MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013642	GAAAAA	2	12	24408	24419	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	281411469
502	NC_013642	A	7	7	24415	24421	100 %	0 %	0 %	0 %	281411469
503	NC_013642	AGA	2	6	24432	24437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411469
504	NC_013642	GTT	2	6	24447	24452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411469
505	NC_013642	AAGA	2	8	24491	24498	75 %	0 %	25 %	0 %	281411470
506	NC_013642	GCT	2	6	24656	24661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411470
507	NC_013642	GAA	2	6	24662	24667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411470
508	NC_013642	A	6	6	24675	24680	100 %	0 %	0 %	0 %	281411470
509	NC_013642	GAC	2	6	24723	24728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411470
510	NC_013642	CTT	2	6	24732	24737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411470
511	NC_013642	AGAA	2	8	24746	24753	75 %	0 %	25 %	0 %	281411470
512	NC_013642	GT	3	6	24778	24783	0 %	50 %	50 %	0 %	281411470
513	NC_013642	TTC	2	6	24796	24801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411470
514	NC_013642	A	6	6	24858	24863	100 %	0 %	0 %	0 %	281411470
515	NC_013642	TCT	2	6	24872	24877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411470
516	NC_013642	TCT	2	6	24982	24987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411471
517	NC_013642	GAA	2	6	25010	25015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411471
518	NC_013642	CTT	2	6	25023	25028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411471
519	NC_013642	TC	3	6	25080	25085	0 %	50 %	0 %	50 %	281411471
520	NC_013642	AGA	2	6	25090	25095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411471
521	NC_013642	AAC	2	6	25096	25101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411471
522	NC_013642	ACA	2	6	25115	25120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411471
523	NC_013642	TTCAT	2	10	25260	25269	20 %	60 %	0 %	20 %	281411471
524	NC_013642	GATG	2	8	25300	25307	25 %	25 %	50 %	0 %	281411471
525	NC_013642	AG	3	6	25355	25360	50 %	0 %	50 %	0 %	281411471
526	NC_013642	TCG	2	6	25365	25370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411471
527	NC_013642	A	8	8	25375	25382	100 %	0 %	0 %	0 %	281411471
528	NC_013642	TTA	2	6	25453	25458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411471
529	NC_013642	CTG	2	6	25470	25475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411471
530	NC_013642	TCT	2	6	25493	25498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411471
531	NC_013642	TCT	2	6	25501	25506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411471
532	NC_013642	TCG	2	6	25539	25544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411471
533	NC_013642	AAG	2	6	25571	25576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411471
534	NC_013642	TTC	2	6	25611	25616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411472
535	NC_013642	AGT	2	6	25685	25690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411472
536	NC_013642	CTT	2	6	25698	25703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411472
537	NC_013642	TCC	2	6	25774	25779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411472
538	NC_013642	TCA	2	6	25811	25816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411472
539	NC_013642	GAAA	2	8	25847	25854	75 %	0 %	25 %	0 %	281411473
540	NC_013642	CAT	2	6	25867	25872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411473
541	NC_013642	TTC	2	6	25925	25930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411473
542	NC_013642	TCT	2	6	25937	25942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411473
543	NC_013642	TTG	2	6	26049	26054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411473
544	NC_013642	GTTCGA	2	12	26057	26068	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	281411473
545	NC_013642	TC	3	6	26175	26180	0 %	50 %	0 %	50 %	281411474
546	NC_013642	AGC	2	6	26189	26194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411474
547	NC_013642	TCT	2	6	26196	26201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411474
548	NC_013642	TAA	2	6	26289	26294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281411474
549	NC_013642	GCG	2	6	26358	26363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411474
550	NC_013642	TTC	2	6	26382	26387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411474
551	NC_013642	GAA	2	6	26455	26460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411474
552	NC_013642	TC	3	6	26531	26536	0 %	50 %	0 %	50 %	281411474
553	NC_013642	CT	3	6	26538	26543	0 %	50 %	0 %	50 %	281411474
554	NC_013642	TTC	2	6	26544	26549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411474
555	NC_013642	TTC	2	6	26618	26623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411474
556	NC_013642	ATG	2	6	26640	26645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411474
