MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_013642	CATC	2	8	1145822	1145829	25 %	25 %	0 %	50 %	281412530
23502	NC_013642	AGG	2	6	1145903	1145908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412531
23503	NC_013642	T	6	6	1146032	1146037	0 %	100 %	0 %	0 %	281412531
23504	NC_013642	GGA	2	6	1146120	1146125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412531
23505	NC_013642	CTG	3	9	1146210	1146218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412531
23506	NC_013642	TC	3	6	1146241	1146246	0 %	50 %	0 %	50 %	281412531
23507	NC_013642	CTC	2	6	1146298	1146303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412531
23508	NC_013642	GAG	2	6	1146308	1146313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412531
23509	NC_013642	CAGA	2	8	1146350	1146357	50 %	0 %	25 %	25 %	281412531
23510	NC_013642	AAG	2	6	1146408	1146413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412531
23511	NC_013642	ATCC	2	8	1146498	1146505	25 %	25 %	0 %	50 %	281412531
23512	NC_013642	CGAT	2	8	1146506	1146513	25 %	25 %	25 %	25 %	281412531
23513	NC_013642	CTT	2	6	1146523	1146528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412531
23514	NC_013642	TCT	2	6	1146613	1146618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412531
23515	NC_013642	CGT	2	6	1146719	1146724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412531
23516	NC_013642	T	6	6	1146737	1146742	0 %	100 %	0 %	0 %	281412531
23517	NC_013642	CT	3	6	1146759	1146764	0 %	50 %	0 %	50 %	281412531
23518	NC_013642	TCGA	2	8	1146785	1146792	25 %	25 %	25 %	25 %	281412531
23519	NC_013642	GTT	2	6	1146800	1146805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412531
23520	NC_013642	A	6	6	1146861	1146866	100 %	0 %	0 %	0 %	281412531
23521	NC_013642	ACC	2	6	1146956	1146961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412531
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23523	NC_013642	ACC	2	6	1147009	1147014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412532
23524	NC_013642	AG	3	6	1147036	1147041	50 %	0 %	50 %	0 %	281412532
23525	NC_013642	TCC	2	6	1147046	1147051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412532
23526	NC_013642	GGAA	2	8	1147163	1147170	50 %	0 %	50 %	0 %	281412532
23527	NC_013642	TGG	2	6	1147172	1147177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412532
23528	NC_013642	GAG	2	6	1147178	1147183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412532
23529	NC_013642	AGG	2	6	1147300	1147305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412532
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23531	NC_013642	CACG	2	8	1147415	1147422	25 %	0 %	25 %	50 %	281412532
23532	NC_013642	CAG	2	6	1147433	1147438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412532
23533	NC_013642	TCCA	2	8	1147519	1147526	25 %	25 %	0 %	50 %	281412532
23534	NC_013642	CAG	2	6	1147547	1147552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412532
23535	NC_013642	TGT	2	6	1147573	1147578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412532
23536	NC_013642	GAAT	2	8	1147613	1147620	50 %	25 %	25 %	0 %	281412532
23537	NC_013642	GAG	2	6	1147621	1147626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412532
23538	NC_013642	TCC	3	9	1147644	1147652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412532
23539	NC_013642	TCC	3	9	1147736	1147744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412533
23540	NC_013642	T	7	7	1147768	1147774	0 %	100 %	0 %	0 %	281412533
23541	NC_013642	ATA	3	9	1147777	1147785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281412533
23542	NC_013642	GAG	2	6	1147864	1147869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412533
23543	NC_013642	AGAGG	2	10	1147889	1147898	40 %	0 %	60 %	0 %	281412533
23544	NC_013642	CGA	2	6	1147923	1147928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412533
23545	NC_013642	CTT	2	6	1147929	1147934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412533
23546	NC_013642	TCT	2	6	1148010	1148015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412533
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23550	NC_013642	CCAG	2	8	1148292	1148299	25 %	0 %	25 %	50 %	281412533
23551	NC_013642	ATCT	2	8	1148302	1148309	25 %	50 %	0 %	25 %	281412533
23552	NC_013642	CTTGC	2	10	1148347	1148356	0 %	40 %	20 %	40 %	281412533
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23554	NC_013642	GA	3	6	1148494	1148499	50 %	0 %	50 %	0 %	281412533
23555	NC_013642	ACT	2	6	1148597	1148602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412533
23556	NC_013642	CTT	2	6	1148628	1148633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412533
23557	NC_013642	T	6	6	1148647	1148652	0 %	100 %	0 %	0 %	281412533
23558	NC_013642	TCT	2	6	1148660	1148665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412533
23559	NC_013642	CAA	2	6	1148712	1148717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412533
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23563	NC_013642	CGA	2	6	1149053	1149058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412534
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23567	NC_013642	A	6	6	1149204	1149209	100 %	0 %	0 %	0 %	281412534
23568	NC_013642	A	7	7	1149225	1149231	100 %	0 %	0 %	0 %	281412534
23569	NC_013642	TA	3	6	1149233	1149238	50 %	50 %	0 %	0 %	281412534
23570	NC_013642	GGA	2	6	1149402	1149407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412534
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23572	NC_013642	TC	3	6	1149422	1149427	0 %	50 %	0 %	50 %	281412534
23573	NC_013642	GGA	2	6	1149429	1149434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412534
23574	NC_013642	TCC	2	6	1149506	1149511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412534
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23576	NC_013642	GA	3	6	1149542	1149547	50 %	0 %	50 %	0 %	281412534
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23579	NC_013642	AG	3	6	1149791	1149796	50 %	0 %	50 %	0 %	281412534
