MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_013642	AAT	2	6	1513244	1513249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281412934
31002	NC_013642	ATG	2	6	1513278	1513283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412934
31003	NC_013642	GTA	2	6	1513310	1513315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412934
31004	NC_013642	ATCAGA	2	12	1513356	1513367	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	281412934
31005	NC_013642	TGT	2	6	1513372	1513377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412934
31006	NC_013642	TGG	2	6	1513406	1513411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412934
31007	NC_013642	TCT	2	6	1513538	1513543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412935
31008	NC_013642	AAC	2	6	1513573	1513578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412935
31009	NC_013642	CGA	2	6	1513632	1513637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412935
31010	NC_013642	CTGT	2	8	1513658	1513665	0 %	50 %	25 %	25 %	281412935
31011	NC_013642	TCA	2	6	1513680	1513685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412935
31012	NC_013642	GA	3	6	1513880	1513885	50 %	0 %	50 %	0 %	281412935
31013	NC_013642	CGA	2	6	1513911	1513916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412935
31014	NC_013642	TTC	2	6	1513922	1513927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412935
31015	NC_013642	TCG	2	6	1513989	1513994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412935
31016	NC_013642	CCA	2	6	1514004	1514009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412935
31017	NC_013642	ATG	2	6	1514066	1514071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412935
31018	NC_013642	TCT	2	6	1514169	1514174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412935
31019	NC_013642	T	6	6	1514193	1514198	0 %	100 %	0 %	0 %	281412935
31020	NC_013642	GGA	2	6	1514207	1514212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412935
31021	NC_013642	GAA	2	6	1514254	1514259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412935
31022	NC_013642	CTT	2	6	1514260	1514265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412935
31023	NC_013642	CA	4	8	1514287	1514294	50 %	0 %	0 %	50 %	281412935
31024	NC_013642	CAA	2	6	1514358	1514363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412935
31025	NC_013642	CTC	2	6	1514380	1514385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412935
31026	NC_013642	TCT	2	6	1514400	1514405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412935
31027	NC_013642	CCA	2	6	1514406	1514411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412935
31028	NC_013642	TTG	2	6	1514415	1514420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412935
31029	NC_013642	TCG	2	6	1514483	1514488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412935
31030	NC_013642	GTC	2	6	1514578	1514583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412935
31031	NC_013642	ATC	2	6	1514710	1514715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412936
31032	NC_013642	TCA	2	6	1514717	1514722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412936
31033	NC_013642	CTGT	2	8	1514787	1514794	0 %	50 %	25 %	25 %	281412936
31034	NC_013642	TC	3	6	1514849	1514854	0 %	50 %	0 %	50 %	281412936
31035	NC_013642	TCC	2	6	1514856	1514861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412936
31036	NC_013642	GGT	2	6	1514883	1514888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412936
31037	NC_013642	GAA	2	6	1514909	1514914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412936
31038	NC_013642	CCA	2	6	1514930	1514935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412936
31039	NC_013642	CTTT	2	8	1514960	1514967	0 %	75 %	0 %	25 %	281412936
31040	NC_013642	CCA	2	6	1515014	1515019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412936
31041	NC_013642	TTC	2	6	1515034	1515039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412936
31042	NC_013642	CCA	2	6	1515089	1515094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412936
31043	NC_013642	GAA	2	6	1515188	1515193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412936
31044	NC_013642	CTT	2	6	1515239	1515244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412936
31045	NC_013642	CT	3	6	1515261	1515266	0 %	50 %	0 %	50 %	281412936
31046	NC_013642	TCT	2	6	1515305	1515310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412936
31047	NC_013642	GTA	2	6	1515348	1515353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412936
31048	NC_013642	TCT	2	6	1515358	1515363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412936
31049	NC_013642	GAA	2	6	1515371	1515376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412936
