MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_013642	CAC	2	6	1413810	1413815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412832
29003	NC_013642	AGA	2	6	1413827	1413832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412832
29004	NC_013642	AGA	2	6	1413888	1413893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412832
29005	NC_013642	TGG	2	6	1413896	1413901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412832
29006	NC_013642	GAA	2	6	1413906	1413911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412832
29007	NC_013642	CTTC	2	8	1413927	1413934	0 %	50 %	0 %	50 %	281412832
29008	NC_013642	TCA	2	6	1413979	1413984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412833
29009	NC_013642	CTT	2	6	1413995	1414000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412833
29010	NC_013642	CTA	3	9	1414030	1414038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412833
29011	NC_013642	TC	3	6	1414094	1414099	0 %	50 %	0 %	50 %	281412833
29012	NC_013642	TCT	2	6	1414105	1414110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412833
29013	NC_013642	CT	3	6	1414109	1414114	0 %	50 %	0 %	50 %	281412833
29014	NC_013642	ACT	2	6	1414122	1414127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412833
29015	NC_013642	TGA	2	6	1414129	1414134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412833
29016	NC_013642	ACA	2	6	1414188	1414193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412833
29017	NC_013642	CTT	3	9	1414226	1414234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412833
29018	NC_013642	CTT	2	6	1414262	1414267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412833
29019	NC_013642	TTTC	2	8	1414304	1414311	0 %	75 %	0 %	25 %	281412833
29020	NC_013642	CAA	2	6	1414354	1414359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412833
29021	NC_013642	AAGA	2	8	1414552	1414559	75 %	0 %	25 %	0 %	281412834
29022	NC_013642	TCCTC	2	10	1414599	1414608	0 %	40 %	0 %	60 %	281412834
29023	NC_013642	ATC	2	6	1414618	1414623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412834
29024	NC_013642	GAT	2	6	1414630	1414635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412834
29025	NC_013642	GAA	2	6	1414672	1414677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412834
29026	NC_013642	TC	3	6	1414691	1414696	0 %	50 %	0 %	50 %	281412834
29027	NC_013642	CTT	2	6	1414701	1414706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412834
29028	NC_013642	CTT	2	6	1414731	1414736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412835
29029	NC_013642	TCT	2	6	1414793	1414798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412835
29030	NC_013642	AAG	2	6	1414839	1414844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412835
29031	NC_013642	GTA	2	6	1414872	1414877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412835
29032	NC_013642	TGT	2	6	1414895	1414900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412835
29033	NC_013642	CTT	2	6	1414958	1414963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412835
29034	NC_013642	TCTGC	2	10	1414973	1414982	0 %	40 %	20 %	40 %	281412835
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29036	NC_013642	TTC	2	6	1415002	1415007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412835
29037	NC_013642	AGTTC	2	10	1415023	1415032	20 %	40 %	20 %	20 %	281412835
29038	NC_013642	TTA	2	6	1415087	1415092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412835
29039	NC_013642	CTT	2	6	1415183	1415188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412835
29040	NC_013642	CTGT	2	8	1415232	1415239	0 %	50 %	25 %	25 %	281412835
29041	NC_013642	AGAT	2	8	1415251	1415258	50 %	25 %	25 %	0 %	281412835
29042	NC_013642	CAT	2	6	1415277	1415282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412835
29043	NC_013642	CTTTC	2	10	1415295	1415304	0 %	60 %	0 %	40 %	281412835
29044	NC_013642	GT	3	6	1415319	1415324	0 %	50 %	50 %	0 %	281412835
29045	NC_013642	T	6	6	1415386	1415391	0 %	100 %	0 %	0 %	281412835
29046	NC_013642	GAG	2	6	1415439	1415444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412835
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29050	NC_013642	TGT	2	6	1415553	1415558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412835
29051	NC_013642	GTT	2	6	1415674	1415679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412835
29052	NC_013642	CCA	2	6	1415732	1415737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412835
29053	NC_013642	TTTC	2	8	1415758	1415765	0 %	75 %	0 %	25 %	281412835
29054	NC_013642	CT	3	6	1415766	1415771	0 %	50 %	0 %	50 %	281412835
29055	NC_013642	AGT	2	6	1415804	1415809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412835
29056	NC_013642	CCG	2	6	1415836	1415841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281412835
29057	NC_013642	TAT	2	6	1415871	1415876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412835
