MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_013642	ATC	2	6	949444	949449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412337
19502	NC_013642	GA	3	6	949467	949472	50 %	0 %	50 %	0 %	281412337
19503	NC_013642	TGT	2	6	949509	949514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412337
19504	NC_013642	AC	3	6	949526	949531	50 %	0 %	0 %	50 %	281412337
19505	NC_013642	CTT	3	9	949560	949568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412337
19506	NC_013642	GGT	2	6	949681	949686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412337
19507	NC_013642	GAA	2	6	949780	949785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412337
19508	NC_013642	AAACGA	2	12	949830	949841	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	281412337
19509	NC_013642	CA	3	6	949893	949898	50 %	0 %	0 %	50 %	281412337
19510	NC_013642	TGA	2	6	949980	949985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412337
19511	NC_013642	GA	3	6	950003	950008	50 %	0 %	50 %	0 %	281412337
19512	NC_013642	GA	3	6	950058	950063	50 %	0 %	50 %	0 %	281412337
19513	NC_013642	ACA	2	6	950089	950094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412337
19514	NC_013642	TCG	2	6	950175	950180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412337
19515	NC_013642	ACA	2	6	950197	950202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412337
19516	NC_013642	TAC	2	6	950263	950268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412337
19517	NC_013642	AGCAC	2	10	950295	950304	40 %	0 %	20 %	40 %	281412337
19518	NC_013642	GAG	2	6	950359	950364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412337
19519	NC_013642	CAGG	2	8	950367	950374	25 %	0 %	50 %	25 %	281412337
19520	NC_013642	TGT	2	6	950391	950396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412337
19521	NC_013642	GAAAA	2	10	950410	950419	80 %	0 %	20 %	0 %	281412337
19522	NC_013642	GAA	2	6	950585	950590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412338
19523	NC_013642	TGT	2	6	950599	950604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412338
19524	NC_013642	TGC	2	6	950617	950622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412338
19525	NC_013642	GTTT	2	8	950630	950637	0 %	75 %	25 %	0 %	281412338
19526	NC_013642	CAA	2	6	950678	950683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412338
19527	NC_013642	GCG	2	6	950775	950780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281412338
19528	NC_013642	GCAG	2	8	950783	950790	25 %	0 %	50 %	25 %	281412338
19529	NC_013642	AGA	2	6	950791	950796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412338
19530	NC_013642	CAA	2	6	950957	950962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412338
19531	NC_013642	GCTCA	2	10	950997	951006	20 %	20 %	20 %	40 %	281412338
19532	NC_013642	GCT	2	6	951066	951071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412338
19533	NC_013642	ACT	2	6	951118	951123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412338
19534	NC_013642	ATG	3	9	951175	951183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412338
19535	NC_013642	TTG	2	6	951265	951270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412338
19536	NC_013642	ATT	2	6	951285	951290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412338
19537	NC_013642	GGA	2	6	951300	951305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412338
19538	NC_013642	AG	3	6	951310	951315	50 %	0 %	50 %	0 %	281412338
19539	NC_013642	A	6	6	951469	951474	100 %	0 %	0 %	0 %	281412338
19540	NC_013642	A	6	6	951490	951495	100 %	0 %	0 %	0 %	281412338
19541	NC_013642	AAG	2	6	951535	951540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412338
19542	NC_013642	TGA	2	6	951590	951595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412338
19543	NC_013642	GAA	2	6	951611	951616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412338
19544	NC_013642	GAA	2	6	951750	951755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412339
19545	NC_013642	ACG	2	6	951823	951828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412339
19546	NC_013642	ATC	2	6	951916	951921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412339
19547	NC_013642	GATG	2	8	951987	951994	25 %	25 %	50 %	0 %	281412339
19548	NC_013642	ATTGG	2	10	952027	952036	20 %	40 %	40 %	0 %	281412339
19549	NC_013642	GGTAGG	2	12	952038	952049	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	281412339
19550	NC_013642	TCA	2	6	952100	952105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412339
19551	NC_013642	TGA	2	6	952148	952153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412339
19552	NC_013642	AG	3	6	952182	952187	50 %	0 %	50 %	0 %	281412339
19553	NC_013642	AGG	2	6	952314	952319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412339
19554	NC_013642	TGG	2	6	952340	952345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412339
19555	NC_013642	AGAC	2	8	952352	952359	50 %	0 %	25 %	25 %	281412339
19556	NC_013642	AGC	2	6	952398	952403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412339
19557	NC_013642	CTTT	2	8	952413	952420	0 %	75 %	0 %	25 %	281412339
19558	NC_013642	AGG	2	6	952497	952502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412339
19559	NC_013642	TGG	2	6	952515	952520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412339
