MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_013642	CTC	2	6	246999	247004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411685
5003	NC_013642	ATG	2	6	247010	247015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411685
5004	NC_013642	CTC	2	6	247113	247118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411685
5005	NC_013642	GAAT	2	8	247122	247129	50 %	25 %	25 %	0 %	281411685
5006	NC_013642	CTG	2	6	247151	247156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411685
5007	NC_013642	AG	4	8	247178	247185	50 %	0 %	50 %	0 %	281411685
5008	NC_013642	AAC	2	6	247189	247194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411685
5009	NC_013642	CTC	2	6	247254	247259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411685
5010	NC_013642	GTTG	2	8	247261	247268	0 %	50 %	50 %	0 %	281411685
5011	NC_013642	A	6	6	247283	247288	100 %	0 %	0 %	0 %	281411685
5012	NC_013642	GAA	2	6	247300	247305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411685
5013	NC_013642	TCGC	2	8	247319	247326	0 %	25 %	25 %	50 %	281411685
5014	NC_013642	C	6	6	247475	247480	0 %	0 %	0 %	100 %	281411686
5015	NC_013642	AC	3	6	247555	247560	50 %	0 %	0 %	50 %	281411686
5016	NC_013642	TTC	2	6	247625	247630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411686
5017	NC_013642	TTC	2	6	247717	247722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411686
5018	NC_013642	TTC	2	6	247834	247839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411686
5019	NC_013642	GAA	2	6	247844	247849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411686
5020	NC_013642	T	6	6	247883	247888	0 %	100 %	0 %	0 %	281411686
5021	NC_013642	CAC	2	6	247922	247927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411686
5022	NC_013642	GAA	2	6	247942	247947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411686
5023	NC_013642	TGA	2	6	248004	248009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411686
5024	NC_013642	CT	3	6	248023	248028	0 %	50 %	0 %	50 %	281411686
5025	NC_013642	GTTCT	2	10	248058	248067	0 %	60 %	20 %	20 %	281411686
5026	NC_013642	AAG	2	6	248091	248096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411686
5027	NC_013642	AG	3	6	248095	248100	50 %	0 %	50 %	0 %	281411686
5028	NC_013642	CTT	2	6	248124	248129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411686
5029	NC_013642	TCC	2	6	248147	248152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411686
5030	NC_013642	TTTTC	2	10	248202	248211	0 %	80 %	0 %	20 %	281411686
5031	NC_013642	TCC	2	6	248219	248224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411686
5032	NC_013642	CTTC	2	8	248250	248257	0 %	50 %	0 %	50 %	281411687
5033	NC_013642	AGA	2	6	248334	248339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411687
5034	NC_013642	ACC	2	6	248343	248348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411687
5035	NC_013642	T	7	7	248350	248356	0 %	100 %	0 %	0 %	281411687
5036	NC_013642	TTTTCA	2	12	248430	248441	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	281411687
5037	NC_013642	ATC	2	6	248498	248503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411687
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5039	NC_013642	ACC	2	6	248567	248572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411687
5040	NC_013642	CGAA	2	8	248650	248657	50 %	0 %	25 %	25 %	281411687
5041	NC_013642	ATC	2	6	248660	248665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411687
5042	NC_013642	AGGA	2	8	248705	248712	50 %	0 %	50 %	0 %	281411687
5043	NC_013642	GA	4	8	248711	248718	50 %	0 %	50 %	0 %	281411687
5044	NC_013642	A	7	7	248741	248747	100 %	0 %	0 %	0 %	281411687
5045	NC_013642	TAT	2	6	248807	248812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411687
5046	NC_013642	AACA	2	8	248879	248886	75 %	0 %	0 %	25 %	281411687
5047	NC_013642	TCC	2	6	248921	248926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411688
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5049	NC_013642	CGT	2	6	248970	248975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411688
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5052	NC_013642	TCC	2	6	249089	249094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411688
5053	NC_013642	TCT	2	6	249149	249154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411688
5054	NC_013642	ATC	2	6	249191	249196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411688
5055	NC_013642	TTC	2	6	249202	249207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411688
5056	NC_013642	TTTC	2	8	249248	249255	0 %	75 %	0 %	25 %	281411688
5057	NC_013642	CT	3	6	249278	249283	0 %	50 %	0 %	50 %	281411688
5058	NC_013642	TTG	2	6	249302	249307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411688
5059	NC_013642	GTTCT	2	10	249332	249341	0 %	60 %	20 %	20 %	281411688
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5063	NC_013642	TCC	3	9	249535	249543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411688
5064	NC_013642	TGC	2	6	249550	249555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411688
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5069	NC_013642	TAG	2	6	250997	251002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411689
