MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 36927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013642	ATG	2	6	222265	222270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411667
4502	NC_013642	ATG	2	6	222421	222426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411667
4503	NC_013642	ACA	2	6	222427	222432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411667
4504	NC_013642	GGT	2	6	222522	222527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411667
4505	NC_013642	ACC	2	6	222568	222573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411667
4506	NC_013642	TGA	2	6	222584	222589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411667
4507	NC_013642	CT	3	6	222633	222638	0 %	50 %	0 %	50 %	281411667
4508	NC_013642	CAC	2	6	222645	222650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411667
4509	NC_013642	ATG	2	6	222703	222708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411667
4510	NC_013642	CGC	2	6	222761	222766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411667
4511	NC_013642	TCA	2	6	222799	222804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411667
4512	NC_013642	GAA	2	6	222809	222814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411667
4513	NC_013642	TCG	2	6	222838	222843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411667
4514	NC_013642	CGT	2	6	222998	223003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411667
4515	NC_013642	CTGT	2	8	223024	223031	0 %	50 %	25 %	25 %	281411667
4516	NC_013642	CAT	2	6	223106	223111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411667
4517	NC_013642	GTG	2	6	223186	223191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411667
4518	NC_013642	TCAC	2	8	223201	223208	25 %	25 %	0 %	50 %	281411667
4519	NC_013642	GT	3	6	223232	223237	0 %	50 %	50 %	0 %	281411667
4520	NC_013642	GAT	2	6	223246	223251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411667
4521	NC_013642	TCT	2	6	223263	223268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411667
4522	NC_013642	TTCT	2	8	223514	223521	0 %	75 %	0 %	25 %	281411668
4523	NC_013642	CCTT	2	8	223535	223542	0 %	50 %	0 %	50 %	281411668
4524	NC_013642	GTT	2	6	223602	223607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411668
4525	NC_013642	GGTG	2	8	223715	223722	0 %	25 %	75 %	0 %	281411668
4526	NC_013642	CCA	2	6	223730	223735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411668
4527	NC_013642	GCT	2	6	223750	223755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411668
4528	NC_013642	CTCCCG	2	12	223757	223768	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	281411668
4529	NC_013642	TTC	2	6	223791	223796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411668
4530	NC_013642	TTC	2	6	223875	223880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411668
4531	NC_013642	CTGC	2	8	223892	223899	0 %	25 %	25 %	50 %	281411668
4532	NC_013642	ATG	2	6	223930	223935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411668
4533	NC_013642	CTCC	2	8	223957	223964	0 %	25 %	0 %	75 %	281411669
4534	NC_013642	GAC	2	6	223970	223975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411669
4535	NC_013642	TTC	2	6	223986	223991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411669
4536	NC_013642	CCA	2	6	224032	224037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411669
4537	NC_013642	T	7	7	224075	224081	0 %	100 %	0 %	0 %	281411669
4538	NC_013642	CTT	2	6	224119	224124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411669
4539	NC_013642	CCAAT	2	10	224125	224134	40 %	20 %	0 %	40 %	281411669
4540	NC_013642	ATA	2	6	224150	224155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281411669
4541	NC_013642	TCCT	2	8	224156	224163	0 %	50 %	0 %	50 %	281411669
4542	NC_013642	GAG	2	6	224168	224173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411669
4543	NC_013642	CA	3	6	224261	224266	50 %	0 %	0 %	50 %	281411669
4544	NC_013642	TG	3	6	224293	224298	0 %	50 %	50 %	0 %	281411669
4545	NC_013642	ACA	2	6	224388	224393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411669
4546	NC_013642	TCT	2	6	224430	224435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411669
4547	NC_013642	TCG	2	6	224478	224483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411669
4548	NC_013642	CCA	2	6	224494	224499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411669
4549	NC_013642	CCA	2	6	224536	224541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411669
4550	NC_013642	TTCT	2	8	224552	224559	0 %	75 %	0 %	25 %	281411669
4551	NC_013642	CTC	2	6	224573	224578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411669
4552	NC_013642	AGGT	2	8	224580	224587	25 %	25 %	50 %	0 %	281411669
4553	NC_013642	T	6	6	224622	224627	0 %	100 %	0 %	0 %	281411669
4554	NC_013642	ATG	2	6	224628	224633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411669
4555	NC_013642	AC	3	6	224635	224640	50 %	0 %	0 %	50 %	281411669
4556	NC_013642	CGT	2	6	224647	224652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411669
4557	NC_013642	TCC	2	6	224654	224659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411669
4558	NC_013642	AAC	2	6	224675	224680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411669
4559	NC_013642	TTC	2	6	224754	224759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411669
4560	NC_013642	TGAA	2	8	224772	224779	50 %	25 %	25 %	0 %	281411669
4561	NC_013642	TCG	2	6	224832	224837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411669
4562	NC_013642	TTC	2	6	224844	224849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411669
4563	NC_013642	GGT	2	6	224882	224887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411669
4564	NC_013642	TTCT	2	8	224917	224924	0 %	75 %	0 %	25 %	281411669
