MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_013642	CTC	2	6	799399	799404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412201
16502	NC_013642	TCG	2	6	799422	799427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412201
16503	NC_013642	GAGAG	2	10	799475	799484	40 %	0 %	60 %	0 %	281412201
16504	NC_013642	GCT	2	6	799498	799503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412201
16505	NC_013642	T	7	7	799547	799553	0 %	100 %	0 %	0 %	281412201
16506	NC_013642	TTC	2	6	799622	799627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412201
16507	NC_013642	TTA	2	6	799722	799727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412202
16508	NC_013642	T	6	6	799770	799775	0 %	100 %	0 %	0 %	281412202
16509	NC_013642	CTTT	2	8	799811	799818	0 %	75 %	0 %	25 %	281412202
16510	NC_013642	CTC	2	6	799829	799834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412202
16511	NC_013642	CTTT	2	8	799847	799854	0 %	75 %	0 %	25 %	281412202
16512	NC_013642	TCT	2	6	799868	799873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412202
16513	NC_013642	ATG	2	6	799900	799905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412202
16514	NC_013642	ACC	2	6	799921	799926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412202
16515	NC_013642	ACC	2	6	799951	799956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412202
16516	NC_013642	CTC	2	6	799962	799967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412202
16517	NC_013642	TCT	2	6	800072	800077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412202
16518	NC_013642	CAT	2	6	800094	800099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412202
16519	NC_013642	GAA	2	6	800126	800131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412202
16520	NC_013642	CCT	2	6	800132	800137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412202
16521	NC_013642	ATG	2	6	800149	800154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412202
16522	NC_013642	TTG	2	6	800161	800166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412202
16523	NC_013642	TCT	2	6	800260	800265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412202
16524	NC_013642	ATC	2	6	800358	800363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412202
16525	NC_013642	CTT	2	6	800456	800461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412202
16526	NC_013642	TCCT	2	8	800489	800496	0 %	50 %	0 %	50 %	281412202
16527	NC_013642	AAG	2	6	800511	800516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412202
16528	NC_013642	AG	3	6	800536	800541	50 %	0 %	50 %	0 %	281412202
16529	NC_013642	AAG	2	6	800562	800567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412202
16530	NC_013642	TC	3	6	800580	800585	0 %	50 %	0 %	50 %	281412202
16531	NC_013642	AG	3	6	800607	800612	50 %	0 %	50 %	0 %	281412202
16532	NC_013642	TTTC	2	8	800615	800622	0 %	75 %	0 %	25 %	281412202
16533	NC_013642	GCT	2	6	800679	800684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412202
16534	NC_013642	GA	3	6	800697	800702	50 %	0 %	50 %	0 %	281412202
16535	NC_013642	T	7	7	800751	800757	0 %	100 %	0 %	0 %	281412202
16536	NC_013642	TC	3	6	800866	800871	0 %	50 %	0 %	50 %	281412202
16537	NC_013642	ACA	2	6	800875	800880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412202
16538	NC_013642	TGT	2	6	800909	800914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412202
16539	NC_013642	GAT	2	6	800919	800924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412202
16540	NC_013642	AGT	2	6	800927	800932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412202
16541	NC_013642	GAG	2	6	800982	800987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412202
16542	NC_013642	TCTT	2	8	800998	801005	0 %	75 %	0 %	25 %	281412202
16543	NC_013642	T	6	6	801010	801015	0 %	100 %	0 %	0 %	281412202
16544	NC_013642	GCC	2	6	801035	801040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281412202
16545	NC_013642	GTC	2	6	801051	801056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412202
16546	NC_013642	TCA	2	6	801074	801079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412202
16547	NC_013642	GAA	2	6	801324	801329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412203
16548	NC_013642	AAC	2	6	801341	801346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412203
16549	NC_013642	GTG	2	6	801394	801399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412203
16550	NC_013642	ATT	2	6	801432	801437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412203
16551	NC_013642	AGAA	2	8	801487	801494	75 %	0 %	25 %	0 %	281412203
16552	NC_013642	AAAG	2	8	801515	801522	75 %	0 %	25 %	0 %	281412203
16553	NC_013642	GAA	2	6	801644	801649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412204
16554	NC_013642	TC	3	6	801690	801695	0 %	50 %	0 %	50 %	281412204
16555	NC_013642	CTC	2	6	801715	801720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412204
16556	NC_013642	CGA	2	6	801721	801726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412204
16557	NC_013642	T	6	6	801769	801774	0 %	100 %	0 %	0 %	281412204
16558	NC_013642	AAG	2	6	801805	801810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412204
16559	NC_013642	TCT	2	6	801819	801824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412204
16560	NC_013642	TCA	2	6	801900	801905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412204
