MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sibiricus MM 739

Total Repeats: 34174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012883	TGTAT	2	10	21	30	20 %	60 %	20 %	0 %	242397998
2	NC_012883	T	6	6	126	131	0 %	100 %	0 %	0 %	242397998
3	NC_012883	T	8	8	134	141	0 %	100 %	0 %	0 %	242397998
4	NC_012883	CTTT	2	8	145	152	0 %	75 %	0 %	25 %	242397998
5	NC_012883	CCTCT	2	10	235	244	0 %	40 %	0 %	60 %	242397998
6	NC_012883	TTC	2	6	247	252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242397998
7	NC_012883	CAG	2	6	309	314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242397998
8	NC_012883	CCA	2	6	342	347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	242397998
9	NC_012883	AGA	2	6	352	357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242397998
10	NC_012883	GCAG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	242397998
11	NC_012883	A	6	6	445	450	100 %	0 %	0 %	0 %	242397998
12	NC_012883	T	7	7	472	478	0 %	100 %	0 %	0 %	242397998
13	NC_012883	AGAT	2	8	482	489	50 %	25 %	25 %	0 %	242397998
14	NC_012883	TAA	2	6	556	561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242397998
15	NC_012883	ACTC	2	8	577	584	25 %	25 %	0 %	50 %	242397998
16	NC_012883	TCCA	2	8	778	785	25 %	25 %	0 %	50 %	242397998
17	NC_012883	CCA	3	9	839	847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	242397998
18	NC_012883	ATTTT	2	10	866	875	20 %	80 %	0 %	0 %	242397998
19	NC_012883	ATA	2	6	965	970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242397998
20	NC_012883	CAA	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242397998
21	NC_012883	TA	3	6	1062	1067	50 %	50 %	0 %	0 %	242397998
22	NC_012883	C	6	6	1130	1135	0 %	0 %	0 %	100 %	242397998
23	NC_012883	TTTCT	2	10	3170	3179	0 %	80 %	0 %	20 %	242397999
24	NC_012883	TCT	2	6	3201	3206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242397999
25	NC_012883	AGG	2	6	3368	3373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	242397999
26	NC_012883	GCATA	2	10	3395	3404	40 %	20 %	20 %	20 %	242397999
27	NC_012883	CT	3	6	3412	3417	0 %	50 %	0 %	50 %	242397999
28	NC_012883	AGA	2	6	3484	3489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242397999
29	NC_012883	CT	3	6	3546	3551	0 %	50 %	0 %	50 %	242397999
30	NC_012883	TC	3	6	3594	3599	0 %	50 %	0 %	50 %	242397999
31	NC_012883	TCTTT	2	10	3675	3684	0 %	80 %	0 %	20 %	242398000
32	NC_012883	AGA	2	6	3765	3770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398000
33	NC_012883	T	6	6	3773	3778	0 %	100 %	0 %	0 %	242398000
34	NC_012883	A	6	6	3818	3823	100 %	0 %	0 %	0 %	242398000
35	NC_012883	AAG	2	6	3938	3943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398001
36	NC_012883	CTC	2	6	3991	3996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398001
37	NC_012883	TCCAG	2	10	4005	4014	20 %	20 %	20 %	40 %	242398001
38	NC_012883	T	6	6	4027	4032	0 %	100 %	0 %	0 %	242398001
39	NC_012883	TA	3	6	4210	4215	50 %	50 %	0 %	0 %	242398001
40	NC_012883	AT	3	6	4234	4239	50 %	50 %	0 %	0 %	242398001
41	NC_012883	CTT	2	6	4240	4245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398001
42	NC_012883	TCC	2	6	4343	4348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398001
43	NC_012883	CAGA	2	8	4422	4429	50 %	0 %	25 %	25 %	242398001
44	NC_012883	TCA	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398001
45	NC_012883	TAAT	2	8	4566	4573	50 %	50 %	0 %	0 %	242398001
46	NC_012883	AGCC	2	8	4610	4617	25 %	0 %	25 %	50 %	242398001
47	NC_012883	AAC	2	6	4648	4653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398001
48	NC_012883	C	6	6	4659	4664	0 %	0 %	0 %	100 %	242398001
49	NC_012883	CCA	2	6	4694	4699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	242398001
50	NC_012883	ATT	2	6	4810	4815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398001
51	NC_012883	CAA	2	6	4950	4955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398002
52	NC_012883	GAT	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398002
53	NC_012883	TAAA	2	8	5005	5012	75 %	25 %	0 %	0 %	242398002
54	NC_012883	GTA	2	6	5026	5031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398002
55	NC_012883	CAA	2	6	5101	5106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398002
56	NC_012883	CCT	2	6	5110	5115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398002
57	NC_012883	TTC	2	6	5171	5176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398002
58	NC_012883	CAT	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398002
59	NC_012883	AGT	2	6	5274	5279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398002
60	NC_012883	AGG	2	6	5489	5494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	242398002
61	NC_012883	ACA	3	9	5540	5548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398002
62	NC_012883	AAC	2	6	5626	5631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398002
63	NC_012883	CGT	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	242398002
64	NC_012883	ACG	2	6	5684	5689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242398002
65	NC_012883	CTT	2	6	5704	5709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398002
66	NC_012883	CGA	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242398002
