MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_013642	TTC	2	6	1658484	1658489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413069
34002	NC_013642	T	7	7	1658510	1658516	0 %	100 %	0 %	0 %	281413069
34003	NC_013642	CTC	2	6	1658523	1658528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413069
34004	NC_013642	TC	3	6	1658538	1658543	0 %	50 %	0 %	50 %	281413069
34005	NC_013642	GAT	2	6	1658623	1658628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413070
34006	NC_013642	GACC	2	8	1658640	1658647	25 %	0 %	25 %	50 %	281413070
34007	NC_013642	TCC	3	9	1658779	1658787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413070
34008	NC_013642	ATTCC	2	10	1658838	1658847	20 %	40 %	0 %	40 %	281413070
34009	NC_013642	GTAT	2	8	1658910	1658917	25 %	50 %	25 %	0 %	281413070
34010	NC_013642	GT	3	6	1659076	1659081	0 %	50 %	50 %	0 %	281413070
34011	NC_013642	CCT	2	6	1659114	1659119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413071
34012	NC_013642	AAAAC	2	10	1659152	1659161	80 %	0 %	0 %	20 %	281413071
34013	NC_013642	ACA	2	6	1659178	1659183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281413071
34014	NC_013642	GT	3	6	1659205	1659210	0 %	50 %	50 %	0 %	281413071
34015	NC_013642	TTC	2	6	1659269	1659274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413071
34016	NC_013642	GAA	2	6	1659385	1659390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413071
34017	NC_013642	GAA	2	6	1659413	1659418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413071
34018	NC_013642	GAA	2	6	1659428	1659433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413071
34019	NC_013642	TGA	2	6	1659446	1659451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413071
34020	NC_013642	A	6	6	1659451	1659456	100 %	0 %	0 %	0 %	281413071
34021	NC_013642	CAAT	2	8	1659470	1659477	50 %	25 %	0 %	25 %	281413071
34022	NC_013642	GAAA	2	8	1659501	1659508	75 %	0 %	25 %	0 %	281413071
34023	NC_013642	TTC	2	6	1659598	1659603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413071
34024	NC_013642	TC	3	6	1659602	1659607	0 %	50 %	0 %	50 %	281413071
34025	NC_013642	AACG	2	8	1659669	1659676	50 %	0 %	25 %	25 %	281413071
34026	NC_013642	GA	3	6	1659677	1659682	50 %	0 %	50 %	0 %	281413071
34027	NC_013642	GAA	2	6	1659777	1659782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413071
34028	NC_013642	ATC	2	6	1659871	1659876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281413071
34029	NC_013642	TCCT	2	8	1659945	1659952	0 %	50 %	0 %	50 %	281413071
34030	NC_013642	CAA	2	6	1660013	1660018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281413071
34031	NC_013642	TGT	2	6	1660046	1660051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281413071
34032	NC_013642	GAAGA	2	10	1660101	1660110	60 %	0 %	40 %	0 %	281413071
34033	NC_013642	GA	3	6	1660109	1660114	50 %	0 %	50 %	0 %	281413071
34034	NC_013642	GAT	2	6	1660140	1660145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413071
34035	NC_013642	CAT	2	6	1660146	1660151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281413071
34036	NC_013642	TTC	2	6	1660165	1660170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413071
34037	NC_013642	ACG	2	6	1660189	1660194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281413071
34038	NC_013642	CTT	2	6	1660220	1660225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413072
34039	NC_013642	TCCA	2	8	1660273	1660280	25 %	25 %	0 %	50 %	281413072
34040	NC_013642	CAC	2	6	1660282	1660287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281413072
34041	NC_013642	T	6	6	1660353	1660358	0 %	100 %	0 %	0 %	281413072
34042	NC_013642	GTCAG	2	10	1660421	1660430	20 %	20 %	40 %	20 %	281413072
34043	NC_013642	TTC	2	6	1660488	1660493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413072
34044	NC_013642	GAA	2	6	1660536	1660541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413072
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34046	NC_013642	CTTC	2	8	1660635	1660642	0 %	50 %	0 %	50 %	281413072
34047	NC_013642	AGA	2	6	1660643	1660648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413072
34048	NC_013642	TCT	2	6	1660659	1660664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413072
