MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_013642	GAA	2	6	1021883	1021888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412406
21002	NC_013642	GAG	2	6	1021905	1021910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412406
21003	NC_013642	GAA	2	6	1021915	1021920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412406
21004	NC_013642	TCCAGA	2	12	1021946	1021957	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	281412406
21005	NC_013642	GGAA	2	8	1021964	1021971	50 %	0 %	50 %	0 %	281412406
21006	NC_013642	AGA	2	6	1021997	1022002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412406
21007	NC_013642	CGG	2	6	1022015	1022020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281412406
21008	NC_013642	GGCA	2	8	1022051	1022058	25 %	0 %	50 %	25 %	281412406
21009	NC_013642	CTCGA	2	10	1022088	1022097	20 %	20 %	20 %	40 %	281412406
21010	NC_013642	T	6	6	1022112	1022117	0 %	100 %	0 %	0 %	281412406
21011	NC_013642	GTG	2	6	1022139	1022144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412406
21012	NC_013642	AGA	2	6	1022217	1022222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412406
21013	NC_013642	ACAA	2	8	1022223	1022230	75 %	0 %	0 %	25 %	281412406
21014	NC_013642	GGA	2	6	1022235	1022240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412406
21015	NC_013642	TGACG	2	10	1022375	1022384	20 %	20 %	40 %	20 %	281412406
21016	NC_013642	TCC	2	6	1022390	1022395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412406
21017	NC_013642	CGT	2	6	1022402	1022407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412406
21018	NC_013642	GT	3	6	1022406	1022411	0 %	50 %	50 %	0 %	281412406
21019	NC_013642	CGCT	2	8	1022419	1022426	0 %	25 %	25 %	50 %	281412406
21020	NC_013642	GTG	2	6	1022427	1022432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412406
21021	NC_013642	CGA	2	6	1022474	1022479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412406
21022	NC_013642	AGG	2	6	1022487	1022492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412406
21023	NC_013642	GAT	2	6	1022520	1022525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412406
21024	NC_013642	AGAA	2	8	1022604	1022611	75 %	0 %	25 %	0 %	281412407
21025	NC_013642	GAA	2	6	1022618	1022623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412407
21026	NC_013642	GAA	2	6	1022641	1022646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412407
21027	NC_013642	GAAAGA	2	12	1022670	1022681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412407
21028	NC_013642	CTT	2	6	1022683	1022688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412407
21029	NC_013642	GATC	2	8	1022742	1022749	25 %	25 %	25 %	25 %	281412407
21030	NC_013642	GAA	2	6	1022769	1022774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412407
21031	NC_013642	AGA	2	6	1022777	1022782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412407
21032	NC_013642	CT	3	6	1022783	1022788	0 %	50 %	0 %	50 %	281412407
21033	NC_013642	AAC	2	6	1022826	1022831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412407
21034	NC_013642	GA	3	6	1022850	1022855	50 %	0 %	50 %	0 %	281412407
21035	NC_013642	AG	3	6	1022862	1022867	50 %	0 %	50 %	0 %	281412407
21036	NC_013642	GA	3	6	1022873	1022878	50 %	0 %	50 %	0 %	281412407
21037	NC_013642	AAC	2	6	1022949	1022954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412407
21038	NC_013642	GAAA	2	8	1022985	1022992	75 %	0 %	25 %	0 %	281412407
21039	NC_013642	ATC	2	6	1023025	1023030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412407
21040	NC_013642	GGT	2	6	1023034	1023039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412407
21041	NC_013642	CAC	2	6	1023072	1023077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412407
21042	NC_013642	CTT	2	6	1023124	1023129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412407
21043	NC_013642	TAC	2	6	1023178	1023183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412407
21044	NC_013642	GGA	2	6	1023232	1023237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412407
21045	NC_013642	CTTT	2	8	1023295	1023302	0 %	75 %	0 %	25 %	281412407
21046	NC_013642	ACA	2	6	1023310	1023315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412407
21047	NC_013642	TGG	2	6	1023342	1023347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412407
21048	NC_013642	CGT	2	6	1023381	1023386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412407
21049	NC_013642	TCA	2	6	1023413	1023418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412407
21050	NC_013642	GATG	2	8	1023441	1023448	25 %	25 %	50 %	0 %	281412407
