MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_013642	T	6	6	1048184	1048189	0 %	100 %	0 %	0 %	281412432
21502	NC_013642	CCTT	2	8	1048221	1048228	0 %	50 %	0 %	50 %	281412432
21503	NC_013642	CAC	2	6	1048249	1048254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412432
21504	NC_013642	AG	3	6	1048287	1048292	50 %	0 %	50 %	0 %	281412432
21505	NC_013642	TGA	2	6	1048299	1048304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412432
21506	NC_013642	CCA	2	6	1048320	1048325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412432
21507	NC_013642	CTCTC	2	10	1048344	1048353	0 %	40 %	0 %	60 %	281412432
21508	NC_013642	CTG	2	6	1048395	1048400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412432
21509	NC_013642	TG	3	6	1048408	1048413	0 %	50 %	50 %	0 %	281412432
21510	NC_013642	TTCT	2	8	1048414	1048421	0 %	75 %	0 %	25 %	281412432
21511	NC_013642	TCA	2	6	1048440	1048445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412432
21512	NC_013642	CGA	2	6	1048531	1048536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412433
21513	NC_013642	GAA	2	6	1048581	1048586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412433
21514	NC_013642	GA	3	6	1048615	1048620	50 %	0 %	50 %	0 %	281412433
21515	NC_013642	CTT	2	6	1048800	1048805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412433
21516	NC_013642	GAGG	2	8	1048823	1048830	25 %	0 %	75 %	0 %	281412433
21517	NC_013642	TGGAC	2	10	1048927	1048936	20 %	20 %	40 %	20 %	281412433
21518	NC_013642	CAG	2	6	1048967	1048972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412433
21519	NC_013642	AAGG	2	8	1048979	1048986	50 %	0 %	50 %	0 %	281412433
21520	NC_013642	CTA	2	6	1049111	1049116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412433
21521	NC_013642	GGA	2	6	1049213	1049218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412433
21522	NC_013642	TCG	2	6	1049236	1049241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412433
21523	NC_013642	GA	4	8	1049468	1049475	50 %	0 %	50 %	0 %	281412433
21524	NC_013642	GAA	2	6	1049493	1049498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412433
21525	NC_013642	GA	3	6	1049647	1049652	50 %	0 %	50 %	0 %	281412433
21526	NC_013642	TTC	2	6	1049658	1049663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412433
21527	NC_013642	GA	3	6	1049667	1049672	50 %	0 %	50 %	0 %	281412433
21528	NC_013642	TGG	2	6	1049736	1049741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412433
21529	NC_013642	GAA	2	6	1049796	1049801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412433
21530	NC_013642	GAA	2	6	1049913	1049918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412433
21531	NC_013642	CAT	2	6	1049972	1049977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412433
21532	NC_013642	CTT	2	6	1049978	1049983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412433
21533	NC_013642	ATG	2	6	1050003	1050008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412433
21534	NC_013642	GGAA	2	8	1050078	1050085	50 %	0 %	50 %	0 %	281412433
21535	NC_013642	TC	3	6	1050096	1050101	0 %	50 %	0 %	50 %	281412433
21536	NC_013642	CCGAT	2	10	1050145	1050154	20 %	20 %	20 %	40 %	281412433
21537	NC_013642	CGC	2	6	1050176	1050181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281412433
21538	NC_013642	AAG	2	6	1050228	1050233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412433
21539	NC_013642	GTTT	2	8	1050263	1050270	0 %	75 %	25 %	0 %	281412433
21540	NC_013642	TGA	2	6	1050271	1050276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412433
21541	NC_013642	CAA	2	6	1050347	1050352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412433
21542	NC_013642	GAA	2	6	1050360	1050365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412433
21543	NC_013642	GCA	2	6	1050402	1050407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412433
21544	NC_013642	CTT	2	6	1050422	1050427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412433
21545	NC_013642	GAT	2	6	1050432	1050437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412433
21546	NC_013642	AG	3	6	1050485	1050490	50 %	0 %	50 %	0 %	281412433
21547	NC_013642	AGA	2	6	1050569	1050574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412433
21548	NC_013642	GCG	2	6	1050697	1050702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281412433
21549	NC_013642	AG	3	6	1050742	1050747	50 %	0 %	50 %	0 %	281412433
21550	NC_013642	GAA	3	9	1050780	1050788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412433
21551	NC_013642	AGA	2	6	1050818	1050823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412433
21552	NC_013642	CCG	2	6	1050846	1050851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281412433
21553	NC_013642	AG	3	6	1050932	1050937	50 %	0 %	50 %	0 %	281412433
21554	NC_013642	AGAA	2	8	1050964	1050971	75 %	0 %	25 %	0 %	281412433
21555	NC_013642	GAA	2	6	1050986	1050991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412433
21556	NC_013642	CAAA	2	8	1050997	1051004	75 %	0 %	0 %	25 %	281412433
21557	NC_013642	GAA	2	6	1051038	1051043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412433
21558	NC_013642	GAAA	2	8	1051046	1051053	75 %	0 %	25 %	0 %	281412433
