MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013642	CAGGGA	2	12	293354	293365	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	281411732
6002	NC_013642	AGCG	2	8	293388	293395	25 %	0 %	50 %	25 %	281411732
6003	NC_013642	CTT	2	6	293439	293444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411732
6004	NC_013642	GAACA	2	10	293503	293512	60 %	0 %	20 %	20 %	281411732
6005	NC_013642	TG	3	6	293517	293522	0 %	50 %	50 %	0 %	281411732
6006	NC_013642	GCC	2	6	293554	293559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411732
6007	NC_013642	GAT	2	6	293563	293568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411732
6008	NC_013642	TG	3	6	293584	293589	0 %	50 %	50 %	0 %	281411732
6009	NC_013642	GGA	2	6	293684	293689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411732
6010	NC_013642	TGT	2	6	293754	293759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411732
6011	NC_013642	AATC	2	8	293823	293830	50 %	25 %	0 %	25 %	281411732
6012	NC_013642	GA	3	6	293917	293922	50 %	0 %	50 %	0 %	281411732
6013	NC_013642	AT	4	8	293932	293939	50 %	50 %	0 %	0 %	281411732
6014	NC_013642	CA	3	6	293950	293955	50 %	0 %	0 %	50 %	281411732
6015	NC_013642	CTT	3	9	293961	293969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411732
6016	NC_013642	GAA	2	6	294030	294035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411732
6017	NC_013642	CTT	2	6	294162	294167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411732
6018	NC_013642	CAC	2	6	294193	294198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411732
6019	NC_013642	CGG	2	6	294270	294275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411732
6020	NC_013642	CAC	2	6	294289	294294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411732
6021	NC_013642	TGT	2	6	294318	294323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411732
6022	NC_013642	GGA	2	6	294376	294381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411732
6023	NC_013642	CCT	2	6	294407	294412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411733
6024	NC_013642	TTC	2	6	294508	294513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411733
6025	NC_013642	CAA	2	6	294518	294523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411733
6026	NC_013642	CCTT	2	8	294526	294533	0 %	50 %	0 %	50 %	281411733
6027	NC_013642	TTTGAA	2	12	294585	294596	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	281411733
6028	NC_013642	AAC	2	6	294624	294629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411733
6029	NC_013642	GA	3	6	294646	294651	50 %	0 %	50 %	0 %	281411733
6030	NC_013642	CGT	2	6	294689	294694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411733
6031	NC_013642	CCA	2	6	294710	294715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411733
6032	NC_013642	GCC	2	6	294784	294789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411733
6033	NC_013642	ATG	2	6	294823	294828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411733
6034	NC_013642	CAC	2	6	294944	294949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411733
6035	NC_013642	CCA	2	6	294971	294976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411733
6036	NC_013642	GGT	2	6	295019	295024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411733
6037	NC_013642	ACG	2	6	295063	295068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411733
6038	NC_013642	TTC	2	6	295105	295110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411733
6039	NC_013642	TCT	2	6	295168	295173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411733
6040	NC_013642	GCTTC	2	10	295217	295226	0 %	40 %	20 %	40 %	281411733
6041	NC_013642	AGA	2	6	295285	295290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411733
6042	NC_013642	GGA	2	6	295309	295314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411733
6043	NC_013642	CTT	2	6	295368	295373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411733
6044	NC_013642	TCT	2	6	295384	295389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411733
6045	NC_013642	AGA	2	6	295460	295465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411733
6046	NC_013642	TC	3	6	295475	295480	0 %	50 %	0 %	50 %	281411733
6047	NC_013642	ACG	2	6	295495	295500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411733
6048	NC_013642	T	6	6	295593	295598	0 %	100 %	0 %	0 %	281411733
6049	NC_013642	ATG	2	6	295660	295665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411733
6050	NC_013642	GTTC	2	8	295766	295773	0 %	50 %	25 %	25 %	281411733
6051	NC_013642	CGTG	2	8	295799	295806	0 %	25 %	50 %	25 %	281411733
6052	NC_013642	TCA	2	6	295847	295852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411733
6053	NC_013642	TCT	2	6	295951	295956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411733
6054	NC_013642	CTT	2	6	295987	295992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411733
6055	NC_013642	AGGT	2	8	296002	296009	25 %	25 %	50 %	0 %	281411733
6056	NC_013642	TA	3	6	296011	296016	50 %	50 %	0 %	0 %	281411733
6057	NC_013642	CGG	2	6	296018	296023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411733
6058	NC_013642	CCT	2	6	296041	296046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411733
