MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013642	T	7	7	270936	270942	0 %	100 %	0 %	0 %	281411705
5502	NC_013642	CCT	2	6	271067	271072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411705
5503	NC_013642	CCG	2	6	271118	271123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411705
5504	NC_013642	CTT	3	9	271160	271168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411705
5505	NC_013642	GTA	2	6	271170	271175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411705
5506	NC_013642	AAC	2	6	271233	271238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411705
5507	NC_013642	TCT	2	6	271292	271297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411705
5508	NC_013642	TCC	2	6	271309	271314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411706
5509	NC_013642	TCT	2	6	271337	271342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411706
5510	NC_013642	CCA	2	6	271354	271359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411706
5511	NC_013642	CAC	2	6	271385	271390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411706
5512	NC_013642	GTCT	2	8	271411	271418	0 %	50 %	25 %	25 %	281411706
5513	NC_013642	CGG	2	6	271492	271497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411706
5514	NC_013642	TAT	2	6	271559	271564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411706
5515	NC_013642	TCA	2	6	271597	271602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411706
5516	NC_013642	TC	3	6	271795	271800	0 %	50 %	0 %	50 %	281411706
5517	NC_013642	TGA	2	6	271801	271806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411706
5518	NC_013642	AG	3	6	271868	271873	50 %	0 %	50 %	0 %	281411706
5519	NC_013642	ATC	2	6	271926	271931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411706
5520	NC_013642	GGA	2	6	271943	271948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411706
5521	NC_013642	GAAC	2	8	272090	272097	50 %	0 %	25 %	25 %	281411707
5522	NC_013642	TCG	2	6	272152	272157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411707
5523	NC_013642	T	6	6	272219	272224	0 %	100 %	0 %	0 %	281411707
5524	NC_013642	TAC	2	6	272274	272279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411707
5525	NC_013642	A	6	6	272382	272387	100 %	0 %	0 %	0 %	281411708
5526	NC_013642	AGA	2	6	272397	272402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411708
5527	NC_013642	GTG	2	6	272452	272457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411708
5528	NC_013642	AAC	2	6	272497	272502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411708
5529	NC_013642	ATGACG	2	12	272515	272526	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	281411708
5530	NC_013642	A	6	6	272580	272585	100 %	0 %	0 %	0 %	281411708
5531	NC_013642	GTGGAG	2	12	272605	272616	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	281411708
5532	NC_013642	AG	3	6	272643	272648	50 %	0 %	50 %	0 %	281411708
5533	NC_013642	GA	3	6	272664	272669	50 %	0 %	50 %	0 %	281411708
5534	NC_013642	TCT	2	6	272697	272702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411709
5535	NC_013642	AGA	2	6	272777	272782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411709
5536	NC_013642	CAT	2	6	272798	272803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411709
5537	NC_013642	ATC	2	6	272826	272831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411709
5538	NC_013642	TGG	2	6	272839	272844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411709
5539	NC_013642	A	6	6	272845	272850	100 %	0 %	0 %	0 %	281411709
5540	NC_013642	CTTT	2	8	272904	272911	0 %	75 %	0 %	25 %	281411709
5541	NC_013642	T	6	6	272909	272914	0 %	100 %	0 %	0 %	281411709
5542	NC_013642	GT	3	6	272926	272931	0 %	50 %	50 %	0 %	281411709
5543	NC_013642	GAA	2	6	272952	272957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411709
5544	NC_013642	GGT	2	6	273002	273007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411709
5545	NC_013642	GTG	2	6	273028	273033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411709
5546	NC_013642	GTG	2	6	273153	273158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411709
5547	NC_013642	GAT	2	6	273209	273214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411709
5548	NC_013642	TCC	2	6	273224	273229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411709
5549	NC_013642	GGAC	2	8	273302	273309	25 %	0 %	50 %	25 %	281411709
5550	NC_013642	AG	3	6	273321	273326	50 %	0 %	50 %	0 %	281411709
5551	NC_013642	TTC	2	6	273327	273332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411709
5552	NC_013642	GGAA	2	8	273347	273354	50 %	0 %	50 %	0 %	281411709
5553	NC_013642	A	6	6	273398	273403	100 %	0 %	0 %	0 %	281411709
5554	NC_013642	TTC	2	6	273454	273459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411709
5555	NC_013642	T	6	6	273526	273531	0 %	100 %	0 %	0 %	281411710
5556	NC_013642	GTC	2	6	273607	273612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411710
5557	NC_013642	TTCT	2	8	273619	273626	0 %	75 %	0 %	25 %	281411710
5558	NC_013642	T	6	6	273630	273635	0 %	100 %	0 %	0 %	281411710
5559	NC_013642	TTC	2	6	273637	273642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411710
5560	NC_013642	TC	3	6	273641	273646	0 %	50 %	0 %	50 %	281411710
5561	NC_013642	TCT	2	6	273751	273756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411710
5562	NC_013642	TC	3	6	273772	273777	0 %	50 %	0 %	50 %	281411710
5563	NC_013642	AGT	2	6	273779	273784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411710
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5565	NC_013642	TTC	2	6	273838	273843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411710
5566	NC_013642	CT	3	6	273850	273855	0 %	50 %	0 %	50 %	281411710
5567	NC_013642	CT	4	8	273862	273869	0 %	50 %	0 %	50 %	281411710
5568	NC_013642	AAG	3	9	273886	273894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411710
5569	NC_013642	A	6	6	273906	273911	100 %	0 %	0 %	0 %	281411710
5570	NC_013642	TCC	2	6	273966	273971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411711
5571	NC_013642	TTG	2	6	273985	273990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411711
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5574	NC_013642	TCC	2	6	274074	274079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411711
5575	NC_013642	AG	3	6	274126	274131	50 %	0 %	50 %	0 %	281411711