557	NC_013642	GA	3	6	26678	26683	50 %	0 %	50 %	0 %	281411474
558	NC_013642	GTAT	2	8	26719	26726	25 %	50 %	25 %	0 %	281411474
559	NC_013642	TC	3	6	26732	26737	0 %	50 %	0 %	50 %	281411474
560	NC_013642	GCT	2	6	26749	26754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411474
561	NC_013642	CTT	2	6	26782	26787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411474
562	NC_013642	AAC	2	6	26942	26947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411474
563	NC_013642	CACC	2	8	26951	26958	25 %	0 %	0 %	75 %	281411474
564	NC_013642	GT	3	6	26965	26970	0 %	50 %	50 %	0 %	281411474
565	NC_013642	GGT	2	6	27009	27014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411474
566	NC_013642	GTG	2	6	27015	27020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411474
567	NC_013642	CTT	2	6	27061	27066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411474
568	NC_013642	CT	3	6	27103	27108	0 %	50 %	0 %	50 %	281411474
569	NC_013642	TCCT	2	8	27144	27151	0 %	50 %	0 %	50 %	281411474
570	NC_013642	T	6	6	27192	27197	0 %	100 %	0 %	0 %	281411475
571	NC_013642	TTC	2	6	27266	27271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411475
572	NC_013642	GTA	2	6	27291	27296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411475
573	NC_013642	CTT	2	6	27345	27350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411475
574	NC_013642	TTCC	2	8	27365	27372	0 %	50 %	0 %	50 %	281411475
575	NC_013642	TCT	2	6	27524	27529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411475
576	NC_013642	AAC	2	6	27633	27638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411475
577	NC_013642	CATCA	2	10	27669	27678	40 %	20 %	0 %	40 %	281411475
578	NC_013642	TTC	2	6	27762	27767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411475
579	NC_013642	CTGT	2	8	28023	28030	0 %	50 %	25 %	25 %	281411475
580	NC_013642	AG	3	6	28080	28085	50 %	0 %	50 %	0 %	281411475
581	NC_013642	AGA	2	6	28277	28282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411475
582	NC_013642	GAA	2	6	28379	28384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411475
583	NC_013642	TA	3	6	28393	28398	50 %	50 %	0 %	0 %	281411475
584	NC_013642	AG	3	6	28431	28436	50 %	0 %	50 %	0 %	281411475
585	NC_013642	T	7	7	28480	28486	0 %	100 %	0 %	0 %	281411475
586	NC_013642	TTC	2	6	28534	28539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411475
587	NC_013642	TCC	2	6	28575	28580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411475
588	NC_013642	TAC	2	6	28617	28622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411475
589	NC_013642	T	6	6	28628	28633	0 %	100 %	0 %	0 %	281411475
590	NC_013642	CGT	2	6	28654	28659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411476
591	NC_013642	GATC	2	8	28675	28682	25 %	25 %	25 %	25 %	281411476
592	NC_013642	TAG	2	6	28743	28748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411476
593	NC_013642	GAA	2	6	28810	28815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411476
594	NC_013642	CT	3	6	28826	28831	0 %	50 %	0 %	50 %	281411476
595	NC_013642	CAC	2	6	28898	28903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411476
596	NC_013642	TTC	2	6	28905	28910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411476
597	NC_013642	TTC	2	6	28936	28941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411476
598	NC_013642	AAAG	2	8	28956	28963	75 %	0 %	25 %	0 %	281411476
599	NC_013642	TTC	2	6	28968	28973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411476
600	NC_013642	ATC	2	6	29072	29077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411476
601	NC_013642	TTC	2	6	29105	29110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411476
602	NC_013642	AGA	2	6	29123	29128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411476
603	NC_013642	GAT	3	9	29144	29152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411476
604	NC_013642	TCT	2	6	29153	29158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411476
605	NC_013642	TCC	2	6	29225	29230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411476
606	NC_013642	AACA	2	8	29292	29299	75 %	0 %	0 %	25 %	281411477
607	NC_013642	GTA	2	6	29300	29305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411477
608	NC_013642	AGAA	2	8	29369	29376	75 %	0 %	25 %	0 %	281411477
609	NC_013642	ACG	2	6	29442	29447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411477
610	NC_013642	AGA	2	6	29510	29515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411477
611	NC_013642	AG	3	6	29548	29553	50 %	0 %	50 %	0 %	281411477
612	NC_013642	CAA	2	6	29572	29577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411477
613	NC_013642	GAA	2	6	29625	29630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411477
614	NC_013642	GGA	2	6	29677	29682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411477
