MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_012804	GTA	2	6	1837432	1837437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103970
33502	NC_012804	GCA	2	6	1837443	1837448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103970
33503	NC_012804	CTC	2	6	1837498	1837503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103970
33504	NC_012804	GTC	2	6	1837525	1837530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103970
33505	NC_012804	GGCC	2	8	1837545	1837552	0 %	0 %	50 %	50 %	240103970
33506	NC_012804	TC	4	8	1837585	1837592	0 %	50 %	0 %	50 %	240103970
33507	NC_012804	GTC	2	6	1837657	1837662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103970
33508	NC_012804	CGG	2	6	1837698	1837703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103970
33509	NC_012804	ATCTTG	2	12	1837742	1837753	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	240103970
33510	NC_012804	TCG	2	6	1837754	1837759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103970
33511	NC_012804	GTT	2	6	1837843	1837848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103970
33512	NC_012804	CTT	2	6	1837909	1837914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103970
33513	NC_012804	TCT	2	6	1838007	1838012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103970
33514	NC_012804	GTA	2	6	1838017	1838022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103970
33515	NC_012804	TGG	2	6	1838165	1838170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103970
33516	NC_012804	TTG	2	6	1838273	1838278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103970
33517	NC_012804	CTT	2	6	1838332	1838337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103970
33518	NC_012804	TCG	2	6	1838397	1838402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103970
33519	NC_012804	TGA	2	6	1838421	1838426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103970
33520	NC_012804	CCA	2	6	1838462	1838467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103970
33521	NC_012804	TCT	2	6	1838499	1838504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103970
33522	NC_012804	GCC	2	6	1838621	1838626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103970
33523	NC_012804	CGT	2	6	1838634	1838639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103970
33524	NC_012804	CGG	2	6	1838673	1838678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103970
33525	NC_012804	TCT	2	6	1838700	1838705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103970
33526	NC_012804	TTTC	2	8	1838715	1838722	0 %	75 %	0 %	25 %	240103970
33527	NC_012804	ACT	2	6	1838747	1838752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103970
33528	NC_012804	GTC	2	6	1838791	1838796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103970
33529	NC_012804	CCG	2	6	1838885	1838890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103970
33530	NC_012804	ACG	2	6	1838933	1838938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103970
33531	NC_012804	GCC	2	6	1838947	1838952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103970
33532	NC_012804	TTA	2	6	1838988	1838993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103970
33533	NC_012804	GAAG	2	8	1839045	1839052	50 %	0 %	50 %	0 %	240103970
33534	NC_012804	CTG	2	6	1839068	1839073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103970
33535	NC_012804	CTT	2	6	1839082	1839087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103970
33536	NC_012804	CTC	2	6	1839094	1839099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103970
33537	NC_012804	CTC	2	6	1839106	1839111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103970
33538	NC_012804	CTC	2	6	1839428	1839433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103971
33539	NC_012804	A	6	6	1839489	1839494	100 %	0 %	0 %	0 %	240103971
33540	NC_012804	TCC	2	6	1839521	1839526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103971
33541	NC_012804	TCG	2	6	1839540	1839545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103971
33542	NC_012804	C	6	6	1839586	1839591	0 %	0 %	0 %	100 %	240103971
33543	NC_012804	GGA	2	6	1839634	1839639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103971
33544	NC_012804	CTA	2	6	1839661	1839666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103971
33545	NC_012804	CGCT	2	8	1839668	1839675	0 %	25 %	25 %	50 %	240103971
33546	NC_012804	GGA	2	6	1839723	1839728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103971
33547	NC_012804	CGAG	2	8	1839819	1839826	25 %	0 %	50 %	25 %	240103971
33548	NC_012804	CCCA	2	8	1839832	1839839	25 %	0 %	0 %	75 %	240103971
33549	NC_012804	CTC	2	6	1839857	1839862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103971
33550	NC_012804	GTG	2	6	1839911	1839916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103971
33551	NC_012804	CGA	2	6	1839919	1839924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103971
