MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 2

Total Repeats: 23339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013526	TGG	2	6	249383	249388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839145
5502	NC_013526	GAG	2	6	249407	249412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839145
5503	NC_013526	GGA	2	6	249466	249471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839145
5504	NC_013526	TTC	2	6	249479	249484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269839145
5505	NC_013526	AGG	2	6	249588	249593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839145
5506	NC_013526	TCA	2	6	249600	249605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839145
5507	NC_013526	TGA	2	6	249654	249659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839145
5508	NC_013526	GGA	2	6	249673	249678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839145
5509	NC_013526	CAT	2	6	249710	249715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839145
5510	NC_013526	AGG	2	6	250335	250340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839146
5511	NC_013526	GTG	2	6	250359	250364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839146
5512	NC_013526	GGT	2	6	250430	250435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839146
5513	NC_013526	CCTC	2	8	250456	250463	0 %	25 %	0 %	75 %	269839146
5514	NC_013526	GCC	2	6	250575	250580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839146
5515	NC_013526	GGT	2	6	250606	250611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839146
5516	NC_013526	CCA	2	6	250633	250638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839146
5517	NC_013526	TGA	2	6	250705	250710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839146
5518	NC_013526	GGC	2	6	250732	250737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839146
5519	NC_013526	GCA	2	6	250741	250746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839146
5520	NC_013526	GGT	2	6	250757	250762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839146
5521	NC_013526	CGT	2	6	250780	250785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839146
5522	NC_013526	CAC	2	6	250796	250801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839146
5523	NC_013526	TAGG	2	8	250883	250890	25 %	25 %	50 %	0 %	269839146
5524	NC_013526	GTCG	2	8	250943	250950	0 %	25 %	50 %	25 %	269839146
5525	NC_013526	TGG	2	6	251056	251061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839146
5526	NC_013526	TGGG	2	8	251084	251091	0 %	25 %	75 %	0 %	269839146
5527	NC_013526	CGG	2	6	251114	251119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839146
5528	NC_013526	GAG	2	6	251234	251239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839146
5529	NC_013526	AGC	2	6	251250	251255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839146
5530	NC_013526	GCTG	2	8	251311	251318	0 %	25 %	50 %	25 %	269839147
5531	NC_013526	GTT	2	6	251346	251351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269839147
5532	NC_013526	GTA	2	6	251370	251375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839147
5533	NC_013526	CCAG	2	8	251378	251385	25 %	0 %	25 %	50 %	269839147
5534	NC_013526	TCG	2	6	251386	251391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839147
5535	NC_013526	GCA	3	9	251399	251407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839147
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5537	NC_013526	CGGC	2	8	251477	251484	0 %	0 %	50 %	50 %	269839147
5538	NC_013526	GGT	2	6	251523	251528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839147
5539	NC_013526	ACC	2	6	251536	251541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839147
5540	NC_013526	CAGC	2	8	251573	251580	25 %	0 %	25 %	50 %	269839147
5541	NC_013526	AGT	2	6	251642	251647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839147
5542	NC_013526	TGA	2	6	251729	251734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839147
5543	NC_013526	TCTG	2	8	251735	251742	0 %	50 %	25 %	25 %	269839147
5544	NC_013526	ACC	2	6	251815	251820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839147
5545	NC_013526	CCT	2	6	251825	251830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839147
5546	NC_013526	TGT	2	6	251843	251848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269839147
5547	NC_013526	CTCC	2	8	252066	252073	0 %	25 %	0 %	75 %	269839148
5548	NC_013526	AGG	2	6	252074	252079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839148
5549	NC_013526	GCTC	2	8	252120	252127	0 %	25 %	25 %	50 %	269839148
5550	NC_013526	CCCT	2	8	252139	252146	0 %	25 %	0 %	75 %	269839148
5551	NC_013526	CCT	2	6	252153	252158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839148
5552	NC_013526	GCC	2	6	252214	252219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839148
