MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_012804	CGCA	2	8	1979301	1979308	25 %	0 %	25 %	50 %	240104143
36002	NC_012804	TCC	2	6	1979392	1979397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104143
36003	NC_012804	CTC	2	6	1979484	1979489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104143
36004	NC_012804	GAC	2	6	1979490	1979495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104143
36005	NC_012804	TC	3	6	1979531	1979536	0 %	50 %	0 %	50 %	240104143
36006	NC_012804	TCA	2	6	1979676	1979681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104144
36007	NC_012804	AG	3	6	1979695	1979700	50 %	0 %	50 %	0 %	240104144
36008	NC_012804	TCC	2	6	1979739	1979744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104144
36009	NC_012804	CTG	2	6	1979889	1979894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104144
36010	NC_012804	AGG	2	6	1979906	1979911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104144
36011	NC_012804	TCC	2	6	1979944	1979949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104144
36012	NC_012804	CCT	2	6	1979965	1979970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104144
36013	NC_012804	CCAT	2	8	1980039	1980046	25 %	25 %	0 %	50 %	240104144
36014	NC_012804	CCA	2	6	1980049	1980054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240104144
36015	NC_012804	CCT	2	6	1980127	1980132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104144
36016	NC_012804	CTT	2	6	1980220	1980225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240104144
36017	NC_012804	CCG	2	6	1980234	1980239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240104144
36018	NC_012804	TCC	2	6	1980261	1980266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104144
36019	NC_012804	CGG	2	6	1980454	1980459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240104144
36020	NC_012804	GAA	2	6	1980679	1980684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104145
36021	NC_012804	GCTC	2	8	1980698	1980705	0 %	25 %	25 %	50 %	240104145
36022	NC_012804	CG	3	6	1980711	1980716	0 %	0 %	50 %	50 %	240104145
36023	NC_012804	CGG	2	6	1980795	1980800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240104145
36024	NC_012804	GTGATT	2	12	1980895	1980906	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	240104145
36025	NC_012804	GGAG	2	8	1980918	1980925	25 %	0 %	75 %	0 %	240104145
36026	NC_012804	GCG	2	6	1980937	1980942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240104145
36027	NC_012804	TCA	2	6	1980962	1980967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104145
36028	NC_012804	CTC	2	6	1981006	1981011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104145
36029	NC_012804	GC	3	6	1981029	1981034	0 %	0 %	50 %	50 %	240104145
36030	NC_012804	ACG	2	6	1981127	1981132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104145
36031	NC_012804	TCG	2	6	1981181	1981186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104145
36032	NC_012804	GAC	2	6	1981221	1981226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104145
36033	NC_012804	GAG	3	9	1981300	1981308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104145
36034	NC_012804	GAA	2	6	1981353	1981358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104145
36035	NC_012804	CAGG	2	8	1981449	1981456	25 %	0 %	50 %	25 %	240104145
36036	NC_012804	TCT	2	6	1981457	1981462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240104145
36037	NC_012804	TGAA	2	8	1981513	1981520	50 %	25 %	25 %	0 %	240104145
36038	NC_012804	CCGG	2	8	1981706	1981713	0 %	0 %	50 %	50 %	240104146
36039	NC_012804	GCT	2	6	1981768	1981773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104146
36040	NC_012804	AAG	2	6	1981796	1981801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104146
36041	NC_012804	GGAA	2	8	1981805	1981812	50 %	0 %	50 %	0 %	240104146
36042	NC_012804	CAA	2	6	1981858	1981863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240104146
36043	NC_012804	ACT	2	6	1982058	1982063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104146
36044	NC_012804	GA	3	6	1982066	1982071	50 %	0 %	50 %	0 %	240104146
36045	NC_012804	GAT	2	6	1982137	1982142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104147
36046	NC_012804	AG	3	6	1982206	1982211	50 %	0 %	50 %	0 %	240104147
36047	NC_012804	G	6	6	1982247	1982252	0 %	0 %	100 %	0 %	240104147
36048	NC_012804	ATA	2	6	1982264	1982269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240104147
36049	NC_012804	ATC	2	6	1982297	1982302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104147
36050	NC_012804	CTC	2	6	1982549	1982554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104147
36051	NC_012804	TTC	2	6	1982657	1982662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240104147
36052	NC_012804	GAGG	2	8	1982746	1982753	25 %	0 %	75 %	0 %	240104147
36053	NC_012804	CCT	2	6	1982761	1982766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104147
36054	NC_012804	CTT	2	6	1982794	1982799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240104147
36055	NC_012804	CCT	2	6	1982854	1982859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104147
36056	NC_012804	TCG	2	6	1982865	1982870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104147
36057	NC_012804	ACG	2	6	1982883	1982888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104147