31050	NC_013642	CGA	2	6	1515419	1515424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412936
31051	NC_013642	TTG	2	6	1515460	1515465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412936
31052	NC_013642	TTCT	2	8	1515493	1515500	0 %	75 %	0 %	25 %	281412936
31053	NC_013642	ATG	2	6	1515520	1515525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412936
31054	NC_013642	TCT	2	6	1515558	1515563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412936
31055	NC_013642	AG	3	6	1515584	1515589	50 %	0 %	50 %	0 %	281412936
31056	NC_013642	TCT	2	6	1515651	1515656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412936
31057	NC_013642	TCA	2	6	1515693	1515698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412937
31058	NC_013642	TTC	2	6	1515718	1515723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412937
31059	NC_013642	TCT	2	6	1515763	1515768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412937
31060	NC_013642	CGA	2	6	1515794	1515799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412937
31061	NC_013642	CGG	2	6	1515806	1515811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281412937
31062	NC_013642	TTCCC	2	10	1515822	1515831	0 %	40 %	0 %	60 %	281412937
31063	NC_013642	TCT	2	6	1515869	1515874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412937
31064	NC_013642	CT	3	6	1515973	1515978	0 %	50 %	0 %	50 %	281412938
31065	NC_013642	CT	5	10	1515981	1515990	0 %	50 %	0 %	50 %	281412938
31066	NC_013642	TCT	2	6	1516005	1516010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412938
31067	NC_013642	TTC	2	6	1516115	1516120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412938
31068	NC_013642	CTT	2	6	1516206	1516211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412938
31069	NC_013642	TCA	2	6	1516224	1516229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412938
31070	NC_013642	TCG	2	6	1516280	1516285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412938
31071	NC_013642	TC	3	6	1516382	1516387	0 %	50 %	0 %	50 %	281412938
31072	NC_013642	ATG	2	6	1516427	1516432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412938
31073	NC_013642	CGA	2	6	1516434	1516439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412938
31074	NC_013642	CTT	2	6	1516441	1516446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412938
31075	NC_013642	ACG	2	6	1516463	1516468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412938
31076	NC_013642	GT	3	6	1516491	1516496	0 %	50 %	50 %	0 %	281412938
31077	NC_013642	TC	3	6	1516549	1516554	0 %	50 %	0 %	50 %	281412938
31078	NC_013642	CGT	2	6	1516635	1516640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412938
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31081	NC_013642	TTC	2	6	1516998	1517003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412938
31082	NC_013642	CCA	2	6	1517007	1517012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412938
31083	NC_013642	TTG	2	6	1517015	1517020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412938
31084	NC_013642	GTG	2	6	1517076	1517081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412938
31085	NC_013642	TC	3	6	1517110	1517115	0 %	50 %	0 %	50 %	281412938
31086	NC_013642	GCT	2	6	1517129	1517134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412938
31087	NC_013642	TCC	2	6	1517144	1517149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412938
31088	NC_013642	GAT	2	6	1517227	1517232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412938
31089	NC_013642	CT	3	6	1517233	1517238	0 %	50 %	0 %	50 %	281412938
31090	NC_013642	TTC	2	6	1517290	1517295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412938
31091	NC_013642	CT	3	6	1517312	1517317	0 %	50 %	0 %	50 %	281412938
31092	NC_013642	ACAT	2	8	1517336	1517343	50 %	25 %	0 %	25 %	281412938
31093	NC_013642	TTCTC	2	10	1517464	1517473	0 %	60 %	0 %	40 %	281412939
31094	NC_013642	GTTC	2	8	1517525	1517532	0 %	50 %	25 %	25 %	281412939
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31098	NC_013642	TTTCTT	2	12	1517822	1517833	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	281412940
31099	NC_013642	CCA	2	6	1517841	1517846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412940
31100	NC_013642	CTT	3	9	1517881	1517889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412940
31101	NC_013642	CT	3	6	1517945	1517950	0 %	50 %	0 %	50 %	281412940
31102	NC_013642	GTA	2	6	1517978	1517983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412940
31103	NC_013642	AAG	2	6	1518000	1518005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412940
31104	NC_013642	T	7	7	1518040	1518046	0 %	100 %	0 %	0 %	281412940
31105	NC_013642	TTGT	2	8	1518079	1518086	0 %	75 %	25 %	0 %	281412940
