MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 2

Total Repeats: 23339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013526	CTT	2	6	139722	139727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269839047
3002	NC_013526	TGC	2	6	139751	139756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839047
3003	NC_013526	G	6	6	139774	139779	0 %	0 %	100 %	0 %	269839047
3004	NC_013526	GGC	2	6	139803	139808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839047
3005	NC_013526	TGC	2	6	139817	139822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839047
3006	NC_013526	GAG	2	6	139902	139907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839047
3007	NC_013526	GTG	2	6	139923	139928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839048
3008	NC_013526	CTG	2	6	139983	139988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839048
3009	NC_013526	ACA	2	6	140044	140049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269839048
3010	NC_013526	CGT	2	6	140063	140068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839048
3011	NC_013526	GTG	2	6	140115	140120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839048
3012	NC_013526	CAT	2	6	140189	140194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839048
3013	NC_013526	CTCG	2	8	140255	140262	0 %	25 %	25 %	50 %	269839048
3014	NC_013526	CCG	2	6	140263	140268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839048
3015	NC_013526	TC	4	8	140302	140309	0 %	50 %	0 %	50 %	269839048
3016	NC_013526	GCC	2	6	140312	140317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839048
3017	NC_013526	CGCTG	2	10	140318	140327	0 %	20 %	40 %	40 %	269839048
3018	NC_013526	GCC	2	6	140334	140339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839048
3019	NC_013526	GTG	2	6	140340	140345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839048
3020	NC_013526	G	6	6	140375	140380	0 %	0 %	100 %	0 %	269839048
3021	NC_013526	GCTGGT	2	12	140396	140407	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	269839048
3022	NC_013526	GGGGT	2	10	140409	140418	0 %	20 %	80 %	0 %	269839048
3023	NC_013526	ACC	2	6	140442	140447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839048
3024	NC_013526	GAG	2	6	140529	140534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839048
3025	NC_013526	TGC	2	6	140545	140550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839048
3026	NC_013526	TGC	2	6	140560	140565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839048
3027	NC_013526	CGG	2	6	140572	140577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839048
3028	NC_013526	CCA	2	6	140590	140595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839048
3029	NC_013526	GAG	2	6	140619	140624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839048
3030	NC_013526	GCC	3	9	140682	140690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839048
3031	NC_013526	CGG	2	6	140695	140700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839048
3032	NC_013526	C	6	6	140746	140751	0 %	0 %	0 %	100 %	269839048
3033	NC_013526	CCA	2	6	140780	140785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839048
3034	NC_013526	GCT	2	6	140789	140794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839048
3035	NC_013526	GCCG	2	8	140795	140802	0 %	0 %	50 %	50 %	269839048
3036	NC_013526	CTGG	2	8	140808	140815	0 %	25 %	50 %	25 %	269839048
3037	NC_013526	GCTG	2	8	140831	140838	0 %	25 %	50 %	25 %	269839048
3038	NC_013526	GTG	2	6	140886	140891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839048
3039	NC_013526	CTG	2	6	140916	140921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839048
3040	NC_013526	CTG	2	6	140925	140930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839048
3041	NC_013526	CTG	2	6	141032	141037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839049
3042	NC_013526	CTG	2	6	141092	141097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839049
3043	NC_013526	CGGG	2	8	141125	141132	0 %	0 %	75 %	25 %	269839049
3044	NC_013526	AGG	2	6	141188	141193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839049
3045	NC_013526	TCC	2	6	141201	141206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839049
3046	NC_013526	GCTG	2	8	141279	141286	0 %	25 %	50 %	25 %	269839049
3047	NC_013526	CAG	2	6	141287	141292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839049
3048	NC_013526	GAG	2	6	141308	141313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839049
3049	NC_013526	GTG	2	6	141365	141370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839049
3050	NC_013526	GGC	2	6	141383	141388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839049
3051	NC_013526	CTG	2	6	141443	141448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839049
3052	NC_013526	CAC	2	6	141457	141462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839049
3053	NC_013526	TGC	2	6	141492	141497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839049
3054	NC_013526	GCT	2	6	141499	141504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839049
3055	NC_013526	GCA	2	6	141505	141510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839049
3056	NC_013526	TGC	2	6	141546	141551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839049
3057	NC_013526	TGG	2	6	141588	141593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839049
3058	NC_013526	CGC	2	6	141616	141621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839049
3059	NC_013526	TGC	2	6	141654	141659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839049
3060	NC_013526	TGG	2	6	141690	141695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839049
3061	NC_013526	AG	3	6	141700	141705	50 %	0 %	50 %	0 %	269839049
3062	NC_013526	CCT	2	6	141711	141716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839049
3063	NC_013526	CTGC	2	8	141718	141725	0 %	25 %	25 %	50 %	269839049
3064	NC_013526	TC	3	6	141978	141983	0 %	50 %	0 %	50 %	269839050
3065	NC_013526	TGG	2	6	142003	142008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839050