36058	NC_012804	GGA	2	6	1982940	1982945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104147
36059	NC_012804	GAT	2	6	1982946	1982951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104147
36060	NC_012804	GAG	2	6	1983007	1983012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104148
36061	NC_012804	CCT	2	6	1983054	1983059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104148
36062	NC_012804	ACT	2	6	1983077	1983082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104148
36063	NC_012804	GCCGA	2	10	1983109	1983118	20 %	0 %	40 %	40 %	240104148
36064	NC_012804	CG	3	6	1983119	1983124	0 %	0 %	50 %	50 %	240104148
36065	NC_012804	CGG	2	6	1983165	1983170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240104148
36066	NC_012804	TCGCC	2	10	1983183	1983192	0 %	20 %	20 %	60 %	240104148
36067	NC_012804	AAG	2	6	1983199	1983204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104148
36068	NC_012804	GTC	2	6	1983220	1983225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104148
36069	NC_012804	GGA	2	6	1983246	1983251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104148
36070	NC_012804	TGA	2	6	1983326	1983331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104148
36071	NC_012804	GGA	2	6	1983332	1983337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104148
36072	NC_012804	GAC	2	6	1983388	1983393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104148
36073	NC_012804	GAG	2	6	1983397	1983402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104148
36074	NC_012804	CGAG	2	8	1983416	1983423	25 %	0 %	50 %	25 %	240104148
36075	NC_012804	GAG	2	6	1983469	1983474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104148
36076	NC_012804	ATT	2	6	1983496	1983501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240104148
36077	NC_012804	GAG	2	6	1983502	1983507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104148
36078	NC_012804	GTT	2	6	1983562	1983567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240104149
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36080	NC_012804	AC	3	6	1983624	1983629	50 %	0 %	0 %	50 %	240104149
36081	NC_012804	TAA	2	6	1983644	1983649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240104149
36082	NC_012804	TCA	2	6	1983683	1983688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104149
36083	NC_012804	A	6	6	1983698	1983703	100 %	0 %	0 %	0 %	240104149
36084	NC_012804	AGG	2	6	1983722	1983727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104149
36085	NC_012804	CCT	2	6	1983891	1983896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104151
36086	NC_012804	ATC	2	6	1983898	1983903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104151
36087	NC_012804	CCTG	2	8	1983908	1983915	0 %	25 %	25 %	50 %	240104151
36088	NC_012804	GAAGGA	2	12	1983945	1983956	50 %	0 %	50 %	0 %	240104151
36089	NC_012804	AG	3	6	1983970	1983975	50 %	0 %	50 %	0 %	240104151
36090	NC_012804	CGA	2	6	1984002	1984007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104151
36091	NC_012804	GA	3	6	1984087	1984092	50 %	0 %	50 %	0 %	240104151
36092	NC_012804	GA	3	6	1984105	1984110	50 %	0 %	50 %	0 %	240104151
36093	NC_012804	AGGG	2	8	1984134	1984141	25 %	0 %	75 %	0 %	240104151
36094	NC_012804	GAA	2	6	1984150	1984155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104151
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36097	NC_012804	TGA	2	6	1984293	1984298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104151
36098	NC_012804	GAG	2	6	1984360	1984365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104151
36099	NC_012804	GAC	2	6	1984411	1984416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104151
36100	NC_012804	CTC	2	6	1984465	1984470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104152
36101	NC_012804	TCC	2	6	1984522	1984527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104152
36102	NC_012804	CCA	2	6	1984587	1984592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240104152
36103	NC_012804	ATCAAT	2	12	1984617	1984628	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	240104152
36104	NC_012804	CCT	2	6	1984658	1984663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104152
36105	NC_012804	TCT	2	6	1984691	1984696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240104152
36106	NC_012804	ATC	2	6	1984780	1984785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104152
36107	NC_012804	GCTCG	2	10	1984854	1984863	0 %	20 %	40 %	40 %	240104152
36108	NC_012804	CG	3	6	1984919	1984924	0 %	0 %	50 %	50 %	240104152
36109	NC_012804	GTC	2	6	1984959	1984964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104152
36110	NC_012804	GGT	2	6	1984986	1984991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240104152
36111	NC_012804	CGA	2	6	1985060	1985065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104152
36112	NC_012804	TCG	2	6	1985074	1985079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104152
36113	NC_012804	CGT	2	6	1985108	1985113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104152
36114	NC_012804	CCTT	2	8	1985342	1985349	0 %	50 %	0 %	50 %	240104152
36115	NC_012804	CTC	2	6	1985355	1985360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104152
36116	NC_012804	TC	3	6	1985433	1985438	0 %	50 %	0 %	50 %	240104152
