MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 31593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013894	AGAGG	2	10	464	473	40 %	0 %	60 %	0 %	289547778
2	NC_013894	ATGT	2	8	587	594	25 %	50 %	25 %	0 %	289547778
3	NC_013894	T	6	6	694	699	0 %	100 %	0 %	0 %	289547778
4	NC_013894	GAG	2	6	821	826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547778
5	NC_013894	TTA	2	6	827	832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547778
6	NC_013894	AGG	2	6	905	910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547779
7	NC_013894	AAG	2	6	940	945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547779
8	NC_013894	AGG	2	6	968	973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547779
9	NC_013894	CTT	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547779
10	NC_013894	CT	3	6	1018	1023	0 %	50 %	0 %	50 %	289547779
11	NC_013894	AAGA	2	8	1024	1031	75 %	0 %	25 %	0 %	289547779
12	NC_013894	AAG	2	6	1065	1070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547779
13	NC_013894	AGA	2	6	1077	1082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547779
14	NC_013894	TTA	2	6	1171	1176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547779
15	NC_013894	CTA	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547779
16	NC_013894	CT	3	6	1334	1339	0 %	50 %	0 %	50 %	289547779
17	NC_013894	A	6	6	1374	1379	100 %	0 %	0 %	0 %	289547779
18	NC_013894	A	6	6	1421	1426	100 %	0 %	0 %	0 %	289547779
19	NC_013894	A	6	6	1487	1492	100 %	0 %	0 %	0 %	289547780
20	NC_013894	AAG	2	6	1510	1515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547780
21	NC_013894	TGA	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547780
22	NC_013894	AG	3	6	1546	1551	50 %	0 %	50 %	0 %	289547780
23	NC_013894	AAGG	2	8	1565	1572	50 %	0 %	50 %	0 %	289547780
24	NC_013894	TCC	2	6	1597	1602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547780
25	NC_013894	CAT	2	6	1642	1647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547780
26	NC_013894	GAA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547780
27	NC_013894	ATC	2	6	1722	1727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547780
28	NC_013894	GGT	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547780
29	NC_013894	GAA	4	12	1994	2005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547780
30	NC_013894	AAGG	2	8	2042	2049	50 %	0 %	50 %	0 %	289547780
31	NC_013894	AT	3	6	2070	2075	50 %	50 %	0 %	0 %	289547780
32	NC_013894	TTAT	2	8	2127	2134	25 %	75 %	0 %	0 %	289547780
33	NC_013894	GGT	2	6	2161	2166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547780
34	NC_013894	CAT	2	6	2179	2184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547780
35	NC_013894	TTG	2	6	2211	2216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547780
36	NC_013894	AGG	2	6	2250	2255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547780
37	NC_013894	AGAGG	2	10	2282	2291	40 %	0 %	60 %	0 %	289547781
38	NC_013894	GATG	2	8	2321	2328	25 %	25 %	50 %	0 %	289547781
39	NC_013894	GA	3	6	2348	2353	50 %	0 %	50 %	0 %	289547781
40	NC_013894	TGGTA	2	10	2389	2398	20 %	40 %	40 %	0 %	289547781
41	NC_013894	TA	3	6	2397	2402	50 %	50 %	0 %	0 %	289547781
42	NC_013894	AGA	3	9	2459	2467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547781
43	NC_013894	CTT	2	6	2601	2606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547781
44	NC_013894	AAG	2	6	2638	2643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547781
45	NC_013894	T	6	6	2655	2660	0 %	100 %	0 %	0 %	289547781
46	NC_013894	GAA	2	6	2661	2666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547781
47	NC_013894	GA	3	6	2677	2682	50 %	0 %	50 %	0 %	289547781
48	NC_013894	CTG	3	9	2695	2703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547781
49	NC_013894	CCT	2	6	2724	2729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547781
50	NC_013894	A	7	7	2796	2802	100 %	0 %	0 %	0 %	289547781
51	NC_013894	GCG	2	6	2808	2813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289547781
52	NC_013894	AAG	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547781
53	NC_013894	CAC	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547781
54	NC_013894	ACC	2	6	2916	2921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547781
55	NC_013894	AGA	2	6	2930	2935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547781
56	NC_013894	TC	3	6	2960	2965	0 %	50 %	0 %	50 %	289547781
57	NC_013894	CAG	2	6	3022	3027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547781
58	NC_013894	AAC	2	6	3049	3054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289547781
59	NC_013894	ATG	2	6	3081	3086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547781
60	NC_013894	A	6	6	3115	3120	100 %	0 %	0 %	0 %	289547781
61	NC_013894	TTTGG	2	10	3177	3186	0 %	60 %	40 %	0 %	289547781
62	NC_013894	CA	3	6	3369	3374	50 %	0 %	0 %	50 %	289547781
63	NC_013894	TA	3	6	3396	3401	50 %	50 %	0 %	0 %	289547781
64	NC_013894	GAT	2	6	3402	3407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547781
65	NC_013894	CTT	3	9	3539	3547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547781
66	NC_013894	GTA	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547781
67	NC_013894	AT	3	6	3652	3657	50 %	50 %	0 %	0 %	289547781
68	NC_013894	AGGG	2	8	3675	3682	25 %	0 %	75 %	0 %	289547781
69	NC_013894	ATT	2	6	3794	3799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547782
