MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35502	NC_013642	CGA	2	6	1728672	1728677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281413142
35503	NC_013642	AG	3	6	1728683	1728688	50 %	0 %	50 %	0 %	281413142
35504	NC_013642	TCT	2	6	1728709	1728714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413142
35505	NC_013642	CT	3	6	1728928	1728933	0 %	50 %	0 %	50 %	281413142
35506	NC_013642	TCT	2	6	1728966	1728971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413142
35507	NC_013642	TTC	2	6	1729036	1729041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413142
35508	NC_013642	AGA	2	6	1729042	1729047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413142
35509	NC_013642	ATC	2	6	1729117	1729122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281413142
35510	NC_013642	GGA	2	6	1729126	1729131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281413142
35511	NC_013642	GAGC	2	8	1729139	1729146	25 %	0 %	50 %	25 %	281413142
35512	NC_013642	TTC	2	6	1729210	1729215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413142
35513	NC_013642	TCT	2	6	1729245	1729250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413142
35514	NC_013642	TCG	2	6	1729271	1729276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413142
35515	NC_013642	CTT	2	6	1729277	1729282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413142
35516	NC_013642	AGGA	2	8	1729350	1729357	50 %	0 %	50 %	0 %	281413142
35517	NC_013642	GAG	2	6	1729415	1729420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281413142
35518	NC_013642	TC	3	6	1729441	1729446	0 %	50 %	0 %	50 %	281413142
35519	NC_013642	TGC	2	6	1729493	1729498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413142
35520	NC_013642	T	6	6	1729511	1729516	0 %	100 %	0 %	0 %	281413142
35521	NC_013642	ATG	2	6	1729552	1729557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413142
35522	NC_013642	TCT	2	6	1729576	1729581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413142
35523	NC_013642	CTTT	2	8	1729660	1729667	0 %	75 %	0 %	25 %	281413143
35524	NC_013642	GAA	2	6	1729677	1729682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413143
35525	NC_013642	TCTT	2	8	1729713	1729720	0 %	75 %	0 %	25 %	281413143
35526	NC_013642	GAAA	2	8	1729784	1729791	75 %	0 %	25 %	0 %	281413143
35527	NC_013642	CTTT	2	8	1729839	1729846	0 %	75 %	0 %	25 %	281413143
35528	NC_013642	CTC	2	6	1729875	1729880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413143
35529	NC_013642	CTT	2	6	1729924	1729929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413143
35530	NC_013642	TCT	2	6	1729959	1729964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413143
35531	NC_013642	ACT	2	6	1729967	1729972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281413143
35532	NC_013642	CAT	2	6	1730037	1730042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281413143
35533	NC_013642	CTT	2	6	1730052	1730057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413143
35534	NC_013642	TC	3	6	1730070	1730075	0 %	50 %	0 %	50 %	281413143
35535	NC_013642	CTG	2	6	1730126	1730131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413143
35536	NC_013642	ATG	3	9	1730146	1730154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413143
35537	NC_013642	TTC	2	6	1730167	1730172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413143
35538	NC_013642	TTCT	2	8	1730252	1730259	0 %	75 %	0 %	25 %	281413143
35539	NC_013642	CAC	2	6	1730316	1730321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281413143
35540	NC_013642	GTT	2	6	1730365	1730370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281413143
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35542	NC_013642	GGGAT	2	10	1730407	1730416	20 %	20 %	60 %	0 %	281413143
35543	NC_013642	TGA	2	6	1730500	1730505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413144
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35545	NC_013642	TTG	2	6	1730587	1730592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281413144
35546	NC_013642	ATT	2	6	1730593	1730598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281413144
35547	NC_013642	A	7	7	1730607	1730613	100 %	0 %	0 %	0 %	281413144
35548	NC_013642	ATGT	2	8	1730697	1730704	25 %	50 %	25 %	0 %	281413144
35549	NC_013642	GGA	2	6	1730723	1730728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281413144
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35552	NC_013642	A	7	7	1730873	1730879	100 %	0 %	0 %	0 %	281413144
35553	NC_013642	AAATAG	2	12	1730921	1730932	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	281413144
35554	NC_013642	TC	4	8	1731080	1731087	0 %	50 %	0 %	50 %	281413145
35555	NC_013642	TG	3	6	1731113	1731118	0 %	50 %	50 %	0 %	281413145
35556	NC_013642	GAA	2	6	1731178	1731183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413145
35557	NC_013642	TCT	2	6	1731235	1731240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413145
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35560	NC_013642	GAG	2	6	1733057	1733062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281413146
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35586	NC_013642	CGAT	2	8	1734166	1734173	25 %	25 %	25 %	25 %	281413146
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35588	NC_013642	TATC	2	8	1734203	1734210	25 %	50 %	0 %	25 %	281413146
35589	NC_013642	A	6	6	1734215	1734220	100 %	0 %	0 %	0 %	281413146
35590	NC_013642	GT	3	6	1734473	1734478	0 %	50 %	50 %	0 %	281413147
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35595	NC_013642	CT	3	6	1734553	1734558	0 %	50 %	0 %	50 %	281413147
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35599	NC_013642	CGTT	2	8	1734727	1734734	0 %	50 %	25 %	25 %	281413147
35600	NC_013642	TC	3	6	1734746	1734751	0 %	50 %	0 %	50 %	281413147
35601	NC_013642	AGA	2	6	1734785	1734790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413147
35602	NC_013642	CTT	2	6	1734817	1734822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413147
35603	NC_013642	CTTT	2	8	1734865	1734872	0 %	75 %	0 %	25 %	281413147
35604	NC_013642	TGAT	2	8	1734880	1734887	25 %	50 %	25 %	0 %	281413147
35605	NC_013642	TTCT	2	8	1734918	1734925	0 %	75 %	0 %	25 %	281413147
35606	NC_013642	CTT	2	6	1734940	1734945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413147
35607	NC_013642	TC	3	6	1734999	1735004	0 %	50 %	0 %	50 %	281413147
35608	NC_013642	TCC	2	6	1735179	1735184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413147
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35612	NC_013642	ATC	2	6	1735485	1735490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281413147
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35615	NC_013642	CT	4	8	1735678	1735685	0 %	50 %	0 %	50 %	281413147
35616	NC_013642	AGCT	2	8	1735724	1735731	25 %	25 %	25 %	25 %	281413147
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35997	NC_013642	GAA	2	6	1761611	1761616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413167
35998	NC_013642	TC	3	6	1761625	1761630	0 %	50 %	0 %	50 %	281413167
35999	NC_013642	TCT	2	6	1761688	1761693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413167
36000	NC_013642	T	7	7	1761805	1761811	0 %	100 %	0 %	0 %	281413167

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