MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 57881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013889	GC	3	6	162166	162171	0 %	0 %	50 %	50 %	289207343
3502	NC_013889	CGG	2	6	162190	162195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207343
3503	NC_013889	GC	3	6	162198	162203	0 %	0 %	50 %	50 %	289207343
3504	NC_013889	GC	3	6	162253	162258	0 %	0 %	50 %	50 %	289207343
3505	NC_013889	CTG	2	6	162323	162328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207343
3506	NC_013889	GGGGTG	2	12	162341	162352	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	289207343
3507	NC_013889	CTG	2	6	162383	162388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207343
3508	NC_013889	CGC	2	6	162504	162509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207343
3509	NC_013889	AGC	2	6	162771	162776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207344
3510	NC_013889	CGG	2	6	162782	162787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207344
3511	NC_013889	GCC	2	6	162859	162864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207344
3512	NC_013889	GGC	2	6	162888	162893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207344
3513	NC_013889	TCCG	2	8	162968	162975	0 %	25 %	25 %	50 %	289207344
3514	NC_013889	CGG	2	6	162986	162991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207344
3515	NC_013889	GGT	2	6	163006	163011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207344
3516	NC_013889	CTA	2	6	163032	163037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207344
3517	NC_013889	GTC	2	6	163039	163044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207344
3518	NC_013889	CAT	3	9	163194	163202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207344
3519	NC_013889	GTGG	2	8	163212	163219	0 %	25 %	75 %	0 %	289207344
3520	NC_013889	CTG	2	6	163246	163251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207344
3521	NC_013889	TTC	2	6	163288	163293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207344
3522	NC_013889	TGC	2	6	163319	163324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207344
3523	NC_013889	CAA	2	6	163332	163337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207344
3524	NC_013889	GTG	2	6	163413	163418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207344
3525	NC_013889	CTT	2	6	163440	163445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207344
3526	NC_013889	GAT	2	6	163467	163472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207344
3527	NC_013889	TAC	2	6	163474	163479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207344
3528	NC_013889	ATC	2	6	163528	163533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207344
3529	NC_013889	TGGG	2	8	163564	163571	0 %	25 %	75 %	0 %	289207344
3530	NC_013889	CAC	2	6	163576	163581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207344
3531	NC_013889	GGC	2	6	163620	163625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207344
3532	NC_013889	CTG	4	12	163639	163650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207344
3533	NC_013889	CCT	2	6	163652	163657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207344
3534	NC_013889	CAT	2	6	163677	163682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207344
3535	NC_013889	GAT	2	6	163782	163787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207344
3536	NC_013889	GCTGG	2	10	163857	163866	0 %	20 %	60 %	20 %	289207344
3537	NC_013889	GAT	2	6	163872	163877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207344
3538	NC_013889	ACC	2	6	163895	163900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207344
3539	NC_013889	CTT	2	6	163956	163961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207344
3540	NC_013889	TGC	2	6	164030	164035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207344
3541	NC_013889	GGT	2	6	164082	164087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207344
3542	NC_013889	GTGC	2	8	164110	164117	0 %	25 %	50 %	25 %	289207344
3543	NC_013889	TGG	2	6	164121	164126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207344
3544	NC_013889	TTC	2	6	164131	164136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207344
3545	NC_013889	GAA	2	6	164215	164220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207344
3546	NC_013889	CG	3	6	164224	164229	0 %	0 %	50 %	50 %	289207344
3547	NC_013889	CTG	2	6	164302	164307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207345
3548	NC_013889	ATC	2	6	164308	164313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207345
3549	NC_013889	GGC	2	6	164338	164343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207345
3550	NC_013889	CGA	2	6	164373	164378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207345
3551	NC_013889	GAA	2	6	164386	164391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207345
3552	NC_013889	AGC	2	6	164423	164428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207345
3553	NC_013889	GCGG	2	8	164429	164436	0 %	0 %	75 %	25 %	289207345
3554	NC_013889	GCT	2	6	164456	164461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207345
3555	NC_013889	TGC	2	6	164504	164509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207345
3556	NC_013889	ACT	2	6	164519	164524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207345
3557	NC_013889	GC	3	6	164593	164598	0 %	0 %	50 %	50 %	289207345
3558	NC_013889	TGG	2	6	164601	164606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207345
3559	NC_013889	AATG	2	8	164617	164624	50 %	25 %	25 %	0 %	289207345
3560	NC_013889	TGGC	2	8	164689	164696	0 %	25 %	50 %	25 %	289207345
3561	NC_013889	CGC	2	6	164702	164707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207345
3562	NC_013889	ACT	2	6	164711	164716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207345
