MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013642	TTC	2	6	172174	172179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411616
3502	NC_013642	CGAA	2	8	172191	172198	50 %	0 %	25 %	25 %	281411616
3503	NC_013642	CTC	2	6	172221	172226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411617
3504	NC_013642	TC	3	6	172244	172249	0 %	50 %	0 %	50 %	281411617
3505	NC_013642	TCTCT	2	10	172465	172474	0 %	60 %	0 %	40 %	281411617
3506	NC_013642	GGC	2	6	172514	172519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411617
3507	NC_013642	GAT	2	6	172559	172564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411617
3508	NC_013642	TTC	2	6	172595	172600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411617
3509	NC_013642	TCGCA	2	10	172648	172657	20 %	20 %	20 %	40 %	281411617
3510	NC_013642	GAT	2	6	172693	172698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411617
3511	NC_013642	AAG	2	6	172969	172974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411618
3512	NC_013642	CT	3	6	172975	172980	0 %	50 %	0 %	50 %	281411618
3513	NC_013642	CT	3	6	172999	173004	0 %	50 %	0 %	50 %	281411618
3514	NC_013642	CCACA	2	10	173015	173024	40 %	0 %	0 %	60 %	281411618
3515	NC_013642	AGA	2	6	173054	173059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411618
3516	NC_013642	CGG	2	6	173070	173075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411618
3517	NC_013642	T	6	6	173195	173200	0 %	100 %	0 %	0 %	281411618
3518	NC_013642	TTC	2	6	173203	173208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411618
3519	NC_013642	AAC	2	6	173218	173223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411618
3520	NC_013642	GTT	2	6	173235	173240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411618
3521	NC_013642	GGC	2	6	173266	173271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411618
3522	NC_013642	GAT	2	6	173275	173280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411618
3523	NC_013642	GAT	2	6	173344	173349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411618
3524	NC_013642	TGG	2	6	173441	173446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411619
3525	NC_013642	GAA	2	6	173503	173508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411619
3526	NC_013642	CTG	2	6	173558	173563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411619
3527	NC_013642	GAG	2	6	173585	173590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411619
3528	NC_013642	TTC	2	6	173621	173626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411619
3529	NC_013642	ATCT	2	8	173685	173692	25 %	50 %	0 %	25 %	281411619
3530	NC_013642	GA	3	6	173698	173703	50 %	0 %	50 %	0 %	281411619
3531	NC_013642	CTC	2	6	173732	173737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411619
3532	NC_013642	CCG	2	6	173763	173768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411619
3533	NC_013642	TCG	2	6	173805	173810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411619
3534	NC_013642	AAG	2	6	173824	173829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411619
3535	NC_013642	ACG	2	6	173868	173873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411619
3536	NC_013642	A	6	6	173957	173962	100 %	0 %	0 %	0 %	281411619
3537	NC_013642	GCA	2	6	173967	173972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411619
3538	NC_013642	AAAG	2	8	174001	174008	75 %	0 %	25 %	0 %	281411619
3539	NC_013642	TGC	2	6	174011	174016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411619
3540	NC_013642	CTT	2	6	174212	174217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411620
3541	NC_013642	CTT	2	6	174304	174309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411620
3542	NC_013642	TC	3	6	174327	174332	0 %	50 %	0 %	50 %	281411620
3543	NC_013642	GGAGA	2	10	174354	174363	40 %	0 %	60 %	0 %	281411620
3544	NC_013642	GAT	2	6	174365	174370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411620
3545	NC_013642	TTC	2	6	174395	174400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411620
3546	NC_013642	GAGC	2	8	174454	174461	25 %	0 %	50 %	25 %	281411620
3547	NC_013642	CGTT	2	8	174505	174512	0 %	50 %	25 %	25 %	281411620
3548	NC_013642	GAC	2	6	174530	174535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411620
3549	NC_013642	TCC	2	6	174570	174575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411620
3550	NC_013642	GCG	2	6	174597	174602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411620
3551	NC_013642	GGA	2	6	174677	174682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411620
3552	NC_013642	T	6	6	174691	174696	0 %	100 %	0 %	0 %	281411620
3553	NC_013642	CCTTT	2	10	174711	174720	0 %	60 %	0 %	40 %	281411620
3554	NC_013642	CTT	2	6	174736	174741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411620
3555	NC_013642	GGA	2	6	174766	174771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411620
3556	NC_013642	GAA	2	6	174818	174823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411620
3557	NC_013642	ACC	2	6	174848	174853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411620
3558	NC_013642	TAT	2	6	174857	174862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411620
3559	NC_013642	TCA	2	6	174900	174905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411620
3560	NC_013642	A	6	6	174937	174942	100 %	0 %	0 %	0 %	281411620
3561	NC_013642	TC	3	6	174991	174996	0 %	50 %	0 %	50 %	281411620
3562	NC_013642	GAC	2	6	175007	175012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411620
3563	NC_013642	ACG	2	6	175032	175037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411620
3564	NC_013642	CAT	2	6	175100	175105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411620
