MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013642	AGG	2	6	145829	145834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411596
3002	NC_013642	A	6	6	145864	145869	100 %	0 %	0 %	0 %	281411596
3003	NC_013642	AAC	2	6	145990	145995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411596
3004	NC_013642	AGG	2	6	146037	146042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411596
3005	NC_013642	AGA	2	6	146072	146077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411596
3006	NC_013642	TCG	2	6	146087	146092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411596
3007	NC_013642	A	6	6	146160	146165	100 %	0 %	0 %	0 %	281411596
3008	NC_013642	GAT	2	6	146226	146231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411596
3009	NC_013642	AGAC	2	8	146271	146278	50 %	0 %	25 %	25 %	281411596
3010	NC_013642	GAA	2	6	146308	146313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411596
3011	NC_013642	GGA	2	6	146397	146402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411596
3012	NC_013642	AAAG	2	8	146406	146413	75 %	0 %	25 %	0 %	281411596
3013	NC_013642	AG	3	6	146492	146497	50 %	0 %	50 %	0 %	281411597
3014	NC_013642	CAAC	2	8	146537	146544	50 %	0 %	0 %	50 %	281411597
3015	NC_013642	ATT	3	9	146553	146561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411597
3016	NC_013642	GT	3	6	146588	146593	0 %	50 %	50 %	0 %	281411597
3017	NC_013642	AGA	2	6	146632	146637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411597
3018	NC_013642	AAT	2	6	146803	146808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281411597
3019	NC_013642	CA	3	6	146859	146864	50 %	0 %	0 %	50 %	281411597
3020	NC_013642	AG	3	6	146883	146888	50 %	0 %	50 %	0 %	281411597
3021	NC_013642	TCC	2	6	146892	146897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411597
3022	NC_013642	TTGAA	2	10	146943	146952	40 %	40 %	20 %	0 %	281411597
3023	NC_013642	AG	3	6	146965	146970	50 %	0 %	50 %	0 %	281411597
3024	NC_013642	A	6	6	146973	146978	100 %	0 %	0 %	0 %	281411597
3025	NC_013642	CTT	2	6	147002	147007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411597
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3029	NC_013642	GTTT	2	8	147148	147155	0 %	75 %	25 %	0 %	281411597
3030	NC_013642	AAAG	2	8	147215	147222	75 %	0 %	25 %	0 %	281411597
3031	NC_013642	AGA	2	6	147271	147276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411597
3032	NC_013642	GGA	2	6	147343	147348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411597
3033	NC_013642	GAA	2	6	147353	147358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411597
3034	NC_013642	A	6	6	147404	147409	100 %	0 %	0 %	0 %	281411597
3035	NC_013642	A	6	6	147557	147562	100 %	0 %	0 %	0 %	281411597
3036	NC_013642	A	7	7	147571	147577	100 %	0 %	0 %	0 %	281411597
3037	NC_013642	GAA	2	6	147599	147604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411597
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3039	NC_013642	GA	3	6	147697	147702	50 %	0 %	50 %	0 %	281411597
3040	NC_013642	AGA	2	6	147720	147725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411597
3041	NC_013642	AG	3	6	147761	147766	50 %	0 %	50 %	0 %	281411597
3042	NC_013642	TTA	2	6	147769	147774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411597
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3045	NC_013642	GGAA	2	8	147901	147908	50 %	0 %	50 %	0 %	281411597
3046	NC_013642	GCG	2	6	147938	147943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411597
3047	NC_013642	A	6	6	147970	147975	100 %	0 %	0 %	0 %	281411597
3048	NC_013642	TTG	2	6	148077	148082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411597
3049	NC_013642	AGG	2	6	148088	148093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411597
3050	NC_013642	GAT	2	6	148101	148106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411597
3051	NC_013642	TTTG	2	8	148216	148223	0 %	75 %	25 %	0 %	281411598
3052	NC_013642	T	6	6	148235	148240	0 %	100 %	0 %	0 %	281411598
3053	NC_013642	ACG	2	6	148262	148267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411598
3054	NC_013642	TGG	2	6	148268	148273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411598
3055	NC_013642	GA	4	8	148306	148313	50 %	0 %	50 %	0 %	281411598
3056	NC_013642	AGT	2	6	148356	148361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411598
3057	NC_013642	CCA	2	6	148377	148382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411598
3058	NC_013642	CA	3	6	148381	148386	50 %	0 %	0 %	50 %	281411598
3059	NC_013642	GGAG	2	8	148419	148426	25 %	0 %	75 %	0 %	281411598
3060	NC_013642	TAC	2	6	148444	148449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411598
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3063	NC_013642	CCA	2	6	148617	148622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411598
3064	NC_013642	CGTT	2	8	148695	148702	0 %	50 %	25 %	25 %	281411598
