MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 31593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_013894	CCT	2	6	517701	517706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548312
11002	NC_013894	AC	3	6	517714	517719	50 %	0 %	0 %	50 %	289548312
11003	NC_013894	TGG	2	6	517737	517742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548312
11004	NC_013894	TGCCC	2	10	517805	517814	0 %	20 %	20 %	60 %	289548312
11005	NC_013894	CAC	2	6	517834	517839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548312
11006	NC_013894	CAC	2	6	517848	517853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548312
11007	NC_013894	TC	3	6	517953	517958	0 %	50 %	0 %	50 %	289548312
11008	NC_013894	C	6	6	518008	518013	0 %	0 %	0 %	100 %	289548313
11009	NC_013894	AAAC	2	8	518080	518087	75 %	0 %	0 %	25 %	289548313
11010	NC_013894	CAC	2	6	518116	518121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548313
11011	NC_013894	CAC	2	6	518144	518149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548313
11012	NC_013894	TGG	2	6	518185	518190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548313
11013	NC_013894	TCC	2	6	518199	518204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548313
11014	NC_013894	GAA	2	6	518205	518210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548313
11015	NC_013894	AGGT	2	8	518225	518232	25 %	25 %	50 %	0 %	289548313
11016	NC_013894	CTC	2	6	518239	518244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548313
11017	NC_013894	ACC	2	6	518249	518254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548313
11018	NC_013894	TGG	2	6	518305	518310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548313
11019	NC_013894	TAC	2	6	518312	518317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548313
11020	NC_013894	AGCTT	2	10	518367	518376	20 %	40 %	20 %	20 %	289548313
11021	NC_013894	GGT	2	6	518475	518480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548313
11022	NC_013894	CCT	2	6	518494	518499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548313
11023	NC_013894	TAC	2	6	518537	518542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548313
11024	NC_013894	ATA	2	6	518574	518579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289548313
11025	NC_013894	AGAA	2	8	518586	518593	75 %	0 %	25 %	0 %	289548313
11026	NC_013894	CCT	2	6	518613	518618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548313
11027	NC_013894	TAC	2	6	518655	518660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548314
11028	NC_013894	CAG	2	6	518731	518736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548314
11029	NC_013894	GTCT	2	8	518737	518744	0 %	50 %	25 %	25 %	289548314
11030	NC_013894	AGG	2	6	518893	518898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548314
11031	NC_013894	CTTC	2	8	518901	518908	0 %	50 %	0 %	50 %	289548314
11032	NC_013894	TA	3	6	518939	518944	50 %	50 %	0 %	0 %	289548314
11033	NC_013894	CAG	2	6	518960	518965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548314
11034	NC_013894	CTCC	2	8	518989	518996	0 %	25 %	0 %	75 %	289548314
11035	NC_013894	TAT	2	6	519008	519013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289548314
11036	NC_013894	TTCTT	2	10	519111	519120	0 %	80 %	0 %	20 %	289548314
11037	NC_013894	ACCTT	2	10	519186	519195	20 %	40 %	0 %	40 %	289548314
11038	NC_013894	GGT	2	6	519340	519345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548315
11039	NC_013894	GTCA	2	8	519354	519361	25 %	25 %	25 %	25 %	289548315
11040	NC_013894	GA	3	6	519379	519384	50 %	0 %	50 %	0 %	289548315
11041	NC_013894	TTA	2	6	519395	519400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289548315
11042	NC_013894	GAG	2	6	519427	519432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548315
11043	NC_013894	ACT	2	6	519515	519520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548315
11044	NC_013894	TAGC	2	8	519596	519603	25 %	25 %	25 %	25 %	289548315
11045	NC_013894	CTGT	2	8	519691	519698	0 %	50 %	25 %	25 %	289548315
11046	NC_013894	AG	3	6	519739	519744	50 %	0 %	50 %	0 %	289548315
11047	NC_013894	AAGAG	2	10	519759	519768	60 %	0 %	40 %	0 %	289548315
11048	NC_013894	GCATA	2	10	519789	519798	40 %	20 %	20 %	20 %	289548315
11049	NC_013894	GT	3	6	519851	519856	0 %	50 %	50 %	0 %	289548315
11050	NC_013894	CCG	2	6	519895	519900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289548315
11051	NC_013894	GAA	2	6	519943	519948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548315
11052	NC_013894	TA	3	6	519955	519960	50 %	50 %	0 %	0 %	289548315
11053	NC_013894	TGG	2	6	520082	520087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548315
11054	NC_013894	TGG	2	6	520097	520102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548315
11055	NC_013894	TCT	2	6	520167	520172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548315
11056	NC_013894	ACT	2	6	520202	520207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548315
11057	NC_013894	GGT	2	6	520370	520375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548315
11058	NC_013894	GAG	2	6	520497	520502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548315
11059	NC_013894	CACC	2	8	520605	520612	25 %	0 %	0 %	75 %	289548316
11060	NC_013894	AGG	2	6	520693	520698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548316
11061	NC_013894	TCCT	2	8	520785	520792	0 %	50 %	0 %	50 %	289548316