3066	NC_013526	CTG	2	6	142026	142031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839050
3067	NC_013526	AGC	2	6	142056	142061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839050
3068	NC_013526	GGAGGC	2	12	142112	142123	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	269839050
3069	NC_013526	CACC	2	8	142132	142139	25 %	0 %	0 %	75 %	269839050
3070	NC_013526	GGT	2	6	142145	142150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839050
3071	NC_013526	CGA	2	6	142199	142204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839050
3072	NC_013526	CGT	2	6	142214	142219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839050
3073	NC_013526	GCC	2	6	142260	142265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839050
3074	NC_013526	AGG	2	6	142372	142377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839050
3075	NC_013526	CAG	2	6	142401	142406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839050
3076	NC_013526	TGC	2	6	142528	142533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839050
3077	NC_013526	CTG	2	6	142539	142544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839050
3078	NC_013526	GAA	2	6	142583	142588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269839050
3079	NC_013526	GAG	2	6	142602	142607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839050
3080	NC_013526	TCC	2	6	142627	142632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839050
3081	NC_013526	CGA	2	6	142640	142645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839050
3082	NC_013526	GAG	2	6	142698	142703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839050
3083	NC_013526	GAG	2	6	142719	142724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839050
3084	NC_013526	GAG	2	6	142785	142790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839050
3085	NC_013526	GGA	2	6	142871	142876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839050
3086	NC_013526	ATG	2	6	142887	142892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839050
3087	NC_013526	GAG	2	6	142893	142898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839050
3088	NC_013526	GCA	2	6	142997	143002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839050
3089	NC_013526	TGG	2	6	143017	143022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839050
3090	NC_013526	GCGA	2	8	143079	143086	25 %	0 %	50 %	25 %	269839050
3091	NC_013526	GAG	2	6	143103	143108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839050
3092	NC_013526	TGC	2	6	143170	143175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839051
3093	NC_013526	TGA	2	6	143197	143202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839051
3094	NC_013526	TGG	2	6	143212	143217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839051
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3098	NC_013526	CTG	2	6	143550	143555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839051
3099	NC_013526	CCT	2	6	143596	143601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839051
3100	NC_013526	CTG	2	6	143712	143717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839051
3101	NC_013526	GCT	2	6	143747	143752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839051
3102	NC_013526	GCT	2	6	143789	143794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839051
3103	NC_013526	GGT	2	6	143801	143806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839051
3104	NC_013526	TGG	2	6	143812	143817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839051
3105	NC_013526	TGC	2	6	143851	143856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839051
3106	NC_013526	TGGA	2	8	143877	143884	25 %	25 %	50 %	0 %	269839051
3107	NC_013526	GCT	2	6	144002	144007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839051
3108	NC_013526	TCC	2	6	144049	144054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839051
3109	NC_013526	CCG	2	6	144061	144066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839051
3110	NC_013526	TGC	2	6	144154	144159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839051
3111	NC_013526	AG	3	6	144189	144194	50 %	0 %	50 %	0 %	269839051
3112	NC_013526	GGC	2	6	144302	144307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839051
3113	NC_013526	GCT	3	9	144317	144325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839051
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3115	NC_013526	CAGG	2	8	144398	144405	25 %	0 %	50 %	25 %	269839051
3116	NC_013526	GGATAG	2	12	144441	144452	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	269839052
3117	NC_013526	GGC	2	6	144458	144463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839052
3118	NC_013526	TGC	2	6	144480	144485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839052
3119	NC_013526	CAC	2	6	144529	144534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839052
3120	NC_013526	ACG	2	6	144537	144542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839052
3121	NC_013526	CGT	2	6	144565	144570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839052
3122	NC_013526	GGC	2	6	144592	144597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839052
3123	NC_013526	GTG	2	6	144629	144634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839052
3124	NC_013526	CAC	2	6	144640	144645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839052
3125	NC_013526	AGC	2	6	144717	144722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839052
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3129	NC_013526	GGA	2	6	144904	144909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839052
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3133	NC_013526	CT	3	6	145181	145186	0 %	50 %	0 %	50 %	269839052
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3135	NC_013526	CTG	2	6	145214	145219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839052
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3141	NC_013526	GTCG	2	8	145345	145352	0 %	25 %	50 %	25 %	269839052
