MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013642	AT	3	6	629529	629534	50 %	50 %	0 %	0 %	281412042
13002	NC_013642	AT	3	6	629660	629665	50 %	50 %	0 %	0 %	281412042
13003	NC_013642	C	6	6	629672	629677	0 %	0 %	0 %	100 %	281412042
13004	NC_013642	AG	3	6	629681	629686	50 %	0 %	50 %	0 %	281412042
13005	NC_013642	CCAA	2	8	629756	629763	50 %	0 %	0 %	50 %	281412042
13006	NC_013642	TCT	2	6	629805	629810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412042
13007	NC_013642	CAA	2	6	629921	629926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412042
13008	NC_013642	ACC	2	6	629953	629958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412042
13009	NC_013642	TAT	2	6	630033	630038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412042
13010	NC_013642	TTC	2	6	630072	630077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412042
13011	NC_013642	CACT	2	8	630128	630135	25 %	25 %	0 %	50 %	281412042
13012	NC_013642	TGA	2	6	630185	630190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412042
13013	NC_013642	TTG	2	6	630208	630213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412042
13014	NC_013642	T	6	6	630227	630232	0 %	100 %	0 %	0 %	281412042
13015	NC_013642	ACTC	2	8	630297	630304	25 %	25 %	0 %	50 %	281412042
13016	NC_013642	TC	3	6	630303	630308	0 %	50 %	0 %	50 %	281412042
13017	NC_013642	TCCTTT	2	12	630327	630338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412042
13018	NC_013642	TTTCC	2	10	630410	630419	0 %	60 %	0 %	40 %	281412042
13019	NC_013642	TCT	2	6	630460	630465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412042
13020	NC_013642	AAC	2	6	630498	630503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412042
13021	NC_013642	CTA	2	6	630524	630529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412042
13022	NC_013642	CAC	2	6	630652	630657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412043
13023	NC_013642	TCT	2	6	630874	630879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412043
13024	NC_013642	GCGG	2	8	630883	630890	0 %	0 %	75 %	25 %	281412043
13025	NC_013642	GCGT	2	8	630912	630919	0 %	25 %	50 %	25 %	281412043
13026	NC_013642	TGA	2	6	630947	630952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412043
13027	NC_013642	CTTC	2	8	630962	630969	0 %	50 %	0 %	50 %	281412043
13028	NC_013642	GAG	2	6	631058	631063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412043
13029	NC_013642	TCA	2	6	631067	631072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412043
13030	NC_013642	GT	3	6	631208	631213	0 %	50 %	50 %	0 %	281412043
13031	NC_013642	CCA	2	6	631285	631290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412043
13032	NC_013642	TAG	2	6	631300	631305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412043
13033	NC_013642	CCA	2	6	631332	631337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412043
13034	NC_013642	AAC	2	6	631380	631385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412043
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13036	NC_013642	TCTCC	2	10	631459	631468	0 %	40 %	0 %	60 %	281412043
13037	NC_013642	AGA	2	6	631472	631477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412043
13038	NC_013642	GTA	2	6	631506	631511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412043
13039	NC_013642	CTC	2	6	631590	631595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412043
13040	NC_013642	TTC	2	6	631620	631625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412043
13041	NC_013642	GCA	2	6	631636	631641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412043
13042	NC_013642	CTT	2	6	631706	631711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412043
13043	NC_013642	AGAA	2	8	631866	631873	75 %	0 %	25 %	0 %	281412043
13044	NC_013642	AAG	2	6	631887	631892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412043
13045	NC_013642	CT	3	6	631895	631900	0 %	50 %	0 %	50 %	281412043
13046	NC_013642	TG	3	6	631965	631970	0 %	50 %	50 %	0 %	281412044
13047	NC_013642	GTC	2	6	632070	632075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412044
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13050	NC_013642	TCT	2	6	632133	632138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412044
13051	NC_013642	ATG	2	6	632238	632243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412044
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13053	NC_013642	CGT	2	6	632332	632337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412044
13054	NC_013642	CA	3	6	632453	632458	50 %	0 %	0 %	50 %	281412044
13055	NC_013642	CCA	2	6	632488	632493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412044
13056	NC_013642	TTC	2	6	632505	632510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412044
13057	NC_013642	GATTT	2	10	632514	632523	20 %	60 %	20 %	0 %	281412044
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13059	NC_013642	GA	3	6	632541	632546	50 %	0 %	50 %	0 %	281412044
13060	NC_013642	A	6	6	632588	632593	100 %	0 %	0 %	0 %	281412044
13061	NC_013642	CATT	2	8	632617	632624	25 %	50 %	0 %	25 %	281412044
13062	NC_013642	TTA	2	6	632656	632661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412044
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13072	NC_013642	AG	4	8	633411	633418	50 %	0 %	50 %	0 %	281412045
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13107	NC_013642	TAT	2	6	634491	634496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412045
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13109	NC_013642	T	6	6	634504	634509	0 %	100 %	0 %	0 %	281412045
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13123	NC_013642	CTTC	2	8	635096	635103	0 %	50 %	0 %	50 %	281412046
13124	NC_013642	TTC	2	6	635109	635114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412046
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13230	NC_013642	TTC	2	6	639546	639551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412052
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13240	NC_013642	CTTC	2	8	639829	639836	0 %	50 %	0 %	50 %	281412053
13241	NC_013642	CA	3	6	639849	639854	50 %	0 %	0 %	50 %	281412053
13242	NC_013642	TAT	2	6	639858	639863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281412053
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13244	NC_013642	CGT	2	6	639872	639877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412053
13245	NC_013642	ACA	2	6	640036	640041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412053
13246	NC_013642	AAG	2	6	640166	640171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412053
13247	NC_013642	CTT	2	6	640202	640207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412053
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13249	NC_013642	TCT	2	6	640277	640282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412053
13250	NC_013642	GTTC	2	8	640289	640296	0 %	50 %	25 %	25 %	281412053
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13253	NC_013642	GTA	2	6	640447	640452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412054
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13268	NC_013642	T	6	6	641344	641349	0 %	100 %	0 %	0 %	281412054
13269	NC_013642	CAA	2	6	641364	641369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412054
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13273	NC_013642	GAT	2	6	641492	641497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412054
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13278	NC_013642	TGA	2	6	641655	641660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412055
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13352	NC_013642	CAT	2	6	645463	645468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412057
13353	NC_013642	TTC	3	9	645480	645488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412057
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13356	NC_013642	A	6	6	645626	645631	100 %	0 %	0 %	0 %	281412057
13357	NC_013642	TAG	2	6	645791	645796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412058
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13360	NC_013642	GA	3	6	645869	645874	50 %	0 %	50 %	0 %	281412058
13361	NC_013642	GT	3	6	645877	645882	0 %	50 %	50 %	0 %	281412058
13362	NC_013642	TC	3	6	645980	645985	0 %	50 %	0 %	50 %	281412058
13363	NC_013642	GAA	2	6	646017	646022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412058
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13365	NC_013642	GAAA	2	8	646056	646063	75 %	0 %	25 %	0 %	281412058
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13481	NC_013642	AGA	2	6	652150	652155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412066
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13483	NC_013642	ATG	2	6	652277	652282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412066
13484	NC_013642	AGA	2	6	652393	652398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412066
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13486	NC_013642	TCG	2	6	652425	652430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412066
13487	NC_013642	CAT	2	6	652456	652461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412066
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13489	NC_013642	AGA	2	6	652474	652479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412066
13490	NC_013642	A	6	6	652565	652570	100 %	0 %	0 %	0 %	281412066
13491	NC_013642	TGT	2	6	652579	652584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412066
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