MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013642	TGT	3	9	47619	47627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411496
1002	NC_013642	GAA	2	6	47628	47633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411496
1003	NC_013642	GCT	2	6	47634	47639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411496
1004	NC_013642	GGA	2	6	47698	47703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411496
1005	NC_013642	CTC	2	6	47771	47776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411496
1006	NC_013642	AGA	2	6	47836	47841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411496
1007	NC_013642	ACT	2	6	47858	47863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411496
1008	NC_013642	CTG	2	6	47896	47901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411496
1009	NC_013642	GAA	2	6	47926	47931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411496
1010	NC_013642	GAC	2	6	47977	47982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411496
1011	NC_013642	TCTCA	2	10	47985	47994	20 %	40 %	0 %	40 %	281411496
1012	NC_013642	CTG	2	6	47996	48001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411496
1013	NC_013642	AG	3	6	48012	48017	50 %	0 %	50 %	0 %	281411496
1014	NC_013642	ACT	2	6	48050	48055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411496
1015	NC_013642	A	7	7	48107	48113	100 %	0 %	0 %	0 %	281411496
1016	NC_013642	ATC	2	6	48233	48238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411497
1017	NC_013642	GTG	2	6	48246	48251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411497
1018	NC_013642	GCC	2	6	48273	48278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411497
1019	NC_013642	CTT	2	6	48312	48317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411497
1020	NC_013642	TCT	2	6	48388	48393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411497
1021	NC_013642	ATT	2	6	48398	48403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411497
1022	NC_013642	ACA	2	6	48446	48451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411497
1023	NC_013642	AGT	2	6	48486	48491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411497
1024	NC_013642	TTC	2	6	48514	48519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411497
1025	NC_013642	CTT	2	6	48540	48545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411497
1026	NC_013642	ATG	3	9	48587	48595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411497
1027	NC_013642	CTGT	2	8	48629	48636	0 %	50 %	25 %	25 %	281411497
1028	NC_013642	CGT	2	6	48645	48650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411497
1029	NC_013642	TCA	2	6	48701	48706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411497
1030	NC_013642	TCT	3	9	48727	48735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411497
1031	NC_013642	ACC	2	6	48754	48759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411497
1032	NC_013642	AGGAAG	2	12	48923	48934	50 %	0 %	50 %	0 %	281411497
1033	NC_013642	TCC	2	6	49010	49015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411497
1034	NC_013642	TGG	2	6	49031	49036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411497
1035	NC_013642	CTTTTC	2	12	49060	49071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411497
1036	NC_013642	ACCAG	2	10	49099	49108	40 %	0 %	20 %	40 %	281411497
1037	NC_013642	TTCT	2	8	49195	49202	0 %	75 %	0 %	25 %	281411497
1038	NC_013642	CTT	2	6	49215	49220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411497
1039	NC_013642	TCG	2	6	49244	49249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411497
1040	NC_013642	T	6	6	49272	49277	0 %	100 %	0 %	0 %	281411497
1041	NC_013642	TGC	2	6	49339	49344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411497
1042	NC_013642	TCTG	2	8	49384	49391	0 %	50 %	25 %	25 %	281411497
1043	NC_013642	TCT	2	6	49436	49441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411497
1044	NC_013642	CTC	2	6	49459	49464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411497
1045	NC_013642	TTC	2	6	49472	49477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411497
1046	NC_013642	TCC	2	6	49502	49507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411497
1047	NC_013642	TC	3	6	49517	49522	0 %	50 %	0 %	50 %	281411497
