MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_013642	CTG	3	9	1707700	1707708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413117
35002	NC_013642	ACC	2	6	1707741	1707746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281413117
35003	NC_013642	ATCG	2	8	1707804	1707811	25 %	25 %	25 %	25 %	281413117
35004	NC_013642	ACCA	2	8	1707855	1707862	50 %	0 %	0 %	50 %	281413117
35005	NC_013642	CTT	2	6	1707869	1707874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413117
35006	NC_013642	CGA	2	6	1707932	1707937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281413117
35007	NC_013642	ATCCT	2	10	1707947	1707956	20 %	40 %	0 %	40 %	281413117
35008	NC_013642	GTC	2	6	1707957	1707962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413117
35009	NC_013642	TCT	2	6	1708040	1708045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413117
35010	NC_013642	TCC	2	6	1708051	1708056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413117
35011	NC_013642	TCT	2	6	1708123	1708128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413117
35012	NC_013642	GTT	2	6	1708129	1708134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281413117
35013	NC_013642	CAA	2	6	1708148	1708153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281413117
35014	NC_013642	AAG	2	6	1708191	1708196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413117
35015	NC_013642	GA	3	6	1708205	1708210	50 %	0 %	50 %	0 %	281413117
35016	NC_013642	CAC	2	6	1708211	1708216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281413117
35017	NC_013642	AAC	3	9	1708260	1708268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281413117
35018	NC_013642	CTT	2	6	1708302	1708307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413117
35019	NC_013642	TTC	2	6	1708380	1708385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413117
35020	NC_013642	GAT	2	6	1708389	1708394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413117
35021	NC_013642	TCT	2	6	1708395	1708400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413117
35022	NC_013642	CTT	2	6	1708406	1708411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413117
35023	NC_013642	ACC	2	6	1708467	1708472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281413118
35024	NC_013642	TCCT	2	8	1708484	1708491	0 %	50 %	0 %	50 %	281413118
35025	NC_013642	TTC	2	6	1708512	1708517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413118
35026	NC_013642	TGGAG	2	10	1708574	1708583	20 %	20 %	60 %	0 %	281413118
35027	NC_013642	CTG	2	6	1708591	1708596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413118
35028	NC_013642	TTC	2	6	1708648	1708653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413118
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35031	NC_013642	TTTCC	2	10	1708781	1708790	0 %	60 %	0 %	40 %	281413118
35032	NC_013642	GCCG	2	8	1708808	1708815	0 %	0 %	50 %	50 %	281413118
35033	NC_013642	TGG	2	6	1708816	1708821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281413118
35034	NC_013642	ACG	2	6	1708827	1708832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281413118
35035	NC_013642	CCA	2	6	1708858	1708863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281413118
35036	NC_013642	CAGAA	2	10	1708958	1708967	60 %	0 %	20 %	20 %	281413118
35037	NC_013642	GTC	2	6	1708979	1708984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413118
35038	NC_013642	TCAC	2	8	1709025	1709032	25 %	25 %	0 %	50 %	281413118
35039	NC_013642	AGA	2	6	1709081	1709086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413118
35040	NC_013642	ACC	2	6	1709196	1709201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281413118
35041	NC_013642	CTC	2	6	1709227	1709232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413118
35042	NC_013642	T	6	6	1709318	1709323	0 %	100 %	0 %	0 %	281413118
35043	NC_013642	GAA	2	6	1709325	1709330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413118
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35046	NC_013642	CAT	2	6	1709453	1709458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281413118
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35048	NC_013642	TCC	2	6	1709529	1709534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413119
35049	NC_013642	GA	3	6	1709594	1709599	50 %	0 %	50 %	0 %	281413119
35050	NC_013642	TCC	2	6	1709654	1709659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413119
35051	NC_013642	CTT	2	6	1709665	1709670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413119
35052	NC_013642	TTC	2	6	1709691	1709696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413119
35053	NC_013642	AACGT	2	10	1709805	1709814	40 %	20 %	20 %	20 %	281413119
35054	NC_013642	GCTC	2	8	1709966	1709973	0 %	25 %	25 %	50 %	281413119
35055	NC_013642	TGT	2	6	1709974	1709979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281413119
35056	NC_013642	ACC	2	6	1709994	1709999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281413119
35057	NC_013642	CA	3	6	1710064	1710069	50 %	0 %	0 %	50 %	281413119
35058	NC_013642	CGA	2	6	1710079	1710084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281413119
35059	NC_013642	CTTT	2	8	1710106	1710113	0 %	75 %	0 %	25 %	281413119
