MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_013642	CT	3	6	653157	653162	0 %	50 %	0 %	50 %	281412066
13502	NC_013642	CGC	2	6	653209	653214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281412066
13503	NC_013642	TCC	2	6	653241	653246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412066
13504	NC_013642	AAC	2	6	653348	653353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412066
13505	NC_013642	GGT	2	6	653363	653368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412066
13506	NC_013642	AGA	2	6	653473	653478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412066
13507	NC_013642	ACG	2	6	653481	653486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412066
13508	NC_013642	GA	3	6	653503	653508	50 %	0 %	50 %	0 %	281412066
13509	NC_013642	CTT	2	6	654904	654909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412067
13510	NC_013642	TGGA	2	8	654940	654947	25 %	25 %	50 %	0 %	281412067
13511	NC_013642	AG	3	6	654949	654954	50 %	0 %	50 %	0 %	281412067
13512	NC_013642	TTTTC	2	10	654982	654991	0 %	80 %	0 %	20 %	281412067
13513	NC_013642	GTGA	2	8	654998	655005	25 %	25 %	50 %	0 %	281412067
13514	NC_013642	TCT	2	6	655015	655020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412067
13515	NC_013642	GAT	3	9	655072	655080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412067
13516	NC_013642	CTT	2	6	655083	655088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412067
13517	NC_013642	TTC	2	6	655132	655137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412067
13518	NC_013642	CT	3	6	655144	655149	0 %	50 %	0 %	50 %	281412067
13519	NC_013642	ATC	2	6	655165	655170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412067
13520	NC_013642	TGA	2	6	655179	655184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412067
13521	NC_013642	GA	3	6	655214	655219	50 %	0 %	50 %	0 %	281412067
13522	NC_013642	TC	4	8	655263	655270	0 %	50 %	0 %	50 %	281412067
13523	NC_013642	T	6	6	655340	655345	0 %	100 %	0 %	0 %	281412067
13524	NC_013642	GA	3	6	655349	655354	50 %	0 %	50 %	0 %	281412067
13525	NC_013642	ACA	2	6	655355	655360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412067
13526	NC_013642	CGT	2	6	655446	655451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412067
13527	NC_013642	TTC	2	6	655456	655461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412067
13528	NC_013642	GTTC	2	8	655482	655489	0 %	50 %	25 %	25 %	281412067
13529	NC_013642	GAGAA	2	10	655507	655516	60 %	0 %	40 %	0 %	281412067
13530	NC_013642	TTC	2	6	655543	655548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412067
13531	NC_013642	GTGG	2	8	655592	655599	0 %	25 %	75 %	0 %	281412067
13532	NC_013642	CAA	2	6	655689	655694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412067
13533	NC_013642	ATT	2	6	655721	655726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412067
13534	NC_013642	TAT	2	6	655789	655794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412067
13535	NC_013642	TTC	2	6	655904	655909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412067
13536	NC_013642	TCT	2	6	655926	655931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412067
13537	NC_013642	T	6	6	655983	655988	0 %	100 %	0 %	0 %	281412067
13538	NC_013642	TTC	2	6	656005	656010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412067
13539	NC_013642	T	6	6	656018	656023	0 %	100 %	0 %	0 %	281412067
13540	NC_013642	CG	3	6	656091	656096	0 %	0 %	50 %	50 %	281412067
13541	NC_013642	TTTC	2	8	656188	656195	0 %	75 %	0 %	25 %	281412067
13542	NC_013642	GAAA	2	8	656268	656275	75 %	0 %	25 %	0 %	281412067
13543	NC_013642	CTT	2	6	656349	656354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412067
13544	NC_013642	T	6	6	656401	656406	0 %	100 %	0 %	0 %	281412067
13545	NC_013642	TCA	2	6	656424	656429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412067
13546	NC_013642	TCT	2	6	656443	656448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412067
13547	NC_013642	TCGC	2	8	656459	656466	0 %	25 %	25 %	50 %	281412067
13548	NC_013642	TGA	2	6	656526	656531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412067
13549	NC_013642	TCT	2	6	656631	656636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412067
13550	NC_013642	TTC	3	9	656637	656645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412067
13551	NC_013642	TTC	2	6	656671	656676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412067
13552	NC_013642	TC	3	6	656721	656726	0 %	50 %	0 %	50 %	281412067
13553	NC_013642	TCC	2	6	656729	656734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412067
13554	NC_013642	TCATC	2	10	656748	656757	20 %	40 %	0 %	40 %	281412067
13555	NC_013642	CTT	2	6	656809	656814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412067
13556	NC_013642	CTG	2	6	656821	656826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412067