19560	NC_013642	GAT	2	6	952581	952586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412339
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19562	NC_013642	GTG	2	6	952619	952624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412339
19563	NC_013642	ATC	2	6	952637	952642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412339
19564	NC_013642	ATAGCG	2	12	952643	952654	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	281412339
19565	NC_013642	AGG	2	6	952667	952672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412339
19566	NC_013642	AG	3	6	952678	952683	50 %	0 %	50 %	0 %	281412339
19567	NC_013642	TAG	2	6	952787	952792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412339
19568	NC_013642	TGA	2	6	952820	952825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412339
19569	NC_013642	ATA	2	6	952828	952833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281412339
19570	NC_013642	TGA	2	6	952851	952856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412339
19571	NC_013642	AGGG	2	8	952875	952882	25 %	0 %	75 %	0 %	281412339
19572	NC_013642	GAAGA	2	10	952996	953005	60 %	0 %	40 %	0 %	281412339
19573	NC_013642	AAG	2	6	953026	953031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412339
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19575	NC_013642	AGAT	2	8	953078	953085	50 %	25 %	25 %	0 %	281412339
19576	NC_013642	GAG	2	6	953089	953094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412339
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19580	NC_013642	CTCTT	2	10	953190	953199	0 %	60 %	0 %	40 %	281412339
19581	NC_013642	AAT	2	6	953262	953267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281412339
19582	NC_013642	GA	3	6	953325	953330	50 %	0 %	50 %	0 %	281412339
19583	NC_013642	GAAA	2	8	953370	953377	75 %	0 %	25 %	0 %	281412339
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19586	NC_013642	AAG	2	6	953426	953431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412339
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19588	NC_013642	GAG	2	6	953508	953513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412339
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19591	NC_013642	AGGGG	2	10	953596	953605	20 %	0 %	80 %	0 %	281412339
19592	NC_013642	AG	3	6	953624	953629	50 %	0 %	50 %	0 %	281412339
19593	NC_013642	GAA	2	6	953691	953696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412339
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19595	NC_013642	AG	3	6	953788	953793	50 %	0 %	50 %	0 %	281412339
19596	NC_013642	CAG	2	6	953881	953886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412339
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19599	NC_013642	AAG	2	6	954008	954013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412339
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19603	NC_013642	AAG	2	6	954119	954124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412339
19604	NC_013642	GCT	2	6	954151	954156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412339
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19606	NC_013642	TCT	2	6	954232	954237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412340
19607	NC_013642	TCG	2	6	954354	954359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412340
19608	NC_013642	TGG	2	6	954360	954365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412340
19609	NC_013642	GA	3	6	954390	954395	50 %	0 %	50 %	0 %	281412340
19610	NC_013642	AATC	2	8	954510	954517	50 %	25 %	0 %	25 %	281412340
19611	NC_013642	GGAGA	2	10	954551	954560	40 %	0 %	60 %	0 %	281412340
19612	NC_013642	TTC	2	6	954642	954647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412340
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19615	NC_013642	AG	3	6	954931	954936	50 %	0 %	50 %	0 %	281412341
19616	NC_013642	GTG	2	6	955021	955026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412341
19617	NC_013642	AAAG	2	8	955044	955051	75 %	0 %	25 %	0 %	281412341
19618	NC_013642	TGGA	2	8	955141	955148	25 %	25 %	50 %	0 %	281412341
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19620	NC_013642	AAC	2	6	955270	955275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412341
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19727	NC_013642	CGAT	2	8	960009	960016	25 %	25 %	25 %	25 %	281412345
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19739	NC_013642	CAA	2	6	960631	960636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412345
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19983	NC_013642	TAA	2	6	973430	973435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281412357
19984	NC_013642	GATAA	2	10	973456	973465	60 %	20 %	20 %	0 %	281412357
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19987	NC_013642	AGGA	2	8	973691	973698	50 %	0 %	50 %	0 %	281412357
19988	NC_013642	AAT	2	6	973728	973733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281412357
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19991	NC_013642	CTT	2	6	973788	973793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412357
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19999	NC_013642	TTC	2	6	974134	974139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412358
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