MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 57881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28003	NC_013889	GTCGG	2	10	1327614	1327623	0 %	20 %	60 %	20 %	289208433
28004	NC_013889	CGG	2	6	1327641	1327646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289208433
28005	NC_013889	CTC	2	6	1327682	1327687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289208433
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28007	NC_013889	CATC	2	8	1327795	1327802	25 %	25 %	0 %	50 %	289208433
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28009	NC_013889	AAG	2	6	1327851	1327856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289208433
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28012	NC_013889	CGCC	2	8	1328098	1328105	0 %	0 %	25 %	75 %	289208433
28013	NC_013889	ACC	2	6	1328290	1328295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289208433
28014	NC_013889	GCAG	2	8	1328526	1328533	25 %	0 %	50 %	25 %	289208434
28015	NC_013889	G	7	7	1328590	1328596	0 %	0 %	100 %	0 %	289208434
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28020	NC_013889	GGC	2	6	1328726	1328731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289208434
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28023	NC_013889	GCG	2	6	1328876	1328881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289208434
28024	NC_013889	CG	3	6	1328888	1328893	0 %	0 %	50 %	50 %	289208434
28025	NC_013889	GGTAAT	2	12	1328907	1328918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289208434
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28027	NC_013889	CTG	2	6	1328949	1328954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289208434
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28030	NC_013889	TCG	2	6	1328977	1328982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289208434
28031	NC_013889	GCGG	2	8	1328983	1328990	0 %	0 %	75 %	25 %	289208434
28032	NC_013889	GGCG	2	8	1329020	1329027	0 %	0 %	75 %	25 %	289208434
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28042	NC_013889	ATG	2	6	1329503	1329508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289208435
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28051	NC_013889	CG	3	6	1329877	1329882	0 %	0 %	50 %	50 %	289208435
28052	NC_013889	CG	3	6	1329908	1329913	0 %	0 %	50 %	50 %	289208435
28053	NC_013889	TCG	2	6	1329966	1329971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289208435
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28059	NC_013889	GCG	2	6	1330110	1330115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289208435
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28113	NC_013889	TCCT	2	8	1332713	1332720	0 %	50 %	0 %	50 %	289208438
28114	NC_013889	CGG	2	6	1332879	1332884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289208438
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28117	NC_013889	CCGG	2	8	1333175	1333182	0 %	0 %	50 %	50 %	289208439
28118	NC_013889	CGG	2	6	1333226	1333231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289208439
28119	NC_013889	TCG	2	6	1333280	1333285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289208439
28120	NC_013889	CGG	2	6	1333310	1333315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289208439
28121	NC_013889	GC	3	6	1333328	1333333	0 %	0 %	50 %	50 %	289208439
28122	NC_013889	CGC	2	6	1333389	1333394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289208439
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28124	NC_013889	GTT	2	6	1333502	1333507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289208439
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28130	NC_013889	GC	3	6	1333643	1333648	0 %	0 %	50 %	50 %	289208439
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28132	NC_013889	CG	3	6	1333687	1333692	0 %	0 %	50 %	50 %	289208439
28133	NC_013889	CTG	2	6	1333698	1333703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289208439
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28145	NC_013889	TCG	2	6	1334570	1334575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289208441
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28219	NC_013889	ATG	2	6	1337766	1337771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289208443
28220	NC_013889	CGG	2	6	1337884	1337889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289208443
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28223	NC_013889	CGT	2	6	1338061	1338066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289208443
28224	NC_013889	GCAG	2	8	1338082	1338089	25 %	0 %	50 %	25 %	289208443
28225	NC_013889	GCGCA	2	10	1338110	1338119	20 %	0 %	40 %	40 %	289208443
28226	NC_013889	CGC	2	6	1338139	1338144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289208443
28227	NC_013889	GTC	2	6	1338153	1338158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289208443
28228	NC_013889	TTC	2	6	1338206	1338211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289208443
28229	NC_013889	GTC	2	6	1338227	1338232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289208443
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28232	NC_013889	CAC	2	6	1338398	1338403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289208443
28233	NC_013889	TCG	2	6	1338417	1338422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289208443
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28343	NC_013889	CCG	2	6	1343050	1343055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289208447
28344	NC_013889	CGCGG	2	10	1343074	1343083	0 %	0 %	60 %	40 %	289208447
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28462	NC_013889	GCTC	2	8	1348840	1348847	0 %	25 %	25 %	50 %	289208452
28463	NC_013889	CTG	2	6	1348868	1348873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289208452
28464	NC_013889	GC	3	6	1348954	1348959	0 %	0 %	50 %	50 %	289208452
28465	NC_013889	CGC	2	6	1348966	1348971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289208452
28466	NC_013889	CGGTG	2	10	1348996	1349005	0 %	20 %	60 %	20 %	289208452
28467	NC_013889	TGG	2	6	1349070	1349075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289208452
28468	NC_013889	CAC	2	6	1349104	1349109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289208452
28469	NC_013889	CTG	2	6	1349174	1349179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289208452
28470	NC_013889	CG	3	6	1349187	1349192	0 %	0 %	50 %	50 %	289208452
28471	NC_013889	TGACC	2	10	1349377	1349386	20 %	20 %	20 %	40 %	289208452
28472	NC_013889	TGC	2	6	1349397	1349402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289208452
28473	NC_013889	CGGC	2	8	1349485	1349492	0 %	0 %	50 %	50 %	289208452
28474	NC_013889	CGC	2	6	1349616	1349621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289208452
28475	NC_013889	AGC	2	6	1349670	1349675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289208452
28476	NC_013889	GC	4	8	1349680	1349687	0 %	0 %	50 %	50 %	289208452
28477	NC_013889	GCCA	2	8	1349714	1349721	25 %	0 %	25 %	50 %	289208452
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28480	NC_013889	GGGC	2	8	1349782	1349789	0 %	0 %	75 %	25 %	289208453
28481	NC_013889	CGG	2	6	1349796	1349801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289208453
28482	NC_013889	ACT	2	6	1349814	1349819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289208453
28483	NC_013889	CAA	2	6	1349822	1349827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289208453
28484	NC_013889	CGA	2	6	1349881	1349886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289208453
28485	NC_013889	GCT	2	6	1350022	1350027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289208453
28486	NC_013889	CGA	2	6	1350106	1350111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289208453
28487	NC_013889	TGA	2	6	1350114	1350119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289208453
28488	NC_013889	TCGG	2	8	1350143	1350150	0 %	25 %	50 %	25 %	289208453
28489	NC_013889	GGC	2	6	1350187	1350192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289208453
28490	NC_013889	GCG	3	9	1350196	1350204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289208453
28491	NC_013889	CAC	2	6	1350219	1350224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289208453
28492	NC_013889	ACG	2	6	1350243	1350248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289208453
28493	NC_013889	AACC	2	8	1350279	1350286	50 %	0 %	0 %	50 %	289208453
28494	NC_013889	C	6	6	1350326	1350331	0 %	0 %	0 %	100 %	289208453
28495	NC_013889	ACCT	2	8	1350401	1350408	25 %	25 %	0 %	50 %	289208453
28496	NC_013889	CTG	2	6	1350413	1350418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289208453
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28499	NC_013889	CCTT	2	8	1350585	1350592	0 %	50 %	0 %	50 %	289208453
28500	NC_013889	CCCG	2	8	1350606	1350613	0 %	0 %	25 %	75 %	289208453

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