1048	NC_013642	TCT	2	6	49540	49545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411497
1049	NC_013642	ACCA	2	8	49681	49688	50 %	0 %	0 %	50 %	281411497
1050	NC_013642	GT	3	6	49691	49696	0 %	50 %	50 %	0 %	281411497
1051	NC_013642	T	6	6	49719	49724	0 %	100 %	0 %	0 %	281411497
1052	NC_013642	TCA	2	6	49734	49739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411497
1053	NC_013642	TTC	2	6	49765	49770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411497
1054	NC_013642	ATC	2	6	49799	49804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411497
1055	NC_013642	CCA	2	6	49815	49820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411497
1056	NC_013642	TG	3	6	49874	49879	0 %	50 %	50 %	0 %	281411497
1057	NC_013642	GTT	2	6	49933	49938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411497
1058	NC_013642	CTT	2	6	50079	50084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411497
1059	NC_013642	TCT	2	6	50097	50102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411497
1060	NC_013642	GCGT	2	8	50150	50157	0 %	25 %	50 %	25 %	281411497
1061	NC_013642	TC	3	6	50165	50170	0 %	50 %	0 %	50 %	281411497
1062	NC_013642	GAAG	2	8	50181	50188	50 %	0 %	50 %	0 %	281411497
1063	NC_013642	GTA	2	6	50293	50298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411497
1064	NC_013642	TCC	2	6	50324	50329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411497
1065	NC_013642	CTT	2	6	50343	50348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411497
1066	NC_013642	TTTC	2	8	50444	50451	0 %	75 %	0 %	25 %	281411497
1067	NC_013642	TCC	2	6	50459	50464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411497
1068	NC_013642	GGA	2	6	50832	50837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411498
1069	NC_013642	ATC	2	6	50845	50850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411498
1070	NC_013642	AGG	2	6	50871	50876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411498
1071	NC_013642	AGA	2	6	50958	50963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411498
1072	NC_013642	TCT	2	6	51027	51032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411498
1073	NC_013642	GA	3	6	51104	51109	50 %	0 %	50 %	0 %	281411498
1074	NC_013642	GA	4	8	51127	51134	50 %	0 %	50 %	0 %	281411498
1075	NC_013642	GAAGA	2	10	51241	51250	60 %	0 %	40 %	0 %	281411498
1076	NC_013642	ACT	2	6	51301	51306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411498
1077	NC_013642	GA	3	6	51327	51332	50 %	0 %	50 %	0 %	281411498
1078	NC_013642	CAA	2	6	51377	51382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411498
1079	NC_013642	GGA	2	6	51453	51458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411498
1080	NC_013642	TCT	2	6	51459	51464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411498
1081	NC_013642	GGT	2	6	51472	51477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411498
1082	NC_013642	GGA	2	6	51507	51512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411498
1083	NC_013642	AGA	3	9	51585	51593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411498
1084	NC_013642	AG	3	6	51598	51603	50 %	0 %	50 %	0 %	281411498
1085	NC_013642	AGCGG	2	10	51636	51645	20 %	0 %	60 %	20 %	281411498
1086	NC_013642	AGG	2	6	51654	51659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411498
1087	NC_013642	A	6	6	51815	51820	100 %	0 %	0 %	0 %	281411499
1088	NC_013642	GA	3	6	51845	51850	50 %	0 %	50 %	0 %	281411499
1089	NC_013642	GAA	2	6	51866	51871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411499
1090	NC_013642	GAGTGA	2	12	51917	51928	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	281411499
1091	NC_013642	A	6	6	51936	51941	100 %	0 %	0 %	0 %	281411500
1092	NC_013642	TTC	2	6	52001	52006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411500
1093	NC_013642	AGAA	2	8	52018	52025	75 %	0 %	25 %	0 %	281411500
1094	NC_013642	TCCC	2	8	52044	52051	0 %	25 %	0 %	75 %	281411500
1095	NC_013642	AG	3	6	52053	52058	50 %	0 %	50 %	0 %	281411500
1096	NC_013642	GGAA	2	8	52079	52086	50 %	0 %	50 %	0 %	281411500
1097	NC_013642	CGC	2	6	52111	52116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411500
1098	NC_013642	T	6	6	52133	52138	0 %	100 %	0 %	0 %	281411500