21051	NC_013642	GAGAA	2	10	1023541	1023550	60 %	0 %	40 %	0 %	281412407
21052	NC_013642	AC	3	6	1023657	1023662	50 %	0 %	0 %	50 %	281412407
21053	NC_013642	AAG	2	6	1023871	1023876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412407
21054	NC_013642	GAAA	2	8	1023912	1023919	75 %	0 %	25 %	0 %	281412407
21055	NC_013642	GGT	2	6	1023966	1023971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412407
21056	NC_013642	GTG	2	6	1023987	1023992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412408
21057	NC_013642	GAT	2	6	1024070	1024075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412408
21058	NC_013642	AGA	2	6	1024076	1024081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412408
21059	NC_013642	GGAA	2	8	1024086	1024093	50 %	0 %	50 %	0 %	281412408
21060	NC_013642	AGG	2	6	1024281	1024286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412408
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21062	NC_013642	GT	3	6	1024348	1024353	0 %	50 %	50 %	0 %	281412408
21063	NC_013642	A	6	6	1024382	1024387	100 %	0 %	0 %	0 %	281412408
21064	NC_013642	GAA	2	6	1024395	1024400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412408
21065	NC_013642	GAA	2	6	1024423	1024428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412409
21066	NC_013642	AG	3	6	1024523	1024528	50 %	0 %	50 %	0 %	281412409
21067	NC_013642	GA	3	6	1024544	1024549	50 %	0 %	50 %	0 %	281412409
21068	NC_013642	CCAG	2	8	1024577	1024584	25 %	0 %	25 %	50 %	281412409
21069	NC_013642	CCA	2	6	1024630	1024635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412409
21070	NC_013642	AAG	2	6	1024636	1024641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412409
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21072	NC_013642	TCC	2	6	1024774	1024779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412409
21073	NC_013642	AAG	2	6	1024780	1024785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412409
21074	NC_013642	CAG	2	6	1024840	1024845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412409
21075	NC_013642	AAC	2	6	1024867	1024872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412409
21076	NC_013642	ATC	2	6	1024931	1024936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412409
21077	NC_013642	GAA	2	6	1024987	1024992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412409
21078	NC_013642	ATC	3	9	1025000	1025008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412409
21079	NC_013642	CAA	2	6	1027014	1027019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412410
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21081	NC_013642	ACTG	2	8	1027056	1027063	25 %	25 %	25 %	25 %	281412410
21082	NC_013642	CAA	2	6	1027224	1027229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412410
21083	NC_013642	ATG	2	6	1027241	1027246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412410
21084	NC_013642	GATACC	2	12	1027252	1027263	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	281412410
21085	NC_013642	TGA	2	6	1027308	1027313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412410
21086	NC_013642	AC	3	6	1027317	1027322	50 %	0 %	0 %	50 %	281412410
21087	NC_013642	CTGA	2	8	1027351	1027358	25 %	25 %	25 %	25 %	281412410
21088	NC_013642	TGT	2	6	1027362	1027367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412410
21089	NC_013642	TTC	2	6	1027375	1027380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412410
21090	NC_013642	ATCT	2	8	1027408	1027415	25 %	50 %	0 %	25 %	281412410
21091	NC_013642	TTG	2	6	1027452	1027457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412410
21092	NC_013642	GT	3	6	1027480	1027485	0 %	50 %	50 %	0 %	281412410
21093	NC_013642	TGT	2	6	1027530	1027535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412410
21094	NC_013642	CTT	2	6	1027668	1027673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412410
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21097	NC_013642	AGA	2	6	1027726	1027731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412410
21098	NC_013642	TC	3	6	1027797	1027802	0 %	50 %	0 %	50 %	281412410
21099	NC_013642	TCT	2	6	1027874	1027879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412410
21100	NC_013642	CCT	2	6	1027922	1027927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412410
21101	NC_013642	TCC	2	6	1027930	1027935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412410
21102	NC_013642	ATG	3	9	1027955	1027963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412410
21103	NC_013642	CT	3	6	1027985	1027990	0 %	50 %	0 %	50 %	281412410
21104	NC_013642	CTTT	2	8	1027997	1028004	0 %	75 %	0 %	25 %	281412410