615	NC_013642	GAA	2	6	29691	29696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411477
616	NC_013642	GAT	2	6	29771	29776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411477
617	NC_013642	CTT	2	6	29796	29801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411477
618	NC_013642	AAC	2	6	29822	29827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411477
619	NC_013642	AGA	2	6	29898	29903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411477
620	NC_013642	GAA	2	6	29929	29934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411477
621	NC_013642	TAT	2	6	29951	29956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411477
622	NC_013642	AGC	2	6	29961	29966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411477
623	NC_013642	TGA	2	6	30035	30040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411478
624	NC_013642	TGA	2	6	30068	30073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411478
625	NC_013642	CT	4	8	30078	30085	0 %	50 %	0 %	50 %	281411478
626	NC_013642	TTG	2	6	30101	30106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411478
627	NC_013642	TCA	2	6	30286	30291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411478
628	NC_013642	ACC	2	6	30292	30297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411478
629	NC_013642	TGT	2	6	30347	30352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411478
630	NC_013642	CTT	2	6	30353	30358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411478
631	NC_013642	AGA	2	6	30399	30404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411478
632	NC_013642	GATCCA	2	12	30410	30421	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	281411478
633	NC_013642	CAC	2	6	30438	30443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411478
634	NC_013642	TTCG	2	8	30480	30487	0 %	50 %	25 %	25 %	281411478
635	NC_013642	TC	3	6	30517	30522	0 %	50 %	0 %	50 %	281411478
636	NC_013642	TTC	2	6	30534	30539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411478
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641	NC_013642	TC	3	6	30661	30666	0 %	50 %	0 %	50 %	281411479
642	NC_013642	GAAA	2	8	30787	30794	75 %	0 %	25 %	0 %	281411479
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645	NC_013642	CGA	2	6	30910	30915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411479
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652	NC_013642	AGT	2	6	31158	31163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411479
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662	NC_013642	ATC	2	6	31730	31735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411480
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666	NC_013642	CAC	2	6	31885	31890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411480
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673	NC_013642	TTC	2	6	32060	32065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411480
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723	NC_013642	CTC	2	6	34720	34725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411482
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744	NC_013642	CA	3	6	35608	35613	50 %	0 %	0 %	50 %	281411484
745	NC_013642	GAAA	2	8	35668	35675	75 %	0 %	25 %	0 %	281411484
746	NC_013642	TG	3	6	35832	35837	0 %	50 %	50 %	0 %	281411484
747	NC_013642	A	7	7	35942	35948	100 %	0 %	0 %	0 %	281411484
748	NC_013642	CTG	2	6	35976	35981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411484
749	NC_013642	CA	3	6	36004	36009	50 %	0 %	0 %	50 %	281411484
750	NC_013642	GAA	2	6	36026	36031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411484
751	NC_013642	GA	3	6	36049	36054	50 %	0 %	50 %	0 %	281411484
752	NC_013642	GAAC	2	8	36079	36086	50 %	0 %	25 %	25 %	281411484
753	NC_013642	ACA	2	6	36144	36149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411484
754	NC_013642	GAT	2	6	36158	36163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411484
755	NC_013642	TTG	2	6	36174	36179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411484
756	NC_013642	GA	3	6	36198	36203	50 %	0 %	50 %	0 %	281411484
757	NC_013642	GAG	2	6	36216	36221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411484
758	NC_013642	TAT	2	6	36278	36283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411484
759	NC_013642	GAA	2	6	36303	36308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411484
760	NC_013642	TCT	2	6	36319	36324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411484
761	NC_013642	TCAG	2	8	36389	36396	25 %	25 %	25 %	25 %	281411484
762	NC_013642	GAAG	2	8	36400	36407	50 %	0 %	50 %	0 %	281411484
763	NC_013642	TCG	2	6	36411	36416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411484
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773	NC_013642	GGA	2	6	36845	36850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411484
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