MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013642	TCCTT	2	10	122238	122247	0 %	60 %	0 %	40 %	281411566
2502	NC_013642	TC	3	6	122262	122267	0 %	50 %	0 %	50 %	281411566
2503	NC_013642	CCT	2	6	122310	122315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411566
2504	NC_013642	GAG	2	6	122327	122332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411566
2505	NC_013642	TCTT	2	8	122420	122427	0 %	75 %	0 %	25 %	281411566
2506	NC_013642	CCTGC	2	10	122449	122458	0 %	20 %	20 %	60 %	281411566
2507	NC_013642	TGT	2	6	122464	122469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411566
2508	NC_013642	TC	3	6	122498	122503	0 %	50 %	0 %	50 %	281411566
2509	NC_013642	TCA	2	6	122644	122649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411566
2510	NC_013642	TTCCC	2	10	122674	122683	0 %	40 %	0 %	60 %	281411566
2511	NC_013642	CTC	2	6	122698	122703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411566
2512	NC_013642	TTC	2	6	122721	122726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411566
2513	NC_013642	TCT	2	6	122978	122983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411567
2514	NC_013642	CGC	2	6	123013	123018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411567
2515	NC_013642	GA	3	6	123025	123030	50 %	0 %	50 %	0 %	281411567
2516	NC_013642	GGA	2	6	123040	123045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411567
2517	NC_013642	AAG	2	6	123111	123116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411567
2518	NC_013642	CCA	2	6	123165	123170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411567
2519	NC_013642	GGA	2	6	123188	123193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411567
2520	NC_013642	AAC	2	6	123215	123220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411567
2521	NC_013642	AGTC	2	8	123247	123254	25 %	25 %	25 %	25 %	281411567
2522	NC_013642	GAT	2	6	123268	123273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411567
2523	NC_013642	CTTCT	2	10	123331	123340	0 %	60 %	0 %	40 %	281411567
2524	NC_013642	CTT	2	6	123354	123359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411567
2525	NC_013642	CTC	2	6	123386	123391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411567
2526	NC_013642	GTC	2	6	123419	123424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411567
2527	NC_013642	AGG	2	6	123491	123496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411567
2528	NC_013642	ACG	2	6	123498	123503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411567
2529	NC_013642	CCGT	2	8	123520	123527	0 %	25 %	25 %	50 %	281411567
2530	NC_013642	GCGGT	2	10	123564	123573	0 %	20 %	60 %	20 %	281411567
2531	NC_013642	GAG	2	6	123609	123614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411567
2532	NC_013642	GACG	2	8	123649	123656	25 %	0 %	50 %	25 %	281411567
2533	NC_013642	GCA	2	6	123698	123703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411567
2534	NC_013642	CAG	2	6	123786	123791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411567
2535	NC_013642	TGA	2	6	123793	123798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411567
2536	NC_013642	AAAG	2	8	123817	123824	75 %	0 %	25 %	0 %	281411567
2537	NC_013642	TGC	2	6	123892	123897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411567
2538	NC_013642	CGA	2	6	123979	123984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411567
2539	NC_013642	TTG	2	6	124002	124007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411567
2540	NC_013642	CGG	2	6	124063	124068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411567
2541	NC_013642	GTG	2	6	124085	124090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411567
2542	NC_013642	AGA	2	6	124173	124178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411568
2543	NC_013642	AGA	2	6	124182	124187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411568
2544	NC_013642	TCG	2	6	124193	124198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411568
2545	NC_013642	AGG	2	6	124373	124378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411568
2546	NC_013642	TCT	2	6	124541	124546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411569
2547	NC_013642	GCA	2	6	124605	124610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411569
2548	NC_013642	AGG	2	6	124625	124630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411569
2549	NC_013642	ATC	2	6	124638	124643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411569
2550	NC_013642	GAC	2	6	124665	124670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411569
2551	NC_013642	AGA	2	6	124699	124704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411569
2552	NC_013642	AGA	2	6	124775	124780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411569
2553	NC_013642	CGT	2	6	124790	124795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411569
2554	NC_013642	CT	3	6	124880	124885	0 %	50 %	0 %	50 %	281411569
2555	NC_013642	TGG	2	6	124894	124899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411569
2556	NC_013642	CAA	2	6	124982	124987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411569
2557	NC_013642	GCA	2	6	125052	125057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411569
2558	NC_013642	AAAGA	2	10	125139	125148	80 %	0 %	20 %	0 %	281411569
2559	NC_013642	CG	4	8	125204	125211	0 %	0 %	50 %	50 %	281411569
2560	NC_013642	GAA	2	6	125274	125279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411569
2561	NC_013642	TGG	2	6	125284	125289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411569
2562	NC_013642	AGA	2	6	125298	125303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411569
2563	NC_013642	GTT	2	6	125307	125312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411569
2564	NC_013642	GA	3	6	125325	125330	50 %	0 %	50 %	0 %	281411569