4565	NC_013642	A	6	6	224931	224936	100 %	0 %	0 %	0 %	281411669
4566	NC_013642	CGG	2	6	224968	224973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411669
4567	NC_013642	TCT	2	6	225016	225021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411669
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4569	NC_013642	CCG	2	6	225057	225062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411669
4570	NC_013642	CTC	2	6	225092	225097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411670
4571	NC_013642	GAA	2	6	225111	225116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411670
4572	NC_013642	AAG	2	6	225174	225179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411670
4573	NC_013642	ACG	2	6	225184	225189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411670
4574	NC_013642	CTG	2	6	225206	225211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411670
4575	NC_013642	AG	4	8	225213	225220	50 %	0 %	50 %	0 %	281411670
4576	NC_013642	TCT	2	6	225238	225243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411670
4577	NC_013642	CCG	2	6	225247	225252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411670
4578	NC_013642	GAC	2	6	225273	225278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411670
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4580	NC_013642	AGT	2	6	225347	225352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411670
4581	NC_013642	GTTCC	2	10	225392	225401	0 %	40 %	20 %	40 %	281411670
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4583	NC_013642	CG	4	8	225528	225535	0 %	0 %	50 %	50 %	281411670
4584	NC_013642	CGAG	2	8	225542	225549	25 %	0 %	50 %	25 %	281411670
4585	NC_013642	GTA	2	6	225552	225557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411670
4586	NC_013642	TGTATC	2	12	225593	225604	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	281411670
4587	NC_013642	T	6	6	225647	225652	0 %	100 %	0 %	0 %	281411670
4588	NC_013642	GAAGA	2	10	225692	225701	60 %	0 %	40 %	0 %	281411670
4589	NC_013642	GGT	2	6	225741	225746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411670
4590	NC_013642	CTTC	2	8	225814	225821	0 %	50 %	0 %	50 %	281411670
4591	NC_013642	CTT	2	6	225826	225831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411670
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4593	NC_013642	CTT	2	6	225935	225940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411670
4594	NC_013642	TCCA	2	8	225950	225957	25 %	25 %	0 %	50 %	281411670
4595	NC_013642	T	6	6	225980	225985	0 %	100 %	0 %	0 %	281411670
4596	NC_013642	CTT	2	6	225989	225994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411670
4597	NC_013642	AT	3	6	226044	226049	50 %	50 %	0 %	0 %	281411670
4598	NC_013642	CTG	2	6	226069	226074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411670
4599	NC_013642	TCT	2	6	226105	226110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411670
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4601	NC_013642	CCA	2	6	226151	226156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411670
4602	NC_013642	GTTTT	2	10	226163	226172	0 %	80 %	20 %	0 %	281411670
4603	NC_013642	GTC	2	6	226233	226238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411670
4604	NC_013642	CCAC	2	8	226253	226260	25 %	0 %	0 %	75 %	281411670
4605	NC_013642	TTC	2	6	226276	226281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411670
4606	NC_013642	TC	3	6	226424	226429	0 %	50 %	0 %	50 %	281411670
4607	NC_013642	TCT	2	6	226440	226445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411670
4608	NC_013642	TAC	2	6	226449	226454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411670
4609	NC_013642	ACC	2	6	226459	226464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411670
4610	NC_013642	TTCTT	2	10	226477	226486	0 %	80 %	0 %	20 %	281411670
4611	NC_013642	TTTC	2	8	226526	226533	0 %	75 %	0 %	25 %	281411670
4612	NC_013642	GAA	2	6	226536	226541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411670
4613	NC_013642	GTT	2	6	226569	226574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411670
4614	NC_013642	TCTT	2	8	226600	226607	0 %	75 %	0 %	25 %	281411670
4615	NC_013642	GAA	2	6	226639	226644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411670
4616	NC_013642	TC	3	6	226651	226656	0 %	50 %	0 %	50 %	281411670
4617	NC_013642	TTTC	2	8	226844	226851	0 %	75 %	0 %	25 %	281411670
4618	NC_013642	T	6	6	226908	226913	0 %	100 %	0 %	0 %	281411670
4619	NC_013642	CCA	2	6	226916	226921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411670
4620	NC_013642	TCC	2	6	226969	226974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411670
4621	NC_013642	GAC	2	6	226980	226985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411670
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4623	NC_013642	AG	3	6	227026	227031	50 %	0 %	50 %	0 %	281411670
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4991	NC_013642	TCTT	2	8	246421	246428	0 %	75 %	0 %	25 %	281411684
4992	NC_013642	TTC	2	6	246460	246465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411684
4993	NC_013642	GA	3	6	246490	246495	50 %	0 %	50 %	0 %	281411684
4994	NC_013642	CCGG	2	8	246569	246576	0 %	0 %	50 %	50 %	281411684
4995	NC_013642	TCC	2	6	246582	246587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411684
4996	NC_013642	GAG	2	6	246615	246620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411684
4997	NC_013642	CTA	2	6	246782	246787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411684
4998	NC_013642	TC	3	6	246788	246793	0 %	50 %	0 %	50 %	281411684
4999	NC_013642	CCT	2	6	246794	246799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411684
5000	NC_013642	CTCTT	2	10	246930	246939	0 %	60 %	0 %	40 %	281411684

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