_014152	AGA	2	6	618309	618314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132148
10003	NC_014152	T	6	6	618328	618333	0 %	100 %	0 %	0 %	296132148
10004	NC_014152	GTA	2	6	618367	618372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132148
10005	NC_014152	AAAAG	2	10	618378	618387	80 %	0 %	20 %	0 %	296132148
10006	NC_014152	TGGT	2	8	618542	618549	0 %	50 %	50 %	0 %	296132148
10007	NC_014152	AGT	2	6	618609	618614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132148
10008	NC_014152	GCAG	2	8	618639	618646	25 %	0 %	50 %	25 %	296132148
10009	NC_014152	GAA	2	6	618855	618860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132149
10010	NC_014152	GTG	2	6	618967	618972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296132149
10011	NC_014152	CGG	2	6	619000	619005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132149
10012	NC_014152	A	7	7	619062	619068	100 %	0 %	0 %	0 %	296132149
10013	NC_014152	GCA	2	6	619170	619175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132150
10014	NC_014152	TGC	2	6	619178	619183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132150
10015	NC_014152	GCT	2	6	619191	619196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132150
10016	NC_014152	GCC	2	6	619203	619208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296132150
10017	NC_014152	GCT	2	6	619217	619222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132150
10018	NC_014152	GGC	2	6	619245	619250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132150
10019	NC_014152	TGC	2	6	619280	619285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132150
10020	NC_014152	AGC	2	6	619310	619315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132150
10021	NC_014152	CGG	2	6	619323	619328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132150
10022	NC_014152	ACG	2	6	619333	619338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132150
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10025	NC_014152	CCAAC	2	10	619540	619549	40 %	0 %	0 %	60 %	296132150
10026	NC_014152	AAG	2	6	619581	619586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132150
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10028	NC_014152	A	6	6	619785	619790	100 %	0 %	0 %	0 %	296132151
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10039	NC_014152	GCA	2	6	620134	620139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132152
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10041	NC_014152	AG	3	6	620274	620279	50 %	0 %	50 %	0 %	296132152
10042	NC_014152	GGCC	2	8	620291	620298	0 %	0 %	50 %	50 %	296132152
10043	NC_014152	TAT	2	6	620306	620311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132152
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10050	NC_014152	ATTG	2	8	620757	620764	25 %	50 %	25 %	0 %	296132153
10051	NC_014152	A	6	6	620777	620782	100 %	0 %	0 %	0 %	296132153
10052	NC_014152	TCG	2	6	620852	620857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132153
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10106	NC_014152	AT	3	6	623100	623105	50 %	50 %	0 %	0 %	296132156
10107	NC_014152	TTAT	2	8	623125	623132	25 %	75 %	0 %	0 %	296132156
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10120	NC_014152	GAA	2	6	623921	623926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132157
10121	NC_014152	ATT	2	6	623954	623959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132157
10122	NC_014152	TGC	2	6	623971	623976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132157
10123	NC_014152	CTA	2	6	624087	624092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132157
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10151	NC_014152	GTC	2	6	625241	625246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132158
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10233	NC_014152	T	6	6	630127	630132	0 %	100 %	0 %	0 %	296132163
10234	NC_014152	TGAAA	2	10	630341	630350	60 %	20 %	20 %	0 %	296132164
10235	NC_014152	TGC	2	6	630380	630385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132164
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10237	NC_014152	GAC	2	6	630444	630449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132164
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10239	NC_014152	A	6	6	630491	630496	100 %	0 %	0 %	0 %	296132164
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10360	NC_014152	TCA	2	6	642170	642175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296132171
10361	NC_014152	ATT	2	6	642215	642220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296132171
10362	NC_014152	TCC	2	6	642282	642287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296132171
10363	NC_014152	T	6	6	642289	642294	0 %	100 %	0 %	0 %	296132171
10364	NC_014152	CTTC	2	8	642332	642339	0 %	50 %	0 %	50 %	296132171
10365	NC_014152	AGC	2	6	642434	642439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132171
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10367	NC_014152	GTTTC	2	10	642547	642556	0 %	60 %	20 %	20 %	296132171
10368	NC_014152	TCAT	2	8	642609	642616	25 %	50 %	0 %	25 %	296132171
10369	NC_014152	TGTTGA	2	12	642630	642641	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	296132171
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10371	NC_014152	CGA	2	6	642893	642898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132172
10372	NC_014152	CGT	2	6	642965	642970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132172
10373	NC_014152	CGG	2	6	643048	643053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132172
10374	NC_014152	TGA	2	6	643331	643336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132172
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10376	NC_014152	T	7	7	643398	643404	0 %	100 %	0 %	0 %	296132172
10377	NC_014152	AT	3	6	643516	643521	50 %	50 %	0 %	0 %	296132172
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10384	NC_014152	CGG	2	6	643827	643832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132172
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10389	NC_014152	CAG	2	6	644238	644243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296132173
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10391	NC_014152	CTG	2	6	644292	644297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132173
10392	NC_014152	T	7	7	644342	644348	0 %	100 %	0 %	0 %	296132173
10393	NC_014152	GCT	2	6	644371	644376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132173
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10399	NC_014152	ATTT	2	8	644570	644577	25 %	75 %	0 %	0 %	296132173
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10403	NC_014152	TCTG	2	8	644785	644792	0 %	50 %	25 %	25 %	296132173
10404	NC_014152	CTT	3	9	644804	644812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296132173
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10420	NC_014152	TGT	2	6	645561	645566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132174
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10425	NC_014152	GGC	2	6	645735	645740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296132174
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10464	NC_014152	TA	3	6	647987	647992	50 %	50 %	0 %	0 %	296132176
10465	NC_014152	GCT	2	6	648083	648088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132176
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10472	NC_014152	GAA	2	6	648479	648484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296132177
10473	NC_014152	GATTT	2	10	648487	648496	20 %	60 %	20 %	0 %	296132177
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10477	NC_014152	GAAT	2	8	648817	648824	50 %	25 %	25 %	0 %	296132178
10478	NC_014152	A	8	8	648829	648836	100 %	0 %	0 %	0 %	296132178
10479	NC_014152	AAGG	2	8	648859	648866	50 %	0 %	50 %	0 %	296132178
10480	NC_014152	TTG	2	6	648901	648906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296132178
10481	NC_014152	TA	3	6	648919	648924	50 %	50 %	0 %	0 %	296132178
10482	NC_014152	AT	3	6	648925	648930	50 %	50 %	0 %	0 %	296132178
10483	NC_014152	TGC	2	6	649025	649030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132178
10484	NC_014152	GAAG	2	8	649043	649050	50 %	0 %	50 %	0 %	296132178
10485	NC_014152	GAAA	2	8	649094	649101	75 %	0 %	25 %	0 %	296132178
10486	NC_014152	GTTAA	2	10	649137	649146	40 %	40 %	20 %	0 %	296132178
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10489	NC_014152	GTA	2	6	649390	649395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296132179
10490	NC_014152	CTG	2	6	649528	649533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296132179
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