MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_012804	TCC	2	6	1919816	1919821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104076
35003	NC_012804	CTT	2	6	1919851	1919856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240104076
35004	NC_012804	TAT	2	6	1919929	1919934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240104076
35005	NC_012804	TA	4	8	1919963	1919970	50 %	50 %	0 %	0 %	240104076
35006	NC_012804	CCTT	2	8	1920043	1920050	0 %	50 %	0 %	50 %	240104077
35007	NC_012804	ACC	2	6	1920051	1920056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240104077
35008	NC_012804	GGT	2	6	1920142	1920147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240104077
35009	NC_012804	TC	3	6	1920169	1920174	0 %	50 %	0 %	50 %	240104077
35010	NC_012804	CT	3	6	1920422	1920427	0 %	50 %	0 %	50 %	240104077
35011	NC_012804	TC	3	6	1920431	1920436	0 %	50 %	0 %	50 %	240104077
35012	NC_012804	CCG	2	6	1920439	1920444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240104077
35013	NC_012804	GCCT	2	8	1920450	1920457	0 %	25 %	25 %	50 %	240104077
35014	NC_012804	CCA	2	6	1920582	1920587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240104077
35015	NC_012804	CTC	2	6	1920606	1920611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104077
35016	NC_012804	CGG	2	6	1920683	1920688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240104077
35017	NC_012804	CCG	2	6	1920729	1920734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240104077
35018	NC_012804	AGC	2	6	1920753	1920758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104077
35019	NC_012804	GGA	2	6	1920763	1920768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104077
35020	NC_012804	TAC	2	6	1920778	1920783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104077
35021	NC_012804	TCGGC	2	10	1920814	1920823	0 %	20 %	40 %	40 %	240104077
35022	NC_012804	GAAC	2	8	1920832	1920839	50 %	0 %	25 %	25 %	240104077
35023	NC_012804	ACAG	2	8	1920990	1920997	50 %	0 %	25 %	25 %	240104077
35024	NC_012804	CCCT	2	8	1921025	1921032	0 %	25 %	0 %	75 %	240104077
35025	NC_012804	CTTC	2	8	1921210	1921217	0 %	50 %	0 %	50 %	240104078
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35032	NC_012804	CTC	2	6	1921631	1921636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104078
35033	NC_012804	GAG	2	6	1921721	1921726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104078
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35052	NC_012804	AGAGG	2	10	1922822	1922831	40 %	0 %	60 %	0 %	240104080
35053	NC_012804	AT	3	6	1922889	1922894	50 %	50 %	0 %	0 %	240104080
35054	NC_012804	AGA	2	6	1922977	1922982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104080
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35101	NC_012804	CAA	2	6	1925554	1925559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240104081
35102	NC_012804	AG	4	8	1925614	1925621	50 %	0 %	50 %	0 %	240104081
35103	NC_012804	GA	3	6	1925672	1925677	50 %	0 %	50 %	0 %	240104081
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35108	NC_012804	CACAA	2	10	1925837	1925846	60 %	0 %	0 %	40 %	240104081
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35119	NC_012804	GCG	2	6	1926350	1926355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240104081
35120	NC_012804	ATG	2	6	1926374	1926379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104081
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35227	NC_012804	CGAG	2	8	1931469	1931476	25 %	0 %	50 %	25 %	240104087
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35231	NC_012804	CAA	2	6	1931716	1931721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240104087
35232	NC_012804	AG	4	8	1931846	1931853	50 %	0 %	50 %	0 %	240104088
35233	NC_012804	GTC	2	6	1931873	1931878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104088
35234	NC_012804	CTC	2	6	1931939	1931944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104088
35235	NC_012804	ACGA	2	8	1931978	1931985	50 %	0 %	25 %	25 %	240104088
35236	NC_012804	CGT	2	6	1932112	1932117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104088
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35341	NC_012804	AGT	2	6	1938077	1938082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104096
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35343	NC_012804	CTTCCT	2	12	1938122	1938133	0 %	50 %	0 %	50 %	240104096
35344	NC_012804	ATATCG	2	12	1938298	1938309	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	240104096
35345	NC_012804	CGCC	2	8	1938431	1938438	0 %	0 %	25 %	75 %	240104096