31106	NC_013642	TCG	2	6	1518148	1518153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412940
31107	NC_013642	GGA	2	6	1518166	1518171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412940
31108	NC_013642	CGA	2	6	1518178	1518183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412940
31109	NC_013642	GTA	2	6	1518242	1518247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412940
31110	NC_013642	TC	3	6	1518277	1518282	0 %	50 %	0 %	50 %	281412940
31111	NC_013642	TC	3	6	1518319	1518324	0 %	50 %	0 %	50 %	281412940
31112	NC_013642	TCA	2	6	1518343	1518348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412940
31113	NC_013642	CTT	2	6	1518355	1518360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412940
31114	NC_013642	CGG	2	6	1518370	1518375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281412940
31115	NC_013642	TCT	2	6	1518485	1518490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412940
31116	NC_013642	CTG	2	6	1518528	1518533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412940
31117	NC_013642	TCG	2	6	1518615	1518620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412940
31118	NC_013642	ATG	3	9	1518621	1518629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412940
31119	NC_013642	T	6	6	1518834	1518839	0 %	100 %	0 %	0 %	281412940
31120	NC_013642	GAAA	2	8	1518840	1518847	75 %	0 %	25 %	0 %	281412940
31121	NC_013642	GAT	2	6	1518884	1518889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412940
31122	NC_013642	CTC	2	6	1518890	1518895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412940
31123	NC_013642	CTT	3	9	1519144	1519152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412941
31124	NC_013642	TCA	2	6	1519190	1519195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412941
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31127	NC_013642	AAGG	2	8	1519384	1519391	50 %	0 %	50 %	0 %	281412941
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31131	NC_013642	GA	3	6	1519502	1519507	50 %	0 %	50 %	0 %	281412941
31132	NC_013642	GTT	2	6	1519555	1519560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412941
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31136	NC_013642	CAT	2	6	1519875	1519880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412941
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31146	NC_013642	CATC	2	8	1520400	1520407	25 %	25 %	0 %	50 %	281412942
31147	NC_013642	AG	3	6	1520485	1520490	50 %	0 %	50 %	0 %	281412942
31148	NC_013642	CAC	2	6	1520518	1520523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412942
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31199	NC_013642	TAG	2	6	1522005	1522010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412944
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31207	NC_013642	GAA	2	6	1522348	1522353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412944
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31212	NC_013642	ATGA	2	8	1522522	1522529	50 %	25 %	25 %	0 %	281412945
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31216	NC_013642	TC	3	6	1522731	1522736	0 %	50 %	0 %	50 %	281412945
31217	NC_013642	GAAGA	2	10	1522738	1522747	60 %	0 %	40 %	0 %	281412945
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31220	NC_013642	CGA	2	6	1522869	1522874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412945
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31223	NC_013642	GTG	2	6	1522912	1522917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412945
31224	NC_013642	AGGG	2	8	1522927	1522934	25 %	0 %	75 %	0 %	281412945
31225	NC_013642	CAA	2	6	1523007	1523012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412945
31226	NC_013642	GAG	2	6	1523020	1523025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412945
31227	NC_013642	A	6	6	1523046	1523051	100 %	0 %	0 %	0 %	281412945
31228	NC_013642	GAC	2	6	1523108	1523113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412946
31229	NC_013642	CGA	2	6	1523167	1523172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412946
31230	NC_013642	A	6	6	1523198	1523203	100 %	0 %	0 %	0 %	281412946
31231	NC_013642	CT	3	6	1523204	1523209	0 %	50 %	0 %	50 %	281412946
31232	NC_013642	CAT	4	12	1523308	1523319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412946
31233	NC_013642	AGGGAC	2	12	1523327	1523338	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	281412946
31234	NC_013642	GAT	2	6	1523372	1523377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412946
31235	NC_013642	A	6	6	1523518	1523523	100 %	0 %	0 %	0 %	281412946
31236	NC_013642	CTC	2	6	1523561	1523566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412946
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31238	NC_013642	TCGA	2	8	1523671	1523678	25 %	25 %	25 %	25 %	281412946