70	NC_013894	CAAAA	2	10	3810	3819	80 %	0 %	0 %	20 %	289547782
71	NC_013894	GT	3	6	3947	3952	0 %	50 %	50 %	0 %	289547782
72	NC_013894	GAA	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547782
73	NC_013894	TGG	2	6	4070	4075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547782
74	NC_013894	AGA	2	6	4110	4115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547782
75	NC_013894	CTA	2	6	4179	4184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547782
76	NC_013894	A	6	6	4243	4248	100 %	0 %	0 %	0 %	289547782
77	NC_013894	TA	4	8	4335	4342	50 %	50 %	0 %	0 %	289547782
78	NC_013894	AGA	2	6	4392	4397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547782
79	NC_013894	CT	3	6	4412	4417	0 %	50 %	0 %	50 %	289547783
80	NC_013894	AC	3	6	4423	4428	50 %	0 %	0 %	50 %	289547783
81	NC_013894	GGT	3	9	4513	4521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547783
82	NC_013894	AAACTA	2	12	4657	4668	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	289547783
83	NC_013894	AG	3	6	4705	4710	50 %	0 %	50 %	0 %	289547783
84	NC_013894	AAGG	2	8	4832	4839	50 %	0 %	50 %	0 %	289547783
85	NC_013894	CTA	2	6	4872	4877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547783
86	NC_013894	TC	3	6	5109	5114	0 %	50 %	0 %	50 %	289547783
87	NC_013894	TAGT	2	8	5149	5156	25 %	50 %	25 %	0 %	289547783
88	NC_013894	T	6	6	5193	5198	0 %	100 %	0 %	0 %	289547783
89	NC_013894	AGG	2	6	5271	5276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547783
90	NC_013894	GCC	2	6	5280	5285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289547783
91	NC_013894	AGA	2	6	5423	5428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547783
92	NC_013894	ACT	2	6	5434	5439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547783
93	NC_013894	GA	3	6	5442	5447	50 %	0 %	50 %	0 %	289547783
94	NC_013894	TTC	2	6	5448	5453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547783
95	NC_013894	A	7	7	5454	5460	100 %	0 %	0 %	0 %	289547783
96	NC_013894	GAA	2	6	5469	5474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547783
97	NC_013894	GGAG	2	8	5484	5491	25 %	0 %	75 %	0 %	289547783
98	NC_013894	TC	3	6	5523	5528	0 %	50 %	0 %	50 %	289547784
99	NC_013894	AGA	2	6	5555	5560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
100	NC_013894	TA	3	6	5659	5664	50 %	50 %	0 %	0 %	289547784
101	NC_013894	A	6	6	5789	5794	100 %	0 %	0 %	0 %	289547784
102	NC_013894	AAG	2	6	5822	5827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
103	NC_013894	AGA	2	6	5860	5865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
104	NC_013894	CTT	2	6	5893	5898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547784
105	NC_013894	CTG	2	6	5955	5960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547784
106	NC_013894	GGAT	2	8	6052	6059	25 %	25 %	50 %	0 %	289547784
107	NC_013894	TG	3	6	6066	6071	0 %	50 %	50 %	0 %	289547784
108	NC_013894	GA	3	6	6074	6079	50 %	0 %	50 %	0 %	289547784
109	NC_013894	GAA	2	6	6100	6105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
110	NC_013894	A	6	6	6104	6109	100 %	0 %	0 %	0 %	289547784
111	NC_013894	AGA	2	6	6208	6213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
112	NC_013894	AGA	2	6	6253	6258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
113	NC_013894	TAA	2	6	6288	6293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547784
114	NC_013894	A	6	6	6292	6297	100 %	0 %	0 %	0 %	289547784
115	NC_013894	GAA	2	6	6302	6307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
116	NC_013894	A	6	6	6331	6336	100 %	0 %	0 %	0 %	289547784
117	NC_013894	TTA	2	6	6364	6369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547784
118	NC_013894	GAA	2	6	6470	6475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
119	NC_013894	GAA	2	6	6490	6495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
120	NC_013894	AGT	2	6	6611	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547784
121	NC_013894	GTT	2	6	6689	6694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547784
122	NC_013894	GAA	2	6	6695	6700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
123	NC_013894	AGG	2	6	6730	6735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547784
124	NC_013894	AGC	2	6	6810	6815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547784
125	NC_013894	AGG	2	6	6835	6840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547784
126	NC_013894	CAGGA	2	10	6979	6988	40 %	0 %	40 %	20 %	289547784
127	NC_013894	GA	3	6	7119	7124	50 %	0 %	50 %	0 %	289547784
128	NC_013894	ATA	2	6	7136	7141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547784
129	NC_013894	C	6	6	7143	7148	0 %	0 %	0 %	100 %	289547784
130	NC_013894	AAT	2	6	7187	7192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547784
131	NC_013894	AT	3	6	7215	7220	50 %	50 %	0 %	0 %	289547784
132	NC_013894	ATT	2	6	7248	7253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547784
133	NC_013894	TGA	2	6	7264	7269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547784
134	NC_013894	AGA	2	6	7270	7275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
135	NC_013894	A	6	6	7275	7280	100 %	0 %	0 %	0 %	289547784
136	NC_013894	GAA	2	6	7284	7289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547784
137	NC_013894	AAT	2	6	7295	7300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547784
138	NC_013894	CTT	2	6	7310	7315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547784
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