16561	NC_013642	CTTT	2	8	801946	801953	0 %	75 %	0 %	25 %	281412204
16562	NC_013642	TCCGAG	2	12	801986	801997	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	281412204
16563	NC_013642	ATC	2	6	802034	802039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412204
16564	NC_013642	TCA	2	6	802084	802089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412204
16565	NC_013642	TG	4	8	802092	802099	0 %	50 %	50 %	0 %	281412204
16566	NC_013642	AAC	2	6	802118	802123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412204
16567	NC_013642	GGT	2	6	802128	802133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412204
16568	NC_013642	A	7	7	802152	802158	100 %	0 %	0 %	0 %	281412204
16569	NC_013642	CAA	2	6	802192	802197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412204
16570	NC_013642	TGC	2	6	802229	802234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412204
16571	NC_013642	GAG	2	6	802247	802252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412204
16572	NC_013642	TTC	2	6	802326	802331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412204
16573	NC_013642	GGT	2	6	802354	802359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412204
16574	NC_013642	GCC	2	6	802365	802370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281412204
16575	NC_013642	CAC	2	6	802379	802384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412204
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16577	NC_013642	CAA	2	6	802432	802437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412204
16578	NC_013642	CCG	2	6	802465	802470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281412204
16579	NC_013642	AAC	2	6	802522	802527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412205
16580	NC_013642	TTTCC	2	10	802536	802545	0 %	60 %	0 %	40 %	281412205
16581	NC_013642	CTT	2	6	802554	802559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412205
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16583	NC_013642	CAT	2	6	802606	802611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412205
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16585	NC_013642	TTC	2	6	802637	802642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412205
16586	NC_013642	CT	3	6	802662	802667	0 %	50 %	0 %	50 %	281412205
16587	NC_013642	CTT	2	6	802675	802680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412205
16588	NC_013642	TTC	2	6	802766	802771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412205
16589	NC_013642	ATC	2	6	802810	802815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412205
16590	NC_013642	CAA	2	6	802842	802847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412205
16591	NC_013642	TC	3	6	802902	802907	0 %	50 %	0 %	50 %	281412205
16592	NC_013642	T	6	6	802921	802926	0 %	100 %	0 %	0 %	281412205
16593	NC_013642	TGG	2	6	802953	802958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412205
16594	NC_013642	CTC	2	6	803004	803009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412205
16595	NC_013642	TTCC	2	8	803066	803073	0 %	50 %	0 %	50 %	281412205
16596	NC_013642	TGG	2	6	803080	803085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412205
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16600	NC_013642	CT	3	6	803226	803231	0 %	50 %	0 %	50 %	281412205
16601	NC_013642	GCT	2	6	803246	803251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412205
16602	NC_013642	CAG	2	6	803254	803259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412205
16603	NC_013642	AAC	2	6	803266	803271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412205
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16605	NC_013642	TTC	2	6	803495	803500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412205
16606	NC_013642	TAT	2	6	803515	803520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412205
16607	NC_013642	T	6	6	803576	803581	0 %	100 %	0 %	0 %	281412205
16608	NC_013642	AGA	2	6	803606	803611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412205
16609	NC_013642	GTT	2	6	803650	803655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412205
16610	NC_013642	CTG	2	6	803680	803685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412205
16611	NC_013642	CTGC	2	8	803826	803833	0 %	25 %	25 %	50 %	281412206
16612	NC_013642	TTC	2	6	803855	803860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412206
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16615	NC_013642	TC	3	6	804016	804021	0 %	50 %	0 %	50 %	281412206
16616	NC_013642	TTC	2	6	804051	804056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412206
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16618	NC_013642	ATGA	2	8	804226	804233	50 %	25 %	25 %	0 %	281412207
16619	NC_013642	GAA	2	6	804334	804339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412207
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16621	NC_013642	CAGTG	2	10	804475	804484	20 %	20 %	40 %	20 %	281412207
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16737	NC_013642	CT	3	6	810614	810619	0 %	50 %	0 %	50 %	281412212
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16744	NC_013642	TCT	2	6	811346	811351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412213
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16750	NC_013642	AG	3	6	811547	811552	50 %	0 %	50 %	0 %	281412213
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