MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 2

Total Repeats: 23339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013526	CCA	3	9	226362	226370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839128
5002	NC_013526	TCA	2	6	226422	226427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839128
5003	NC_013526	TGTC	2	8	226509	226516	0 %	50 %	25 %	25 %	269839128
5004	NC_013526	GTTG	2	8	226517	226524	0 %	50 %	50 %	0 %	269839128
5005	NC_013526	TGA	2	6	226539	226544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839128
5006	NC_013526	CT	3	6	226558	226563	0 %	50 %	0 %	50 %	269839128
5007	NC_013526	TGT	2	6	227257	227262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269839129
5008	NC_013526	TCT	2	6	227398	227403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269839129
5009	NC_013526	AGC	2	6	227413	227418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839129
5010	NC_013526	GC	3	6	227443	227448	0 %	0 %	50 %	50 %	269839129
5011	NC_013526	GCC	2	6	227542	227547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839129
5012	NC_013526	TAC	2	6	227574	227579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839129
5013	NC_013526	AAG	2	6	227592	227597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269839129
5014	NC_013526	CAA	2	6	227624	227629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269839129
5015	NC_013526	TGG	2	6	227634	227639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839129
5016	NC_013526	CTG	2	6	227769	227774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839129
5017	NC_013526	GCC	2	6	227787	227792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839129
5018	NC_013526	CGG	2	6	229156	229161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839130
5019	NC_013526	CAG	2	6	229184	229189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839130
5020	NC_013526	GCA	2	6	229222	229227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839130
5021	NC_013526	GCC	2	6	229245	229250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839130
5022	NC_013526	ACC	2	6	229260	229265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839130
5023	NC_013526	CTG	2	6	229285	229290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839130
5024	NC_013526	TCC	2	6	229315	229320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839130
5025	NC_013526	ACC	2	6	229374	229379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839130
5026	NC_013526	GA	3	6	229411	229416	50 %	0 %	50 %	0 %	269839130
5027	NC_013526	CGC	2	6	229442	229447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839130
5028	NC_013526	GCT	2	6	229526	229531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839130
5029	NC_013526	ACG	2	6	229551	229556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839130
5030	NC_013526	GGT	2	6	229576	229581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839130
5031	NC_013526	CCA	2	6	229594	229599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839130
5032	NC_013526	GCA	2	6	229622	229627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839130
5033	NC_013526	GGTA	2	8	229716	229723	25 %	25 %	50 %	0 %	269839130
5034	NC_013526	GGGC	2	8	229750	229757	0 %	0 %	75 %	25 %	269839130
5035	NC_013526	GGAG	3	12	229771	229782	25 %	0 %	75 %	0 %	269839130
5036	NC_013526	AG	3	6	229808	229813	50 %	0 %	50 %	0 %	269839130
5037	NC_013526	CGG	2	6	229871	229876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839130
5038	NC_013526	CGC	2	6	229907	229912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839130
5039	NC_013526	GCAG	2	8	229930	229937	25 %	0 %	50 %	25 %	269839130
5040	NC_013526	GTGG	2	8	229943	229950	0 %	25 %	75 %	0 %	269839130
5041	NC_013526	GGCA	2	8	229958	229965	25 %	0 %	50 %	25 %	269839130
5042	NC_013526	GGCGC	2	10	230039	230048	0 %	0 %	60 %	40 %	269839130
5043	NC_013526	GTGGAC	2	12	230145	230156	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	269839130
5044	NC_013526	GC	3	6	230201	230206	0 %	0 %	50 %	50 %	269839131
5045	NC_013526	CGA	2	6	230221	230226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839131
5046	NC_013526	CCCCA	2	10	230232	230241	20 %	0 %	0 %	80 %	269839131
5047	NC_013526	CAG	2	6	230264	230269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839131
5048	NC_013526	G	6	6	230352	230357	0 %	0 %	100 %	0 %	269839131
5049	NC_013526	GCT	2	6	230422	230427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839131
5050	NC_013526	CT	3	6	230426	230431	0 %	50 %	0 %	50 %	269839131
5051	NC_013526	G	6	6	230463	230468	0 %	0 %	100 %	0 %	269839131
5052	NC_013526	CCA	2	6	230521	230526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839131
5053	NC_013526	CTCC	2	8	230557	230564	0 %	25 %	0 %	75 %	269839131
5054	NC_013526	TCC	2	6	230586	230591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839131
5055	NC_013526	GTC	2	6	230725	230730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839131
5056	NC_013526	GGT	2	6	230793	230798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839132
5057	NC_013526	CAG	2	6	230859	230864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839132
5058	NC_013526	CCA	2	6	230895	230900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839132
5059	NC_013526	CAG	2	6	230907	230912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839132
5060	NC_013526	TGG	2	6	230951	230956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839132
5061	NC_013526	AGG	2	6	230983	230988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839132
5062	NC_013526	TCG	2	6	230992	230997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839132
5063	NC_013526	GAT	2	6	231060	231065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839132
5064	NC_013526	CAG	2	6	231075	231080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839132
5065	NC_013526	ACC	2	6	231097	231102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839132
5066	NC_013526	CCA	2	6	231103	231108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839132
5067	NC_013526	CCA	2	6	231111	231116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839132
5068	NC_013526	GCT	2	6	231136	231141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839132
5069	NC_013526	CT	3	6	231177	231182	0 %	50 %	0 %	50 %	269839132
5070	NC_013526	TGC	2	6	231297	231302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839133
5071	NC_013526	CTG	3	9	231326	231334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839133
5072	NC_013526	GTG	2	6	231335	231340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839133
5073	NC_013526	CTG	2	6	231344	231349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839133
5074	NC_013526	TGC	2	6	231357	231362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839133
5075	NC_013526	CGC	2	6	231363	231368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839133
