MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 31593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013894	TCC	2	6	542235	542240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548340
11502	NC_013894	G	7	7	542245	542251	0 %	0 %	100 %	0 %	289548340
11503	NC_013894	GAG	2	6	542280	542285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548340
11504	NC_013894	AGG	2	6	542305	542310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548340
11505	NC_013894	G	6	6	542309	542314	0 %	0 %	100 %	0 %	289548340
11506	NC_013894	CCG	2	6	542386	542391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289548340
11507	NC_013894	T	6	6	542404	542409	0 %	100 %	0 %	0 %	289548340
11508	NC_013894	ACGT	2	8	542442	542449	25 %	25 %	25 %	25 %	289548340
11509	NC_013894	GAT	2	6	542553	542558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548340
11510	NC_013894	CCG	2	6	542611	542616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289548340
11511	NC_013894	GT	3	6	542629	542634	0 %	50 %	50 %	0 %	289548340
11512	NC_013894	CTC	2	6	542641	542646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548340
11513	NC_013894	A	6	6	542680	542685	100 %	0 %	0 %	0 %	289548340
11514	NC_013894	AAG	2	6	542779	542784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548340
11515	NC_013894	C	6	6	542817	542822	0 %	0 %	0 %	100 %	289548340
11516	NC_013894	AG	3	6	542875	542880	50 %	0 %	50 %	0 %	289548340
11517	NC_013894	TAC	2	6	542901	542906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548340
11518	NC_013894	GAT	2	6	542916	542921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548340
11519	NC_013894	AGGT	2	8	542953	542960	25 %	25 %	50 %	0 %	289548340
11520	NC_013894	AGG	2	6	543005	543010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548340
11521	NC_013894	GGA	2	6	543063	543068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548340
11522	NC_013894	GCCA	2	8	543095	543102	25 %	0 %	25 %	50 %	289548340
11523	NC_013894	CTT	2	6	543107	543112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548340
11524	NC_013894	TCAA	2	8	543118	543125	50 %	25 %	0 %	25 %	289548340
11525	NC_013894	ATAG	2	8	543204	543211	50 %	25 %	25 %	0 %	289548340
11526	NC_013894	TAC	2	6	543288	543293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548340
11527	NC_013894	AAGG	2	8	543294	543301	50 %	0 %	50 %	0 %	289548340
11528	NC_013894	GGAT	2	8	543377	543384	25 %	25 %	50 %	0 %	289548340
11529	NC_013894	GA	3	6	543389	543394	50 %	0 %	50 %	0 %	289548340
11530	NC_013894	AC	3	6	543404	543409	50 %	0 %	0 %	50 %	289548340
11531	NC_013894	CTC	2	6	543423	543428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548340
11532	NC_013894	ACA	2	6	543439	543444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548340
11533	NC_013894	AG	4	8	543446	543453	50 %	0 %	50 %	0 %	289548340
11534	NC_013894	AGA	2	6	543487	543492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548340
11535	NC_013894	GAA	2	6	543616	543621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548340
11536	NC_013894	CTC	2	6	543632	543637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548340
11537	NC_013894	A	7	7	543669	543675	100 %	0 %	0 %	0 %	289548340
11538	NC_013894	GGC	2	6	543719	543724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289548340
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11540	NC_013894	GAA	2	6	543786	543791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548340
11541	NC_013894	CAA	2	6	543848	543853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548340
11542	NC_013894	AG	3	6	543882	543887	50 %	0 %	50 %	0 %	289548340
11543	NC_013894	TGA	2	6	543906	543911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548340
11544	NC_013894	TC	3	6	543912	543917	0 %	50 %	0 %	50 %	289548341
11545	NC_013894	TC	3	6	543922	543927	0 %	50 %	0 %	50 %	289548341
11546	NC_013894	CTT	2	6	543945	543950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548341
11547	NC_013894	TTA	2	6	543954	543959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289548341
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11549	NC_013894	CCT	2	6	544011	544016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548341
11550	NC_013894	CCT	2	6	544023	544028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548341
11551	NC_013894	ATC	2	6	544070	544075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548341
11552	NC_013894	AAGG	3	12	544112	544123	50 %	0 %	50 %	0 %	289548341
11553	NC_013894	CT	3	6	544138	544143	0 %	50 %	0 %	50 %	289548341
11554	NC_013894	GCG	2	6	544182	544187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289548341