34049	NC_013642	TTCCG	2	10	1660672	1660681	0 %	40 %	20 %	40 %	281413072
34050	NC_013642	CT	3	6	1660704	1660709	0 %	50 %	0 %	50 %	281413072
34051	NC_013642	CT	3	6	1660713	1660718	0 %	50 %	0 %	50 %	281413072
34052	NC_013642	TG	3	6	1660748	1660753	0 %	50 %	50 %	0 %	281413072
34053	NC_013642	CCT	2	6	1661479	1661484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413073
34054	NC_013642	CT	3	6	1661548	1661553	0 %	50 %	0 %	50 %	281413073
34055	NC_013642	GAAA	2	8	1661678	1661685	75 %	0 %	25 %	0 %	281413073
34056	NC_013642	TTC	2	6	1661750	1661755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413073
34057	NC_013642	GAGG	2	8	1661804	1661811	25 %	0 %	75 %	0 %	281413073
34058	NC_013642	GTT	2	6	1661819	1661824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281413073
34059	NC_013642	AAC	2	6	1661843	1661848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281413073
34060	NC_013642	TCA	2	6	1661887	1661892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281413073
34061	NC_013642	TCG	2	6	1661922	1661927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413073
34062	NC_013642	CAGC	2	8	1661962	1661969	25 %	0 %	25 %	50 %	281413073
34063	NC_013642	ATG	2	6	1662003	1662008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413073
34064	NC_013642	CCA	2	6	1662013	1662018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281413073
34065	NC_013642	TTC	2	6	1662019	1662024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413073
34066	NC_013642	CG	4	8	1662031	1662038	0 %	0 %	50 %	50 %	281413073
34067	NC_013642	GA	3	6	1662084	1662089	50 %	0 %	50 %	0 %	281413073
34068	NC_013642	CTT	2	6	1662106	1662111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413073
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34073	NC_013642	TC	3	6	1662385	1662390	0 %	50 %	0 %	50 %	281413074
34074	NC_013642	CAA	2	6	1662403	1662408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281413074
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34087	NC_013642	TTC	2	6	1663064	1663069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413074
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34089	NC_013642	TAT	2	6	1663169	1663174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281413074
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34100	NC_013642	CTT	2	6	1663599	1663604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413075
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34102	NC_013642	CAG	2	6	1663741	1663746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281413075
34103	NC_013642	CT	3	6	1663749	1663754	0 %	50 %	0 %	50 %	281413075
34104	NC_013642	TTC	3	9	1663787	1663795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413075
34105	NC_013642	CAC	2	6	1663825	1663830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281413075
34106	NC_013642	GTA	2	6	1663852	1663857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413075
34107	NC_013642	TG	3	6	1663865	1663870	0 %	50 %	50 %	0 %	281413075
34108	NC_013642	GGA	2	6	1663897	1663902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281413075
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34113	NC_013642	TCC	2	6	1664060	1664065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413075
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34119	NC_013642	TGG	2	6	1664409	1664414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281413075
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34238	NC_013642	GA	3	6	1671027	1671032	50 %	0 %	50 %	0 %	281413081
34239	NC_013642	CATT	2	8	1671040	1671047	25 %	50 %	0 %	25 %	281413081
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34262	NC_013642	T	6	6	1672166	1672171	0 %	100 %	0 %	0 %	281413081
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34336	NC_013642	TGG	2	6	1675803	1675808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281413086
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34340	NC_013642	TTC	2	6	1675983	1675988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413086
34341	NC_013642	ACG	2	6	1676005	1676010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281413086
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34344	NC_013642	CTTC	2	8	1676169	1676176	0 %	50 %	0 %	50 %	281413086