36117	NC_012804	CGG	2	6	1985508	1985513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240104152
36118	NC_012804	ACG	2	6	1985686	1985691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104152
36119	NC_012804	TCC	2	6	1985697	1985702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104152
36120	NC_012804	TCC	2	6	1985899	1985904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104153
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36122	NC_012804	GCC	2	6	1986008	1986013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240104153
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36124	NC_012804	GGA	2	6	1986068	1986073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104153
36125	NC_012804	CTCG	2	8	1986149	1986156	0 %	25 %	25 %	50 %	240104153
36126	NC_012804	GTC	2	6	1986215	1986220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104153
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36131	NC_012804	GCCT	2	8	1986774	1986781	0 %	25 %	25 %	50 %	240104153
36132	NC_012804	TCCCG	2	10	1986806	1986815	0 %	20 %	20 %	60 %	240104153
36133	NC_012804	CGG	2	6	1986850	1986855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240104153
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36142	NC_012804	GGCTGA	2	12	1987327	1987338	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	240104153
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36152	NC_012804	GTT	2	6	1987813	1987818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240104154
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36202	NC_012804	ACC	2	6	1990463	1990468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240104158
36203	NC_012804	ATC	2	6	1990528	1990533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104158
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36205	NC_012804	GAAA	2	8	1990674	1990681	75 %	0 %	25 %	0 %	240104158
36206	NC_012804	CAAAAA	2	12	1990808	1990819	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	240104158
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36212	NC_012804	CGA	2	6	1991897	1991902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104159
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36216	NC_012804	CT	3	6	1992150	1992155	0 %	50 %	0 %	50 %	240104160
36217	NC_012804	AC	3	6	1992278	1992283	50 %	0 %	0 %	50 %	240104160
36218	NC_012804	AGT	2	6	1992306	1992311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104160
36219	NC_012804	AAC	2	6	1992377	1992382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240104160
36220	NC_012804	TCA	2	6	1992391	1992396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104160
36221	NC_012804	ATC	2	6	1992420	1992425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104160
36222	NC_012804	G	6	6	1992443	1992448	0 %	0 %	100 %	0 %	240104160
36223	NC_012804	CAT	2	6	1992466	1992471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104160
36224	NC_012804	CTT	2	6	1992559	1992564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240104160
36225	NC_012804	TGA	2	6	1992592	1992597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104160
36226	NC_012804	TAA	2	6	1992620	1992625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240104160
36227	NC_012804	A	6	6	1992629	1992634	100 %	0 %	0 %	0 %	240104160
36228	NC_012804	TTG	2	6	1992692	1992697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240104161
36229	NC_012804	CTC	2	6	1992735	1992740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104161
36230	NC_012804	ACT	2	6	1992752	1992757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104161
36231	NC_012804	CCA	2	6	1992782	1992787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240104161
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36465	NC_012804	GAA	2	6	2004985	2004990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104171
36466	NC_012804	TCGA	2	8	2005056	2005063	25 %	25 %	25 %	25 %	240104171
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36472	NC_012804	CGA	2	6	2005277	2005282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104171
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36476	NC_012804	TTA	2	6	2005521	2005526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240104172
36477	NC_012804	GTTAA	2	10	2005591	2005600	40 %	40 %	20 %	0 %	240104172
36478	NC_012804	G	6	6	2005614	2005619	0 %	0 %	100 %	0 %	240104172
36479	NC_012804	ATC	2	6	2005645	2005650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104172
36480	NC_012804	CAC	2	6	2005701	2005706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240104172
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36482	NC_012804	CT	3	6	2005991	2005996	0 %	50 %	0 %	50 %	240104173
36483	NC_012804	CTTTTC	2	12	2006022	2006033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240104173
36484	NC_012804	CTC	2	6	2006042	2006047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104173
36485	NC_012804	CGA	2	6	2006077	2006082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104173
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36492	NC_012804	GTA	2	6	2006565	2006570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104174
36493	NC_012804	GAT	2	6	2006676	2006681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104175
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