3065	NC_013642	CTTT	2	8	148713	148720	0 %	75 %	0 %	25 %	281411598
3066	NC_013642	GAAA	2	8	148845	148852	75 %	0 %	25 %	0 %	281411598
3067	NC_013642	AATC	2	8	148871	148878	50 %	25 %	0 %	25 %	281411598
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3071	NC_013642	AGA	2	6	149195	149200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411598
3072	NC_013642	CGATT	2	10	149208	149217	20 %	40 %	20 %	20 %	281411598
3073	NC_013642	CA	4	8	149222	149229	50 %	0 %	0 %	50 %	281411598
3074	NC_013642	GATG	2	8	149234	149241	25 %	25 %	50 %	0 %	281411598
3075	NC_013642	AGAAA	2	10	149248	149257	80 %	0 %	20 %	0 %	281411598
3076	NC_013642	GATC	2	8	149265	149272	25 %	25 %	25 %	25 %	281411598
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3083	NC_013642	GGA	2	6	149468	149473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411599
3084	NC_013642	AGCAA	2	10	149511	149520	60 %	0 %	20 %	20 %	281411599
3085	NC_013642	GAAA	2	8	149540	149547	75 %	0 %	25 %	0 %	281411599
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3098	NC_013642	GA	3	6	150128	150133	50 %	0 %	50 %	0 %	281411599
3099	NC_013642	GAC	2	6	150174	150179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411599
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3101	NC_013642	TCT	2	6	150247	150252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411599
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3103	NC_013642	TG	3	6	150407	150412	0 %	50 %	50 %	0 %	281411599
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3105	NC_013642	ACGA	2	8	150522	150529	50 %	0 %	25 %	25 %	281411599
3106	NC_013642	GAAC	2	8	150569	150576	50 %	0 %	25 %	25 %	281411599
3107	NC_013642	GGA	3	9	150624	150632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411599
3108	NC_013642	GA	3	6	150654	150659	50 %	0 %	50 %	0 %	281411599
3109	NC_013642	AGA	2	6	150797	150802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411600
3110	NC_013642	CG	3	6	150895	150900	0 %	0 %	50 %	50 %	281411600
3111	NC_013642	GAA	2	6	150923	150928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411600
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3115	NC_013642	TGGG	2	8	151149	151156	0 %	25 %	75 %	0 %	281411600
3116	NC_013642	TGGGT	2	10	151213	151222	0 %	40 %	60 %	0 %	281411600
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3123	NC_013642	TTTC	2	8	151453	151460	0 %	75 %	0 %	25 %	281411601
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3125	NC_013642	CTT	2	6	151700	151705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411601
3126	NC_013642	GGT	2	6	151747	151752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411601
3127	NC_013642	TTC	2	6	151762	151767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411601
3128	NC_013642	TCT	2	6	151822	151827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411601
3129	NC_013642	GGA	2	6	151831	151836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411601
3130	NC_013642	TGT	2	6	151890	151895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411601
3131	NC_013642	TGG	2	6	151935	151940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411601
3132	NC_013642	GT	3	6	151991	151996	0 %	50 %	50 %	0 %	281411601
3133	NC_013642	GAA	2	6	152013	152018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411601
3134	NC_013642	TTG	2	6	152205	152210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411602
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3138	NC_013642	CA	4	8	152321	152328	50 %	0 %	0 %	50 %	281411602
3139	NC_013642	GAA	2	6	152390	152395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411602
3140	NC_013642	TCA	2	6	152571	152576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411602
3141	NC_013642	CAT	2	6	152611	152616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411602
3142	NC_013642	TGA	2	6	152695	152700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411602
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3144	NC_013642	AT	3	6	152728	152733	50 %	50 %	0 %	0 %	281411602
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3147	NC_013642	A	6	6	152897	152902	100 %	0 %	0 %	0 %	281411602
3148	NC_013642	AGA	2	6	152938	152943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411602
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3152	NC_013642	ATCT	2	8	153076	153083	25 %	50 %	0 %	25 %	281411602
3153	NC_013642	AAACG	2	10	153230	153239	60 %	0 %	20 %	20 %	281411602
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3157	NC_013642	AAG	2	6	153453	153458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411602
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3162	NC_013642	AGCAG	2	10	153595	153604	40 %	0 %	40 %	20 %	281411602
3163	NC_013642	CTT	2	6	153611	153616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411602
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3166	NC_013642	A	6	6	153726	153731	100 %	0 %	0 %	0 %	281411602
