MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 31593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_013894	GGAT	2	8	637271	637278	25 %	25 %	50 %	0 %	289548442
13503	NC_013894	AAG	2	6	637323	637328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548442
13504	NC_013894	TCTG	2	8	637461	637468	0 %	50 %	25 %	25 %	289548443
13505	NC_013894	TCTG	2	8	637619	637626	0 %	50 %	25 %	25 %	289548443
13506	NC_013894	CTT	2	6	637646	637651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548443
13507	NC_013894	TTC	2	6	637655	637660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548443
13508	NC_013894	TTC	3	9	637727	637735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548443
13509	NC_013894	GTC	2	6	637751	637756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548443
13510	NC_013894	GA	3	6	637771	637776	50 %	0 %	50 %	0 %	289548443
13511	NC_013894	TGC	2	6	637783	637788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548443
13512	NC_013894	CA	3	6	637834	637839	50 %	0 %	0 %	50 %	289548443
13513	NC_013894	CAC	2	6	637883	637888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548443
13514	NC_013894	T	6	6	637901	637906	0 %	100 %	0 %	0 %	289548443
13515	NC_013894	TCC	2	6	637957	637962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548443
13516	NC_013894	GAA	2	6	638126	638131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548444
13517	NC_013894	TACC	2	8	638208	638215	25 %	25 %	0 %	50 %	289548444
13518	NC_013894	CT	3	6	638240	638245	0 %	50 %	0 %	50 %	289548444
13519	NC_013894	A	6	6	638253	638258	100 %	0 %	0 %	0 %	289548444
13520	NC_013894	CTC	2	6	638304	638309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548444
13521	NC_013894	CA	3	6	638432	638437	50 %	0 %	0 %	50 %	289548444
13522	NC_013894	GACAG	2	10	638452	638461	40 %	0 %	40 %	20 %	289548444
13523	NC_013894	TC	3	6	638496	638501	0 %	50 %	0 %	50 %	289548444
13524	NC_013894	GA	3	6	638580	638585	50 %	0 %	50 %	0 %	289548444
13525	NC_013894	GAA	2	6	638595	638600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548444
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13527	NC_013894	AAAT	2	8	638670	638677	75 %	25 %	0 %	0 %	289548444
13528	NC_013894	ATA	2	6	638761	638766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289548444
13529	NC_013894	TCT	2	6	638787	638792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548444
13530	NC_013894	GAA	2	6	638805	638810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548444
13531	NC_013894	GGA	2	6	638874	638879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548444
13532	NC_013894	AAGC	2	8	638886	638893	50 %	0 %	25 %	25 %	289548444
13533	NC_013894	GAAA	2	8	638979	638986	75 %	0 %	25 %	0 %	289548444
13534	NC_013894	TA	3	6	638989	638994	50 %	50 %	0 %	0 %	289548444
13535	NC_013894	GCA	2	6	639001	639006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548444
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13537	NC_013894	GTG	2	6	639040	639045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548444
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13539	NC_013894	AG	3	6	639218	639223	50 %	0 %	50 %	0 %	289548444
13540	NC_013894	CT	3	6	639237	639242	0 %	50 %	0 %	50 %	289548444
13541	NC_013894	AAG	2	6	639286	639291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548444
13542	NC_013894	GGT	2	6	639388	639393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548444
13543	NC_013894	GTA	2	6	639430	639435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548444
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13545	NC_013894	TCT	2	6	639806	639811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548445
13546	NC_013894	TGG	2	6	639905	639910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548445
13547	NC_013894	CAGG	2	8	640054	640061	25 %	0 %	50 %	25 %	289548445
13548	NC_013894	TGAGGA	2	12	640119	640130	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	289548445
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13550	NC_013894	GA	3	6	640302	640307	50 %	0 %	50 %	0 %	289548445
13551	NC_013894	GGGT	2	8	640418	640425	0 %	25 %	75 %	0 %	289548445
13552	NC_013894	TGG	2	6	640433	640438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548445
13553	NC_013894	GAAG	2	8	640560	640567	50 %	0 %	50 %	0 %	289548445
13554	NC_013894	TTC	2	6	640573	640578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548445
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13557	NC_013894	AAC	2	6	640676	640681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548445
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13561	NC_013894	TGT	2	6	641050	641055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548446
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13563	NC_013894	GTCC	2	8	641245	641252	0 %	25 %	25 %	50 %	289548446
13564	NC_013894	T	6	6	641279	641284	0 %	100 %	0 %	0 %	289548446
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13573	NC_013894	TGA	2	6	641551	641556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548446
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13591	NC_013894	CTC	2	6	642797	642802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548447
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13593	NC_013894	TTC	2	6	642900	642905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548447
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13595	NC_013894	C	6	6	643001	643006	0 %	0 %	0 %	100 %	289548447
13596	NC_013894	TCC	2	6	643031	643036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548447
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13599	NC_013894	ACGT	2	8	643295	643302	25 %	25 %	25 %	25 %	289548448
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13603	NC_013894	CAGGA	2	10	643526	643535	40 %	0 %	40 %	20 %	289548448
13604	NC_013894	AC	3	6	643649	643654	50 %	0 %	0 %	50 %	289548449
13605	NC_013894	AAG	2	6	643664	643669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548449
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13617	NC_013894	TTCC	2	8	644071	644078	0 %	50 %	0 %	50 %	289548450
13618	NC_013894	CTT	2	6	644108	644113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548450
13619	NC_013894	T	6	6	644180	644185	0 %	100 %	0 %	0 %	289548450
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13621	NC_013894	T	7	7	644345	644351	0 %	100 %	0 %	0 %	289548450
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13986	NC_013894	CTCC	2	8	661005	661012	0 %	25 %	0 %	75 %	289548463
13987	NC_013894	TCC	2	6	661018	661023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548463
13988	NC_013894	CT	3	6	661026	661031	0 %	50 %	0 %	50 %	289548463
13989	NC_013894	CTTC	2	8	661055	661062	0 %	50 %	0 %	50 %	289548463
13990	NC_013894	CAC	2	6	661236	661241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548463
13991	NC_013894	TA	3	6	661276	661281	50 %	50 %	0 %	0 %	289548463
13992	NC_013894	TC	3	6	661313	661318	0 %	50 %	0 %	50 %	289548463
13993	NC_013894	CTC	2	6	661348	661353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548463
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13995	NC_013894	TG	3	6	661467	661472	0 %	50 %	50 %	0 %	289548463
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13999	NC_013894	TAC	2	6	661773	661778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548464
14000	NC_013894	GAGAT	2	10	661912	661921	40 %	20 %	40 %	0 %	289548464

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