2565	NC_013642	GGA	2	6	125451	125456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411569
2566	NC_013642	GTG	2	6	125498	125503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411570
2567	NC_013642	TTC	2	6	125555	125560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411570
2568	NC_013642	TCTT	2	8	125562	125569	0 %	75 %	0 %	25 %	281411570
2569	NC_013642	GAAA	2	8	125586	125593	75 %	0 %	25 %	0 %	281411570
2570	NC_013642	ACGT	2	8	125615	125622	25 %	25 %	25 %	25 %	281411570
2571	NC_013642	GGT	2	6	125666	125671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411570
2572	NC_013642	TGG	2	6	125695	125700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411570
2573	NC_013642	AAG	2	6	125753	125758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411570
2574	NC_013642	CAT	2	6	125803	125808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411570
2575	NC_013642	TGC	2	6	125917	125922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411570
2576	NC_013642	GAAA	2	8	126039	126046	75 %	0 %	25 %	0 %	281411571
2577	NC_013642	GAA	2	6	126106	126111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411571
2578	NC_013642	AG	3	6	126185	126190	50 %	0 %	50 %	0 %	281411571
2579	NC_013642	TGT	2	6	126204	126209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411571
2580	NC_013642	TGGCAG	2	12	126242	126253	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	281411571
2581	NC_013642	GTG	2	6	126382	126387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411571
2582	NC_013642	CGTCG	2	10	126502	126511	0 %	20 %	40 %	40 %	281411571
2583	NC_013642	CA	3	6	126538	126543	50 %	0 %	0 %	50 %	281411571
2584	NC_013642	GAAG	2	8	126573	126580	50 %	0 %	50 %	0 %	281411571
2585	NC_013642	AGA	2	6	126793	126798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411571
2586	NC_013642	AC	3	6	126844	126849	50 %	0 %	0 %	50 %	281411572
2587	NC_013642	GGTA	2	8	126860	126867	25 %	25 %	50 %	0 %	281411572
2588	NC_013642	GAG	2	6	126945	126950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411572
2589	NC_013642	T	6	6	126953	126958	0 %	100 %	0 %	0 %	281411572
2590	NC_013642	TCC	2	6	126963	126968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411572
2591	NC_013642	CCG	2	6	127000	127005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411572
2592	NC_013642	CG	3	6	127004	127009	0 %	0 %	50 %	50 %	281411572
2593	NC_013642	CGTT	2	8	127090	127097	0 %	50 %	25 %	25 %	281411572
2594	NC_013642	CA	3	6	127102	127107	50 %	0 %	0 %	50 %	281411572
2595	NC_013642	TCT	2	6	127119	127124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411572
2596	NC_013642	A	6	6	127161	127166	100 %	0 %	0 %	0 %	281411572
2597	NC_013642	TAT	2	6	127175	127180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411572
2598	NC_013642	TC	3	6	127196	127201	0 %	50 %	0 %	50 %	281411572
2599	NC_013642	TCCT	2	8	127257	127264	0 %	50 %	0 %	50 %	281411572
2600	NC_013642	TC	4	8	127316	127323	0 %	50 %	0 %	50 %	281411572
2601	NC_013642	CTT	2	6	127339	127344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411572
2602	NC_013642	TCT	2	6	127348	127353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411572
2603	NC_013642	CCG	2	6	127453	127458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411572
2604	NC_013642	TACCA	2	10	127499	127508	40 %	20 %	0 %	40 %	281411572
2605	NC_013642	TCG	2	6	127526	127531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411573
2606	NC_013642	TCT	2	6	127535	127540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411573
2607	NC_013642	GA	3	6	127588	127593	50 %	0 %	50 %	0 %	281411573
2608	NC_013642	AG	4	8	127618	127625	50 %	0 %	50 %	0 %	281411573
2609	NC_013642	CTT	2	6	127637	127642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411573
2610	NC_013642	TCT	2	6	127643	127648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411573
2611	NC_013642	T	7	7	127660	127666	0 %	100 %	0 %	0 %	281411573
2612	NC_013642	AGA	2	6	127745	127750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411573
2613	NC_013642	T	6	6	127824	127829	0 %	100 %	0 %	0 %	281411573
2614	NC_013642	CCA	2	6	127851	127856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411573
2615	NC_013642	CTGT	2	8	127923	127930	0 %	50 %	25 %	25 %	281411573
2616	NC_013642	GGT	2	6	127993	127998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411573
2617	NC_013642	CAC	2	6	128008	128013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411573
2618	NC_013642	CAGT	2	8	128015	128022	25 %	25 %	25 %	25 %	281411573
2619	NC_013642	CGA	2	6	128034	128039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411573
2620	NC_013642	TCT	2	6	128046	128051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411573
2621	NC_013642	TA	3	6	128057	128062	50 %	50 %	0 %	0 %	281411573
2622	NC_013642	TAT	2	6	128107	128112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411573
2623	NC_013642	CGAG	2	8	128196	128203	25 %	0 %	50 %	25 %	281411573
2624	NC_013642	T	7	7	128209	128215	0 %	100 %	0 %	0 %	281411573
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2993	NC_013642	TCTT	2	8	145216	145223	0 %	75 %	0 %	25 %	281411595
2994	NC_013642	CTTCT	2	10	145388	145397	0 %	60 %	0 %	40 %	281411595
2995	NC_013642	TC	3	6	145406	145411	0 %	50 %	0 %	50 %	281411595
2996	NC_013642	TTC	2	6	145413	145418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411595
2997	NC_013642	GAT	2	6	145449	145454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411595
2998	NC_013642	AAC	2	6	145512	145517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411595
2999	NC_013642	G	6	6	145663	145668	0 %	0 %	100 %	0 %	281411596
3000	NC_013642	A	8	8	145759	145766	100 %	0 %	0 %	0 %	281411596

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