23580	NC_013642	TCG	2	6	1149850	1149855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412534
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23585	NC_013642	TACTTC	2	12	1150079	1150090	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	281412535
23586	NC_013642	T	6	6	1150110	1150115	0 %	100 %	0 %	0 %	281412535
23587	NC_013642	GA	3	6	1150150	1150155	50 %	0 %	50 %	0 %	281412535
23588	NC_013642	T	6	6	1150224	1150229	0 %	100 %	0 %	0 %	281412535
23589	NC_013642	TAG	2	6	1150281	1150286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412535
23590	NC_013642	ATC	2	6	1150293	1150298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412535
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23592	NC_013642	GT	3	6	1150413	1150418	0 %	50 %	50 %	0 %	281412535
23593	NC_013642	TTC	2	6	1150539	1150544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412535
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23597	NC_013642	CGAG	2	8	1150707	1150714	25 %	0 %	50 %	25 %	281412535
23598	NC_013642	GAA	2	6	1150715	1150720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412535
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23602	NC_013642	GAT	2	6	1150845	1150850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412536
23603	NC_013642	GA	3	6	1150932	1150937	50 %	0 %	50 %	0 %	281412536
23604	NC_013642	TTC	2	6	1150978	1150983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412536
23605	NC_013642	CCT	2	6	1150985	1150990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412536
23606	NC_013642	A	6	6	1151042	1151047	100 %	0 %	0 %	0 %	281412536
23607	NC_013642	CAT	2	6	1151058	1151063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412536
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23609	NC_013642	CAT	2	6	1151217	1151222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412536
23610	NC_013642	AAC	2	6	1151230	1151235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412536
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23612	NC_013642	GC	3	6	1151384	1151389	0 %	0 %	50 %	50 %	281412536
23613	NC_013642	TCG	2	6	1151516	1151521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412536
23614	NC_013642	GGC	2	6	1151523	1151528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281412536
23615	NC_013642	AGC	2	6	1151565	1151570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412536
23616	NC_013642	TGA	2	6	1151612	1151617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412536
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23618	NC_013642	TCT	2	6	1151712	1151717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412536
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23723	NC_013642	CGT	2	6	1156875	1156880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412544
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23727	NC_013642	TCC	2	6	1157209	1157214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412545
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23730	NC_013642	TCT	2	6	1157489	1157494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412546
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23732	NC_013642	TGTTTT	2	12	1157510	1157521	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	281412546
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23735	NC_013642	TAC	2	6	1157748	1157753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412546
23736	NC_013642	AT	3	6	1157754	1157759	50 %	50 %	0 %	0 %	281412546
23737	NC_013642	GTC	2	6	1157877	1157882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412546
23738	NC_013642	TGA	2	6	1157909	1157914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412546
23739	NC_013642	CCT	2	6	1157924	1157929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412546
23740	NC_013642	TGA	2	6	1157965	1157970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412546
23741	NC_013642	TCT	2	6	1157975	1157980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412546
23742	NC_013642	AGA	2	6	1158005	1158010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412546
23743	NC_013642	CTT	2	6	1158021	1158026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412546
23744	NC_013642	TCT	2	6	1158182	1158187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412546
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23746	NC_013642	CAT	2	6	1158404	1158409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412546
23747	NC_013642	AG	3	6	1158418	1158423	50 %	0 %	50 %	0 %	281412546
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23751	NC_013642	TGG	2	6	1158547	1158552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412546
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23755	NC_013642	CGCTC	2	10	1158674	1158683	0 %	20 %	20 %	60 %	281412546
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23841	NC_013642	TTTC	2	8	1163923	1163930	0 %	75 %	0 %	25 %	281412552
23842	NC_013642	CAC	3	9	1163933	1163941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412552
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23844	NC_013642	GA	3	6	1164000	1164005	50 %	0 %	50 %	0 %	281412552
23845	NC_013642	AGAGAA	2	12	1164008	1164019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412552
23846	NC_013642	CTG	2	6	1164034	1164039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412552
23847	NC_013642	T	6	6	1164084	1164089	0 %	100 %	0 %	0 %	281412552
23848	NC_013642	GAT	2	6	1164153	1164158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412552
23849	NC_013642	T	6	6	1164158	1164163	0 %	100 %	0 %	0 %	281412552
23850	NC_013642	GAA	2	6	1164231	1164236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412553
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23852	NC_013642	CATCCT	2	12	1164298	1164309	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	281412553
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