MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 31593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_013894	ACC	2	6	1350397	1350402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549213
28503	NC_013894	TGG	2	6	1350404	1350409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549213
28504	NC_013894	GGC	2	6	1350453	1350458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289549213
28505	NC_013894	GCG	2	6	1350541	1350546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289549213
28506	NC_013894	CTTT	2	8	1350572	1350579	0 %	75 %	0 %	25 %	289549213
28507	NC_013894	ACC	2	6	1350660	1350665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549213
28508	NC_013894	CTT	2	6	1350680	1350685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549213
28509	NC_013894	TCT	2	6	1350715	1350720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549213
28510	NC_013894	CTT	2	6	1350729	1350734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549213
28511	NC_013894	AGC	2	6	1350756	1350761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289549213
28512	NC_013894	ACCC	2	8	1350762	1350769	25 %	0 %	0 %	75 %	289549213
28513	NC_013894	ATG	2	6	1350772	1350777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549213
28514	NC_013894	CAC	2	6	1350782	1350787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549213
28515	NC_013894	TCTT	2	8	1350804	1350811	0 %	75 %	0 %	25 %	289549213
28516	NC_013894	CTT	2	6	1350855	1350860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549213
28517	NC_013894	ACC	2	6	1350903	1350908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549213
28518	NC_013894	TGG	2	6	1350914	1350919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549213
28519	NC_013894	TGT	2	6	1350920	1350925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549213
28520	NC_013894	TCC	2	6	1350997	1351002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289549213
28521	NC_013894	ACC	2	6	1351014	1351019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549213
28522	NC_013894	CAC	2	6	1351116	1351121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549213
28523	NC_013894	TCT	2	6	1351150	1351155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549213
28524	NC_013894	TCT	3	9	1351229	1351237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549213
28525	NC_013894	AC	3	6	1351267	1351272	50 %	0 %	0 %	50 %	289549213
28526	NC_013894	TGA	2	6	1351292	1351297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549213
28527	NC_013894	TGA	2	6	1351382	1351387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549213
28528	NC_013894	TAT	2	6	1351422	1351427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549213
28529	NC_013894	TTG	2	6	1351436	1351441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549213
28530	NC_013894	GTT	2	6	1351446	1351451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549213
28531	NC_013894	TCCT	2	8	1351480	1351487	0 %	50 %	0 %	50 %	289549213
28532	NC_013894	CTT	2	6	1351509	1351514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549213
28533	NC_013894	CCA	3	9	1351523	1351531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549213
28534	NC_013894	GTG	2	6	1351636	1351641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549213
28535	NC_013894	ATG	2	6	1351789	1351794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549213
28536	NC_013894	TTTAG	2	10	1351858	1351867	20 %	60 %	20 %	0 %	289549213
28537	NC_013894	CTT	2	6	1351874	1351879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549213
28538	NC_013894	T	6	6	1351923	1351928	0 %	100 %	0 %	0 %	289549214
28539	NC_013894	TTG	2	6	1352012	1352017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549214
28540	NC_013894	ACT	2	6	1352021	1352026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549214
28541	NC_013894	CACC	2	8	1352031	1352038	25 %	0 %	0 %	75 %	289549214
28542	NC_013894	GTT	2	6	1352065	1352070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549214
28543	NC_013894	GAG	2	6	1352071	1352076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549214
28544	NC_013894	ATG	2	6	1352141	1352146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549214
28545	NC_013894	CTGTTC	2	12	1352161	1352172	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	289549214
28546	NC_013894	CAC	2	6	1352185	1352190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549214
28547	NC_013894	GCTAAC	2	12	1352419	1352430	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289549215
28548	NC_013894	ATG	2	6	1352451	1352456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549215
28549	NC_013894	TCA	3	9	1352457	1352465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549215
28550	NC_013894	CTG	2	6	1352478	1352483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549215
28551	NC_013894	TTC	2	6	1352485	1352490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549215
28552	NC_013894	TA	3	6	1352497	1352502	50 %	50 %	0 %	0 %	289549215
28553	NC_013894	GCA	2	6	1352572	1352577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289549215
28554	NC_013894	CTC	2	6	1352624	1352629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289549215
28555	NC_013894	AAG	2	6	1352714	1352719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549215
28556	NC_013894	ATA	2	6	1352762	1352767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549215
28557	NC_013894	GA	3	6	1352783	1352788	50 %	0 %	50 %	0 %	289549215
28558	NC_013894	CAA	2	6	1352791	1352796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549215
28559	NC_013894	GAG	3	9	1352807	1352815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549215
28560	NC_013894	GT	4	8	1352844	1352851	0 %	50 %	50 %	0 %	289549215
28561	NC_013894	TTC	2	6	1352861	1352866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549215
28562	NC_013894	CTC	2	6	1352965	1352970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289549215
28563	NC_013894	GGA	2	6	1352986	1352991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549215
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28569	NC_013894	AAAC	2	8	1353157	1353164	75 %	0 %	0 %	25 %	289549215
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28571	NC_013894	TGC	2	6	1353259	1353264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549215
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28577	NC_013894	CTG	2	6	1353449	1353454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549216
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28582	NC_013894	CAC	3	9	1353645	1353653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549216
28583	NC_013894	AG	3	6	1353785	1353790	50 %	0 %	50 %	0 %	289549216
28584	NC_013894	T	6	6	1353827	1353832	0 %	100 %	0 %	0 %	289549216
28585	NC_013894	GCTC	2	8	1353966	1353973	0 %	25 %	25 %	50 %	289549216
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28587	NC_013894	GGTA	2	8	1354080	1354087	25 %	25 %	50 %	0 %	289549216
28588	NC_013894	TGG	2	6	1354109	1354114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549216
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28590	NC_013894	TG	3	6	1354190	1354195	0 %	50 %	50 %	0 %	289549216
28591	NC_013894	AG	3	6	1354246	1354251	50 %	0 %	50 %	0 %	289549216
28592	NC_013894	AGG	2	6	1354306	1354311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549216
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28598	NC_013894	GT	3	6	1354582	1354587	0 %	50 %	50 %	0 %	289549216
28599	NC_013894	A	6	6	1354671	1354676	100 %	0 %	0 %	0 %	289549217
28600	NC_013894	ATAC	2	8	1354682	1354689	50 %	25 %	0 %	25 %	289549217
28601	NC_013894	GA	3	6	1354696	1354701	50 %	0 %	50 %	0 %	289549217
28602	NC_013894	CTT	2	6	1354742	1354747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549217
28603	NC_013894	CCA	2	6	1354792	1354797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549217
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28605	NC_013894	T	6	6	1354975	1354980	0 %	100 %	0 %	0 %	289549217
28606	NC_013894	GA	3	6	1354998	1355003	50 %	0 %	50 %	0 %	289549217
28607	NC_013894	TGG	2	6	1355107	1355112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549217
28608	NC_013894	GGAA	2	8	1355243	1355250	50 %	0 %	50 %	0 %	289549217
28609	NC_013894	AGG	2	6	1355275	1355280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549217
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28611	NC_013894	TGTT	2	8	1355348	1355355	0 %	75 %	25 %	0 %	289549217
28612	NC_013894	AAG	2	6	1355372	1355377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549217
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28616	NC_013894	TGG	2	6	1355533	1355538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549217
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