MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 1

Total Repeats: 35255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32001	NC_013525	GCA	3	9	1846162	1846170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926813
32002	NC_013525	AGA	3	9	1846197	1846205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926813
32003	NC_013525	AAG	2	6	1846211	1846216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926813
32004	NC_013525	GAG	2	6	1846267	1846272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269926813
32005	NC_013525	TAC	2	6	1846315	1846320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926813
32006	NC_013525	GAT	2	6	1846402	1846407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926813
32007	NC_013525	TGCCT	2	10	1846547	1846556	0 %	40 %	20 %	40 %	269926813
32008	NC_013525	TTC	2	6	1846557	1846562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926813
32009	NC_013525	GCA	2	6	1846577	1846582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926813
32010	NC_013525	AAG	2	6	1846594	1846599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926813
32011	NC_013525	AG	3	6	1846648	1846653	50 %	0 %	50 %	0 %	269926813
32012	NC_013525	CAT	2	6	1846666	1846671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926813
32013	NC_013525	TCGC	2	8	1846679	1846686	0 %	25 %	25 %	50 %	269926813
32014	NC_013525	GAG	2	6	1846702	1846707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269926813
32015	NC_013525	TGA	2	6	1846731	1846736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926813
32016	NC_013525	GCT	2	6	1846756	1846761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926813
32017	NC_013525	ACG	2	6	1846814	1846819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926813
32018	NC_013525	ACACTC	2	12	1846841	1846852	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	269926813
32019	NC_013525	AGCT	2	8	1846885	1846892	25 %	25 %	25 %	25 %	269926814
32020	NC_013525	GTA	2	6	1846932	1846937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926814
32021	NC_013525	GC	3	6	1847011	1847016	0 %	0 %	50 %	50 %	269926814
32022	NC_013525	CTA	2	6	1847024	1847029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926814
32023	NC_013525	TAC	2	6	1847076	1847081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926814
32024	NC_013525	TCC	3	9	1847183	1847191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926814
32025	NC_013525	GCT	2	6	1847248	1847253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926814
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32028	NC_013525	CTA	2	6	1847354	1847359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926814
32029	NC_013525	TGC	2	6	1847447	1847452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926814
32030	NC_013525	TGGA	2	8	1847500	1847507	25 %	25 %	50 %	0 %	269926814
32031	NC_013525	ACC	2	6	1847541	1847546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269926814
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32033	NC_013525	CGT	2	6	1847663	1847668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926814
32034	NC_013525	AGGG	2	8	1847749	1847756	25 %	0 %	75 %	0 %	269926814
32035	NC_013525	AG	3	6	1847766	1847771	50 %	0 %	50 %	0 %	269926814
32036	NC_013525	CAT	2	6	1847786	1847791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926814
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32038	NC_013525	ATCT	2	8	1847991	1847998	25 %	50 %	0 %	25 %	269926814
32039	NC_013525	TTA	2	6	1848025	1848030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926814
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32041	NC_013525	ATT	2	6	1848144	1848149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926814
32042	NC_013525	CCA	2	6	1848253	1848258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269926814
32043	NC_013525	TTTG	2	8	1848300	1848307	0 %	75 %	25 %	0 %	269926814
32044	NC_013525	CAA	2	6	1848402	1848407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269926814
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32048	NC_013525	CAT	2	6	1848575	1848580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926814
32049	NC_013525	AG	3	6	1848834	1848839	50 %	0 %	50 %	0 %	269926815
32050	NC_013525	AG	3	6	1848889	1848894	50 %	0 %	50 %	0 %	269926815
32051	NC_013525	AT	3	6	1849081	1849086	50 %	50 %	0 %	0 %	269926815
32052	NC_013525	GC	3	6	1849130	1849135	0 %	0 %	50 %	50 %	269926815
32053	NC_013525	GGA	2	6	1849179	1849184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269926815
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32056	NC_013525	CCAT	2	8	1849378	1849385	25 %	25 %	0 %	50 %	269926815
32057	NC_013525	GCAGA	2	10	1849387	1849396	40 %	0 %	40 %	20 %	269926815
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32063	NC_013525	GA	3	6	1849794	1849799	50 %	0 %	50 %	0 %	269926815
32064	NC_013525	CCTA	2	8	1849849	1849856	25 %	25 %	0 %	50 %	269926816
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32072	NC_013525	AGAA	2	8	1850209	1850216	75 %	0 %	25 %	0 %	269926816
32073	NC_013525	TGC	2	6	1850494	1850499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926816
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32101	NC_013525	GTA	2	6	1852424	1852429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926817
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32108	NC_013525	GAG	2	6	1852830	1852835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269926818
