MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_012804	ATC	2	6	1952060	1952065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104107
35502	NC_012804	AACCT	2	10	1952114	1952123	40 %	20 %	0 %	40 %	240104107
35503	NC_012804	ACG	2	6	1952135	1952140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104107
35504	NC_012804	TCC	2	6	1952156	1952161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104107
35505	NC_012804	AGC	2	6	1952248	1952253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104107
35506	NC_012804	AAC	2	6	1952284	1952289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240104107
35507	NC_012804	GAAGG	2	10	1952314	1952323	40 %	0 %	60 %	0 %	240104107
35508	NC_012804	ATACCT	2	12	1952341	1952352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104107
35509	NC_012804	TCC	3	9	1952355	1952363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104107
35510	NC_012804	AG	3	6	1952458	1952463	50 %	0 %	50 %	0 %	240104108
35511	NC_012804	CTC	2	6	1952531	1952536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104108
35512	NC_012804	TTA	2	6	1952596	1952601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240104108
35513	NC_012804	ATCC	2	8	1952667	1952674	25 %	25 %	0 %	50 %	240104108
35514	NC_012804	TAT	2	6	1952690	1952695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240104108
35515	NC_012804	TCA	2	6	1952710	1952715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104109
35516	NC_012804	CTC	2	6	1952734	1952739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104109
35517	NC_012804	AAC	2	6	1952761	1952766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240104109
35518	NC_012804	TC	3	6	1952779	1952784	0 %	50 %	0 %	50 %	240104109
35519	NC_012804	CAGC	2	8	1952829	1952836	25 %	0 %	25 %	50 %	240104109
35520	NC_012804	CCT	2	6	1952844	1952849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104109
35521	NC_012804	TAT	2	6	1952881	1952886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240104109
35522	NC_012804	CCA	2	6	1952942	1952947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240104109
35523	NC_012804	ATG	2	6	1952993	1952998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104109
35524	NC_012804	CAG	2	6	1953046	1953051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104109
35525	NC_012804	ATA	2	6	1953097	1953102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240104109
35526	NC_012804	CGT	2	6	1953160	1953165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104109
35527	NC_012804	ACA	2	6	1953257	1953262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240104109
35528	NC_012804	CCTT	2	8	1953263	1953270	0 %	50 %	0 %	50 %	240104109
35529	NC_012804	GGT	2	6	1953286	1953291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240104109
35530	NC_012804	TTTTC	2	10	1953300	1953309	0 %	80 %	0 %	20 %	240104109
35531	NC_012804	AG	3	6	1953372	1953377	50 %	0 %	50 %	0 %	240104110
35532	NC_012804	ACA	2	6	1953379	1953384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240104110
35533	NC_012804	GAA	2	6	1953544	1953549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104110
35534	NC_012804	TCC	2	6	1953567	1953572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104110
35535	NC_012804	TCG	2	6	1953628	1953633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104110
35536	NC_012804	C	6	6	1953657	1953662	0 %	0 %	0 %	100 %	240104110
35537	NC_012804	AGT	2	6	1953681	1953686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104110
35538	NC_012804	TGAAAG	2	12	1953707	1953718	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	240104110
35539	NC_012804	CTC	2	6	1953809	1953814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104110
35540	NC_012804	TAT	2	6	1953989	1953994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240104110
35541	NC_012804	GGA	2	6	1954078	1954083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104110
35542	NC_012804	C	6	6	1954098	1954103	0 %	0 %	0 %	100 %	240104111
35543	NC_012804	GGA	2	6	1954116	1954121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104111
35544	NC_012804	GAA	2	6	1954129	1954134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104111
35545	NC_012804	GCCC	2	8	1954137	1954144	0 %	0 %	25 %	75 %	240104111
35546	NC_012804	ATC	2	6	1954145	1954150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104111
35547	NC_012804	GAG	2	6	1954234	1954239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104111
35548	NC_012804	CAA	2	6	1954374	1954379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240104111
35549	NC_012804	CTC	2	6	1954420	1954425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104111
35550	NC_012804	GAA	2	6	1954434	1954439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104111
35551	NC_012804	AGA	2	6	1954463	1954468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104111
35552	NC_012804	AAAG	2	8	1954718	1954725	75 %	0 %	25 %	0 %	240104111
35553	NC_012804	GAT	2	6	1954795	1954800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104111
35554	NC_012804	AGGC	2	8	1954894	1954901	25 %	0 %	50 %	25 %	240104111