3563	NC_013889	AAC	2	6	164813	164818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207345
3564	NC_013889	CAA	2	6	164838	164843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207345
3565	NC_013889	GCAGGC	2	12	164865	164876	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289207345
3566	NC_013889	CTC	2	6	164895	164900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207345
3567	NC_013889	GATG	2	8	164913	164920	25 %	25 %	50 %	0 %	289207345
3568	NC_013889	TGG	2	6	164924	164929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207345
3569	NC_013889	TGG	2	6	164954	164959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207345
3570	NC_013889	ACG	3	9	164972	164980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207345
3571	NC_013889	GCA	2	6	165036	165041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207346
3572	NC_013889	AGCCG	2	10	165139	165148	20 %	0 %	40 %	40 %	289207346
3573	NC_013889	GAA	2	6	165186	165191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207346
3574	NC_013889	GAT	2	6	165192	165197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207346
3575	NC_013889	CA	3	6	165253	165258	50 %	0 %	0 %	50 %	289207347
3576	NC_013889	ACC	2	6	165287	165292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207347
3577	NC_013889	ACA	2	6	165324	165329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207347
3578	NC_013889	TGG	2	6	165344	165349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207347
3579	NC_013889	CCA	2	6	165444	165449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207347
3580	NC_013889	CAC	2	6	165478	165483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207347
3581	NC_013889	CTG	2	6	165503	165508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207347
3582	NC_013889	GCCA	2	8	165569	165576	25 %	0 %	25 %	50 %	289207347
3583	NC_013889	GCCGAC	2	12	165596	165607	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	289207347
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3585	NC_013889	CGG	2	6	165676	165681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207347
3586	NC_013889	GGC	2	6	165734	165739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207347
3587	NC_013889	GTC	2	6	165774	165779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207347
3588	NC_013889	GGC	2	6	165835	165840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207347
3589	NC_013889	GCT	2	6	165924	165929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207347
3590	NC_013889	GGCCT	2	10	165956	165965	0 %	20 %	40 %	40 %	289207347
3591	NC_013889	GC	3	6	165972	165977	0 %	0 %	50 %	50 %	289207347
3592	NC_013889	CAA	2	6	165988	165993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207347
3593	NC_013889	GCGCCT	2	12	166039	166050	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289207347
3594	NC_013889	GAC	2	6	166115	166120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207347
3595	NC_013889	GCCA	2	8	166342	166349	25 %	0 %	25 %	50 %	289207348
3596	NC_013889	CCAG	2	8	166486	166493	25 %	0 %	25 %	50 %	289207348
3597	NC_013889	GTC	2	6	166542	166547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207348
3598	NC_013889	TCT	2	6	166561	166566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207348
3599	NC_013889	TGC	2	6	166597	166602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207348
3600	NC_013889	TTC	2	6	166605	166610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207348
3601	NC_013889	CGGC	2	8	166710	166717	0 %	0 %	50 %	50 %	289207348
3602	NC_013889	AGC	2	6	166735	166740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207348
3603	NC_013889	CCAC	2	8	166774	166781	25 %	0 %	0 %	75 %	289207348
3604	NC_013889	CTT	2	6	166862	166867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207348
3605	NC_013889	CCT	2	6	166888	166893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207348
3606	NC_013889	CCA	2	6	166918	166923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207348
3607	NC_013889	GC	3	6	166944	166949	0 %	0 %	50 %	50 %	289207348
3608	NC_013889	CG	3	6	167061	167066	0 %	0 %	50 %	50 %	289207348
3609	NC_013889	GAG	2	6	167094	167099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207348
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3611	NC_013889	CAT	2	6	167234	167239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207348
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3613	NC_013889	GCTG	2	8	167311	167318	0 %	25 %	50 %	25 %	289207348
3614	NC_013889	GCG	2	6	167343	167348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207348
3615	NC_013889	TGG	2	6	167353	167358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207348
3616	NC_013889	GC	3	6	167365	167370	0 %	0 %	50 %	50 %	289207348
3617	NC_013889	CGCC	2	8	167391	167398	0 %	0 %	25 %	75 %	289207348
3618	NC_013889	AAC	2	6	167487	167492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207348
3619	NC_013889	ACG	2	6	167623	167628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207348
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3621	NC_013889	GC	3	6	168087	168092	0 %	0 %	50 %	50 %	289207349
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3984	NC_013889	GGTG	2	8	184038	184045	0 %	25 %	75 %	0 %	289207362
3985	NC_013889	CAC	2	6	184066	184071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207362
3986	NC_013889	GAC	2	6	184075	184080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207362
3987	NC_013889	CGT	2	6	184113	184118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207362
3988	NC_013889	GT	3	6	184135	184140	0 %	50 %	50 %	0 %	289207362
3989	NC_013889	GGC	2	6	184150	184155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207362
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