MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_013642	GA	3	6	579910	579915	50 %	0 %	50 %	0 %	281412008
12003	NC_013642	AGG	2	6	579978	579983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412008
12004	NC_013642	TCT	2	6	580065	580070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412008
12005	NC_013642	GTT	2	6	580161	580166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412008
12006	NC_013642	CTGC	2	8	580186	580193	0 %	25 %	25 %	50 %	281412008
12007	NC_013642	GTA	2	6	580277	580282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412008
12008	NC_013642	GTA	2	6	580322	580327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412008
12009	NC_013642	TCTG	2	8	580345	580352	0 %	50 %	25 %	25 %	281412008
12010	NC_013642	CCAC	2	8	580374	580381	25 %	0 %	0 %	75 %	281412008
12011	NC_013642	GAT	2	6	580412	580417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412008
12012	NC_013642	T	6	6	580438	580443	0 %	100 %	0 %	0 %	281412008
12013	NC_013642	CTT	2	6	580465	580470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412008
12014	NC_013642	T	6	6	580478	580483	0 %	100 %	0 %	0 %	281412008
12015	NC_013642	TCTT	2	8	580508	580515	0 %	75 %	0 %	25 %	281412008
12016	NC_013642	TGC	2	6	580540	580545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412008
12017	NC_013642	AG	3	6	580547	580552	50 %	0 %	50 %	0 %	281412008
12018	NC_013642	TCAC	2	8	580572	580579	25 %	25 %	0 %	50 %	281412008
12019	NC_013642	GAT	2	6	580613	580618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412008
12020	NC_013642	AT	3	6	580638	580643	50 %	50 %	0 %	0 %	281412008
12021	NC_013642	CCT	2	6	580649	580654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412009
12022	NC_013642	A	6	6	580684	580689	100 %	0 %	0 %	0 %	281412009
12023	NC_013642	TGG	2	6	580725	580730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412009
12024	NC_013642	TTCT	2	8	580731	580738	0 %	75 %	0 %	25 %	281412009
12025	NC_013642	TCC	2	6	580829	580834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412009
12026	NC_013642	ATCTGG	2	12	580848	580859	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	281412009
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12032	NC_013642	TAA	2	6	580981	580986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281412009
12033	NC_013642	AT	4	8	581008	581015	50 %	50 %	0 %	0 %	281412009
12034	NC_013642	AAG	2	6	581112	581117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412009
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12037	NC_013642	AAAT	2	8	581298	581305	75 %	25 %	0 %	0 %	281412009
12038	NC_013642	T	7	7	581316	581322	0 %	100 %	0 %	0 %	281412009
12039	NC_013642	T	6	6	581398	581403	0 %	100 %	0 %	0 %	281412009
12040	NC_013642	AAT	2	6	581430	581435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281412009
12041	NC_013642	AGT	2	6	581481	581486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412009
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12043	NC_013642	CCA	2	6	581567	581572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412009
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12051	NC_013642	AACTC	2	10	581913	581922	40 %	20 %	0 %	40 %	281412010
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12053	NC_013642	T	6	6	582018	582023	0 %	100 %	0 %	0 %	281412010
12054	NC_013642	AC	3	6	582045	582050	50 %	0 %	0 %	50 %	281412010
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12059	NC_013642	TGA	2	6	582164	582169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412010
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12061	NC_013642	T	6	6	582206	582211	0 %	100 %	0 %	0 %	281412010
12062	NC_013642	ACC	2	6	582221	582226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412010
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12064	NC_013642	T	6	6	582290	582295	0 %	100 %	0 %	0 %	281412010
12065	NC_013642	TA	3	6	582337	582342	50 %	50 %	0 %	0 %	281412010
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12106	NC_013642	AT	3	6	584319	584324	50 %	50 %	0 %	0 %	281412012
12107	NC_013642	TTTC	2	8	584355	584362	0 %	75 %	0 %	25 %	281412012
12108	NC_013642	CAA	2	6	584481	584486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412012
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12115	NC_013642	AATC	2	8	585147	585154	50 %	25 %	0 %	25 %	281412013
12116	NC_013642	T	6	6	585223	585228	0 %	100 %	0 %	0 %	281412013
12117	NC_013642	CCA	2	6	585277	585282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412013
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12120	NC_013642	ATA	2	6	585445	585450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281412013
12121	NC_013642	TGGAG	2	10	585479	585488	20 %	20 %	60 %	0 %	281412013
12122	NC_013642	TAA	2	6	585519	585524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281412013
12123	NC_013642	CTT	2	6	585525	585530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412013
12124	NC_013642	GCT	2	6	585614	585619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412013
12125	NC_013642	CAT	2	6	585621	585626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412013
12126	NC_013642	CCAT	2	8	585627	585634	25 %	25 %	0 %	50 %	281412013
12127	NC_013642	ATC	2	6	585646	585651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412013
12128	NC_013642	T	6	6	585754	585759	0 %	100 %	0 %	0 %	281412013
12129	NC_013642	TCA	2	6	585761	585766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412013
12130	NC_013642	TAAA	2	8	585776	585783	75 %	25 %	0 %	0 %	281412013
12131	NC_013642	ATAC	2	8	585786	585793	50 %	25 %	0 %	25 %	281412013
12132	NC_013642	TCT	2	6	585842	585847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412013
12133	NC_013642	CTT	2	6	585848	585853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412013
12134	NC_013642	A	6	6	585856	585861	100 %	0 %	0 %	0 %	281412013
12135	NC_013642	CCA	2	6	585862	585867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412013
