MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 57881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_013889	CGCA	2	8	2558533	2558540	25 %	0 %	25 %	50 %	289209597
54002	NC_013889	CTGGTC	2	12	2558642	2558653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209597
54003	NC_013889	CGC	2	6	2558683	2558688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209597
54004	NC_013889	TGC	2	6	2558691	2558696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209597
54005	NC_013889	CCA	2	6	2558770	2558775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209598
54006	NC_013889	GCC	2	6	2558887	2558892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209598
54007	NC_013889	CGG	2	6	2558911	2558916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209598
54008	NC_013889	GC	3	6	2558937	2558942	0 %	0 %	50 %	50 %	289209598
54009	NC_013889	GGC	2	6	2558954	2558959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209598
54010	NC_013889	CGGCG	2	10	2558965	2558974	0 %	0 %	60 %	40 %	289209598
54011	NC_013889	TGC	2	6	2559046	2559051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209598
54012	NC_013889	ACT	2	6	2559055	2559060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209598
54013	NC_013889	TGG	2	6	2559148	2559153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209598
54014	NC_013889	TGG	2	6	2559172	2559177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209598
54015	NC_013889	GC	3	6	2559196	2559201	0 %	0 %	50 %	50 %	289209598
54016	NC_013889	GCCT	2	8	2559231	2559238	0 %	25 %	25 %	50 %	289209598
54017	NC_013889	CAT	2	6	2559274	2559279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209598
54018	NC_013889	CGA	2	6	2559410	2559415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209598
54019	NC_013889	CAC	2	6	2559435	2559440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209598
54020	NC_013889	AGG	2	6	2559487	2559492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209598
54021	NC_013889	TCA	2	6	2559575	2559580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209598
54022	NC_013889	CGGT	2	8	2559863	2559870	0 %	25 %	50 %	25 %	289209599
54023	NC_013889	TCG	2	6	2560043	2560048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209599
54024	NC_013889	CCG	2	6	2560059	2560064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209599
54025	NC_013889	GGGCAG	2	12	2560111	2560122	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	289209599
54026	NC_013889	GACC	2	8	2560143	2560150	25 %	0 %	25 %	50 %	289209599
54027	NC_013889	CGCTG	2	10	2560164	2560173	0 %	20 %	40 %	40 %	289209599
54028	NC_013889	CGGCC	2	10	2560200	2560209	0 %	0 %	40 %	60 %	289209599
54029	NC_013889	GCG	2	6	2560295	2560300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209599
54030	NC_013889	GGA	2	6	2560315	2560320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209599
54031	NC_013889	GCCG	2	8	2560424	2560431	0 %	0 %	50 %	50 %	289209599
54032	NC_013889	CG	4	8	2560590	2560597	0 %	0 %	50 %	50 %	289209599
54033	NC_013889	CTGG	2	8	2560641	2560648	0 %	25 %	50 %	25 %	289209599
54034	NC_013889	ACCC	2	8	2560684	2560691	25 %	0 %	0 %	75 %	289209599
54035	NC_013889	GCGT	2	8	2560706	2560713	0 %	25 %	50 %	25 %	289209599
54036	NC_013889	AGC	2	6	2560714	2560719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209599
54037	NC_013889	AC	3	6	2560782	2560787	50 %	0 %	0 %	50 %	289209599
54038	NC_013889	CGA	2	6	2560924	2560929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209600
54039	NC_013889	CTG	2	6	2560931	2560936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209600
54040	NC_013889	TGCC	2	8	2560941	2560948	0 %	25 %	25 %	50 %	289209600
54041	NC_013889	CGA	2	6	2561008	2561013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209600
54042	NC_013889	GCT	2	6	2561047	2561052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209600
54043	NC_013889	CG	3	6	2561084	2561089	0 %	0 %	50 %	50 %	289209600
54044	NC_013889	GGA	2	6	2561095	2561100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209600
54045	NC_013889	CTC	2	6	2561108	2561113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209600
54046	NC_013889	CTG	2	6	2561144	2561149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209600
54047	NC_013889	CTG	2	6	2561237	2561242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209600
54048	NC_013889	GCT	2	6	2561437	2561442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209601
54049	NC_013889	CAA	2	6	2561443	2561448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289209601
54050	NC_013889	GCG	2	6	2561532	2561537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209601
54051	NC_013889	CTG	2	6	2561596	2561601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209601
54052	NC_013889	GAC	2	6	2561612	2561617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209601