1099	NC_013642	GAA	2	6	52208	52213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411500
1100	NC_013642	TGA	2	6	52215	52220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411500
1101	NC_013642	GAA	2	6	52247	52252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411500
1102	NC_013642	GAA	2	6	52270	52275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411500
1103	NC_013642	TGC	2	6	52290	52295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411500
1104	NC_013642	A	8	8	52327	52334	100 %	0 %	0 %	0 %	281411500
1105	NC_013642	CAG	2	6	52347	52352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411500
1106	NC_013642	GGA	2	6	52391	52396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411500
1107	NC_013642	T	7	7	52405	52411	0 %	100 %	0 %	0 %	281411500
1108	NC_013642	T	6	6	52441	52446	0 %	100 %	0 %	0 %	281411500
1109	NC_013642	CT	3	6	52472	52477	0 %	50 %	0 %	50 %	281411500
1110	NC_013642	CAT	2	6	52564	52569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411500
1111	NC_013642	TGTGAT	2	12	52609	52620	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	281411500
1112	NC_013642	CGG	2	6	52681	52686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411500
1113	NC_013642	CGA	2	6	52704	52709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411500
1114	NC_013642	TGG	2	6	52842	52847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411500
1115	NC_013642	TGA	2	6	52881	52886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411500
1116	NC_013642	AGGT	2	8	52953	52960	25 %	25 %	50 %	0 %	281411500
1117	NC_013642	A	6	6	52968	52973	100 %	0 %	0 %	0 %	281411500
1118	NC_013642	GA	3	6	53011	53016	50 %	0 %	50 %	0 %	281411500
1119	NC_013642	A	6	6	53021	53026	100 %	0 %	0 %	0 %	281411500
1120	NC_013642	TC	3	6	53099	53104	0 %	50 %	0 %	50 %	281411500
1121	NC_013642	A	6	6	53166	53171	100 %	0 %	0 %	0 %	281411500
1122	NC_013642	GAA	2	6	53231	53236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411500
1123	NC_013642	CGGT	2	8	53304	53311	0 %	25 %	50 %	25 %	281411500
1124	NC_013642	TCAC	2	8	53332	53339	25 %	25 %	0 %	50 %	281411500
1125	NC_013642	T	6	6	53350	53355	0 %	100 %	0 %	0 %	281411500
1126	NC_013642	GGA	2	6	53420	53425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411500
1127	NC_013642	CGC	2	6	53431	53436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411500
1128	NC_013642	AG	3	6	53447	53452	50 %	0 %	50 %	0 %	281411500
1129	NC_013642	AGA	2	6	53476	53481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411500
1130	NC_013642	GAA	2	6	53484	53489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411500
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1133	NC_013642	ATC	2	6	53631	53636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411500
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1158	NC_013642	TTCG	2	8	54769	54776	0 %	50 %	25 %	25 %	281411502
1159	NC_013642	TAT	2	6	54793	54798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411502
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1253	NC_013642	AG	3	6	59784	59789	50 %	0 %	50 %	0 %	281411509
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1255	NC_013642	TCT	2	6	59861	59866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411509
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1372	NC_013642	TCTT	2	8	64598	64605	0 %	75 %	0 %	25 %	281411515
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1375	NC_013642	TTC	2	6	64789	64794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411515
1376	NC_013642	TCTT	2	8	64874	64881	0 %	75 %	0 %	25 %	281411515
1377	NC_013642	TC	3	6	64892	64897	0 %	50 %	0 %	50 %	281411515
1378	NC_013642	ATTC	2	8	64966	64973	25 %	50 %	0 %	25 %	281411515
1379	NC_013642	CCT	2	6	64980	64985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411516
1380	NC_013642	ATCT	2	8	64987	64994	25 %	50 %	0 %	25 %	281411516
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1382	NC_013642	GTTC	2	8	65190	65197	0 %	50 %	25 %	25 %	281411516
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1497	NC_013642	GA	3	6	70715	70720	50 %	0 %	50 %	0 %	281411521
1498	NC_013642	GGC	2	6	70724	70729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411521
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