29058	NC_013642	GA	3	6	1415886	1415891	50 %	0 %	50 %	0 %	281412835
29059	NC_013642	CT	3	6	1415972	1415977	0 %	50 %	0 %	50 %	281412835
29060	NC_013642	ACC	2	6	1416009	1416014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412835
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29063	NC_013642	C	6	6	1416213	1416218	0 %	0 %	0 %	100 %	281412836
29064	NC_013642	CAT	2	6	1416229	1416234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412836
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29066	NC_013642	CTT	2	6	1416481	1416486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412836
29067	NC_013642	CCT	2	6	1416493	1416498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412836
29068	NC_013642	AG	3	6	1416632	1416637	50 %	0 %	50 %	0 %	281412837
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29087	NC_013642	GA	3	6	1417682	1417687	50 %	0 %	50 %	0 %	281412838
29088	NC_013642	TGT	2	6	1417721	1417726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412838
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29101	NC_013642	TCCTT	2	10	1418098	1418107	0 %	60 %	0 %	40 %	281412839
29102	NC_013642	GCTC	2	8	1418113	1418120	0 %	25 %	25 %	50 %	281412839
29103	NC_013642	CT	3	6	1418130	1418135	0 %	50 %	0 %	50 %	281412839
29104	NC_013642	TTC	2	6	1418168	1418173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412839
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29106	NC_013642	CTT	2	6	1418247	1418252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412839
29107	NC_013642	TCT	2	6	1418280	1418285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412839
29108	NC_013642	AG	3	6	1418312	1418317	50 %	0 %	50 %	0 %	281412839
29109	NC_013642	TG	3	6	1418338	1418343	0 %	50 %	50 %	0 %	281412839
29110	NC_013642	T	6	6	1418360	1418365	0 %	100 %	0 %	0 %	281412840
29111	NC_013642	T	7	7	1418367	1418373	0 %	100 %	0 %	0 %	281412840
29112	NC_013642	TTC	2	6	1418425	1418430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412840
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29115	NC_013642	TCTT	2	8	1418469	1418476	0 %	75 %	0 %	25 %	281412840
29116	NC_013642	CCCT	2	8	1418487	1418494	0 %	25 %	0 %	75 %	281412840
29117	NC_013642	ACC	3	9	1418503	1418511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412840
29118	NC_013642	ATCCAG	2	12	1418556	1418567	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	281412840
29119	NC_013642	TCT	2	6	1418628	1418633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412840
29120	NC_013642	AAC	2	6	1418655	1418660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412840
29121	NC_013642	AC	3	6	1418740	1418745	50 %	0 %	0 %	50 %	281412840
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29352	NC_013642	CCG	2	6	1429371	1429376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281412851
29353	NC_013642	AAG	2	6	1429385	1429390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412851
29354	NC_013642	AGC	2	6	1429420	1429425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412851
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29356	NC_013642	TTC	2	6	1429541	1429546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412851
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29358	NC_013642	CTTT	2	8	1429600	1429607	0 %	75 %	0 %	25 %	281412851
29359	NC_013642	CTT	2	6	1429659	1429664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412851
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29362	NC_013642	CAT	2	6	1429933	1429938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412851
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29364	NC_013642	CCG	2	6	1429993	1429998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281412852
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29369	NC_013642	CTTTT	2	10	1430224	1430233	0 %	80 %	0 %	20 %	281412852
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29371	NC_013642	TGA	2	6	1430369	1430374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412852
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29374	NC_013642	ATG	2	6	1430527	1430532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412852
29375	NC_013642	TC	3	6	1430638	1430643	0 %	50 %	0 %	50 %	281412852
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29471	NC_013642	GTC	2	6	1435245	1435250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412859
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29473	NC_013642	TGT	2	6	1435376	1435381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412859
29474	NC_013642	CGA	2	6	1435383	1435388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412859
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29476	NC_013642	GCT	2	6	1435423	1435428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412859
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