13557	NC_013642	CTT	2	6	656888	656893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412068
13558	NC_013642	CGAG	2	8	656975	656982	25 %	0 %	50 %	25 %	281412068
13559	NC_013642	CTT	2	6	657098	657103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412068
13560	NC_013642	TCA	2	6	657116	657121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412068
13561	NC_013642	CCG	2	6	657149	657154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281412068
13562	NC_013642	CTC	2	6	657208	657213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412068
13563	NC_013642	GTT	2	6	657218	657223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412068
13564	NC_013642	CCT	2	6	657278	657283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412068
13565	NC_013642	CTTC	2	8	657365	657372	0 %	50 %	0 %	50 %	281412068
13566	NC_013642	TC	3	6	657377	657382	0 %	50 %	0 %	50 %	281412068
13567	NC_013642	TCT	2	6	657422	657427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412068
13568	NC_013642	CCT	2	6	657431	657436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412068
13569	NC_013642	ATCTC	2	10	657484	657493	20 %	40 %	0 %	40 %	281412068
13570	NC_013642	TCC	2	6	657498	657503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412068
13571	NC_013642	GA	4	8	657536	657543	50 %	0 %	50 %	0 %	281412068
13572	NC_013642	GCT	2	6	657568	657573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412068
13573	NC_013642	CTGT	2	8	657598	657605	0 %	50 %	25 %	25 %	281412068
13574	NC_013642	ATC	2	6	657649	657654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412068
13575	NC_013642	AAG	2	6	657678	657683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412068
13576	NC_013642	AGG	2	6	657713	657718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412068
13577	NC_013642	TCGTAT	2	12	657820	657831	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	281412068
13578	NC_013642	GA	3	6	657837	657842	50 %	0 %	50 %	0 %	281412068
13579	NC_013642	TTCACG	2	12	657847	657858	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	281412068
13580	NC_013642	TC	3	6	657869	657874	0 %	50 %	0 %	50 %	281412068
13581	NC_013642	CCT	2	6	657878	657883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412069
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13585	NC_013642	TC	3	6	658078	658083	0 %	50 %	0 %	50 %	281412069
13586	NC_013642	GAG	2	6	658154	658159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412069
13587	NC_013642	GTT	2	6	658269	658274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412069
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13589	NC_013642	CAC	2	6	658395	658400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412069
13590	NC_013642	ACC	2	6	658412	658417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412069
13591	NC_013642	TG	3	6	658439	658444	0 %	50 %	50 %	0 %	281412069
13592	NC_013642	CTT	2	6	658451	658456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412069
13593	NC_013642	CT	3	6	658521	658526	0 %	50 %	0 %	50 %	281412069
13594	NC_013642	A	6	6	658549	658554	100 %	0 %	0 %	0 %	281412069
13595	NC_013642	GTA	2	6	658611	658616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412069
13596	NC_013642	CCTT	2	8	658663	658670	0 %	50 %	0 %	50 %	281412069
13597	NC_013642	GGA	2	6	658698	658703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412069
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13600	NC_013642	GAA	2	6	658872	658877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412069
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13602	NC_013642	CTT	2	6	658997	659002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412069
13603	NC_013642	GAG	2	6	659025	659030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412069
13604	NC_013642	CT	3	6	659041	659046	0 %	50 %	0 %	50 %	281412069
13605	NC_013642	TCT	2	6	659143	659148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412069
13606	NC_013642	TTATC	2	10	659235	659244	20 %	60 %	0 %	20 %	281412070
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13608	NC_013642	GA	3	6	659253	659258	50 %	0 %	50 %	0 %	281412070
13609	NC_013642	CGC	2	6	659324	659329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281412070
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13612	NC_013642	AC	3	6	659367	659372	50 %	0 %	0 %	50 %	281412070
13613	NC_013642	GAA	2	6	659471	659476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412070
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13617	NC_013642	CT	3	6	659651	659656	0 %	50 %	0 %	50 %	281412070
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13741	NC_013642	GA	3	6	665881	665886	50 %	0 %	50 %	0 %	281412079
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13985	NC_013642	AGT	2	6	676885	676890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412087
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