12136	NC_013642	AGG	2	6	585916	585921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281412013
12137	NC_013642	AT	3	6	585991	585996	50 %	50 %	0 %	0 %	281412013
12138	NC_013642	AAG	2	6	586007	586012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412013
12139	NC_013642	TGG	2	6	586243	586248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412013
12140	NC_013642	TTC	2	6	586249	586254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412013
12141	NC_013642	CCTG	2	8	586334	586341	0 %	25 %	25 %	50 %	281412013
12142	NC_013642	ACT	2	6	586451	586456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412013
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12144	NC_013642	TTC	2	6	586505	586510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412013
12145	NC_013642	CCG	2	6	586795	586800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281412014
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12147	NC_013642	GA	3	6	586873	586878	50 %	0 %	50 %	0 %	281412014
12148	NC_013642	CTTCT	2	10	586887	586896	0 %	60 %	0 %	40 %	281412014
12149	NC_013642	CAC	3	9	586905	586913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412014
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12151	NC_013642	ATC	2	6	587023	587028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412014
12152	NC_013642	TC	3	6	587063	587068	0 %	50 %	0 %	50 %	281412014
12153	NC_013642	TTCCA	2	10	587071	587080	20 %	40 %	0 %	40 %	281412014
12154	NC_013642	TGG	2	6	587081	587086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281412014
12155	NC_013642	TCT	2	6	587101	587106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412014
12156	NC_013642	GAA	2	6	587168	587173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412014
12157	NC_013642	TTC	2	6	587266	587271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412014
12158	NC_013642	TCA	2	6	587360	587365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412014
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12160	NC_013642	CTTTCA	2	12	587438	587449	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	281412014
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12162	NC_013642	CTT	2	6	587561	587566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412014
12163	NC_013642	T	6	6	587673	587678	0 %	100 %	0 %	0 %	281412014
12164	NC_013642	ATCG	2	8	587811	587818	25 %	25 %	25 %	25 %	281412014
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12179	NC_013642	GGAA	2	8	588558	588565	50 %	0 %	50 %	0 %	281412015
12180	NC_013642	ATG	2	6	588609	588614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412015
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12204	NC_013642	TTTC	2	8	589951	589958	0 %	75 %	0 %	25 %	281412015
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12212	NC_013642	T	7	7	590430	590436	0 %	100 %	0 %	0 %	281412015
12213	NC_013642	GAGAC	2	10	590471	590480	40 %	0 %	40 %	20 %	281412015
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12222	NC_013642	AG	3	6	590644	590649	50 %	0 %	50 %	0 %	281412016
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12228	NC_013642	AT	3	6	590836	590841	50 %	50 %	0 %	0 %	281412016
12229	NC_013642	GTT	2	6	590851	590856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412016
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12231	NC_013642	TCC	2	6	590934	590939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412016
12232	NC_013642	ATCG	2	8	590953	590960	25 %	25 %	25 %	25 %	281412016
12233	NC_013642	CTC	2	6	590977	590982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281412016
12234	NC_013642	CAT	2	6	591016	591021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281412016
12235	NC_013642	GAA	2	6	591117	591122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281412016
12236	NC_013642	AAT	2	6	591208	591213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281412016
12237	NC_013642	A	6	6	591344	591349	100 %	0 %	0 %	0 %	281412016
12238	NC_013642	ATCGTA	2	12	591445	591456	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	281412016
12239	NC_013642	TC	4	8	591467	591474	0 %	50 %	0 %	50 %	281412016
12240	NC_013642	CAC	2	6	591505	591510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281412016
12241	NC_013642	GTT	2	6	591518	591523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281412016
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12243	NC_013642	AG	3	6	591557	591562	50 %	0 %	50 %	0 %	281412016
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12361	NC_013642	GGAA	3	12	598329	598340	50 %	0 %	50 %	0 %	281412021
12362	NC_013642	CT	3	6	598551	598556	0 %	50 %	0 %	50 %	281412021
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12365	NC_013642	TGGCGA	2	12	598627	598638	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	281412021
12366	NC_013642	CCAG	2	8	598644	598651	25 %	0 %	25 %	50 %	281412021
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12483	NC_013642	AATC	2	8	604142	604149	50 %	25 %	0 %	25 %	281412024
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12485	NC_013642	GCA	2	6	604193	604198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412024
12486	NC_013642	CT	4	8	604260	604267	0 %	50 %	0 %	50 %	281412024
12487	NC_013642	GAC	2	6	604336	604341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412024
12488	NC_013642	ACA	2	6	604433	604438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412024
12489	NC_013642	ACG	2	6	604519	604524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281412024
12490	NC_013642	ATCC	2	8	604601	604608	25 %	25 %	0 %	50 %	281412024
12491	NC_013642	AAC	2	6	604666	604671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412024
12492	NC_013642	TC	3	6	604734	604739	0 %	50 %	0 %	50 %	281412024
12493	NC_013642	CTG	2	6	604765	604770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412024
12494	NC_013642	GAAC	2	8	604896	604903	50 %	0 %	25 %	25 %	281412024
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