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32112	NC_013525	CT	3	6	1852946	1852951	0 %	50 %	0 %	50 %	269926818
32113	NC_013525	TC	3	6	1852978	1852983	0 %	50 %	0 %	50 %	269926818
32114	NC_013525	AC	3	6	1853048	1853053	50 %	0 %	0 %	50 %	269926818
32115	NC_013525	GAA	2	6	1853109	1853114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926818
32116	NC_013525	GGT	2	6	1853208	1853213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926818
32117	NC_013525	CCG	2	6	1853241	1853246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269926818
32118	NC_013525	TA	3	6	1853269	1853274	50 %	50 %	0 %	0 %	269926818
32119	NC_013525	GAAG	2	8	1853285	1853292	50 %	0 %	50 %	0 %	269926818
32120	NC_013525	ATG	2	6	1853350	1853355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926818
32121	NC_013525	CATG	2	8	1853384	1853391	25 %	25 %	25 %	25 %	269926818
32122	NC_013525	GAG	2	6	1853392	1853397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269926818
32123	NC_013525	CTG	2	6	1853409	1853414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926818
32124	NC_013525	GTTT	2	8	1853441	1853448	0 %	75 %	25 %	0 %	269926818
32125	NC_013525	AGATAA	2	12	1853642	1853653	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	269926819
32126	NC_013525	GTG	2	6	1853660	1853665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926819
32127	NC_013525	AGA	2	6	1853669	1853674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926819
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32129	NC_013525	GAAG	2	8	1853721	1853728	50 %	0 %	50 %	0 %	269926819
32130	NC_013525	CCT	2	6	1853905	1853910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926819
32131	NC_013525	CTGG	2	8	1854009	1854016	0 %	25 %	50 %	25 %	269926819
32132	NC_013525	GA	3	6	1854234	1854239	50 %	0 %	50 %	0 %	269926819
32133	NC_013525	AGT	3	9	1854270	1854278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926819
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32135	NC_013525	GAT	2	6	1854397	1854402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926819
32136	NC_013525	TAC	2	6	1854415	1854420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926819
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32138	NC_013525	AG	3	6	1854496	1854501	50 %	0 %	50 %	0 %	269926819
32139	NC_013525	AAG	2	6	1854505	1854510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926819
32140	NC_013525	AGC	2	6	1854564	1854569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926819
32141	NC_013525	AGA	2	6	1854570	1854575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926819
32142	NC_013525	GA	3	6	1854580	1854585	50 %	0 %	50 %	0 %	269926819
32143	NC_013525	AT	3	6	1854686	1854691	50 %	50 %	0 %	0 %	269926819
32144	NC_013525	AAC	2	6	1854696	1854701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269926819
32145	NC_013525	TCC	2	6	1854712	1854717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926819
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32152	NC_013525	GTC	2	6	1855090	1855095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926820
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32160	NC_013525	TCTTG	2	10	1855831	1855840	0 %	60 %	20 %	20 %	269926821
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32179	NC_013525	CTG	2	6	1856693	1856698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926821
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32181	NC_013525	CAGTG	2	10	1856756	1856765	20 %	20 %	40 %	20 %	269926821
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32185	NC_013525	ATG	2	6	1857086	1857091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926822
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32188	NC_013525	CA	3	6	1857379	1857384	50 %	0 %	0 %	50 %	269926822
32189	NC_013525	CTT	2	6	1857392	1857397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926822
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32200	NC_013525	CTT	2	6	1858176	1858181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926822
32201	NC_013525	CAA	2	6	1858617	1858622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269926823
32202	NC_013525	TGG	2	6	1858665	1858670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926823
32203	NC_013525	ATG	2	6	1858705	1858710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926823
32204	NC_013525	GCAT	2	8	1858721	1858728	25 %	25 %	25 %	25 %	269926823
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32219	NC_013525	CA	3	6	1859790	1859795	50 %	0 %	0 %	50 %	269926823
32220	NC_013525	GAT	2	6	1859797	1859802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926823
32221	NC_013525	GGT	2	6	1859811	1859816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926823
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32223	NC_013525	TGT	2	6	1859861	1859866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926824
32224	NC_013525	AACT	2	8	1859904	1859911	50 %	25 %	0 %	25 %	269926824
32225	NC_013525	CT	4	8	1859952	1859959	0 %	50 %	0 %	50 %	269926824
32226	NC_013525	TGTTC	2	10	1859979	1859988	0 %	60 %	20 %	20 %	269926824
32227	NC_013525	ATC	2	6	1860043	1860048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926824
32228	NC_013525	CTA	2	6	1860145	1860150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926824