3167	NC_013642	ATCAG	2	10	153747	153756	40 %	20 %	20 %	20 %	281411602
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3170	NC_013642	GCAG	2	8	153799	153806	25 %	0 %	50 %	25 %	281411602
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3219	NC_013642	ACG	2	6	156228	156233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411605
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3231	NC_013642	A	7	7	156773	156779	100 %	0 %	0 %	0 %	281411606
3232	NC_013642	AGA	2	6	156802	156807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411606
3233	NC_013642	A	6	6	156812	156817	100 %	0 %	0 %	0 %	281411606
3234	NC_013642	ACCG	2	8	156838	156845	25 %	0 %	25 %	50 %	281411606
3235	NC_013642	GATC	2	8	156934	156941	25 %	25 %	25 %	25 %	281411606
3236	NC_013642	CAGGG	2	10	156991	157000	20 %	0 %	60 %	20 %	281411606
3237	NC_013642	AGAC	2	8	157057	157064	50 %	0 %	25 %	25 %	281411606
3238	NC_013642	AGA	2	6	157143	157148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411606
3239	NC_013642	TCT	2	6	157182	157187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411607
3240	NC_013642	CAAA	2	8	157214	157221	75 %	0 %	0 %	25 %	281411607
3241	NC_013642	CAC	2	6	157254	157259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411607
3242	NC_013642	GTG	2	6	157330	157335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411607
3243	NC_013642	GGT	2	6	157338	157343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411607
3244	NC_013642	GTT	2	6	157446	157451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411607
3245	NC_013642	CAA	2	6	157481	157486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411607
3246	NC_013642	GAA	2	6	157560	157565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411607
3247	NC_013642	ACA	2	6	157639	157644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411607
3248	NC_013642	AGA	2	6	157729	157734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411607
3249	NC_013642	CTTT	2	8	157742	157749	0 %	75 %	0 %	25 %	281411607
3250	NC_013642	ACA	2	6	157795	157800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411607
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3252	NC_013642	AG	3	6	157867	157872	50 %	0 %	50 %	0 %	281411607
3253	NC_013642	CTT	2	6	157961	157966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411607
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3261	NC_013642	CCT	2	6	158328	158333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411607
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3351	NC_013642	CTA	2	6	163104	163109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411610
3352	NC_013642	GA	3	6	163211	163216	50 %	0 %	50 %	0 %	281411610
3353	NC_013642	ATT	2	6	163244	163249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411610
3354	NC_013642	TTCT	2	8	163255	163262	0 %	75 %	0 %	25 %	281411610
3355	NC_013642	TTAA	2	8	163344	163351	50 %	50 %	0 %	0 %	281411611
3356	NC_013642	A	6	6	163350	163355	100 %	0 %	0 %	0 %	281411611
3357	NC_013642	CTG	2	6	163380	163385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411611
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3359	NC_013642	AAG	2	6	163539	163544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411611
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3361	NC_013642	AAG	3	9	163591	163599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411611
3362	NC_013642	GAA	2	6	163617	163622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411611
3363	NC_013642	TGAA	2	8	163637	163644	50 %	25 %	25 %	0 %	281411611
3364	NC_013642	A	6	6	163666	163671	100 %	0 %	0 %	0 %	281411611
3365	NC_013642	CAA	2	6	163854	163859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411611
3366	NC_013642	CTT	2	6	163866	163871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411611
3367	NC_013642	TAT	2	6	163927	163932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411611
3368	NC_013642	TGTT	2	8	163941	163948	0 %	75 %	25 %	0 %	281411611
3369	NC_013642	CCA	2	6	164009	164014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411611
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3494	NC_013642	GTG	2	6	171859	171864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411616
3495	NC_013642	CAA	2	6	171903	171908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411616
3496	NC_013642	AAGT	2	8	172004	172011	50 %	25 %	25 %	0 %	281411616
3497	NC_013642	GAT	2	6	172060	172065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411616
3498	NC_013642	TCT	2	6	172082	172087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411616
3499	NC_013642	AGA	2	6	172157	172162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411616
3500	NC_013642	TCA	2	6	172167	172172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411616

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