21105	NC_013642	CGG	2	6	1028037	1028042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281412410
21106	NC_013642	TTG	2	6	1028087	1028092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412410
21107	NC_013642	AAG	2	6	1028095	1028100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412410
21108	NC_013642	ACA	2	6	1028133	1028138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412411
21109	NC_013642	CCA	2	6	1028200	1028205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412411
21110	NC_013642	CAA	2	6	1028224	1028229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412411
21111	NC_013642	TTG	2	6	1028369	1028374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412411
21112	NC_013642	CCT	2	6	1028379	1028384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412411
21113	NC_013642	GTCT	2	8	1028410	1028417	0 %	50 %	25 %	25 %	281412411
21114	NC_013642	GACC	2	8	1028422	1028429	25 %	0 %	25 %	50 %	281412411
21115	NC_013642	CCT	2	6	1028450	1028455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412411
21116	NC_013642	TC	3	6	1028459	1028464	0 %	50 %	0 %	50 %	281412411
21117	NC_013642	GAA	2	6	1028527	1028532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412411
21118	NC_013642	TAT	2	6	1028702	1028707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412411
21119	NC_013642	GAAA	2	8	1028735	1028742	75 %	0 %	25 %	0 %	281412411
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21124	NC_013642	CTTGT	2	10	1028859	1028868	0 %	60 %	20 %	20 %	281412412
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21227	NC_013642	ATG	3	9	1033770	1033778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412416
21228	NC_013642	A	7	7	1033819	1033825	100 %	0 %	0 %	0 %	281412416
21229	NC_013642	GGA	2	6	1033865	1033870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412416
21230	NC_013642	A	6	6	1033920	1033925	100 %	0 %	0 %	0 %	281412416
21231	NC_013642	GAA	2	6	1033931	1033936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412416
21232	NC_013642	ACACA	2	10	1033989	1033998	60 %	0 %	0 %	40 %	281412416
21233	NC_013642	ACC	2	6	1034059	1034064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412416
21234	NC_013642	GAT	2	6	1034102	1034107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412416
21235	NC_013642	CTAA	2	8	1034114	1034121	50 %	25 %	0 %	25 %	281412416
21236	NC_013642	CT	3	6	1034152	1034157	0 %	50 %	0 %	50 %	281412416
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21349	NC_013642	GA	3	6	1040477	1040482	50 %	0 %	50 %	0 %	281412423
21350	NC_013642	TCT	2	6	1040486	1040491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412423
21351	NC_013642	GA	3	6	1040519	1040524	50 %	0 %	50 %	0 %	281412423
21352	NC_013642	GT	4	8	1040540	1040547	0 %	50 %	50 %	0 %	281412423
21353	NC_013642	AGA	3	9	1040568	1040576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412423
21354	NC_013642	GAG	3	9	1040604	1040612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412423
21355	NC_013642	GCA	2	6	1040666	1040671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412423
21356	NC_013642	CGT	2	6	1040832	1040837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412423
21357	NC_013642	CA	3	6	1040876	1040881	50 %	0 %	0 %	50 %	281412423
21358	NC_013642	ATC	2	6	1040944	1040949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412423
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21360	NC_013642	GA	3	6	1040989	1040994	50 %	0 %	50 %	0 %	281412423
21361	NC_013642	AGGA	2	8	1041003	1041010	50 %	0 %	50 %	0 %	281412423
21362	NC_013642	AG	3	6	1041038	1041043	50 %	0 %	50 %	0 %	281412424
21363	NC_013642	CGA	2	6	1041139	1041144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412424
21364	NC_013642	AG	3	6	1041159	1041164	50 %	0 %	50 %	0 %	281412424
21365	NC_013642	ACT	2	6	1041198	1041203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412424
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21369	NC_013642	TCCC	2	8	1041488	1041495	0 %	25 %	0 %	75 %	281412424
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21468	NC_013642	CTT	2	6	1046500	1046505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412430
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21471	NC_013642	CT	3	6	1046595	1046600	0 %	50 %	0 %	50 %	281412430
21472	NC_013642	CTT	2	6	1046604	1046609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412430
21473	NC_013642	CTCG	2	8	1046610	1046617	0 %	25 %	25 %	50 %	281412430
21474	NC_013642	TTCT	2	8	1046618	1046625	0 %	75 %	0 %	25 %	281412430
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