11062	NC_013894	CAG	2	6	520815	520820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548316
11063	NC_013894	GA	3	6	520853	520858	50 %	0 %	50 %	0 %	289548316
11064	NC_013894	AAG	2	6	520900	520905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548316
11065	NC_013894	ACT	2	6	520966	520971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548316
11066	NC_013894	GGC	2	6	521044	521049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289548316
11067	NC_013894	GAG	2	6	521120	521125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548316
11068	NC_013894	AG	3	6	521138	521143	50 %	0 %	50 %	0 %	289548316
11069	NC_013894	GAA	2	6	521166	521171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548316
11070	NC_013894	TGA	2	6	521228	521233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548317
11071	NC_013894	CAT	2	6	521367	521372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548317
11072	NC_013894	A	6	6	521469	521474	100 %	0 %	0 %	0 %	289548317
11073	NC_013894	CCTT	2	8	521485	521492	0 %	50 %	0 %	50 %	289548317
11074	NC_013894	ATA	2	6	521518	521523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289548317
11075	NC_013894	GAA	2	6	521524	521529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548317
11076	NC_013894	AGAA	2	8	521543	521550	75 %	0 %	25 %	0 %	289548317
11077	NC_013894	ATA	2	6	521599	521604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289548317
11078	NC_013894	AGT	2	6	521617	521622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548317
11079	NC_013894	A	7	7	521629	521635	100 %	0 %	0 %	0 %	289548317
11080	NC_013894	TGG	2	6	521690	521695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548317
11081	NC_013894	ACT	2	6	521708	521713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548317
11082	NC_013894	TGG	2	6	521714	521719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548317
11083	NC_013894	A	6	6	521840	521845	100 %	0 %	0 %	0 %	289548317
11084	NC_013894	CAT	2	6	521856	521861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548317
11085	NC_013894	CTT	2	6	521865	521870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548317
11086	NC_013894	TTC	3	9	521877	521885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548317
11087	NC_013894	CTT	2	6	521886	521891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548317
11088	NC_013894	GA	3	6	521906	521911	50 %	0 %	50 %	0 %	289548317
11089	NC_013894	CCTTC	2	10	522001	522010	0 %	40 %	0 %	60 %	289548317
11090	NC_013894	TAA	2	6	522029	522034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289548317
11091	NC_013894	A	6	6	522038	522043	100 %	0 %	0 %	0 %	289548317
11092	NC_013894	AAGGG	2	10	522173	522182	40 %	0 %	60 %	0 %	289548317
11093	NC_013894	AGGG	2	8	522201	522208	25 %	0 %	75 %	0 %	289548318
11094	NC_013894	TG	4	8	522287	522294	0 %	50 %	50 %	0 %	289548318
11095	NC_013894	GTG	2	6	522310	522315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548318
11096	NC_013894	GAG	2	6	522317	522322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548318
11097	NC_013894	AG	3	6	522392	522397	50 %	0 %	50 %	0 %	289548318
11098	NC_013894	CTT	2	6	522468	522473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548318
11099	NC_013894	CAG	2	6	522647	522652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548318
11100	NC_013894	A	6	6	522704	522709	100 %	0 %	0 %	0 %	289548318
11101	NC_013894	GGT	2	6	522710	522715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548318
11102	NC_013894	GGA	2	6	522716	522721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548318
11103	NC_013894	TCT	2	6	522754	522759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548318
11104	NC_013894	AAGA	2	8	522795	522802	75 %	0 %	25 %	0 %	289548318
11105	NC_013894	CAG	2	6	522834	522839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548318
11106	NC_013894	AGC	2	6	522882	522887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548318
11107	NC_013894	AAGG	2	8	522902	522909	50 %	0 %	50 %	0 %	289548318
11108	NC_013894	GGTCC	2	10	522940	522949	0 %	20 %	40 %	40 %	289548318
11109	NC_013894	TGG	2	6	522982	522987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548318
11110	NC_013894	GGA	2	6	523025	523030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548318
11111	NC_013894	ACT	2	6	523040	523045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548318
11112	NC_013894	GAG	2	6	523059	523064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548318
11113	NC_013894	ATC	2	6	523069	523074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548318
11114	NC_013894	GGAG	2	8	523163	523170	25 %	0 %	75 %	0 %	289548318
11115	NC_013894	CTA	2	6	523245	523250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548318
11116	NC_013894	GA	3	6	523260	523265	50 %	0 %	50 %	0 %	289548319
11117	NC_013894	GGA	2	6	523332	523337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548319
11118	NC_013894	AAGG	2	8	523363	523370	50 %	0 %	50 %	0 %	289548319
11119	NC_013894	TCT	2	6	523382	523387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548319
11120	NC_013894	AAG	2	6	523404	523409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548319
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11122	NC_013894	GAG	2	6	523576	523581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548319
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