MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013642	CCTT	2	8	557022	557029	0 %	50 %	0 %	50 %	281411986
11502	NC_013642	TTC	2	6	557041	557046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411986
11503	NC_013642	AAG	2	6	557064	557069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411986
11504	NC_013642	T	6	6	557084	557089	0 %	100 %	0 %	0 %	281411986
11505	NC_013642	T	7	7	557140	557146	0 %	100 %	0 %	0 %	281411986
11506	NC_013642	TTC	2	6	557208	557213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411986
11507	NC_013642	TCT	2	6	557320	557325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411986
11508	NC_013642	TAT	2	6	557381	557386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411986
11509	NC_013642	T	6	6	557427	557432	0 %	100 %	0 %	0 %	281411986
11510	NC_013642	TTTA	2	8	557529	557536	25 %	75 %	0 %	0 %	281411986
11511	NC_013642	TTTC	2	8	557550	557557	0 %	75 %	0 %	25 %	281411986
11512	NC_013642	TCT	2	6	557586	557591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411986
11513	NC_013642	ATAG	2	8	557595	557602	50 %	25 %	25 %	0 %	281411986
11514	NC_013642	AT	3	6	557711	557716	50 %	50 %	0 %	0 %	281411986
11515	NC_013642	ATT	2	6	557758	557763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411986
11516	NC_013642	GTA	2	6	557844	557849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411986
11517	NC_013642	T	6	6	557852	557857	0 %	100 %	0 %	0 %	281411986
11518	NC_013642	T	6	6	557875	557880	0 %	100 %	0 %	0 %	281411986
11519	NC_013642	TTA	2	6	557891	557896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411986
11520	NC_013642	GTTC	2	8	557905	557912	0 %	50 %	25 %	25 %	281411986
11521	NC_013642	CTTTTT	2	12	557916	557927	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	281411986
11522	NC_013642	TGCA	2	8	557973	557980	25 %	25 %	25 %	25 %	281411986
11523	NC_013642	ATA	2	6	558024	558029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281411986
11524	NC_013642	T	7	7	558074	558080	0 %	100 %	0 %	0 %	281411986
11525	NC_013642	TCT	2	6	558130	558135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411986
11526	NC_013642	CTT	2	6	558185	558190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411986
11527	NC_013642	TCTG	2	8	558321	558328	0 %	50 %	25 %	25 %	281411986
11528	NC_013642	ACC	2	6	558343	558348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411986
11529	NC_013642	ACG	2	6	558361	558366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411986
11530	NC_013642	CTT	2	6	558388	558393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411986
11531	NC_013642	TGT	2	6	558395	558400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411986
11532	NC_013642	AGAA	2	8	558429	558436	75 %	0 %	25 %	0 %	281411986
11533	NC_013642	TCA	2	6	558554	558559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411987
11534	NC_013642	GT	3	6	558581	558586	0 %	50 %	50 %	0 %	281411987
11535	NC_013642	AGCA	2	8	558594	558601	50 %	0 %	25 %	25 %	281411987
11536	NC_013642	CTG	2	6	558627	558632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411987
11537	NC_013642	CAT	2	6	558645	558650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411987
11538	NC_013642	CTG	3	9	558686	558694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411987
11539	NC_013642	CTG	2	6	558704	558709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411987
11540	NC_013642	GT	3	6	558730	558735	0 %	50 %	50 %	0 %	281411987
11541	NC_013642	CCG	2	6	558821	558826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411987
11542	NC_013642	GTT	2	6	558853	558858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411987
11543	NC_013642	TGC	3	9	558870	558878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411987
11544	NC_013642	GTC	2	6	558885	558890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411987
11545	NC_013642	TGT	2	6	558905	558910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411987
11546	NC_013642	AGC	2	6	558948	558953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411987
11547	NC_013642	ACT	2	6	558991	558996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411987
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11551	NC_013642	TGT	2	6	559329	559334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411987
11552	NC_013642	TCT	2	6	559354	559359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411987
11553	NC_013642	TC	3	6	559438	559443	0 %	50 %	0 %	50 %	281411987
11554	NC_013642	AG	3	6	559498	559503	50 %	0 %	50 %	0 %	281411987
11555	NC_013642	CTG	2	6	559580	559585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411987
11556	NC_013642	CGT	2	6	559586	559591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411987
11557	NC_013642	TC	3	6	559626	559631	0 %	50 %	0 %	50 %	281411987