6059	NC_013642	GAA	2	6	296048	296053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411733
6060	NC_013642	AAGGG	2	10	296307	296316	40 %	0 %	60 %	0 %	281411734
6061	NC_013642	CAC	2	6	296353	296358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411734
6062	NC_013642	TGA	2	6	296361	296366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411734
6063	NC_013642	GAA	2	6	296398	296403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411734
6064	NC_013642	A	6	6	296402	296407	100 %	0 %	0 %	0 %	281411734
6065	NC_013642	AAG	2	6	296426	296431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411734
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6067	NC_013642	CT	3	6	296531	296536	0 %	50 %	0 %	50 %	281411734
6068	NC_013642	GAA	2	6	296585	296590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411734
6069	NC_013642	AAG	2	6	296654	296659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411734
6070	NC_013642	AG	3	6	296715	296720	50 %	0 %	50 %	0 %	281411734
6071	NC_013642	GTG	2	6	296732	296737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411734
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6073	NC_013642	GTG	2	6	296843	296848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411734
6074	NC_013642	GAG	2	6	296906	296911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411734
6075	NC_013642	TC	4	8	296944	296951	0 %	50 %	0 %	50 %	281411734
6076	NC_013642	TCC	2	6	296983	296988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411734
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6079	NC_013642	GAGAG	2	10	297062	297071	40 %	0 %	60 %	0 %	281411734
6080	NC_013642	AAG	2	6	297086	297091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411734
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6082	NC_013642	GAT	2	6	297227	297232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411735
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6088	NC_013642	T	6	6	297497	297502	0 %	100 %	0 %	0 %	281411735
6089	NC_013642	GA	3	6	297530	297535	50 %	0 %	50 %	0 %	281411735
6090	NC_013642	ACT	2	6	297661	297666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411735
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6092	NC_013642	TC	3	6	297701	297706	0 %	50 %	0 %	50 %	281411735
6093	NC_013642	GA	3	6	297727	297732	50 %	0 %	50 %	0 %	281411735
6094	NC_013642	AAC	2	6	297828	297833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411735
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6097	NC_013642	TCA	2	6	297930	297935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411735
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6099	NC_013642	AG	3	6	297948	297953	50 %	0 %	50 %	0 %	281411735
6100	NC_013642	CCTGG	2	10	298165	298174	0 %	20 %	40 %	40 %	281411736
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6103	NC_013642	ACAG	2	8	298317	298324	50 %	0 %	25 %	25 %	281411736
6104	NC_013642	AGC	2	6	298374	298379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411736
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6106	NC_013642	T	6	6	298502	298507	0 %	100 %	0 %	0 %	281411736
6107	NC_013642	TCTT	2	8	298512	298519	0 %	75 %	0 %	25 %	281411736
6108	NC_013642	AAAGG	2	10	298609	298618	60 %	0 %	40 %	0 %	281411736
6109	NC_013642	GT	3	6	298659	298664	0 %	50 %	50 %	0 %	281411736
6110	NC_013642	TTG	2	6	298677	298682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411736
6111	NC_013642	CT	3	6	298784	298789	0 %	50 %	0 %	50 %	281411736
6112	NC_013642	CTG	2	6	298831	298836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411736
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6117	NC_013642	GA	3	6	299118	299123	50 %	0 %	50 %	0 %	281411737
6118	NC_013642	GTTT	2	8	299126	299133	0 %	75 %	25 %	0 %	281411737
6119	NC_013642	CT	4	8	299165	299172	0 %	50 %	0 %	50 %	281411737
6120	NC_013642	TCC	2	6	299262	299267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411737
6121	NC_013642	CCCA	2	8	299280	299287	25 %	0 %	0 %	75 %	281411737
6122	NC_013642	GTA	2	6	299291	299296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411737
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6248	NC_013642	TGCC	2	8	304926	304933	0 %	25 %	25 %	50 %	281411744
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6371	NC_013642	CAG	2	6	311328	311333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411751
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6493	NC_013642	CAT	2	6	316791	316796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411756
6494	NC_013642	TTC	2	6	316825	316830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411756
6495	NC_013642	GA	3	6	316957	316962	50 %	0 %	50 %	0 %	281411756
6496	NC_013642	GAA	2	6	317014	317019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411756
6497	NC_013642	GAA	2	6	317049	317054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411756
6498	NC_013642	TTTC	2	8	317074	317081	0 %	75 %	0 %	25 %	281411756
6499	NC_013642	GAA	2	6	317122	317127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411756
6500	NC_013642	GA	3	6	317133	317138	50 %	0 %	50 %	0 %	281411756

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