21559	NC_013642	ATCC	2	8	1051091	1051098	25 %	25 %	0 %	50 %	281412433
21560	NC_013642	GTG	3	9	1051158	1051166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412434
21561	NC_013642	GA	3	6	1051207	1051212	50 %	0 %	50 %	0 %	281412434
21562	NC_013642	CAC	2	6	1051221	1051226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412434
21563	NC_013642	TTC	2	6	1051227	1051232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412434
21564	NC_013642	CTT	2	6	1051294	1051299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412434
21565	NC_013642	GCTCC	2	10	1051322	1051331	0 %	20 %	20 %	60 %	281412434
21566	NC_013642	TTTC	2	8	1051334	1051341	0 %	75 %	0 %	25 %	281412434
21567	NC_013642	TTC	2	6	1051389	1051394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412434
21568	NC_013642	GTT	2	6	1051416	1051421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412434
21569	NC_013642	CTTCAC	2	12	1051422	1051433	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	281412434
21570	NC_013642	GTTTCC	2	12	1051551	1051562	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	281412435
21571	NC_013642	GAT	2	6	1051573	1051578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412435
21572	NC_013642	TAT	2	6	1051598	1051603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412435
21573	NC_013642	TTC	2	6	1051614	1051619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412435
21574	NC_013642	T	6	6	1051644	1051649	0 %	100 %	0 %	0 %	281412435
21575	NC_013642	T	6	6	1051757	1051762	0 %	100 %	0 %	0 %	281412435
21576	NC_013642	GTCGAA	2	12	1051763	1051774	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	281412435
21577	NC_013642	CA	3	6	1051814	1051819	50 %	0 %	0 %	50 %	281412435
21578	NC_013642	TTTC	2	8	1051852	1051859	0 %	75 %	0 %	25 %	281412435
21579	NC_013642	CCA	2	6	1051871	1051876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412435
21580	NC_013642	TCTT	2	8	1052298	1052305	0 %	75 %	0 %	25 %	281412436
21581	NC_013642	GA	3	6	1052437	1052442	50 %	0 %	50 %	0 %	281412436
21582	NC_013642	TGG	2	6	1052467	1052472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412436
21583	NC_013642	AGT	2	6	1052487	1052492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412436
21584	NC_013642	TCT	2	6	1052515	1052520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412436
21585	NC_013642	CT	3	6	1052519	1052524	0 %	50 %	0 %	50 %	281412436
21586	NC_013642	GAA	2	6	1052653	1052658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412436
21587	NC_013642	A	6	6	1052724	1052729	100 %	0 %	0 %	0 %	281412436
21588	NC_013642	GAA	2	6	1052736	1052741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412436
21589	NC_013642	GA	3	6	1052933	1052938	50 %	0 %	50 %	0 %	281412436
21590	NC_013642	A	6	6	1052971	1052976	100 %	0 %	0 %	0 %	281412436
21591	NC_013642	GAA	2	6	1053041	1053046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412437
21592	NC_013642	AAATTA	2	12	1053051	1053062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281412437
21593	NC_013642	GT	3	6	1053082	1053087	0 %	50 %	50 %	0 %	281412437
21594	NC_013642	A	6	6	1053088	1053093	100 %	0 %	0 %	0 %	281412437
21595	NC_013642	TGA	2	6	1053094	1053099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412437
21596	NC_013642	T	6	6	1053111	1053116	0 %	100 %	0 %	0 %	281412437
21597	NC_013642	TTC	2	6	1053191	1053196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412437
21598	NC_013642	GAAA	2	8	1053211	1053218	75 %	0 %	25 %	0 %	281412437
21599	NC_013642	AGA	2	6	1053239	1053244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412437
21600	NC_013642	TGA	2	6	1053303	1053308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412437
21601	NC_013642	GTA	2	6	1053407	1053412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412437
21602	NC_013642	ACTA	2	8	1053511	1053518	50 %	25 %	0 %	25 %	281412437
21603	NC_013642	CAT	2	6	1053525	1053530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412437
21604	NC_013642	AT	3	6	1053533	1053538	50 %	50 %	0 %	0 %	281412437
21605	NC_013642	A	6	6	1053592	1053597	100 %	0 %	0 %	0 %	281412437
21606	NC_013642	GAA	2	6	1053605	1053610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412437
21607	NC_013642	A	6	6	1053635	1053640	100 %	0 %	0 %	0 %	281412437
21608	NC_013642	TCT	2	6	1053686	1053691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412437
21609	NC_013642	TAG	2	6	1053708	1053713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412437
21610	NC_013642	GAA	2	6	1053721	1053726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412437
21611	NC_013642	TTC	2	6	1053737	1053742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412437
21612	NC_013642	AG	3	6	1053773	1053778	50 %	0 %	50 %	0 %	281412437
21613	NC_013642	CT	3	6	1053810	1053815	0 %	50 %	0 %	50 %	281412437
21614	NC_013642	A	6	6	1053828	1053833	100 %	0 %	0 %	0 %	281412437
21615	NC_013642	AG	3	6	1054028	1054033	50 %	0 %	50 %	0 %	281412437
21616	NC_013642	CAA	2	6	1054105	1054110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412437
21617	NC_013642	CCT	2	6	1054122	1054127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412437
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