MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 57881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53003	NC_013889	TCG	2	6	2508576	2508581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209549
53004	NC_013889	CTT	2	6	2508620	2508625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209549
53005	NC_013889	CGT	3	9	2508640	2508648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209549
53006	NC_013889	GCA	2	6	2508748	2508753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209549
53007	NC_013889	GGA	2	6	2508782	2508787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209549
53008	NC_013889	GAT	2	6	2508791	2508796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209549
53009	NC_013889	GCC	2	6	2508815	2508820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209549
53010	NC_013889	TCT	2	6	2508853	2508858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209549
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53020	NC_013889	GCA	2	6	2509270	2509275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209549
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53025	NC_013889	GCA	2	6	2509652	2509657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209550
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53110	NC_013889	TGA	2	6	2513869	2513874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209552
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53112	NC_013889	GGCC	2	8	2513939	2513946	0 %	0 %	50 %	50 %	289209552
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53114	NC_013889	CAT	2	6	2514218	2514223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209552
53115	NC_013889	ATC	2	6	2514243	2514248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209552
53116	NC_013889	GCC	2	6	2514262	2514267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209552
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53230	NC_013889	GGC	2	6	2520198	2520203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209556
53231	NC_013889	ACG	2	6	2520229	2520234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209556
53232	NC_013889	TCG	2	6	2520311	2520316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209556
53233	NC_013889	ACA	2	6	2520378	2520383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289209556
53234	NC_013889	TCG	2	6	2520389	2520394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209556
53235	NC_013889	CGG	2	6	2520427	2520432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209556
53236	NC_013889	GCC	2	6	2520455	2520460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209556
53237	NC_013889	TCC	2	6	2520473	2520478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209556
53238	NC_013889	CCT	2	6	2520522	2520527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209556
53239	NC_013889	TTC	2	6	2520550	2520555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209556
53240	NC_013889	GGA	2	6	2520691	2520696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209556
53241	NC_013889	TCGA	2	8	2520710	2520717	25 %	25 %	25 %	25 %	289209556
53242	NC_013889	GCC	2	6	2520767	2520772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209556
53243	NC_013889	CCG	2	6	2520842	2520847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209556
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53245	NC_013889	CGC	2	6	2520950	2520955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209556
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53250	NC_013889	TCG	2	6	2521103	2521108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209556
53251	NC_013889	GCCCG	2	10	2521113	2521122	0 %	0 %	40 %	60 %	289209556
53252	NC_013889	GTC	2	6	2521297	2521302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209556
53253	NC_013889	GCG	2	6	2521310	2521315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209556
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53255	NC_013889	TCG	2	6	2521355	2521360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209556
53256	NC_013889	CG	4	8	2521396	2521403	0 %	0 %	50 %	50 %	289209556
53257	NC_013889	TCG	2	6	2521493	2521498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209556
53258	NC_013889	GGC	2	6	2521566	2521571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209556
53259	NC_013889	G	6	6	2521658	2521663	0 %	0 %	100 %	0 %	289209556
53260	NC_013889	CTG	2	6	2521678	2521683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209556
53261	NC_013889	GGC	2	6	2521698	2521703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209556
53262	NC_013889	GCC	2	6	2521706	2521711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209556
53263	NC_013889	ATCAC	2	10	2521715	2521724	40 %	20 %	0 %	40 %	289209556
53264	NC_013889	GC	3	6	2521784	2521789	0 %	0 %	50 %	50 %	289209556
53265	NC_013889	CAC	2	6	2521809	2521814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209556
53266	NC_013889	CGT	2	6	2521830	2521835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209556
53267	NC_013889	CCA	2	6	2521836	2521841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209556
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53284	NC_013889	CTG	2	6	2522518	2522523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209557
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53293	NC_013889	CGAC	2	8	2523051	2523058	25 %	0 %	25 %	50 %	289209557
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53299	NC_013889	CAG	3	9	2523421	2523429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209557
53300	NC_013889	ACC	2	6	2523436	2523441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209557
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53302	NC_013889	GAG	2	6	2523551	2523556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209557
53303	NC_013889	CGA	2	6	2523583	2523588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209557
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53314	NC_013889	C	7	7	2524311	2524317	0 %	0 %	0 %	100 %	289209557
53315	NC_013889	GCGGTC	2	12	2524396	2524407	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289209558
53316	NC_013889	CAGC	2	8	2524427	2524434	25 %	0 %	25 %	50 %	289209558
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53327	NC_013889	TCGG	2	8	2525292	2525299	0 %	25 %	50 %	25 %	289209559
53328	NC_013889	TCA	2	6	2525304	2525309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209559
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53330	NC_013889	ATG	2	6	2525504	2525509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209560
53331	NC_013889	TGT	2	6	2525532	2525537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289209560
53332	NC_013889	GC	3	6	2525547	2525552	0 %	0 %	50 %	50 %	289209560
53333	NC_013889	CAT	2	6	2525578	2525583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209560
53334	NC_013889	GCA	2	6	2525679	2525684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209560
53335	NC_013889	ACC	2	6	2526041	2526046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209561
53336	NC_013889	TGC	2	6	2526054	2526059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209561
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53339	NC_013889	GC	3	6	2526127	2526132	0 %	0 %	50 %	50 %	289209561
53340	NC_013889	GCC	2	6	2526144	2526149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209561
53341	NC_013889	ACT	2	6	2526177	2526182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209561
53342	NC_013889	AAG	2	6	2526201	2526206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289209561
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53346	NC_013889	CG	4	8	2526413	2526420	0 %	0 %	50 %	50 %	289209561
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53462	NC_013889	TCG	2	6	2531270	2531275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209568
53463	NC_013889	CTG	2	6	2531487	2531492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209569
53464	NC_013889	CCG	2	6	2531539	2531544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209569
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53466	NC_013889	GCT	2	6	2531588	2531593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209569
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53473	NC_013889	CTG	2	6	2531733	2531738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209569
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53480	NC_013889	CG	3	6	2531981	2531986	0 %	0 %	50 %	50 %	289209569
53481	NC_013889	ATC	2	6	2532129	2532134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209569
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53483	NC_013889	TAC	2	6	2532192	2532197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209569
53484	NC_013889	CCTG	2	8	2532244	2532251	0 %	25 %	25 %	50 %	289209569
53485	NC_013889	GCA	2	6	2532329	2532334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209569
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53489	NC_013889	CG	3	6	2532580	2532585	0 %	0 %	50 %	50 %	289209570
53490	NC_013889	GAG	2	6	2532602	2532607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209570
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53492	NC_013889	CGT	2	6	2532664	2532669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209570
53493	NC_013889	GC	3	6	2532725	2532730	0 %	0 %	50 %	50 %	289209570
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