35060	NC_013642	GAGC	2	8	1710139	1710146	25 %	0 %	50 %	25 %	281413119
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35062	NC_013642	TCCAC	2	10	1710219	1710228	20 %	20 %	0 %	60 %	281413119
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35068	NC_013642	TTCA	2	8	1710483	1710490	25 %	50 %	0 %	25 %	281413120
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35087	NC_013642	GA	3	6	1711330	1711335	50 %	0 %	50 %	0 %	281413121
35088	NC_013642	AG	3	6	1711341	1711346	50 %	0 %	50 %	0 %	281413121
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35090	NC_013642	GGA	2	6	1711413	1711418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281413121
35091	NC_013642	TG	3	6	1711449	1711454	0 %	50 %	50 %	0 %	281413121
35092	NC_013642	CGA	2	6	1711463	1711468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281413121
35093	NC_013642	GATC	2	8	1711484	1711491	25 %	25 %	25 %	25 %	281413121
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35099	NC_013642	TGG	2	6	1711619	1711624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281413121
35100	NC_013642	GA	3	6	1711662	1711667	50 %	0 %	50 %	0 %	281413121
35101	NC_013642	GA	3	6	1711670	1711675	50 %	0 %	50 %	0 %	281413121
35102	NC_013642	AGAA	2	8	1711683	1711690	75 %	0 %	25 %	0 %	281413121
35103	NC_013642	A	7	7	1711790	1711796	100 %	0 %	0 %	0 %	281413121
35104	NC_013642	CGTT	2	8	1711840	1711847	0 %	50 %	25 %	25 %	281413121
35105	NC_013642	TTC	2	6	1711863	1711868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413121
35106	NC_013642	CAAGAA	2	12	1711928	1711939	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	281413121
35107	NC_013642	CTT	2	6	1711976	1711981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413121
35108	NC_013642	GTG	2	6	1712004	1712009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281413121
35109	NC_013642	GAT	2	6	1712022	1712027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413121
35110	NC_013642	GAGT	2	8	1712028	1712035	25 %	25 %	50 %	0 %	281413121
35111	NC_013642	GT	3	6	1712107	1712112	0 %	50 %	50 %	0 %	281413122
35112	NC_013642	GTTC	2	8	1712175	1712182	0 %	50 %	25 %	25 %	281413122
35113	NC_013642	CAC	2	6	1712209	1712214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281413122
35114	NC_013642	CGAGA	2	10	1712235	1712244	40 %	0 %	40 %	20 %	281413122
35115	NC_013642	AG	3	6	1712404	1712409	50 %	0 %	50 %	0 %	281413122
35116	NC_013642	GAT	2	6	1712415	1712420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413122
35117	NC_013642	AGA	2	6	1712435	1712440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413122
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35119	NC_013642	TTCCAC	2	12	1712538	1712549	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	281413122
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35122	NC_013642	GATC	2	8	1712625	1712632	25 %	25 %	25 %	25 %	281413122
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35223	NC_013642	AG	3	6	1716715	1716720	50 %	0 %	50 %	0 %	281413126
35224	NC_013642	TCG	2	6	1716752	1716757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413126
35225	NC_013642	CTA	2	6	1716771	1716776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281413126
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35228	NC_013642	A	6	6	1716811	1716816	100 %	0 %	0 %	0 %	281413126
35229	NC_013642	GCAGC	2	10	1716865	1716874	20 %	0 %	40 %	40 %	281413126
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35231	NC_013642	AG	3	6	1716988	1716993	50 %	0 %	50 %	0 %	281413126
35232	NC_013642	GAG	2	6	1717000	1717005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281413126
35233	NC_013642	GAA	2	6	1717024	1717029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413126
35234	NC_013642	GA	3	6	1717033	1717038	50 %	0 %	50 %	0 %	281413126
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35356	NC_013642	AGA	2	6	1722487	1722492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413133
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35469	NC_013642	TAC	2	6	1726931	1726936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281413139
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35472	NC_013642	TGT	2	6	1727064	1727069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281413140
35473	NC_013642	CAA	2	6	1727125	1727130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281413140
35474	NC_013642	GAAA	2	8	1727173	1727180	75 %	0 %	25 %	0 %	281413140
35475	NC_013642	T	6	6	1727245	1727250	0 %	100 %	0 %	0 %	281413140
35476	NC_013642	ACC	2	6	1727259	1727264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281413140
35477	NC_013642	CTAT	2	8	1727324	1727331	25 %	50 %	0 %	25 %	281413140
35478	NC_013642	AAGAC	2	10	1727402	1727411	60 %	0 %	20 %	20 %	281413140
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35480	NC_013642	A	6	6	1727441	1727446	100 %	0 %	0 %	0 %	281413140
35481	NC_013642	TTCCG	2	10	1727707	1727716	0 %	40 %	20 %	40 %	281413141
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35497	NC_013642	TCC	2	6	1728350	1728355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413142
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