11558	NC_013642	TGT	2	6	559694	559699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411987
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11562	NC_013642	GGAA	2	8	559994	560001	50 %	0 %	50 %	0 %	281411988
11563	NC_013642	CCT	2	6	560052	560057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411988
11564	NC_013642	TCC	2	6	560099	560104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411988
11565	NC_013642	TG	3	6	560142	560147	0 %	50 %	50 %	0 %	281411988
11566	NC_013642	TTTGTG	2	12	560175	560186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411988
11567	NC_013642	AACG	2	8	560297	560304	50 %	0 %	25 %	25 %	281411988
11568	NC_013642	GAA	2	6	560386	560391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411988
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11570	NC_013642	GA	3	6	560397	560402	50 %	0 %	50 %	0 %	281411988
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11581	NC_013642	TC	4	8	560864	560871	0 %	50 %	0 %	50 %	281411989
11582	NC_013642	TC	3	6	560878	560883	0 %	50 %	0 %	50 %	281411989
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11585	NC_013642	ACG	2	6	560934	560939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411989
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11589	NC_013642	TTC	2	6	561014	561019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411989
11590	NC_013642	TAT	2	6	561119	561124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411989
11591	NC_013642	A	6	6	561196	561201	100 %	0 %	0 %	0 %	281411989
11592	NC_013642	CGG	2	6	561261	561266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411989
11593	NC_013642	TGCC	2	8	561288	561295	0 %	25 %	25 %	50 %	281411989
11594	NC_013642	TCG	2	6	561327	561332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411989
11595	NC_013642	GA	3	6	561388	561393	50 %	0 %	50 %	0 %	281411989
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11597	NC_013642	T	6	6	561482	561487	0 %	100 %	0 %	0 %	281411989
11598	NC_013642	GT	3	6	561505	561510	0 %	50 %	50 %	0 %	281411989
11599	NC_013642	CTT	2	6	561518	561523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411989
11600	NC_013642	CT	4	8	561549	561556	0 %	50 %	0 %	50 %	281411989
11601	NC_013642	CCG	2	6	561576	561581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411989
11602	NC_013642	GGT	2	6	561595	561600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411989
11603	NC_013642	AGGA	2	8	561686	561693	50 %	0 %	50 %	0 %	281411989
11604	NC_013642	GAG	2	6	561701	561706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411989
11605	NC_013642	TCC	2	6	561720	561725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411989
11606	NC_013642	AGA	2	6	561749	561754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411989
11607	NC_013642	AG	3	6	561758	561763	50 %	0 %	50 %	0 %	281411989
11608	NC_013642	AGA	3	9	561881	561889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411990
11609	NC_013642	TTC	2	6	561952	561957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411990
11610	NC_013642	GA	3	6	562105	562110	50 %	0 %	50 %	0 %	281411990
11611	NC_013642	GA	3	6	562151	562156	50 %	0 %	50 %	0 %	281411990
11612	NC_013642	TCC	2	6	562278	562283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411990
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11614	NC_013642	T	7	7	562332	562338	0 %	100 %	0 %	0 %	281411990
11615	NC_013642	TC	3	6	562401	562406	0 %	50 %	0 %	50 %	281411990
11616	NC_013642	TCT	2	6	562457	562462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411990
11617	NC_013642	CA	3	6	562510	562515	50 %	0 %	0 %	50 %	281411990
11618	NC_013642	GAA	2	6	562557	562562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411990
11619	NC_013642	GACA	2	8	562573	562580	50 %	0 %	25 %	25 %	281411990
11620	NC_013642	GATA	2	8	562596	562603	50 %	25 %	25 %	0 %	281411990
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11622	NC_013642	TCA	2	6	562640	562645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411990
11623	NC_013642	TCT	2	6	562729	562734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411990
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11984	NC_013642	CAA	2	6	578917	578922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412007
11985	NC_013642	CAA	2	6	579046	579051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281412007
11986	NC_013642	TCG	2	6	579276	579281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281412008
11987	NC_013642	TTC	2	6	579282	579287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281412008
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11992	NC_013642	GAT	2	6	579497	579502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281412008
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