MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 40002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_013522	GAG	2	6	548429	548434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792125
12003	NC_013522	GGC	2	6	548452	548457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792125
12004	NC_013522	TCA	2	6	548469	548474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792125
12005	NC_013522	GAC	2	6	548554	548559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792126
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12007	NC_013522	GTGGA	2	10	548644	548653	20 %	20 %	60 %	0 %	269792126
12008	NC_013522	GCG	2	6	548663	548668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792126
12009	NC_013522	CTA	2	6	548700	548705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792126
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12011	NC_013522	GGA	2	6	548829	548834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792126
12012	NC_013522	GCCC	2	8	548847	548854	0 %	0 %	25 %	75 %	269792126
12013	NC_013522	CGG	2	6	548920	548925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792126
12014	NC_013522	AGG	2	6	548987	548992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792126
12015	NC_013522	TGG	2	6	549005	549010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792126
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12020	NC_013522	TGAC	2	8	549066	549073	25 %	25 %	25 %	25 %	269792126
12021	NC_013522	GCTCAG	2	12	549096	549107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269792127
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12121	NC_013522	TCG	2	6	554227	554232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792131
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12226	NC_013522	TC	3	6	558263	558268	0 %	50 %	0 %	50 %	269792135
12227	NC_013522	GTA	2	6	558269	558274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792135
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12231	NC_013522	TCA	2	6	558448	558453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792135
12232	NC_013522	C	7	7	558470	558476	0 %	0 %	0 %	100 %	269792135
12233	NC_013522	CTC	2	6	558509	558514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792135
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12237	NC_013522	TCC	2	6	558666	558671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792135
12238	NC_013522	CCT	2	6	558724	558729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792135
12239	NC_013522	TCC	2	6	558789	558794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792135
12240	NC_013522	GGA	2	6	558812	558817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792135
12241	NC_013522	AGC	2	6	558828	558833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792135
12242	NC_013522	GGT	2	6	558857	558862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792135
12243	NC_013522	CCA	2	6	558946	558951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792135
12244	NC_013522	TCC	2	6	558960	558965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792135
12245	NC_013522	TCA	2	6	558997	559002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792135
12246	NC_013522	C	6	6	559017	559022	0 %	0 %	0 %	100 %	269792136
12247	NC_013522	GCG	2	6	559052	559057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792136
12248	NC_013522	GTCGTA	2	12	559066	559077	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269792136
12249	NC_013522	TCC	2	6	559106	559111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792136
12250	NC_013522	GATGTA	2	12	559126	559137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792136
12251	NC_013522	AGA	2	6	559140	559145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269792136
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12253	NC_013522	G	8	8	559159	559166	0 %	0 %	100 %	0 %	269792136
12254	NC_013522	CGC	2	6	559183	559188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792136
12255	NC_013522	TGA	2	6	559191	559196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792136
12256	NC_013522	GTC	2	6	559231	559236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792136
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12259	NC_013522	AGT	2	6	559364	559369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792136
12260	NC_013522	AGG	2	6	559457	559462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792136
12261	NC_013522	GGC	2	6	559473	559478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792136
12262	NC_013522	GTC	2	6	559480	559485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792136
12263	NC_013522	GGT	2	6	559525	559530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792136
12264	NC_013522	CCT	2	6	559575	559580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792136
12265	NC_013522	TGG	2	6	559610	559615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792136
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12267	NC_013522	TGT	2	6	559773	559778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269792136
12268	NC_013522	AGG	2	6	559808	559813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792136
12269	NC_013522	CCT	2	6	559816	559821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792136
12270	NC_013522	GGT	2	6	559929	559934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792136
12271	NC_013522	GTG	2	6	559948	559953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792136
12272	NC_013522	ATC	2	6	559972	559977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792136
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12275	NC_013522	TCC	2	6	560099	560104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792137
12276	NC_013522	GCCTCC	2	12	560116	560127	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	269792137
12277	NC_013522	CTCC	2	8	560187	560194	0 %	25 %	0 %	75 %	269792137
12278	NC_013522	GTT	2	6	560205	560210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269792137
12279	NC_013522	TCC	2	6	560218	560223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792137
12280	NC_013522	GGC	2	6	560235	560240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792137
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12285	NC_013522	ATC	2	6	560428	560433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792137