3142	NC_013526	G	6	6	145375	145380	0 %	0 %	100 %	0 %	269839052
3143	NC_013526	CCCG	2	8	145472	145479	0 %	0 %	25 %	75 %	269839052
3144	NC_013526	GTG	2	6	145541	145546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839052
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3162	NC_013526	ATAG	2	8	146348	146355	50 %	25 %	25 %	0 %	269839052
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3210	NC_013526	GCAAC	2	10	147900	147909	40 %	0 %	20 %	40 %	269839055
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3226	NC_013526	GCGG	2	8	148602	148609	0 %	0 %	75 %	25 %	269839055
3227	NC_013526	TCCG	2	8	148655	148662	0 %	25 %	25 %	50 %	269839055
3228	NC_013526	AGGC	2	8	148882	148889	25 %	0 %	50 %	25 %	269839056
3229	NC_013526	TC	3	6	148891	148896	0 %	50 %	0 %	50 %	269839056
3230	NC_013526	GAT	2	6	148939	148944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839056
3231	NC_013526	GC	3	6	149007	149012	0 %	0 %	50 %	50 %	269839056
3232	NC_013526	GATCAT	2	12	149046	149057	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269839056
3233	NC_013526	CGG	2	6	149165	149170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839057
3234	NC_013526	GAA	2	6	149202	149207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269839057
3235	NC_013526	CAG	2	6	149232	149237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839057
3236	NC_013526	AG	3	6	149244	149249	50 %	0 %	50 %	0 %	269839057
3237	NC_013526	TGA	2	6	149303	149308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839057
3238	NC_013526	AGA	2	6	149345	149350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269839057
3239	NC_013526	GCA	2	6	149414	149419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839057
3240	NC_013526	CCA	2	6	149427	149432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839057
3241	NC_013526	GGC	2	6	149463	149468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839057
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3353	NC_013526	GGTG	2	8	153447	153454	0 %	25 %	75 %	0 %	269839061
3354	NC_013526	CGA	2	6	153464	153469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839061
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3356	NC_013526	CTG	2	6	153751	153756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839062
3357	NC_013526	CTC	2	6	153759	153764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839062
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3361	NC_013526	GGA	2	6	153933	153938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839062
3362	NC_013526	GTC	2	6	153981	153986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839062
3363	NC_013526	CAC	2	6	154020	154025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839062
3364	NC_013526	CGC	2	6	154031	154036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839062
3365	NC_013526	AGC	2	6	154045	154050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839062
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3368	NC_013526	GC	3	6	154091	154096	0 %	0 %	50 %	50 %	269839062
3369	NC_013526	CAG	2	6	154143	154148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839062
3370	NC_013526	CAT	2	6	154149	154154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839062
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3372	NC_013526	GAT	2	6	154302	154307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839062
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3382	NC_013526	TGA	2	6	154856	154861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839063
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3384	NC_013526	GTC	3	9	154890	154898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839063
3385	NC_013526	AAGCCA	2	12	154963	154974	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	269839063
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3389	NC_013526	GGC	2	6	155097	155102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839063
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3403	NC_013526	CAGC	2	8	155740	155747	25 %	0 %	25 %	50 %	269839064
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3481	NC_013526	GCTG	2	8	159408	159415	0 %	25 %	50 %	25 %	269839069
3482	NC_013526	CTT	2	6	159462	159467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269839069
3483	NC_013526	GGGGA	2	10	159493	159502	20 %	0 %	80 %	0 %	269839069
3484	NC_013526	GAG	2	6	159568	159573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839069
3485	NC_013526	TGC	2	6	159608	159613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839069
3486	NC_013526	GC	3	6	159612	159617	0 %	0 %	50 %	50 %	269839069
3487	NC_013526	GGA	2	6	159621	159626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839069
3488	NC_013526	ACG	2	6	159659	159664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839069
3489	NC_013526	GGT	2	6	159681	159686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839069
3490	NC_013526	GAG	2	6	159687	159692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839069
3491	NC_013526	GCT	2	6	159708	159713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839069
3492	NC_013526	CAC	2	6	159750	159755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839069
3493	NC_013526	GAG	2	6	159766	159771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839069
3494	NC_013526	CCTC	2	8	159821	159828	0 %	25 %	0 %	75 %	269839069
3495	NC_013526	CTG	2	6	159841	159846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839069
3496	NC_013526	CTT	2	6	159876	159881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269839069
3497	NC_013526	GGAT	2	8	159883	159890	25 %	25 %	50 %	0 %	269839069
3498	NC_013526	ACC	2	6	159958	159963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839069
3499	NC_013526	CGC	2	6	160023	160028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839069
3500	NC_013526	CAGCTG	2	12	160036	160047	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269839069

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