MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_013642	GA	3	6	677458	677463	50 %	0 %	50 %	0 %	281412088
14002	NC_013642	TCC	2	6	677487	677492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412089
14003	NC_013642	CGA	2	6	677521	677526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412089
14004	NC_013642	TTC	2	6	677598	677603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412089
14005	NC_013642	TGT	2	6	677614	677619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412089
14006	NC_013642	GT	3	6	677648	677653	0 %	50 %	50 %	0 %	281412089
14007	NC_013642	ATG	2	6	677661	677666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412089
14008	NC_013642	CT	3	6	677681	677686	0 %	50 %	0 %	50 %	281412089
14009	NC_013642	GAG	2	6	677696	677701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412089
14010	NC_013642	CCT	2	6	677712	677717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412089
14011	NC_013642	GGA	2	6	677720	677725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412089
14012	NC_013642	CCA	2	6	677814	677819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412089
14013	NC_013642	CTT	2	6	677902	677907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412089
14014	NC_013642	AG	3	6	677950	677955	50 %	0 %	50 %	0 %	281412089
14015	NC_013642	TC	3	6	677957	677962	0 %	50 %	0 %	50 %	281412089
14016	NC_013642	CCTT	2	8	678016	678023	0 %	50 %	0 %	50 %	281412089
14017	NC_013642	ATC	2	6	678120	678125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412089
14018	NC_013642	GGT	2	6	678131	678136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412089
14019	NC_013642	TTC	2	6	678204	678209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412089
14020	NC_013642	ACG	2	6	678221	678226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412089
14021	NC_013642	GAA	2	6	678233	678238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412089
14022	NC_013642	TTC	2	6	678264	678269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412089
14023	NC_013642	ACG	2	6	678270	678275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412089
14024	NC_013642	CT	3	6	678288	678293	0 %	50 %	0 %	50 %	281412090
14025	NC_013642	CTT	2	6	678320	678325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412090
14026	NC_013642	GTG	2	6	678345	678350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412090
14027	NC_013642	TTCTTT	2	12	678352	678363	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	281412090
14028	NC_013642	CATC	2	8	678369	678376	25 %	25 %	0 %	50 %	281412090
14029	NC_013642	GGA	2	6	678413	678418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412090
14030	NC_013642	CT	3	6	678459	678464	0 %	50 %	0 %	50 %	281412090
14031	NC_013642	TCTG	2	8	678592	678599	0 %	50 %	25 %	25 %	281412090
14032	NC_013642	TGA	2	6	678630	678635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412090
14033	NC_013642	CCA	2	6	678794	678799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412090
14034	NC_013642	TCT	3	9	678856	678864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412090
14035	NC_013642	TGG	2	6	678939	678944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412090
14036	NC_013642	GCT	2	6	678962	678967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412090
14037	NC_013642	TAT	2	6	678973	678978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412090
14038	NC_013642	TTTTC	2	10	679000	679009	0 %	80 %	0 %	20 %	281412090
14039	NC_013642	GAC	2	6	679028	679033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412090
14040	NC_013642	GA	3	6	679121	679126	50 %	0 %	50 %	0 %	281412090
14041	NC_013642	TAG	2	6	679232	679237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412090
14042	NC_013642	TTTC	2	8	679266	679273	0 %	75 %	0 %	25 %	281412090
14043	NC_013642	TTC	2	6	679275	679280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412090
14044	NC_013642	CTC	2	6	679282	679287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412091
14045	NC_013642	TGA	2	6	679326	679331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412091
14046	NC_013642	AAG	2	6	679338	679343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412091
14047	NC_013642	TGG	2	6	679369	679374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412091
14048	NC_013642	ACC	3	9	679380	679388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412091
14049	NC_013642	TGGG	2	8	679454	679461	0 %	25 %	75 %	0 %	281412091
14050	NC_013642	TCC	2	6	679501	679506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412091
14051	NC_013642	TCT	2	6	679562	679567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412091
14052	NC_013642	TCGC	2	8	679653	679660	0 %	25 %	25 %	50 %	281412091
14053	NC_013642	AGT	2	6	679762	679767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412091
14054	NC_013642	TGTT	2	8	679776	679783	0 %	75 %	25 %	0 %	281412091
14055	NC_013642	CAT	2	6	679797	679802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412091
14056	NC_013642	CGG	2	6	679821	679826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281412091
14057	NC_013642	GAT	2	6	679861	679866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412091
14058	NC_013642	GAA	2	6	679892	679897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412091
14059	NC_013642	GC	3	6	679959	679964	0 %	0 %	50 %	50 %	281412091
14060	NC_013642	AGG	2	6	679969	679974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412091
14061	NC_013642	AGAA	2	8	680045	680052	75 %	0 %	25 %	0 %	281412091
14062	NC_013642	TAT	2	6	680071	680076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412091
14063	NC_013642	ATC	2	6	680105	680110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412091
14064	NC_013642	CCT	2	6	680130	680135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412092
14065	NC_013642	GATA	2	8	680196	680203	50 %	25 %	25 %	0 %	281412092
14066	NC_013642	TGA	2	6	680310	680315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412092
14067	NC_013642	CTC	2	6	680319	680324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412092