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12287	NC_013522	GGC	2	6	560459	560464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792138
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12305	NC_013522	TTCT	2	8	561198	561205	0 %	75 %	0 %	25 %	269792139
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12310	NC_013522	C	7	7	561443	561449	0 %	0 %	0 %	100 %	269792139
12311	NC_013522	ACCTGG	2	12	561460	561471	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269792139
12312	NC_013522	G	7	7	561563	561569	0 %	0 %	100 %	0 %	269792139
12313	NC_013522	G	6	6	561602	561607	0 %	0 %	100 %	0 %	269792139
12314	NC_013522	CAC	3	9	561608	561616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792139
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12317	NC_013522	GCCGG	2	10	561666	561675	0 %	0 %	60 %	40 %	269792139
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12321	NC_013522	GGC	2	6	561797	561802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792139
12322	NC_013522	GGT	2	6	561842	561847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792139
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12324	NC_013522	TGGCGG	2	12	561871	561882	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	269792139
12325	NC_013522	CCA	3	9	561925	561933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792139
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12328	NC_013522	G	6	6	562111	562116	0 %	0 %	100 %	0 %	269792139
12329	NC_013522	GAT	2	6	562163	562168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792139
12330	NC_013522	TGGAGG	2	12	562174	562185	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	269792139
12331	NC_013522	TGG	2	6	562235	562240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792140
12332	NC_013522	CTG	2	6	562249	562254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792140
12333	NC_013522	GCG	2	6	562270	562275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792140
12334	NC_013522	G	6	6	562298	562303	0 %	0 %	100 %	0 %	269792140
12335	NC_013522	TCG	2	6	562333	562338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792140
12336	NC_013522	GGC	2	6	562345	562350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792140
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12339	NC_013522	CGG	2	6	562542	562547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792140
12340	NC_013522	TGG	2	6	562553	562558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792140
12341	NC_013522	GAT	2	6	562617	562622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792140
12342	NC_013522	GTG	3	9	562633	562641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792140
12343	NC_013522	CTCC	2	8	562644	562651	0 %	25 %	0 %	75 %	269792140
12344	NC_013522	TCA	2	6	562670	562675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792140
12345	NC_013522	TGG	2	6	562682	562687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792140
12346	NC_013522	GGT	2	6	562742	562747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792140
12347	NC_013522	GCCTCC	2	12	562774	562785	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	269792140
12348	NC_013522	CTG	2	6	562798	562803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792140
12349	NC_013522	CCA	2	6	562844	562849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792140
12350	NC_013522	CGG	2	6	562892	562897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792140
12351	NC_013522	GCC	2	6	562909	562914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792140
12352	NC_013522	TGG	3	9	562916	562924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792140
12353	NC_013522	ATA	2	6	562936	562941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269792140
12354	NC_013522	C	6	6	562961	562966	0 %	0 %	0 %	100 %	269792140
12355	NC_013522	ATCGT	2	10	563011	563020	20 %	40 %	20 %	20 %	269792140
12356	NC_013522	CTC	2	6	563038	563043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792140
12357	NC_013522	GATCT	2	10	563053	563062	20 %	40 %	20 %	20 %	269792140
12358	NC_013522	G	7	7	563109	563115	0 %	0 %	100 %	0 %	269792140
12359	NC_013522	TAACG	2	10	563167	563176	40 %	20 %	20 %	20 %	269792141
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12478	NC_013522	CGG	2	6	568902	568907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792147
12479	NC_013522	TCC	2	6	568923	568928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792147
12480	NC_013522	CGGG	2	8	568929	568936	0 %	0 %	75 %	25 %	269792147
12481	NC_013522	TGG	2	6	568939	568944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792147
12482	NC_013522	GAT	2	6	568994	568999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792147
12483	NC_013522	GAT	2	6	569045	569050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792147
12484	NC_013522	CGG	2	6	569155	569160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792147
12485	NC_013522	GTG	2	6	569187	569192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792147
12486	NC_013522	GGA	2	6	569210	569215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792147
12487	NC_013522	CGC	3	9	569240	569248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792147
12488	NC_013522	CCA	2	6	569261	569266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792147
12489	NC_013522	CTG	2	6	569310	569315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792147
12490	NC_013522	G	7	7	569361	569367	0 %	0 %	100 %	0 %	269792147
12491	NC_013522	GGT	2	6	569399	569404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792147
12492	NC_013522	GCGG	2	8	569420	569427	0 %	0 %	75 %	25 %	269792147
12493	NC_013522	CTT	2	6	569465	569470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792147
12494	NC_013522	GAT	2	6	569478	569483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792147
12495	NC_013522	GGA	2	6	569501	569506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792147
12496	NC_013522	GGC	2	6	569531	569536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792147
12497	NC_013522	TGG	2	6	569647	569652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792147
12498	NC_013522	CTC	2	6	569699	569704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792147
12499	NC_013522	CTT	2	6	569739	569744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792147
12500	NC_013522	TCC	2	6	569754	569759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792147

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