5576	NC_013642	ATC	2	6	274144	274149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411711
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5579	NC_013642	GTCT	2	8	274391	274398	0 %	50 %	25 %	25 %	281411711
5580	NC_013642	TG	3	6	274405	274410	0 %	50 %	50 %	0 %	281411711
5581	NC_013642	CAG	2	6	274449	274454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411711
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5585	NC_013642	ATTC	2	8	274661	274668	25 %	50 %	0 %	25 %	281411711
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5588	NC_013642	AGA	2	6	274913	274918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411712
5589	NC_013642	ATT	2	6	274982	274987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411712
5590	NC_013642	GA	3	6	275013	275018	50 %	0 %	50 %	0 %	281411712
5591	NC_013642	GGAGGC	2	12	275041	275052	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	281411712
5592	NC_013642	TTTTC	2	10	275076	275085	0 %	80 %	0 %	20 %	281411712
5593	NC_013642	AAT	2	6	275133	275138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281411712
5594	NC_013642	GTA	2	6	275158	275163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411712
5595	NC_013642	TCC	2	6	275185	275190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411712
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5597	NC_013642	A	7	7	275198	275204	100 %	0 %	0 %	0 %	281411712
5598	NC_013642	ACC	2	6	275225	275230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411712
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5601	NC_013642	ACG	2	6	275474	275479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411713
5602	NC_013642	AC	3	6	275501	275506	50 %	0 %	0 %	50 %	281411713
5603	NC_013642	GTG	2	6	275557	275562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411713
5604	NC_013642	AAAG	2	8	275664	275671	75 %	0 %	25 %	0 %	281411713
5605	NC_013642	TTC	2	6	275720	275725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411713
5606	NC_013642	AAG	2	6	275814	275819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411713
5607	NC_013642	ACC	2	6	275825	275830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411713
5608	NC_013642	GAA	2	6	275900	275905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411713
5609	NC_013642	CAT	2	6	275928	275933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411713
5610	NC_013642	ATG	2	6	275980	275985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411713
5611	NC_013642	GAA	2	6	276005	276010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411713
5612	NC_013642	ACC	2	6	276050	276055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411713
5613	NC_013642	AGGAT	2	10	276115	276124	40 %	20 %	40 %	0 %	281411713
5614	NC_013642	CTT	2	6	276142	276147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411713
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5619	NC_013642	AAG	2	6	276394	276399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411714
5620	NC_013642	CAGG	2	8	276408	276415	25 %	0 %	50 %	25 %	281411714
5621	NC_013642	TCG	2	6	276443	276448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411714
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5623	NC_013642	AGA	2	6	276570	276575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411714
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5747	NC_013642	GA	3	6	281958	281963	50 %	0 %	50 %	0 %	281411721
5748	NC_013642	TCC	2	6	281999	282004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411721
5749	NC_013642	ACC	2	6	282121	282126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411721
5750	NC_013642	CTT	2	6	282207	282212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411721
5751	NC_013642	TG	4	8	282228	282235	0 %	50 %	50 %	0 %	281411721
5752	NC_013642	TC	3	6	282245	282250	0 %	50 %	0 %	50 %	281411721
5753	NC_013642	AG	3	6	282281	282286	50 %	0 %	50 %	0 %	281411721
5754	NC_013642	TCT	2	6	282319	282324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411721
5755	NC_013642	ATC	2	6	282349	282354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411721
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5759	NC_013642	TCTT	2	8	282452	282459	0 %	75 %	0 %	25 %	281411721
5760	NC_013642	TCTT	2	8	282486	282493	0 %	75 %	0 %	25 %	281411721
5761	NC_013642	AGT	2	6	282525	282530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411721
5762	NC_013642	TCT	2	6	282539	282544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411721
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5768	NC_013642	GAA	2	6	282895	282900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411722
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5770	NC_013642	GAG	2	6	283012	283017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411722
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5772	NC_013642	ACG	2	6	283124	283129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411722
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5774	NC_013642	GGT	2	6	283228	283233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411722
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5776	NC_013642	CT	3	6	283335	283340	0 %	50 %	0 %	50 %	281411722
5777	NC_013642	CTT	2	6	283395	283400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411722
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5855	NC_013642	CCAAT	2	10	287079	287088	40 %	20 %	0 %	40 %	281411726
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5866	NC_013642	AAG	2	6	287771	287776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411726
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5992	NC_013642	CT	3	6	293173	293178	0 %	50 %	0 %	50 %	281411732
5993	NC_013642	TC	3	6	293193	293198	0 %	50 %	0 %	50 %	281411732
5994	NC_013642	T	6	6	293206	293211	0 %	100 %	0 %	0 %	281411732
5995	NC_013642	CAT	2	6	293212	293217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411732
5996	NC_013642	ATCC	2	8	293254	293261	25 %	25 %	0 %	50 %	281411732
5997	NC_013642	AGA	2	6	293267	293272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411732
5998	NC_013642	TTTC	2	8	293284	293291	0 %	75 %	0 %	25 %	281411732
5999	NC_013642	ATG	2	6	293300	293305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411732
6000	NC_013642	GTT	2	6	293328	293333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411732

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