35555	NC_012804	AGG	2	6	1955057	1955062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104111
35556	NC_012804	CGA	2	6	1955505	1955510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104112
35557	NC_012804	G	6	6	1955576	1955581	0 %	0 %	100 %	0 %	240104112
35558	NC_012804	CTA	2	6	1955676	1955681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104112
35559	NC_012804	CTA	2	6	1955700	1955705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104112
35560	NC_012804	CCTG	2	8	1955712	1955719	0 %	25 %	25 %	50 %	240104112
35561	NC_012804	TGA	2	6	1955740	1955745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104112
35562	NC_012804	ACA	2	6	1955809	1955814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240104113
35563	NC_012804	TGG	2	6	1955833	1955838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240104113
35564	NC_012804	TCG	2	6	1955878	1955883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104113
35565	NC_012804	AGGG	2	8	1955904	1955911	25 %	0 %	75 %	0 %	240104113
35566	NC_012804	GAG	2	6	1955931	1955936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104113
35567	NC_012804	AG	4	8	1955952	1955959	50 %	0 %	50 %	0 %	240104113
35568	NC_012804	AGGGTT	2	12	1956147	1956158	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	240104113
35569	NC_012804	GAA	2	6	1956173	1956178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104113
35570	NC_012804	TGA	2	6	1956197	1956202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104113
35571	NC_012804	CTA	2	6	1956218	1956223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104113
35572	NC_012804	AGG	2	6	1956247	1956252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104113
35573	NC_012804	ATGA	2	8	1956260	1956267	50 %	25 %	25 %	0 %	240104114
35574	NC_012804	CCT	2	6	1956271	1956276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104114
35575	NC_012804	TTC	2	6	1956287	1956292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240104114
35576	NC_012804	GGAT	2	8	1956299	1956306	25 %	25 %	50 %	0 %	240104114
35577	NC_012804	TCC	2	6	1956308	1956313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104114
35578	NC_012804	C	6	6	1956435	1956440	0 %	0 %	0 %	100 %	240104114
35579	NC_012804	CTTC	2	8	1956469	1956476	0 %	50 %	0 %	50 %	240104114
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35582	NC_012804	AG	3	6	1956592	1956597	50 %	0 %	50 %	0 %	240104114
35583	NC_012804	AAAG	2	8	1956598	1956605	75 %	0 %	25 %	0 %	240104114
35584	NC_012804	TAGT	2	8	1956615	1956622	25 %	50 %	25 %	0 %	240104114
35585	NC_012804	ATC	2	6	1956647	1956652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104114
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35587	NC_012804	ATA	2	6	1956666	1956671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240104114
35588	NC_012804	ATT	2	6	1956690	1956695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240104114
35589	NC_012804	GAT	2	6	1956936	1956941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104115
35590	NC_012804	AGT	2	6	1956942	1956947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104115
35591	NC_012804	AAC	2	6	1956952	1956957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240104115
35592	NC_012804	TA	3	6	1956999	1957004	50 %	50 %	0 %	0 %	240104115
35593	NC_012804	TGC	2	6	1957005	1957010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104115
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35598	NC_012804	GAA	2	6	1957147	1957152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104115
35599	NC_012804	A	7	7	1957155	1957161	100 %	0 %	0 %	0 %	240104115
35600	NC_012804	ATG	2	6	1957187	1957192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104115
35601	NC_012804	TAA	2	6	1957235	1957240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240104115
35602	NC_012804	A	6	6	1957257	1957262	100 %	0 %	0 %	0 %	240104115
35603	NC_012804	A	6	6	1957264	1957269	100 %	0 %	0 %	0 %	240104115
35604	NC_012804	TGA	2	6	1957278	1957283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104115
35605	NC_012804	A	6	6	1957345	1957350	100 %	0 %	0 %	0 %	240104115
35606	NC_012804	TTA	2	6	1957519	1957524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240104116
35607	NC_012804	TTA	2	6	1957582	1957587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240104116
35608	NC_012804	CAT	2	6	1957624	1957629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104116
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35610	NC_012804	GAA	2	6	1957754	1957759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104116
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35612	NC_012804	C	6	6	1957796	1957801	0 %	0 %	0 %	100 %	240104116
35613	NC_012804	AAG	2	6	1957814	1957819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104116
35614	NC_012804	CTA	2	6	1957840	1957845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104116
35615	NC_012804	TCC	2	6	1957874	1957879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104116
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