5553	NC_013526	TCG	2	6	252223	252228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839148
5554	NC_013526	GCC	2	6	252274	252279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839148
5555	NC_013526	GCG	2	6	252283	252288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839148
5556	NC_013526	AGG	2	6	252305	252310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839148
5557	NC_013526	CCA	2	6	252326	252331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839148
5558	NC_013526	GCA	2	6	252410	252415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839148
5559	NC_013526	CTGC	2	8	252440	252447	0 %	25 %	25 %	50 %	269839148
5560	NC_013526	TCC	2	6	252514	252519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839148
5561	NC_013526	TGG	2	6	252676	252681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839148
5562	NC_013526	TCCT	2	8	252700	252707	0 %	50 %	0 %	50 %	269839148
5563	NC_013526	CAG	2	6	252708	252713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839148
5564	NC_013526	GCC	2	6	252759	252764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839148
5565	NC_013526	GCC	2	6	252766	252771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839148
5566	NC_013526	CG	3	6	252783	252788	0 %	0 %	50 %	50 %	269839148
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5569	NC_013526	GCA	2	6	252842	252847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839148
5570	NC_013526	GCCA	2	8	252873	252880	25 %	0 %	25 %	50 %	269839148
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5573	NC_013526	CCCGC	2	10	253212	253221	0 %	0 %	20 %	80 %	269839149
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5589	NC_013526	GCA	2	6	253872	253877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839149
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5604	NC_013526	CCG	2	6	254271	254276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839149
5605	NC_013526	CAG	2	6	254314	254319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839149
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5609	NC_013526	CTG	2	6	254523	254528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839150
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5611	NC_013526	CAGCTC	2	12	254610	254621	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269839150
5612	NC_013526	TC	3	6	254645	254650	0 %	50 %	0 %	50 %	269839150
5613	NC_013526	GCT	2	6	254718	254723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839150
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5621	NC_013526	GCGG	2	8	255126	255133	0 %	0 %	75 %	25 %	269839150
5622	NC_013526	CCCA	2	8	255160	255167	25 %	0 %	0 %	75 %	269839150
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5741	NC_013526	CGG	2	6	260093	260098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839154
5742	NC_013526	ACG	2	6	260122	260127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839154
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5854	NC_013526	G	6	6	264584	264589	0 %	0 %	100 %	0 %	269839157
5855	NC_013526	CAA	2	6	264598	264603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269839157
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5983	NC_013526	GGAG	2	8	272325	272332	25 %	0 %	75 %	0 %	269839162
5984	NC_013526	AGGA	2	8	272350	272357	50 %	0 %	50 %	0 %	269839162
5985	NC_013526	CAGC	2	8	272364	272371	25 %	0 %	25 %	50 %	269839162
5986	NC_013526	TCA	2	6	272389	272394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839162
5987	NC_013526	CAC	3	9	272517	272525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839162
5988	NC_013526	AGCT	2	8	272568	272575	25 %	25 %	25 %	25 %	269839162
5989	NC_013526	CAG	2	6	272626	272631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839163
5990	NC_013526	CAGG	2	8	272637	272644	25 %	0 %	50 %	25 %	269839163
5991	NC_013526	TCG	2	6	272669	272674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839163
5992	NC_013526	GCC	2	6	272759	272764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839163
5993	NC_013526	CCA	2	6	272880	272885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839163
5994	NC_013526	GTC	2	6	272890	272895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839163
5995	NC_013526	CCAGCT	2	12	272985	272996	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269839163
5996	NC_013526	CG	3	6	273009	273014	0 %	0 %	50 %	50 %	269839163
5997	NC_013526	CTGC	2	8	273048	273055	0 %	25 %	25 %	50 %	269839163
5998	NC_013526	AGT	2	6	273072	273077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839163
5999	NC_013526	ATG	2	6	273092	273097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839163
6000	NC_013526	TCG	2	6	273108	273113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839163

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