67	NC_012883	CTC	2	6	5740	5745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398002
68	NC_012883	CCT	2	6	5853	5858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398003
69	NC_012883	TCC	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398003
70	NC_012883	GGA	2	6	6044	6049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	242398003
71	NC_012883	TTCTCC	2	12	6061	6072	0 %	50 %	0 %	50 %	242398003
72	NC_012883	TGA	2	6	6155	6160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398003
73	NC_012883	AGGT	2	8	6235	6242	25 %	25 %	50 %	0 %	242398003
74	NC_012883	TAT	2	6	6369	6374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398003
75	NC_012883	C	6	6	6383	6388	0 %	0 %	0 %	100 %	242398003
76	NC_012883	TGT	2	6	6455	6460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	242398003
77	NC_012883	ATA	2	6	6513	6518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398003
78	NC_012883	AAC	3	9	6522	6530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398003
79	NC_012883	GTA	2	6	6579	6584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398003
80	NC_012883	CTT	3	9	6625	6633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398003
81	NC_012883	ATA	2	6	6636	6641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398003
82	NC_012883	CCA	2	6	6663	6668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	242398003
83	NC_012883	CGT	2	6	6680	6685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	242398003
84	NC_012883	TC	3	6	6698	6703	0 %	50 %	0 %	50 %	242398003
85	NC_012883	C	6	6	6777	6782	0 %	0 %	0 %	100 %	242398003
86	NC_012883	GAA	2	6	6797	6802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398003
87	NC_012883	CAG	2	6	6804	6809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242398003
88	NC_012883	TTC	2	6	6833	6838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398003
89	NC_012883	GAA	2	6	7017	7022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398003
90	NC_012883	GGGTT	2	10	7080	7089	0 %	40 %	60 %	0 %	242398003
91	NC_012883	CCG	2	6	7396	7401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	242398003
92	NC_012883	CAAG	2	8	7457	7464	50 %	0 %	25 %	25 %	242398003
93	NC_012883	GCAA	2	8	7516	7523	50 %	0 %	25 %	25 %	242398003
94	NC_012883	AGA	2	6	7553	7558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398003
95	NC_012883	TAAA	2	8	7590	7597	75 %	25 %	0 %	0 %	242398003
96	NC_012883	AGA	2	6	7673	7678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398003
97	NC_012883	A	6	6	7758	7763	100 %	0 %	0 %	0 %	242398003
98	NC_012883	CTT	2	6	7767	7772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398003
99	NC_012883	AGA	2	6	7789	7794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398003
100	NC_012883	TTAT	2	8	7933	7940	25 %	75 %	0 %	0 %	242398003
101	NC_012883	CCT	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398003
102	NC_012883	CCT	2	6	8129	8134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398003
103	NC_012883	CATCC	2	10	8142	8151	20 %	20 %	0 %	60 %	242398003
104	NC_012883	ATCT	2	8	8204	8211	25 %	50 %	0 %	25 %	242398004
105	NC_012883	CT	3	6	8223	8228	0 %	50 %	0 %	50 %	242398004
106	NC_012883	CT	3	6	8233	8238	0 %	50 %	0 %	50 %	242398004
107	NC_012883	ACA	2	6	8285	8290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398004
108	NC_012883	ACA	2	6	8357	8362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398004
109	NC_012883	TCA	2	6	8388	8393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398004
110	NC_012883	ATT	2	6	8468	8473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398004
111	NC_012883	CT	3	6	8494	8499	0 %	50 %	0 %	50 %	242398004
112	NC_012883	CAT	2	6	8508	8513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398004
113	NC_012883	AAG	2	6	8515	8520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398004
114	NC_012883	CTC	2	6	8560	8565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398004
115	NC_012883	ACTA	2	8	8584	8591	50 %	25 %	0 %	25 %	242398004
116	NC_012883	AACCA	2	10	8629	8638	60 %	0 %	0 %	40 %	242398004
117	NC_012883	T	6	6	8648	8653	0 %	100 %	0 %	0 %	242398004
118	NC_012883	AAATA	2	10	8665	8674	80 %	20 %	0 %	0 %	242398004
119	NC_012883	TAT	2	6	8716	8721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398004
120	NC_012883	CAA	2	6	8727	8732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398004
121	NC_012883	ATC	2	6	8738	8743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398004
122	NC_012883	ACC	2	6	8747	8752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	242398005
123	NC_012883	T	6	6	8826	8831	0 %	100 %	0 %	0 %	242398005
124	NC_012883	CAG	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242398005
125	NC_012883	GTT	2	6	8974	8979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	242398005
126	NC_012883	AAG	2	6	9003	9008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398005
127	NC_012883	CTTT	2	8	9060	9067	0 %	75 %	0 %	25 %	242398005
128	NC_012883	TCCC	2	8	9092	9099	0 %	25 %	0 %	75 %	242398005
129	NC_012883	TCC	2	6	9171	9176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398005
130	NC_012883	CGC	2	6	9205	9210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	242398005