14068	NC_013642	CCT	2	6	680333	680338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412092
14069	NC_013642	GAG	2	6	680368	680373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412092
14070	NC_013642	ACG	2	6	680507	680512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412092
14071	NC_013642	GAA	2	6	680554	680559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412092
14072	NC_013642	AGCC	2	8	680612	680619	25 %	0 %	25 %	50 %	281412092
14073	NC_013642	TCG	2	6	680778	680783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412092
14074	NC_013642	GAA	3	9	680787	680795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412092
14075	NC_013642	TGA	2	6	680892	680897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412092
14076	NC_013642	TTC	2	6	680938	680943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412092
14077	NC_013642	GCT	2	6	680960	680965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412092
14078	NC_013642	TCC	2	6	681258	681263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412093
14079	NC_013642	TCA	2	6	681265	681270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412093
14080	NC_013642	CTT	2	6	681309	681314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412093
14081	NC_013642	GAT	2	6	681318	681323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412093
14082	NC_013642	TTCG	2	8	681384	681391	0 %	50 %	25 %	25 %	281412093
14083	NC_013642	TCG	2	6	681410	681415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412093
14084	NC_013642	GAT	2	6	681471	681476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412093
14085	NC_013642	CTG	2	6	681477	681482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412093
14086	NC_013642	GAG	2	6	681540	681545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412093
14087	NC_013642	ACT	2	6	681550	681555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412093
14088	NC_013642	GAT	2	6	681653	681658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412093
14089	NC_013642	ATG	2	6	681685	681690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412093
14090	NC_013642	TCTG	2	8	681714	681721	0 %	50 %	25 %	25 %	281412093
14091	NC_013642	ATC	2	6	681787	681792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412093
14092	NC_013642	CA	3	6	681794	681799	50 %	0 %	0 %	50 %	281412093
14093	NC_013642	TCA	2	6	681800	681805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412093
14094	NC_013642	CAGT	2	8	681808	681815	25 %	25 %	25 %	25 %	281412093
14095	NC_013642	T	6	6	681891	681896	0 %	100 %	0 %	0 %	281412093
14096	NC_013642	TTC	2	6	681947	681952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412093
14097	NC_013642	GATC	2	8	682019	682026	25 %	25 %	25 %	25 %	281412093
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14100	NC_013642	GTC	2	6	682380	682385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412093
14101	NC_013642	CT	3	6	682388	682393	0 %	50 %	0 %	50 %	281412093
14102	NC_013642	GTA	3	9	682416	682424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412093
14103	NC_013642	AAC	2	6	682443	682448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412093
14104	NC_013642	TTC	2	6	682452	682457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412093
14105	NC_013642	AGGAA	2	10	682547	682556	60 %	0 %	40 %	0 %	281412093
14106	NC_013642	TCT	2	6	682576	682581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412093
14107	NC_013642	TCC	2	6	682699	682704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412093
14108	NC_013642	GTC	2	6	682767	682772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412093
14109	NC_013642	GGT	2	6	682896	682901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412093
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14112	NC_013642	TAT	2	6	683163	683168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412094
14113	NC_013642	ACA	2	6	683221	683226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412094
14114	NC_013642	GAT	2	6	683262	683267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412094
14115	NC_013642	TTC	2	6	683301	683306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412094
14116	NC_013642	TTTC	2	8	683312	683319	0 %	75 %	0 %	25 %	281412094
14117	NC_013642	AG	3	6	683430	683435	50 %	0 %	50 %	0 %	281412094
14118	NC_013642	CTC	2	6	683439	683444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412094
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14120	NC_013642	ACA	2	6	683473	683478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412094
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14241	NC_013642	AAG	2	6	690064	690069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412099
14242	NC_013642	AAG	2	6	690077	690082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412099
14243	NC_013642	ATC	2	6	690099	690104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412099
14244	NC_013642	CAG	2	6	690123	690128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412099
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14246	NC_013642	GAA	2	6	690235	690240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412100
14247	NC_013642	CA	3	6	690258	690263	50 %	0 %	0 %	50 %	281412100
14248	NC_013642	GA	3	6	690290	690295	50 %	0 %	50 %	0 %	281412100
14249	NC_013642	GTT	2	6	690320	690325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412100
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14252	NC_013642	TCG	2	6	690387	690392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412100
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14254	NC_013642	GATATG	2	12	690469	690480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412100
14255	NC_013642	A	6	6	690627	690632	100 %	0 %	0 %	0 %	281412101
14256	NC_013642	A	6	6	690737	690742	100 %	0 %	0 %	0 %	281412101
14257	NC_013642	AAAC	2	8	690777	690784	75 %	0 %	0 %	25 %	281412101
14258	NC_013642	CTC	2	6	690797	690802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412101
14259	NC_013642	GAT	2	6	690823	690828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412101
14260	NC_013642	AGAA	2	8	690910	690917	75 %	0 %	25 %	0 %	281412101