32229	NC_013525	GTA	2	6	1860214	1860219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926824
32230	NC_013525	TGC	2	6	1860222	1860227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926824
32231	NC_013525	CTA	2	6	1860231	1860236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926824
32232	NC_013525	CTT	2	6	1860253	1860258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926824
32233	NC_013525	GTA	2	6	1860271	1860276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926824
32234	NC_013525	TGC	2	6	1860279	1860284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926824
32235	NC_013525	TGGTC	2	10	1860321	1860330	0 %	40 %	40 %	20 %	269926824
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32237	NC_013525	AG	3	6	1860415	1860420	50 %	0 %	50 %	0 %	269926824
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32239	NC_013525	GTC	2	6	1860461	1860466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926824
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32252	NC_013525	TAA	2	6	1861158	1861163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269926824
32253	NC_013525	GAC	2	6	1861273	1861278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926824
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32258	NC_013525	GCA	2	6	1861612	1861617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926825
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32344	NC_013525	AGC	2	6	1867114	1867119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926834
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32455	NC_013525	TCT	2	6	1874071	1874076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926840
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32457	NC_013525	CCA	2	6	1874210	1874215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269926840
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32462	NC_013525	TAC	2	6	1874467	1874472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926840
32463	NC_013525	AG	3	6	1874645	1874650	50 %	0 %	50 %	0 %	269926840
32464	NC_013525	CAT	2	6	1874679	1874684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926840
32465	NC_013525	AT	3	6	1874700	1874705	50 %	50 %	0 %	0 %	269926840
32466	NC_013525	GCTG	2	8	1874839	1874846	0 %	25 %	50 %	25 %	269926840
32467	NC_013525	GCT	2	6	1874876	1874881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926840
32468	NC_013525	CCCTG	2	10	1874915	1874924	0 %	20 %	20 %	60 %	269926840
32469	NC_013525	TTC	2	6	1874945	1874950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926840
32470	NC_013525	ACG	2	6	1874978	1874983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926840
32471	NC_013525	TAC	2	6	1875037	1875042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926840
32472	NC_013525	GTA	2	6	1875136	1875141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926840
32473	NC_013525	CCT	2	6	1875180	1875185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926840
32474	NC_013525	TCT	2	6	1875228	1875233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926840
32475	NC_013525	GGA	2	6	1875235	1875240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269926840
32476	NC_013525	AGA	2	6	1875337	1875342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926840
32477	NC_013525	TTCC	2	8	1875364	1875371	0 %	50 %	0 %	50 %	269926840
32478	NC_013525	ACC	2	6	1875377	1875382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269926840
32479	NC_013525	GCA	2	6	1875639	1875644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926840
32480	NC_013525	ATA	2	6	1875645	1875650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269926840
32481	NC_013525	TCC	3	9	1875695	1875703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926841
32482	NC_013525	AGC	2	6	1875822	1875827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926841
32483	NC_013525	CCTT	2	8	1875919	1875926	0 %	50 %	0 %	50 %	269926841
32484	NC_013525	TC	3	6	1876017	1876022	0 %	50 %	0 %	50 %	269926841
32485	NC_013525	CAC	2	6	1876038	1876043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269926841
32486	NC_013525	GATT	2	8	1876060	1876067	25 %	50 %	25 %	0 %	269926841
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32488	NC_013525	GGAA	2	8	1876124	1876131	50 %	0 %	50 %	0 %	269926841
32489	NC_013525	CAA	2	6	1876257	1876262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269926841
32490	NC_013525	TGCG	2	8	1876268	1876275	0 %	25 %	50 %	25 %	269926841
32491	NC_013525	GCA	2	6	1876310	1876315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926841
32492	NC_013525	GAT	2	6	1876319	1876324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926841
32493	NC_013525	GA	3	6	1876344	1876349	50 %	0 %	50 %	0 %	269926841
32494	NC_013525	CT	3	6	1876526	1876531	0 %	50 %	0 %	50 %	269926841
32495	NC_013525	GGGA	2	8	1876572	1876579	25 %	0 %	75 %	0 %	269926841
32496	NC_013525	ATC	2	6	1876620	1876625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926841
32497	NC_013525	CAT	2	6	1876667	1876672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926841
32498	NC_013525	ATCT	2	8	1876691	1876698	25 %	50 %	0 %	25 %	269926841
32499	NC_013525	AAGGC	2	10	1876700	1876709	40 %	0 %	40 %	20 %	269926841
32500	NC_013525	CGA	2	6	1876739	1876744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926841

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