54053	NC_013889	CTG	2	6	2561618	2561623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209601
54054	NC_013889	GCC	2	6	2561634	2561639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209601
54055	NC_013889	GCC	2	6	2561708	2561713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209601
54056	NC_013889	CGA	2	6	2561728	2561733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209601
54057	NC_013889	GAT	2	6	2561750	2561755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209601
54058	NC_013889	CGCC	2	8	2561758	2561765	0 %	0 %	25 %	75 %	289209601
54059	NC_013889	CGT	2	6	2561782	2561787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209601
54060	NC_013889	CTG	2	6	2561801	2561806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209601
54061	NC_013889	GAG	2	6	2561858	2561863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209601
54062	NC_013889	CGT	2	6	2561875	2561880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209601
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54064	NC_013889	TCA	4	12	2561916	2561927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209601
54065	NC_013889	CG	3	6	2561939	2561944	0 %	0 %	50 %	50 %	289209601
54066	NC_013889	CTTCGA	2	12	2562061	2562072	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289209601
54067	NC_013889	GCTG	2	8	2562089	2562096	0 %	25 %	50 %	25 %	289209601
54068	NC_013889	GAT	2	6	2562106	2562111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209601
54069	NC_013889	AC	3	6	2562118	2562123	50 %	0 %	0 %	50 %	289209601
54070	NC_013889	CTT	2	6	2562193	2562198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209601
54071	NC_013889	CTG	2	6	2562203	2562208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209601
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54074	NC_013889	CGG	2	6	2562295	2562300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209601
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54082	NC_013889	CGA	3	9	2562502	2562510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209601
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54084	NC_013889	GCA	2	6	2562526	2562531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209601
54085	NC_013889	GCA	2	6	2562535	2562540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209601
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54098	NC_013889	C	6	6	2563131	2563136	0 %	0 %	0 %	100 %	289209602
54099	NC_013889	TGA	2	6	2563166	2563171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209602
54100	NC_013889	GCGCG	2	10	2563200	2563209	0 %	0 %	60 %	40 %	289209602
54101	NC_013889	ATCG	2	8	2563214	2563221	25 %	25 %	25 %	25 %	289209602
54102	NC_013889	GCC	2	6	2563244	2563249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209602
54103	NC_013889	CTGG	2	8	2563507	2563514	0 %	25 %	50 %	25 %	289209603
54104	NC_013889	CACC	2	8	2563519	2563526	25 %	0 %	0 %	75 %	289209603
54105	NC_013889	TCG	2	6	2563539	2563544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209603
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54111	NC_013889	CTG	2	6	2563983	2563988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209604
54112	NC_013889	GGCGC	2	10	2563991	2564000	0 %	0 %	60 %	40 %	289209604
54113	NC_013889	CCG	2	6	2564001	2564006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209604
54114	NC_013889	CG	3	6	2564041	2564046	0 %	0 %	50 %	50 %	289209604
54115	NC_013889	CTG	2	6	2564196	2564201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209604
54116	NC_013889	AGC	2	6	2564209	2564214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209604
54117	NC_013889	CTC	2	6	2564283	2564288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209604
54118	NC_013889	G	6	6	2564295	2564300	0 %	0 %	100 %	0 %	289209604
54119	NC_013889	CGCATC	2	12	2564325	2564336	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289209604
54120	NC_013889	GCGGG	2	10	2564351	2564360	0 %	0 %	80 %	20 %	289209604
54121	NC_013889	GCC	2	6	2564385	2564390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209604
54122	NC_013889	CGATCG	2	12	2564410	2564421	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289209604
54123	NC_013889	CCGA	2	8	2564574	2564581	25 %	0 %	25 %	50 %	289209604
54124	NC_013889	CGA	2	6	2564600	2564605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209604
54125	NC_013889	CCGGC	2	10	2564650	2564659	0 %	0 %	40 %	60 %	289209604
54126	NC_013889	CGA	2	6	2564711	2564716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209604
54127	NC_013889	GC	3	6	2565088	2565093	0 %	0 %	50 %	50 %	289209605
54128	NC_013889	TCAT	2	8	2565097	2565104	25 %	50 %	0 %	25 %	289209605
54129	NC_013889	CGA	2	6	2565156	2565161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209605
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54131	NC_013889	CCG	2	6	2565211	2565216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209605