14261	NC_013642	GAA	2	6	690960	690965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412101
14262	NC_013642	TTTC	2	8	690968	690975	0 %	75 %	0 %	25 %	281412101
14263	NC_013642	CA	3	6	691000	691005	50 %	0 %	0 %	50 %	281412101
14264	NC_013642	CTC	2	6	691139	691144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412101
14265	NC_013642	CTG	2	6	691153	691158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412101
14266	NC_013642	ACTGGA	2	12	691239	691250	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	281412101
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14269	NC_013642	CTT	2	6	691449	691454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412102
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14271	NC_013642	AGA	2	6	691512	691517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412102
14272	NC_013642	ATA	2	6	691528	691533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281412102
14273	NC_013642	GGA	2	6	691540	691545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412102
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14279	NC_013642	TTC	2	6	691964	691969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412102
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14282	NC_013642	GAA	2	6	692065	692070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412102
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14329	NC_013642	CTG	2	6	694029	694034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412105
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14331	NC_013642	GTA	2	6	694063	694068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412105
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14344	NC_013642	ACTC	2	8	694684	694691	25 %	25 %	0 %	50 %	281412105
14345	NC_013642	GTT	2	6	694743	694748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412105
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14347	NC_013642	GGTT	2	8	694878	694885	0 %	50 %	50 %	0 %	281412105
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14351	NC_013642	AAC	2	6	695002	695007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412105
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14353	NC_013642	GAA	2	6	695059	695064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412105
14354	NC_013642	TG	3	6	695078	695083	0 %	50 %	50 %	0 %	281412105
14355	NC_013642	TGG	2	6	695097	695102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412105
14356	NC_013642	ACT	2	6	695105	695110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412105
14357	NC_013642	A	6	6	695129	695134	100 %	0 %	0 %	0 %	281412105
14358	NC_013642	TCA	2	6	695175	695180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412105
14359	NC_013642	GAAAG	2	10	695238	695247	60 %	0 %	40 %	0 %	281412105
14360	NC_013642	TTA	2	6	695277	695282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412105
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14362	NC_013642	TCA	2	6	695349	695354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412105
14363	NC_013642	GGA	2	6	695364	695369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412105
14364	NC_013642	T	6	6	695428	695433	0 %	100 %	0 %	0 %	281412105
14365	NC_013642	TTC	2	6	695570	695575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412106
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14371	NC_013642	TTGGTG	2	12	695963	695974	0 %	50 %	50 %	0 %	281412106
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14426	NC_013642	TC	5	10	700157	700166	0 %	50 %	0 %	50 %	281412111
14427	NC_013642	TTTC	2	8	700202	700209	0 %	75 %	0 %	25 %	281412111
14428	NC_013642	TGT	2	6	700318	700323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412111
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14430	NC_013642	TGG	2	6	700375	700380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412111
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14434	NC_013642	TCA	2	6	700617	700622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412111
14435	NC_013642	TCT	2	6	700677	700682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412111
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14438	NC_013642	CCT	2	6	700741	700746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412111
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14474	NC_013642	GGA	2	6	702630	702635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412113
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14477	NC_013642	G	6	6	702752	702757	0 %	0 %	100 %	0 %	281412113
14478	NC_013642	ATGC	2	8	702814	702821	25 %	25 %	25 %	25 %	281412114
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14481	NC_013642	GAA	3	9	702893	702901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412114
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14483	NC_013642	TAC	2	6	702919	702924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412114
14484	NC_013642	TGT	2	6	702925	702930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412114
14485	NC_013642	ACA	2	6	702933	702938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412114
14486	NC_013642	CTT	2	6	702984	702989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412114
14487	NC_013642	TCA	2	6	703008	703013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412114
14488	NC_013642	AAG	2	6	703031	703036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412114
14489	NC_013642	AGA	2	6	703102	703107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412114
14490	NC_013642	GAA	2	6	703136	703141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412114
14491	NC_013642	CGG	2	6	703144	703149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281412114
14492	NC_013642	CTCA	2	8	703156	703163	25 %	25 %	0 %	50 %	281412114
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14498	NC_013642	TTC	2	6	703369	703374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412115
14499	NC_013642	TCA	2	6	703380	703385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412115
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