5076	NC_013526	GCT	2	6	231377	231382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839133
5077	NC_013526	GCC	2	6	231422	231427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839133
5078	NC_013526	TTGC	2	8	231455	231462	0 %	50 %	25 %	25 %	269839133
5079	NC_013526	ACA	2	6	231471	231476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269839133
5080	NC_013526	CAC	2	6	231491	231496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839133
5081	NC_013526	GGC	2	6	231501	231506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839133
5082	NC_013526	GTC	2	6	231563	231568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839133
5083	NC_013526	GCT	2	6	231658	231663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839133
5084	NC_013526	GCG	2	6	231719	231724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839133
5085	NC_013526	TGC	2	6	231819	231824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839133
5086	NC_013526	CGA	2	6	231844	231849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839133
5087	NC_013526	GCG	2	6	231870	231875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839133
5088	NC_013526	GGT	2	6	231901	231906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839133
5089	NC_013526	GTG	2	6	231926	231931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839133
5090	NC_013526	AGGG	2	8	231974	231981	25 %	0 %	75 %	0 %	269839133
5091	NC_013526	GCCC	2	8	231993	232000	0 %	0 %	25 %	75 %	269839133
5092	NC_013526	GC	3	6	232149	232154	0 %	0 %	50 %	50 %	269839133
5093	NC_013526	TCA	2	6	232197	232202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839133
5094	NC_013526	GTC	2	6	232204	232209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839133
5095	NC_013526	CCA	2	6	232236	232241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839133
5096	NC_013526	CA	3	6	232413	232418	50 %	0 %	0 %	50 %	269839133
5097	NC_013526	ACG	3	9	232428	232436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839133
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5099	NC_013526	GGA	2	6	232566	232571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839133
5100	NC_013526	CAGC	2	8	232654	232661	25 %	0 %	25 %	50 %	269839133
5101	NC_013526	CGG	2	6	232743	232748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839133
5102	NC_013526	ACG	2	6	232751	232756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839133
5103	NC_013526	TCT	2	6	232836	232841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269839133
5104	NC_013526	CGG	2	6	232843	232848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839133
5105	NC_013526	AAG	2	6	232850	232855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269839133
5106	NC_013526	GGC	2	6	232874	232879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839133
5107	NC_013526	GCT	2	6	232906	232911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839133
5108	NC_013526	GCG	2	6	232931	232936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839133
5109	NC_013526	GGC	2	6	232954	232959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839133
5110	NC_013526	CCA	2	6	232998	233003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839133
5111	NC_013526	CCG	2	6	233037	233042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839133
5112	NC_013526	TAC	2	6	233048	233053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839133
5113	NC_013526	ACT	2	6	233082	233087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839133
5114	NC_013526	GGA	2	6	233110	233115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839133
5115	NC_013526	GTG	2	6	233123	233128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839133
5116	NC_013526	GC	3	6	233182	233187	0 %	0 %	50 %	50 %	269839133
5117	NC_013526	TAC	2	6	233388	233393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839134
5118	NC_013526	TGG	2	6	233410	233415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839134
5119	NC_013526	GCGAG	2	10	233460	233469	20 %	0 %	60 %	20 %	269839134
5120	NC_013526	GCC	2	6	233473	233478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839134
5121	NC_013526	GCT	2	6	233486	233491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839134
5122	NC_013526	GGT	2	6	233540	233545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839134
5123	NC_013526	GCC	2	6	233583	233588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839134
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5231	NC_013526	CCGG	2	8	237580	237587	0 %	0 %	50 %	50 %	269839138
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5242	NC_013526	GAT	2	6	238061	238066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839138
5243	NC_013526	GCTCG	2	10	238099	238108	0 %	20 %	40 %	40 %	269839138
5244	NC_013526	GCTG	2	8	238134	238141	0 %	25 %	50 %	25 %	269839138
5245	NC_013526	CCCG	2	8	238147	238154	0 %	0 %	25 %	75 %	269839138
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5255	NC_013526	TCG	2	6	238494	238499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839139
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5360	NC_013526	GCCG	2	8	243421	243428	0 %	0 %	50 %	50 %	269839141
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5364	NC_013526	GAA	2	6	243700	243705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269839141
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5485	NC_013526	GT	3	6	248572	248577	0 %	50 %	50 %	0 %	269839145
5486	NC_013526	ACGT	2	8	248624	248631	25 %	25 %	25 %	25 %	269839145
5487	NC_013526	GGA	2	6	248740	248745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839145
5488	NC_013526	TCT	3	9	248799	248807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269839145
5489	NC_013526	CTA	2	6	248914	248919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839145
5490	NC_013526	ACG	2	6	248936	248941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839145
5491	NC_013526	AGC	2	6	249048	249053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839145
5492	NC_013526	GTG	2	6	249071	249076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839145
5493	NC_013526	GACGGC	2	12	249083	249094	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	269839145
5494	NC_013526	GC	3	6	249144	249149	0 %	0 %	50 %	50 %	269839145
5495	NC_013526	CGG	2	6	249151	249156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839145
5496	NC_013526	AGA	2	6	249171	249176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269839145
5497	NC_013526	GCT	2	6	249181	249186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839145
5498	NC_013526	CGCC	2	8	249217	249224	0 %	0 %	25 %	75 %	269839145
5499	NC_013526	GCC	2	6	249235	249240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839145
5500	NC_013526	GCA	2	6	249271	249276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839145

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