35346	NC_012804	CAG	2	6	1938441	1938446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104096
35347	NC_012804	CCG	2	6	1938469	1938474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240104096
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35349	NC_012804	TAT	2	6	1938606	1938611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240104096
35350	NC_012804	ATCT	2	8	1938639	1938646	25 %	50 %	0 %	25 %	240104096
35351	NC_012804	TCT	2	6	1938653	1938658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240104096
35352	NC_012804	CTG	2	6	1938664	1938669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104096
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35461	NC_012804	G	6	6	1944336	1944341	0 %	0 %	100 %	0 %	240104103
35462	NC_012804	TGT	2	6	1944342	1944347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240104103
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35464	NC_012804	GAC	2	6	1944403	1944408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104103
35465	NC_012804	TGG	2	6	1944425	1944430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240104103
35466	NC_012804	CTG	2	6	1944436	1944441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104103
35467	NC_012804	TCC	2	6	1944443	1944448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104103
35468	NC_012804	CTC	2	6	1944498	1944503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104104
35469	NC_012804	CTC	2	6	1944534	1944539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104104
35470	NC_012804	GTC	2	6	1944690	1944695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104104
35471	NC_012804	GTC	2	6	1944825	1944830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104104
35472	NC_012804	CG	3	6	1944849	1944854	0 %	0 %	50 %	50 %	240104104
35473	NC_012804	GAC	2	6	1944909	1944914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104104
35474	NC_012804	CGT	2	6	1944974	1944979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104104
35475	NC_012804	AGT	2	6	1945037	1945042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104105
35476	NC_012804	CTC	2	6	1945051	1945056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104105
35477	NC_012804	GTC	2	6	1945138	1945143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104105
35478	NC_012804	GAT	2	6	1945150	1945155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104105
35479	NC_012804	GTC	2	6	1945156	1945161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240104105
35480	NC_012804	AGT	2	6	1945251	1945256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104105
35481	NC_012804	CTC	2	6	1945294	1945299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240104105
35482	NC_012804	AGA	2	6	1945441	1945446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104105
35483	NC_012804	GTATT	2	10	1950809	1950818	20 %	60 %	20 %	0 %	240104106
35484	NC_012804	CGA	2	6	1950893	1950898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240104106
35485	NC_012804	TCT	2	6	1950902	1950907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240104106
35486	NC_012804	TTA	2	6	1950962	1950967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240104106
35487	NC_012804	AGT	2	6	1951160	1951165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104106
35488	NC_012804	GTA	2	6	1951260	1951265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104106
35489	NC_012804	TCA	2	6	1951280	1951285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104106
35490	NC_012804	CCTT	2	8	1951309	1951316	0 %	50 %	0 %	50 %	240104106
35491	NC_012804	CCTG	2	8	1951328	1951335	0 %	25 %	25 %	50 %	240104106
35492	NC_012804	ACC	2	6	1951354	1951359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240104106
35493	NC_012804	GAG	2	6	1951404	1951409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240104106
35494	NC_012804	TGA	2	6	1951451	1951456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104106
35495	NC_012804	CT	3	6	1951464	1951469	0 %	50 %	0 %	50 %	240104106
35496	NC_012804	CCG	2	6	1951540	1951545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240104106
35497	NC_012804	AGA	2	6	1951661	1951666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240104107
35498	NC_012804	TCA	2	6	1951761	1951766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240104107
35499	NC_012804	TAT	2	6	1951810	1951815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240104107
35500	NC_012804	TGA	2	6	1951962	1951967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240104107

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