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5077	NC_013642	CAT	2	6	251189	251194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411689
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5080	NC_013642	GAAA	2	8	251297	251304	75 %	0 %	25 %	0 %	281411689
5081	NC_013642	CCG	2	6	251320	251325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411689
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5089	NC_013642	T	6	6	251506	251511	0 %	100 %	0 %	0 %	281411690
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5098	NC_013642	CTTC	2	8	251950	251957	0 %	50 %	0 %	50 %	281411691
5099	NC_013642	TCC	2	6	252019	252024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411691
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5104	NC_013642	A	6	6	252263	252268	100 %	0 %	0 %	0 %	281411691
5105	NC_013642	CTTT	2	8	252300	252307	0 %	75 %	0 %	25 %	281411691
5106	NC_013642	TCT	2	6	252345	252350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411691
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5108	NC_013642	GAGAA	2	10	252519	252528	60 %	0 %	40 %	0 %	281411691
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5112	NC_013642	AAAAC	2	10	252699	252708	80 %	0 %	0 %	20 %	281411691
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5117	NC_013642	A	6	6	252805	252810	100 %	0 %	0 %	0 %	281411691
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5121	NC_013642	AG	3	6	252982	252987	50 %	0 %	50 %	0 %	281411692
5122	NC_013642	GA	3	6	252993	252998	50 %	0 %	50 %	0 %	281411692
5123	NC_013642	TCCA	2	8	253021	253028	25 %	25 %	0 %	50 %	281411692
5124	NC_013642	GAG	2	6	253110	253115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411692
5125	NC_013642	TC	3	6	253116	253121	0 %	50 %	0 %	50 %	281411692
5126	NC_013642	CTT	2	6	253127	253132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411692
5127	NC_013642	GAA	2	6	253145	253150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411692
5128	NC_013642	ATT	2	6	253156	253161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411692
5129	NC_013642	AGA	2	6	253191	253196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411692
5130	NC_013642	GGA	2	6	253211	253216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411692
5131	NC_013642	GAA	2	6	253251	253256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411692
5132	NC_013642	GATA	2	8	253259	253266	50 %	25 %	25 %	0 %	281411692
5133	NC_013642	T	7	7	253368	253374	0 %	100 %	0 %	0 %	281411692
5134	NC_013642	GATC	2	8	253400	253407	25 %	25 %	25 %	25 %	281411692
5135	NC_013642	AC	3	6	253415	253420	50 %	0 %	0 %	50 %	281411692
5136	NC_013642	ATC	2	6	253459	253464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411692
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5138	NC_013642	GAT	2	6	253507	253512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411692
5139	NC_013642	TTTCA	2	10	253593	253602	20 %	60 %	0 %	20 %	281411692
5140	NC_013642	TCG	2	6	253635	253640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411693
5141	NC_013642	TCGTAG	2	12	253698	253709	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	281411693
5142	NC_013642	CAA	2	6	253741	253746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411693
5143	NC_013642	TTTC	2	8	253845	253852	0 %	75 %	0 %	25 %	281411693
5144	NC_013642	TTG	2	6	253893	253898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411693
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5147	NC_013642	CCA	2	6	254025	254030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411693
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5150	NC_013642	CT	3	6	254173	254178	0 %	50 %	0 %	50 %	281411694
5151	NC_013642	TTC	2	6	254198	254203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411694
5152	NC_013642	GAG	2	6	254249	254254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411694
5153	NC_013642	TCTT	2	8	254305	254312	0 %	75 %	0 %	25 %	281411694
5154	NC_013642	CAT	3	9	254366	254374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411694
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5156	NC_013642	CGA	2	6	254494	254499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411694
5157	NC_013642	TTC	2	6	254501	254506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411694
5158	NC_013642	CAT	2	6	254540	254545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411694
5159	NC_013642	ACG	2	6	254571	254576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411694
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5162	NC_013642	TTG	2	6	254691	254696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411694
5163	NC_013642	GTC	2	6	254708	254713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411694
5164	NC_013642	TTC	2	6	254759	254764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411694
5165	NC_013642	CTT	2	6	254878	254883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411694
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5223	NC_013642	AG	3	6	257943	257948	50 %	0 %	50 %	0 %	281411697
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5229	NC_013642	CTG	2	6	258121	258126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411697
