MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 57881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013889	GTGA	2	8	169	176	25 %	25 %	50 %	0 %	289207188
2	NC_013889	GCA	2	6	177	182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
3	NC_013889	GAG	2	6	214	219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207188
4	NC_013889	CTG	2	6	238	243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207188
5	NC_013889	CCG	2	6	383	388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207188
6	NC_013889	GC	3	6	428	433	0 %	0 %	50 %	50 %	289207188
7	NC_013889	GCG	2	6	438	443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207188
8	NC_013889	AGC	2	6	444	449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
9	NC_013889	TCG	2	6	503	508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207188
10	NC_013889	GCGG	2	8	531	538	0 %	0 %	75 %	25 %	289207188
11	NC_013889	GGC	2	6	595	600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207188
12	NC_013889	ATC	2	6	673	678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207188
13	NC_013889	TCG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207188
14	NC_013889	GCA	2	6	723	728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
15	NC_013889	CGA	2	6	738	743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
16	NC_013889	AGC	2	6	749	754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
17	NC_013889	CCT	2	6	774	779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207188
18	NC_013889	CGA	2	6	783	788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
19	NC_013889	CAA	2	6	804	809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207188
20	NC_013889	GAA	2	6	823	828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207188
21	NC_013889	CAG	3	9	862	870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
22	NC_013889	ATC	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207188
23	NC_013889	AGG	2	6	899	904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207188
24	NC_013889	GAG	2	6	916	921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207188
25	NC_013889	CCATCG	2	12	953	964	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289207188
26	NC_013889	CG	3	6	983	988	0 %	0 %	50 %	50 %	289207188
27	NC_013889	CCGA	2	8	1033	1040	25 %	0 %	25 %	50 %	289207188
28	NC_013889	AGA	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207188
29	NC_013889	GATGGC	2	12	1305	1316	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289207188
30	NC_013889	GCA	2	6	1335	1340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
31	NC_013889	CGG	2	6	1368	1373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207188
32	NC_013889	CTG	2	6	1462	1467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207188
33	NC_013889	AGC	2	6	1477	1482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
34	NC_013889	CT	3	6	1744	1749	0 %	50 %	0 %	50 %	289207189
35	NC_013889	TGAC	2	8	1766	1773	25 %	25 %	25 %	25 %	289207189
36	NC_013889	GGC	2	6	1794	1799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207189
37	NC_013889	GGC	2	6	1858	1863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207189
38	NC_013889	ACC	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207189
39	NC_013889	CTGGC	2	10	1891	1900	0 %	20 %	40 %	40 %	289207189
40	NC_013889	GCG	2	6	1909	1914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207189
41	NC_013889	GCT	2	6	1959	1964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207189
42	NC_013889	CAA	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207189
43	NC_013889	CGA	2	6	2159	2164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207189
44	NC_013889	GCA	2	6	2178	2183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207189
45	NC_013889	TGG	2	6	2216	2221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207189
46	NC_013889	GGCCGA	2	12	2274	2285	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289207189
47	NC_013889	CGG	2	6	2486	2491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207189
48	NC_013889	GC	3	6	2542	2547	0 %	0 %	50 %	50 %	289207189
49	NC_013889	TCG	2	6	2555	2560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207189
50	NC_013889	TGA	2	6	2598	2603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207189
51	NC_013889	TGA	2	6	2615	2620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207189
52	NC_013889	GTCG	2	8	2652	2659	0 %	25 %	50 %	25 %	289207189
53	NC_013889	GCC	2	6	2676	2681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207189
54	NC_013889	CGGGA	2	10	2761	2770	20 %	0 %	60 %	20 %	289207189
55	NC_013889	CTC	2	6	2772	2777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207189
56	NC_013889	GCC	2	6	2796	2801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207189
57	NC_013889	CGT	2	6	2817	2822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207189
58	NC_013889	TGG	2	6	2880	2885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207190
59	NC_013889	TC	3	6	2900	2905	0 %	50 %	0 %	50 %	289207190
60	NC_013889	TGG	2	6	2944	2949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207190
61	NC_013889	CGC	2	6	3033	3038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207190
62	NC_013889	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	289207190
63	NC_013889	CGG	2	6	3252	3257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207190
64	NC_013889	CAA	2	6	3312	3317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207190
65	NC_013889	AAC	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207190
66	NC_013889	CGC	2	6	3344	3349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207190
67	NC_013889	TCG	2	6	3365	3370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207190
68	NC_013889	CAGGC	2	10	3423	3432	20 %	0 %	40 %	40 %	289207190
69	NC_013889	ATCG	2	8	3441	3448	25 %	25 %	25 %	25 %	289207190
70	NC_013889	CGCA	2	8	3566	3573	25 %	0 %	25 %	50 %	289207190
71	NC_013889	GAA	2	6	3588	3593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207190
72	NC_013889	AGCG	2	8	3619	3626	25 %	0 %	50 %	25 %	289207190
73	NC_013889	GGTCG	2	10	3648	3657	0 %	20 %	60 %	20 %	289207190
74	NC_013889	CGG	2	6	3658	3663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207190
75	NC_013889	CGG	2	6	3707	3712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207190
76	NC_013889	GGT	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207190
77	NC_013889	GAT	2	6	3765	3770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207190
78	NC_013889	CAC	2	6	3848	3853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207190