11555	NC_013894	GGT	2	6	544204	544209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548341
11556	NC_013894	TTC	2	6	544231	544236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548341
11557	NC_013894	TTCT	2	8	544267	544274	0 %	75 %	0 %	25 %	289548341
11558	NC_013894	TTC	2	6	544312	544317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548341
11559	NC_013894	CT	3	6	544387	544392	0 %	50 %	0 %	50 %	289548341
11560	NC_013894	CCA	2	6	544452	544457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548341
11561	NC_013894	TCC	2	6	544484	544489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548341
11562	NC_013894	CCTC	2	8	544581	544588	0 %	25 %	0 %	75 %	289548341
11563	NC_013894	CTT	2	6	544639	544644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548341
11564	NC_013894	GGA	2	6	544681	544686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548341
11565	NC_013894	CTC	2	6	544707	544712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548341
11566	NC_013894	TC	3	6	544731	544736	0 %	50 %	0 %	50 %	289548341
11567	NC_013894	C	7	7	544736	544742	0 %	0 %	0 %	100 %	289548341
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11571	NC_013894	GAT	2	6	544930	544935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548341
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11585	NC_013894	A	7	7	545602	545608	100 %	0 %	0 %	0 %	289548342
11586	NC_013894	AGG	2	6	545613	545618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548342
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11588	NC_013894	CCAGAA	2	12	545866	545877	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	289548343
11589	NC_013894	TCA	2	6	545883	545888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548343
11590	NC_013894	GCCT	2	8	545921	545928	0 %	25 %	25 %	50 %	289548343
11591	NC_013894	CAA	2	6	546062	546067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548343
11592	NC_013894	CCA	2	6	546142	546147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548343
11593	NC_013894	ACC	2	6	546153	546158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548343
11594	NC_013894	GA	3	6	546235	546240	50 %	0 %	50 %	0 %	289548343
11595	NC_013894	GAA	2	6	546272	546277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548343
11596	NC_013894	ACC	2	6	546279	546284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548343
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11599	NC_013894	TACTC	2	10	546477	546486	20 %	40 %	0 %	40 %	289548343
11600	NC_013894	TCT	2	6	546519	546524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548343
11601	NC_013894	TC	3	6	546578	546583	0 %	50 %	0 %	50 %	289548343
11602	NC_013894	CT	3	6	546630	546635	0 %	50 %	0 %	50 %	289548343
11603	NC_013894	TCC	2	6	546645	546650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548343
11604	NC_013894	CTT	2	6	546691	546696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548343
11605	NC_013894	GGT	2	6	546761	546766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548343
11606	NC_013894	TCC	2	6	546819	546824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548343
11607	NC_013894	CCG	2	6	546912	546917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289548343
11608	NC_013894	TCC	2	6	546924	546929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548343
11609	NC_013894	AGT	2	6	546969	546974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548344
11610	NC_013894	CAG	2	6	547036	547041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548344
11611	NC_013894	CAGCA	2	10	547117	547126	40 %	0 %	20 %	40 %	289548344
11612	NC_013894	GA	4	8	547156	547163	50 %	0 %	50 %	0 %	289548344
11613	NC_013894	ATA	2	6	547173	547178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289548344
11614	NC_013894	CAC	2	6	547182	547187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548344
11615	NC_013894	T	7	7	547206	547212	0 %	100 %	0 %	0 %	289548344
11616	NC_013894	GAAA	2	8	547227	547234	75 %	0 %	25 %	0 %	289548344
11617	NC_013894	GTA	2	6	547261	547266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548344
11618	NC_013894	ACGAAG	2	12	547283	547294	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289548344
11619	NC_013894	CCA	2	6	547323	547328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548344
11620	NC_013894	AG	3	6	547348	547353	50 %	0 %	50 %	0 %	289548344
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11860	NC_013894	GGA	2	6	558020	558025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548357
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