MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_013642	TTC	2	6	1761962	1761967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413167
36003	NC_013642	TGA	2	6	1762000	1762005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413167
36004	NC_013642	AAG	2	6	1762043	1762048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413167
36005	NC_013642	T	6	6	1762100	1762105	0 %	100 %	0 %	0 %	281413167
36006	NC_013642	AGA	2	6	1762107	1762112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413167
36007	NC_013642	TTTC	2	8	1762128	1762135	0 %	75 %	0 %	25 %	281413167
36008	NC_013642	TGA	2	6	1762201	1762206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413167
36009	NC_013642	GAC	2	6	1762253	1762258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281413167
36010	NC_013642	TCA	2	6	1762264	1762269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281413167
36011	NC_013642	AACTCA	2	12	1762291	1762302	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	281413167
36012	NC_013642	CT	3	6	1762414	1762419	0 %	50 %	0 %	50 %	281413167
36013	NC_013642	TCG	2	6	1762506	1762511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413167
36014	NC_013642	GAT	2	6	1762577	1762582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413167
36015	NC_013642	TGC	2	6	1762616	1762621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413167
36016	NC_013642	GAA	2	6	1762634	1762639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413167
36017	NC_013642	CGA	2	6	1762702	1762707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281413167
36018	NC_013642	GATGA	2	10	1762740	1762749	40 %	20 %	40 %	0 %	281413167
36019	NC_013642	ATG	2	6	1762791	1762796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413167
36020	NC_013642	CTTC	2	8	1762893	1762900	0 %	50 %	0 %	50 %	281413167
36021	NC_013642	TG	4	8	1762934	1762941	0 %	50 %	50 %	0 %	281413167
36022	NC_013642	GAG	2	6	1762985	1762990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281413167
36023	NC_013642	CCA	2	6	1763011	1763016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281413167
36024	NC_013642	ATCAC	2	10	1763073	1763082	40 %	20 %	0 %	40 %	281413167
36025	NC_013642	CCTC	2	8	1763083	1763090	0 %	25 %	0 %	75 %	281413167
36026	NC_013642	A	6	6	1763091	1763096	100 %	0 %	0 %	0 %	281413167
36027	NC_013642	AAG	2	6	1763197	1763202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413167
36028	NC_013642	TCT	2	6	1763344	1763349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413167
36029	NC_013642	GGGA	2	8	1763355	1763362	25 %	0 %	75 %	0 %	281413167
36030	NC_013642	GTTT	2	8	1763368	1763375	0 %	75 %	25 %	0 %	281413167
36031	NC_013642	TCC	2	6	1763420	1763425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413167
36032	NC_013642	GGT	2	6	1763475	1763480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281413167
36033	NC_013642	TCA	2	6	1763508	1763513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281413167
36034	NC_013642	AGAC	2	8	1763523	1763530	50 %	0 %	25 %	25 %	281413167
36035	NC_013642	ATTCG	2	10	1763540	1763549	20 %	40 %	20 %	20 %	281413167
36036	NC_013642	TGG	2	6	1763608	1763613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281413167
36037	NC_013642	GTC	2	6	1763669	1763674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413167
36038	NC_013642	TTC	2	6	1763700	1763705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413167
36039	NC_013642	GTA	2	6	1763909	1763914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413167
36040	NC_013642	ACC	2	6	1764021	1764026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281413167
36041	NC_013642	AGA	2	6	1764044	1764049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413167
36042	NC_013642	TTCACC	2	12	1764096	1764107	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	281413167
36043	NC_013642	CTT	2	6	1764259	1764264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413167
36044	NC_013642	CTTC	2	8	1764336	1764343	0 %	50 %	0 %	50 %	281413167
36045	NC_013642	GTA	2	6	1764362	1764367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413167
36046	NC_013642	TTTCGA	2	12	1764463	1764474	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	281413167
36047	NC_013642	TTC	2	6	1764497	1764502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413167
36048	NC_013642	GTA	2	6	1764518	1764523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413167
36049	NC_013642	TCC	2	6	1764530	1764535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413167
36050	NC_013642	TCG	2	6	1764612	1764617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413167
36051	NC_013642	GTT	2	6	1764644	1764649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281413167
36052	NC_013642	AGA	2	6	1764718	1764723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413167
36053	NC_013642	CTGT	2	8	1764768	1764775	0 %	50 %	25 %	25 %	281413167
36054	NC_013642	TTCC	2	8	1765142	1765149	0 %	50 %	0 %	50 %	281413167
36055	NC_013642	CTC	2	6	1765151	1765156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413167
36056	NC_013642	GAG	2	6	1765158	1765163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281413167
36057	NC_013642	TCT	2	6	1765245	1765250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413167