79	NC_013889	TGGTG	2	10	3917	3926	0 %	40 %	60 %	0 %	289207190
80	NC_013889	TTC	2	6	4043	4048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207191
81	NC_013889	CCA	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207191
82	NC_013889	GTC	2	6	4152	4157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
83	NC_013889	GAA	2	6	4278	4283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207191
84	NC_013889	CGG	2	6	4325	4330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207191
85	NC_013889	AAC	2	6	4341	4346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207191
86	NC_013889	CGG	2	6	4361	4366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207191
87	NC_013889	GTCG	2	8	4385	4392	0 %	25 %	50 %	25 %	289207191
88	NC_013889	AGA	3	9	4714	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207191
89	NC_013889	GAT	2	6	4767	4772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207191
90	NC_013889	CGT	2	6	4775	4780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
91	NC_013889	TCT	2	6	4822	4827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207191
92	NC_013889	CAA	2	6	4835	4840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207191
93	NC_013889	GGC	2	6	4857	4862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207191
94	NC_013889	CG	3	6	4881	4886	0 %	0 %	50 %	50 %	289207191
95	NC_013889	AAG	2	6	4935	4940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207191
96	NC_013889	CCG	2	6	4954	4959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207191
97	NC_013889	CGA	2	6	4961	4966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207191
98	NC_013889	TCC	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207191
99	NC_013889	TCG	2	6	5068	5073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
100	NC_013889	CTG	2	6	5106	5111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
101	NC_013889	CCCG	2	8	5117	5124	0 %	0 %	25 %	75 %	289207191
102	NC_013889	GGC	2	6	5156	5161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207191
103	NC_013889	CG	3	6	5177	5182	0 %	0 %	50 %	50 %	289207191
104	NC_013889	GC	3	6	5187	5192	0 %	0 %	50 %	50 %	289207191
105	NC_013889	CGC	2	6	5202	5207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207191
106	NC_013889	TGG	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207191
107	NC_013889	GGGAC	2	10	5327	5336	20 %	0 %	60 %	20 %	289207191
108	NC_013889	CCG	2	6	5416	5421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207191
109	NC_013889	ACC	2	6	5494	5499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207191
110	NC_013889	CAT	4	12	5501	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207191
111	NC_013889	CA	3	6	5536	5541	50 %	0 %	0 %	50 %	289207191
112	NC_013889	CTG	3	9	5550	5558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
113	NC_013889	CTT	3	9	5561	5569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207191
114	NC_013889	GCTT	2	8	5699	5706	0 %	50 %	25 %	25 %	289207191
115	NC_013889	CGCCC	2	10	5738	5747	0 %	0 %	20 %	80 %	289207191
116	NC_013889	GCC	2	6	5793	5798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207191
117	NC_013889	CGGCG	2	10	6029	6038	0 %	0 %	60 %	40 %	289207191
118	NC_013889	CGA	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207191
119	NC_013889	CTCGC	2	10	6066	6075	0 %	20 %	20 %	60 %	289207191
120	NC_013889	CCGC	2	8	6103	6110	0 %	0 %	25 %	75 %	289207191
121	NC_013889	CTG	2	6	6120	6125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
122	NC_013889	GCT	2	6	6197	6202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
123	NC_013889	AGG	2	6	6205	6210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207191
124	NC_013889	GCC	2	6	6211	6216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207191
125	NC_013889	AGC	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207191
126	NC_013889	ACG	2	6	6279	6284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207191
127	NC_013889	CTG	2	6	6306	6311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
128	NC_013889	CAC	2	6	6353	6358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207191
129	NC_013889	TCTGAC	2	12	6485	6496	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289207192
130	NC_013889	TCG	2	6	6677	6682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207192
131	NC_013889	CAA	2	6	6750	6755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207192
132	NC_013889	GATATT	2	12	6756	6767	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289207192
133	NC_013889	A	6	6	6768	6773	100 %	0 %	0 %	0 %	289207192
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135	NC_013889	CGC	2	6	6848	6853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207192
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137	NC_013889	CTG	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207193
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252	NC_013889	TGTCG	2	10	12452	12461	0 %	40 %	40 %	20 %	289207197
253	NC_013889	CGA	2	6	12481	12486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207197
254	NC_013889	GCG	2	6	12570	12575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207197
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256	NC_013889	GAG	2	6	12677	12682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207197
257	NC_013889	CGA	2	6	12736	12741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207197
258	NC_013889	TGG	3	9	12769	12777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207197
259	NC_013889	CCGC	2	8	12835	12842	0 %	0 %	25 %	75 %	289207197
260	NC_013889	ACC	2	6	12843	12848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207197
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262	NC_013889	CGG	2	6	12960	12965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207197
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391	NC_013889	GACC	2	8	19207	19214	25 %	0 %	25 %	50 %	289207204
392	NC_013889	CTGG	2	8	19228	19235	0 %	25 %	50 %	25 %	289207204
393	NC_013889	GT	3	6	19308	19313	0 %	50 %	50 %	0 %	289207204
394	NC_013889	GACG	2	8	19331	19338	25 %	0 %	50 %	25 %	289207204
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396	NC_013889	CG	3	6	19439	19444	0 %	0 %	50 %	50 %	289207204
397	NC_013889	TGC	2	6	19446	19451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207204
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400	NC_013889	CG	3	6	19514	19519	0 %	0 %	50 %	50 %	289207204
401	NC_013889	TGC	2	6	19581	19586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207204
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