5230	NC_013642	CTT	2	6	258211	258216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411697
5231	NC_013642	ACG	2	6	258264	258269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411697
5232	NC_013642	GCT	2	6	258285	258290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411697
5233	NC_013642	CTT	2	6	258329	258334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411697
5234	NC_013642	TTTA	2	8	258371	258378	25 %	75 %	0 %	0 %	281411698
5235	NC_013642	TGT	2	6	258446	258451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411698
5236	NC_013642	GATC	2	8	258497	258504	25 %	25 %	25 %	25 %	281411698
5237	NC_013642	TCT	2	6	258538	258543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411698
5238	NC_013642	GA	3	6	258546	258551	50 %	0 %	50 %	0 %	281411698
5239	NC_013642	TCT	2	6	258602	258607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411698
5240	NC_013642	GAG	2	6	258669	258674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411698
5241	NC_013642	T	7	7	258749	258755	0 %	100 %	0 %	0 %	281411698
5242	NC_013642	TGT	2	6	258785	258790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411698
5243	NC_013642	ATG	2	6	258799	258804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411698
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5245	NC_013642	TCT	2	6	258862	258867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411698
5246	NC_013642	TTG	3	9	258880	258888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411698
5247	NC_013642	TTG	2	6	258913	258918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411698
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5252	NC_013642	TCT	2	6	259169	259174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411698
5253	NC_013642	GA	3	6	259294	259299	50 %	0 %	50 %	0 %	281411698
5254	NC_013642	CAA	2	6	259304	259309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411698
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5262	NC_013642	T	7	7	259663	259669	0 %	100 %	0 %	0 %	281411699
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5266	NC_013642	GAG	2	6	259843	259848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411699
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5269	NC_013642	T	6	6	259943	259948	0 %	100 %	0 %	0 %	281411699
5270	NC_013642	TTC	2	6	259954	259959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411699
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5273	NC_013642	TCTT	2	8	260034	260041	0 %	75 %	0 %	25 %	281411699
5274	NC_013642	TTC	2	6	260059	260064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411699
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5278	NC_013642	AGG	2	6	260279	260284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411699
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5334	NC_013642	AG	3	6	262674	262679	50 %	0 %	50 %	0 %	281411701
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5338	NC_013642	GGAT	2	8	262995	263002	25 %	25 %	50 %	0 %	281411701
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5345	NC_013642	TCTATT	2	12	263326	263337	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	281411701
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5350	NC_013642	T	6	6	263658	263663	0 %	100 %	0 %	0 %	281411701
5351	NC_013642	TCT	2	6	263712	263717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411701
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5355	NC_013642	CTT	2	6	263927	263932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411702
5356	NC_013642	GAA	2	6	263957	263962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411702
5357	NC_013642	ACG	2	6	263976	263981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411702
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5362	NC_013642	GAA	3	9	264142	264150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411702
5363	NC_013642	GA	3	6	264154	264159	50 %	0 %	50 %	0 %	281411702
5364	NC_013642	T	6	6	264187	264192	0 %	100 %	0 %	0 %	281411702
5365	NC_013642	AAGA	2	8	264236	264243	75 %	0 %	25 %	0 %	281411702
5366	NC_013642	AGAA	2	8	264291	264298	75 %	0 %	25 %	0 %	281411702
5367	NC_013642	TCT	2	6	264302	264307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411702
5368	NC_013642	CTG	2	6	264322	264327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411702
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5492	NC_013642	AGT	2	6	270692	270697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411705
5493	NC_013642	GGA	2	6	270725	270730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411705
5494	NC_013642	CTTG	2	8	270753	270760	0 %	50 %	25 %	25 %	281411705
5495	NC_013642	AGA	2	6	270779	270784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411705
5496	NC_013642	CGT	2	6	270803	270808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411705
5497	NC_013642	GAA	2	6	270822	270827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411705
5498	NC_013642	ATG	2	6	270886	270891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411705
5499	NC_013642	TCG	2	6	270899	270904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411705
5500	NC_013642	CT	4	8	270905	270912	0 %	50 %	0 %	50 %	281411705

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