36058	NC_013642	TCC	2	6	1765281	1765286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413167
36059	NC_013642	AG	3	6	1765304	1765309	50 %	0 %	50 %	0 %	281413167
36060	NC_013642	TCC	2	6	1765355	1765360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413167
36061	NC_013642	AGA	2	6	1765380	1765385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413167
36062	NC_013642	AATC	2	8	1765397	1765404	50 %	25 %	0 %	25 %	281413167
36063	NC_013642	GAGAG	2	10	1765653	1765662	40 %	0 %	60 %	0 %	281413168
36064	NC_013642	GT	3	6	1765663	1765668	0 %	50 %	50 %	0 %	281413168
36065	NC_013642	GAAA	2	8	1765755	1765762	75 %	0 %	25 %	0 %	281413168
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36067	NC_013642	GAA	2	6	1765810	1765815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413168
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36072	NC_013642	ATA	2	6	1767159	1767164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281413169
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36074	NC_013642	ATCA	2	8	1767280	1767287	50 %	25 %	0 %	25 %	281413170
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36083	NC_013642	AGAAA	2	10	1768246	1768255	80 %	0 %	20 %	0 %	281413172
36084	NC_013642	AGA	2	6	1768276	1768281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413172
36085	NC_013642	GTC	2	6	1768282	1768287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413172
36086	NC_013642	GA	3	6	1768416	1768421	50 %	0 %	50 %	0 %	281413172
36087	NC_013642	TGA	2	6	1768482	1768487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413172
36088	NC_013642	T	7	7	1771220	1771226	0 %	100 %	0 %	0 %	281413173
36089	NC_013642	TC	4	8	1771245	1771252	0 %	50 %	0 %	50 %	281413173
36090	NC_013642	TTG	2	6	1771408	1771413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281413173
36091	NC_013642	CGAAT	2	10	1771481	1771490	40 %	20 %	20 %	20 %	281413173
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36094	NC_013642	AG	3	6	1771861	1771866	50 %	0 %	50 %	0 %	281413173
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36097	NC_013642	TCCAG	2	10	1772047	1772056	20 %	20 %	20 %	40 %	281413173
36098	NC_013642	A	6	6	1772095	1772100	100 %	0 %	0 %	0 %	281413173
36099	NC_013642	TC	3	6	1772107	1772112	0 %	50 %	0 %	50 %	281413173
36100	NC_013642	GAAG	2	8	1772244	1772251	50 %	0 %	50 %	0 %	281413173
36101	NC_013642	TTGA	2	8	1772305	1772312	25 %	50 %	25 %	0 %	281413173
36102	NC_013642	TAT	2	6	1772374	1772379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281413173
36103	NC_013642	GA	3	6	1772408	1772413	50 %	0 %	50 %	0 %	281413173
36104	NC_013642	A	6	6	1772413	1772418	100 %	0 %	0 %	0 %	281413173
36105	NC_013642	CAGCG	2	10	1772419	1772428	20 %	0 %	40 %	40 %	281413173
36106	NC_013642	AAATGA	2	12	1772442	1772453	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	281413173
36107	NC_013642	AGGGAA	2	12	1772733	1772744	50 %	0 %	50 %	0 %	281413174
36108	NC_013642	AAG	2	6	1772756	1772761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413174
36109	NC_013642	CAA	2	6	1772774	1772779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281413174
36110	NC_013642	ATC	2	6	1772793	1772798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281413174
36111	NC_013642	TCT	2	6	1772828	1772833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413174
36112	NC_013642	TTC	2	6	1772859	1772864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413174
36113	NC_013642	AGT	2	6	1772880	1772885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413174
36114	NC_013642	TGA	2	6	1772893	1772898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413174
36115	NC_013642	T	7	7	1772970	1772976	0 %	100 %	0 %	0 %	281413174
36116	NC_013642	A	6	6	1772984	1772989	100 %	0 %	0 %	0 %	281413174
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36339	NC_013642	CCT	2	6	1783519	1783524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413183
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36345	NC_013642	TTC	2	6	1783757	1783762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413183
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36349	NC_013642	T	7	7	1783816	1783822	0 %	100 %	0 %	0 %	281413183
36350	NC_013642	A	7	7	1783962	1783968	100 %	0 %	0 %	0 %	281413183
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36352	NC_013642	TCA	2	6	1783978	1783983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281413183
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36472	NC_013642	ATC	2	6	1789743	1789748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281413190
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36474	NC_013642	AGT	2	6	1789850	1789855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413190
36475	NC_013642	GAA	2	6	1789888	1789893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413190
36476	NC_013642	GCA	2	6	1789896	1789901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281413190
36477	NC_013642	GCA	2	6	1789971	1789976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281413190
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36479	NC_013642	ATG	2	6	1790134	1790139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413190
36480	NC_013642	GTA	2	6	1790199	1790204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413190
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