131	NC_012883	TAA	2	6	9213	9218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398005
132	NC_012883	CTC	2	6	9229	9234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398005
133	NC_012883	TCGT	2	8	9344	9351	0 %	50 %	25 %	25 %	242398005
134	NC_012883	TTA	2	6	9402	9407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398005
135	NC_012883	TCA	2	6	9455	9460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398005
136	NC_012883	TC	3	6	9473	9478	0 %	50 %	0 %	50 %	242398005
137	NC_012883	CTT	2	6	9520	9525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398005
138	NC_012883	GCT	2	6	9563	9568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	242398005
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142	NC_012883	TCGAG	2	10	9863	9872	20 %	20 %	40 %	20 %	242398005
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152	NC_012883	CCG	2	6	10149	10154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	242398006
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265	NC_012883	ATA	2	6	15211	15216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398010
266	NC_012883	CTT	2	6	15227	15232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398010
267	NC_012883	TCC	3	9	15263	15271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398010
268	NC_012883	A	6	6	15289	15294	100 %	0 %	0 %	0 %	242398010
269	NC_012883	GTA	2	6	15355	15360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398010
270	NC_012883	ATC	2	6	15400	15405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398010
271	NC_012883	TCC	2	6	15486	15491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398010
272	NC_012883	CAT	2	6	15529	15534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398010
273	NC_012883	TAA	2	6	15732	15737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398010
274	NC_012883	T	6	6	15743	15748	0 %	100 %	0 %	0 %	242398010
275	NC_012883	TTC	2	6	15757	15762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398010
276	NC_012883	TTTGT	2	10	15791	15800	0 %	80 %	20 %	0 %	242398010
277	NC_012883	CTC	2	6	15863	15868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398010
278	NC_012883	CT	3	6	15910	15915	0 %	50 %	0 %	50 %	242398010
279	NC_012883	CTC	2	6	16112	16117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398011
280	NC_012883	TC	3	6	16120	16125	0 %	50 %	0 %	50 %	242398011
281	NC_012883	CCT	2	6	16195	16200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398011
282	NC_012883	CTT	3	9	16222	16230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398011
283	NC_012883	AGAA	2	8	16242	16249	75 %	0 %	25 %	0 %	242398011
284	NC_012883	ATA	2	6	16292	16297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398011
285	NC_012883	TGA	2	6	16299	16304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398011
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288	NC_012883	CTT	2	6	16694	16699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398012
289	NC_012883	AGC	2	6	16756	16761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242398012
290	NC_012883	TTCT	2	8	16797	16804	0 %	75 %	0 %	25 %	242398012
291	NC_012883	CTT	2	6	16820	16825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398012
292	NC_012883	CAA	2	6	16931	16936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398013
293	NC_012883	TAA	2	6	16945	16950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398013
294	NC_012883	CTTC	2	8	16975	16982	0 %	50 %	0 %	50 %	242398013
295	NC_012883	TCT	2	6	17073	17078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398013
296	NC_012883	TCA	2	6	17115	17120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398013
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298	NC_012883	T	6	6	17220	17225	0 %	100 %	0 %	0 %	242398013
299	NC_012883	ATC	2	6	17243	17248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398013
300	NC_012883	CTTTT	2	10	17278	17287	0 %	80 %	0 %	20 %	242398013
301	NC_012883	T	6	6	17435	17440	0 %	100 %	0 %	0 %	242398013
302	NC_012883	GA	3	6	17600	17605	50 %	0 %	50 %	0 %	242398014
303	NC_012883	CTT	2	6	17643	17648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398014
304	NC_012883	CTT	2	6	17714	17719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398014
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306	NC_012883	GGCCTT	2	12	17829	17840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	242398014
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311	NC_012883	CTGG	2	8	18248	18255	0 %	25 %	50 %	25 %	242398014
312	NC_012883	TA	4	8	18293	18300	50 %	50 %	0 %	0 %	242398014
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389	NC_012883	TTTCT	2	10	23309	23318	0 %	80 %	0 %	20 %	242398019
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391	NC_012883	AAT	2	6	23454	23459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398019
392	NC_012883	AGGAT	2	10	23521	23530	40 %	20 %	40 %	0 %	242398019
393	NC_012883	AAG	2	6	23565	23570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398019
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395	NC_012883	GGA	2	6	23618	23623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	242398019
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