34345	NC_013642	GCTG	2	8	1676203	1676210	0 %	25 %	50 %	25 %	281413086
34346	NC_013642	GA	3	6	1676214	1676219	50 %	0 %	50 %	0 %	281413086
34347	NC_013642	TTC	2	6	1676220	1676225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413086
34348	NC_013642	TGA	2	6	1676422	1676427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413086
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34350	NC_013642	GAA	2	6	1676481	1676486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413086
34351	NC_013642	CT	3	6	1676557	1676562	0 %	50 %	0 %	50 %	281413086
34352	NC_013642	GGT	2	6	1676594	1676599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281413086
34353	NC_013642	GTCG	2	8	1676609	1676616	0 %	25 %	50 %	25 %	281413086
34354	NC_013642	GAT	2	6	1676637	1676642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413086
34355	NC_013642	GAA	2	6	1676784	1676789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413086
34356	NC_013642	TCG	2	6	1676806	1676811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413086
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34461	NC_013642	CTC	2	6	1682173	1682178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413092
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34467	NC_013642	GA	4	8	1682429	1682436	50 %	0 %	50 %	0 %	281413093
34468	NC_013642	A	7	7	1682439	1682445	100 %	0 %	0 %	0 %	281413093
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34471	NC_013642	GTG	2	6	1682532	1682537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281413093
34472	NC_013642	CCCA	2	8	1682553	1682560	25 %	0 %	0 %	75 %	281413093
34473	NC_013642	GAG	2	6	1682664	1682669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281413093
34474	NC_013642	TCC	2	6	1682675	1682680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281413093
34475	NC_013642	GAA	2	6	1682700	1682705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413093
34476	NC_013642	TG	3	6	1682725	1682730	0 %	50 %	50 %	0 %	281413093
34477	NC_013642	CAG	2	6	1682832	1682837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281413093
34478	NC_013642	GAG	2	6	1682849	1682854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281413093
34479	NC_013642	GA	3	6	1682861	1682866	50 %	0 %	50 %	0 %	281413093
34480	NC_013642	GA	3	6	1682906	1682911	50 %	0 %	50 %	0 %	281413093
34481	NC_013642	GAA	2	6	1682958	1682963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413093
34482	NC_013642	GCA	2	6	1682966	1682971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281413093
34483	NC_013642	AGA	2	6	1683050	1683055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413093
34484	NC_013642	GAT	2	6	1683056	1683061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281413093
34485	NC_013642	GAG	2	6	1683117	1683122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281413093
34486	NC_013642	GATC	2	8	1683143	1683150	25 %	25 %	25 %	25 %	281413093
34487	NC_013642	TCG	2	6	1683160	1683165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281413093
34488	NC_013642	CTT	2	6	1683364	1683369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281413094
34489	NC_013642	GGGTG	2	10	1683490	1683499	0 %	20 %	80 %	0 %	281413094
34490	NC_013642	AC	3	6	1683567	1683572	50 %	0 %	0 %	50 %	281413094
34491	NC_013642	GGA	2	6	1683582	1683587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281413094
34492	NC_013642	TGG	2	6	1683781	1683786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281413095
34493	NC_013642	GAA	2	6	1683813	1683818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413095
34494	NC_013642	GA	3	6	1683861	1683866	50 %	0 %	50 %	0 %	281413095
34495	NC_013642	GA	4	8	1683869	1683876	50 %	0 %	50 %	0 %	281413095
34496	NC_013642	AC	3	6	1683911	1683916	50 %	0 %	0 %	50 %	281413095
34497	NC_013642	TTCC	2	8	1683922	1683929	0 %	50 %	0 %	50 %	281413095
34498	NC_013642	CAC	2	6	1684102	1684107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281413095
34499	NC_013642	AGA	2	6	1684124	1684129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413095
34500	NC_013642	GAA	2	6	1684166	1684171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281413095

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