31239	NC_013642	GGAT	2	8	1523690	1523697	25 %	25 %	50 %	0 %	281412946
31240	NC_013642	TGA	2	6	1523740	1523745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412946
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31351	NC_013642	TCT	2	6	1529287	1529292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412950
31352	NC_013642	T	6	6	1529296	1529301	0 %	100 %	0 %	0 %	281412950
31353	NC_013642	ATGG	2	8	1529505	1529512	25 %	25 %	50 %	0 %	281412951
31354	NC_013642	CT	3	6	1529533	1529538	0 %	50 %	0 %	50 %	281412951
31355	NC_013642	AGA	2	6	1529553	1529558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412951
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31360	NC_013642	AG	3	6	1529751	1529756	50 %	0 %	50 %	0 %	281412951
31361	NC_013642	CCACA	2	10	1529806	1529815	40 %	0 %	0 %	60 %	281412951
31362	NC_013642	GA	3	6	1529829	1529834	50 %	0 %	50 %	0 %	281412951
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31388	NC_013642	ACG	2	6	1531442	1531447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412952
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31452	NC_013642	TG	3	6	1535038	1535043	0 %	50 %	50 %	0 %	281412956
31453	NC_013642	AAGG	2	8	1535044	1535051	50 %	0 %	50 %	0 %	281412956
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31457	NC_013642	TCT	2	6	1535185	1535190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412956
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31462	NC_013642	TC	3	6	1535369	1535374	0 %	50 %	0 %	50 %	281412956
31463	NC_013642	GA	3	6	1535409	1535414	50 %	0 %	50 %	0 %	281412956
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31465	NC_013642	TCG	2	6	1535503	1535508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412956
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31468	NC_013642	CTC	2	6	1535597	1535602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412956
31469	NC_013642	GAG	2	6	1535715	1535720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412956
31470	NC_013642	CGT	2	6	1535747	1535752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412956
31471	NC_013642	TC	3	6	1535830	1535835	0 %	50 %	0 %	50 %	281412956
31472	NC_013642	TTTC	2	8	1535852	1535859	0 %	75 %	0 %	25 %	281412956
31473	NC_013642	TCCT	2	8	1535898	1535905	0 %	50 %	0 %	50 %	281412957
31474	NC_013642	TTCC	2	8	1535919	1535926	0 %	50 %	0 %	50 %	281412957
31475	NC_013642	ATA	2	6	1535950	1535955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281412957
31476	NC_013642	TCT	2	6	1535978	1535983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412957
31477	NC_013642	GA	3	6	1535995	1536000	50 %	0 %	50 %	0 %	281412957
31478	NC_013642	TCTT	2	8	1536005	1536012	0 %	75 %	0 %	25 %	281412957
31479	NC_013642	GAT	2	6	1536034	1536039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412957
31480	NC_013642	TCA	2	6	1536059	1536064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412957
31481	NC_013642	GAA	2	6	1536144	1536149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412957
31482	NC_013642	CTTCCA	2	12	1536172	1536183	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	281412957
31483	NC_013642	CGA	2	6	1536189	1536194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412957
31484	NC_013642	CCG	2	6	1536198	1536203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281412957
31485	NC_013642	GAA	2	6	1536204	1536209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412957
31486	NC_013642	T	7	7	1536261	1536267	0 %	100 %	0 %	0 %	281412957
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31488	NC_013642	CGCT	2	8	1536322	1536329	0 %	25 %	25 %	50 %	281412957
31489	NC_013642	AC	3	6	1536481	1536486	50 %	0 %	0 %	50 %	281412957
31490	NC_013642	CTC	2	6	1536493	1536498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412958
31491	NC_013642	AG	4	8	1536536	1536543	50 %	0 %	50 %	0 %	281412958
31492	NC_013642	T	7	7	1536557	1536563	0 %	100 %	0 %	0 %	281412958
31493	NC_013642	CTT	2	6	1536566	1536571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412958
31494	NC_013642	CGA	2	6	1536590	1536595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412958
31495	NC_013642	CTTT	2	8	1536599	1536606	0 %	75 %	0 %	25 %	281412958
31496	NC_013642	CTTC	2	8	1536671	1536678	0 %	50 %	0 %	50 %	281412958
31497	NC_013642	CT	3	6	1536687	1536692	0 %	50 %	0 %	50 %	281412958
31498	NC_013642	GAT	2	6	1536705	1536710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412958
31499	NC_013642	GTT	2	6	1536718	1536723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412958
31500	NC_013642	ATC	2	6	1536738	1536743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412958

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