3565	NC_013642	CGT	2	6	175141	175146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411620
3566	NC_013642	TTTCA	2	10	175190	175199	20 %	60 %	0 %	20 %	281411620
3567	NC_013642	ATGAG	2	10	175203	175212	40 %	20 %	40 %	0 %	281411620
3568	NC_013642	CTT	2	6	175295	175300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411620
3569	NC_013642	TCC	3	9	175343	175351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411620
3570	NC_013642	ACC	2	6	175478	175483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411621
3571	NC_013642	TCT	3	9	175521	175529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411621
3572	NC_013642	GAT	2	6	175700	175705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411621
3573	NC_013642	GCT	2	6	175714	175719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411621
3574	NC_013642	TTTC	2	8	175738	175745	0 %	75 %	0 %	25 %	281411621
3575	NC_013642	TTA	2	6	175903	175908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411622
3576	NC_013642	TCT	2	6	175971	175976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411622
3577	NC_013642	CTT	2	6	176071	176076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411622
3578	NC_013642	TC	3	6	176087	176092	0 %	50 %	0 %	50 %	281411622
3579	NC_013642	TTTG	2	8	176156	176163	0 %	75 %	25 %	0 %	281411622
3580	NC_013642	CAG	2	6	176218	176223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411622
3581	NC_013642	CA	3	6	176276	176281	50 %	0 %	0 %	50 %	281411622
3582	NC_013642	CTCC	2	8	176455	176462	0 %	25 %	0 %	75 %	281411622
3583	NC_013642	TTCCG	2	10	176468	176477	0 %	40 %	20 %	40 %	281411622
3584	NC_013642	TTC	2	6	176494	176499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411622
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3586	NC_013642	T	6	6	176621	176626	0 %	100 %	0 %	0 %	281411622
3587	NC_013642	ACC	2	6	176657	176662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411622
3588	NC_013642	GAT	2	6	176666	176671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411622
3589	NC_013642	CTT	2	6	176725	176730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411622
3590	NC_013642	GT	3	6	176776	176781	0 %	50 %	50 %	0 %	281411622
3591	NC_013642	GAT	2	6	176801	176806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411622
3592	NC_013642	T	7	7	176850	176856	0 %	100 %	0 %	0 %	281411622
3593	NC_013642	AGA	2	6	176889	176894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411622
3594	NC_013642	TTTC	2	8	176992	176999	0 %	75 %	0 %	25 %	281411622
3595	NC_013642	TCT	2	6	177004	177009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411622
3596	NC_013642	T	7	7	177022	177028	0 %	100 %	0 %	0 %	281411622
3597	NC_013642	CGC	2	6	177056	177061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411622
3598	NC_013642	ACA	4	12	177087	177098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411622
3599	NC_013642	CTT	2	6	177244	177249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411623
3600	NC_013642	TC	3	6	177259	177264	0 %	50 %	0 %	50 %	281411623
3601	NC_013642	ATTG	2	8	177265	177272	25 %	50 %	25 %	0 %	281411623
3602	NC_013642	TTTC	2	8	177283	177290	0 %	75 %	0 %	25 %	281411623
3603	NC_013642	CTT	2	6	177308	177313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411623
3604	NC_013642	TTTTC	2	10	177332	177341	0 %	80 %	0 %	20 %	281411623
3605	NC_013642	TCA	2	6	177353	177358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411623
3606	NC_013642	TGT	2	6	177391	177396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411623
3607	NC_013642	CTG	2	6	177460	177465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411623
3608	NC_013642	TGC	2	6	177585	177590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411623
3609	NC_013642	AGCGAT	2	12	177633	177644	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	281411623
3610	NC_013642	CACC	2	8	177674	177681	25 %	0 %	0 %	75 %	281411623
3611	NC_013642	T	7	7	177777	177783	0 %	100 %	0 %	0 %	281411623
3612	NC_013642	AGA	2	6	177931	177936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411623
3613	NC_013642	CT	3	6	177939	177944	0 %	50 %	0 %	50 %	281411623
3614	NC_013642	TCT	2	6	177979	177984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411623
3615	NC_013642	T	6	6	177984	177989	0 %	100 %	0 %	0 %	281411623
3616	NC_013642	TCA	2	6	177994	177999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411623
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3618	NC_013642	GT	3	6	178051	178056	0 %	50 %	50 %	0 %	281411623
3619	NC_013642	CGA	2	6	178073	178078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411623
3620	NC_013642	CTT	2	6	178087	178092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411623
3621	NC_013642	ACT	2	6	178102	178107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411623
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3623	NC_013642	GCA	2	6	178124	178129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411623
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3993	NC_013642	AGA	2	6	196618	196623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411643
3994	NC_013642	CTTT	2	8	196633	196640	0 %	75 %	0 %	25 %	281411643
3995	NC_013642	GAA	2	6	196728	196733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411643
3996	NC_013642	CGT	2	6	196740	196745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411643
3997	NC_013642	CTTC	2	8	196747	196754	0 %	50 %	0 %	50 %	281411643
3998	NC_013642	GAG	2	6	196780	196785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411643
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