54132	NC_013889	ACT	2	6	2565327	2565332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209605
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54134	NC_013889	CGCT	2	8	2565389	2565396	0 %	25 %	25 %	50 %	289209605
54135	NC_013889	TGA	2	6	2565444	2565449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209605
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54138	NC_013889	CGG	2	6	2565547	2565552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209605
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54142	NC_013889	GGC	2	6	2565790	2565795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209605
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54153	NC_013889	CTA	2	6	2566405	2566410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209606
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54204	NC_013889	GGCT	2	8	2568489	2568496	0 %	25 %	50 %	25 %	289209608
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54206	NC_013889	GCT	2	6	2568521	2568526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209608
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54212	NC_013889	AGC	2	6	2568997	2569002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209608
54213	NC_013889	GCGT	2	8	2569040	2569047	0 %	25 %	50 %	25 %	289209608
54214	NC_013889	T	6	6	2569124	2569129	0 %	100 %	0 %	0 %	289209608
54215	NC_013889	CGAG	2	8	2569205	2569212	25 %	0 %	50 %	25 %	289209608
54216	NC_013889	GCC	2	6	2569326	2569331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209608
54217	NC_013889	TCGGCC	2	12	2569380	2569391	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289209608
54218	NC_013889	TCC	2	6	2569453	2569458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209608
54219	NC_013889	CGC	2	6	2569496	2569501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209608
54220	NC_013889	ACC	2	6	2569525	2569530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209608
54221	NC_013889	GGC	2	6	2569557	2569562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209608
54222	NC_013889	TGC	2	6	2569579	2569584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209608
54223	NC_013889	TGA	2	6	2569588	2569593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209608
54224	NC_013889	CGA	2	6	2569619	2569624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209608
54225	NC_013889	TGC	2	6	2569693	2569698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209608
54226	NC_013889	GTC	2	6	2569700	2569705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209608
54227	NC_013889	TGG	2	6	2569726	2569731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209608
54228	NC_013889	CGG	2	6	2569761	2569766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209608
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54463	NC_013889	GC	3	6	2586448	2586453	0 %	0 %	50 %	50 %	289209618
54464	NC_013889	GGCG	2	8	2586454	2586461	0 %	0 %	75 %	25 %	289209618
54465	NC_013889	TCA	2	6	2586465	2586470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209618
54466	NC_013889	CTG	2	6	2586638	2586643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209619
54467	NC_013889	GAA	2	6	2586761	2586766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289209620
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54470	NC_013889	ACT	2	6	2586864	2586869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209620
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54473	NC_013889	CTG	2	6	2586962	2586967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209620
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54482	NC_013889	CAG	2	6	2587361	2587366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209620
54483	NC_013889	CGA	2	6	2587384	2587389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209620
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54486	NC_013889	ACG	2	6	2587514	2587519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209620
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54489	NC_013889	CAG	3	9	2587681	2587689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209621
54490	NC_013889	ATG	2	6	2587723	2587728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209621
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54492	NC_013889	GGC	2	6	2587743	2587748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209621
54493	NC_013889	TAC	2	6	2587870	2587875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209621
54494	NC_013889	GAA	2	6	2587893	2587898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289209621
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54497	NC_013889	CCAC	2	8	2588039	2588046	25 %	0 %	0 %	75 %	289209621
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54499	NC_013889	CCG	2	6	2588076	2588081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209621
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