33552	NC_012804	AGCA	2	8	1839936	1839943	50 %	0 %	25 %	25 %	240103971
33553	NC_012804	CGA	2	6	1839970	1839975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103971
33554	NC_012804	TAC	2	6	1839977	1839982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103971
33555	NC_012804	CTC	2	6	1839992	1839997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103971
33556	NC_012804	GA	3	6	1840087	1840092	50 %	0 %	50 %	0 %	240103971
33557	NC_012804	TTC	2	6	1840095	1840100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103971
33558	NC_012804	CTG	2	6	1840166	1840171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103971
33559	NC_012804	GCTC	2	8	1840218	1840225	0 %	25 %	25 %	50 %	240103971
33560	NC_012804	GGAA	2	8	1840274	1840281	50 %	0 %	50 %	0 %	240103971
33561	NC_012804	CGC	2	6	1840315	1840320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103971
33562	NC_012804	AGG	2	6	1840355	1840360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103971
33563	NC_012804	GTC	2	6	1840373	1840378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103971
33564	NC_012804	TAC	2	6	1840400	1840405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103971
33565	NC_012804	GAA	2	6	1840441	1840446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103971
33566	NC_012804	GAG	2	6	1840529	1840534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103971
33567	NC_012804	AGG	2	6	1840541	1840546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103971
33568	NC_012804	GGAA	2	8	1840598	1840605	50 %	0 %	50 %	0 %	240103971
33569	NC_012804	GAA	2	6	1840706	1840711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103972
33570	NC_012804	GTC	2	6	1840885	1840890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103972
33571	NC_012804	CTA	2	6	1840899	1840904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103972
33572	NC_012804	TCA	2	6	1840970	1840975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103972
33573	NC_012804	C	6	6	1841047	1841052	0 %	0 %	0 %	100 %	240103972
33574	NC_012804	C	6	6	1841079	1841084	0 %	0 %	0 %	100 %	240103972
33575	NC_012804	TTC	2	6	1841086	1841091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103972
33576	NC_012804	GCGA	2	8	1841092	1841099	25 %	0 %	50 %	25 %	240103972
33577	NC_012804	ACAG	2	8	1841108	1841115	50 %	0 %	25 %	25 %	240103972
33578	NC_012804	GGA	2	6	1841129	1841134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103972
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33581	NC_012804	AGG	3	9	1841354	1841362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103972
33582	NC_012804	TCT	2	6	1841519	1841524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103972
33583	NC_012804	CGA	2	6	1841727	1841732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103972
33584	NC_012804	TTC	2	6	1841770	1841775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103972
33585	NC_012804	TGG	2	6	1841798	1841803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103972
33586	NC_012804	GGT	2	6	1842036	1842041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103973
33587	NC_012804	CG	3	6	1842063	1842068	0 %	0 %	50 %	50 %	240103973
33588	NC_012804	ATA	2	6	1842073	1842078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103973
33589	NC_012804	GGA	2	6	1842108	1842113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103973
33590	NC_012804	GGA	2	6	1842117	1842122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103973
33591	NC_012804	TC	3	6	1842165	1842170	0 %	50 %	0 %	50 %	240103973
33592	NC_012804	TAA	2	6	1842179	1842184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103973
33593	NC_012804	GAG	2	6	1842247	1842252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103973
33594	NC_012804	TA	3	6	1842289	1842294	50 %	50 %	0 %	0 %	240103973
33595	NC_012804	GGAAA	2	10	1842431	1842440	60 %	0 %	40 %	0 %	240103973
33596	NC_012804	GGC	2	6	1842460	1842465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103973
33597	NC_012804	TTC	2	6	1842472	1842477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103973
33598	NC_012804	TCA	2	6	1842764	1842769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103974
33599	NC_012804	AGC	2	6	1842800	1842805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103974
33600	NC_012804	TCC	2	6	1842818	1842823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103974
33601	NC_012804	TTCT	2	8	1842826	1842833	0 %	75 %	0 %	25 %	240103974
33602	NC_012804	GGA	2	6	1842852	1842857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103974
33603	NC_012804	AGA	2	6	1843277	1843282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103975
33604	NC_012804	TTG	2	6	1843328	1843333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103975
33605	NC_012804	AATG	2	8	1843361	1843368	50 %	25 %	25 %	0 %	240103975
33606	NC_012804	TCG	2	6	1843372	1843377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103975
33607	NC_012804	CCT	2	6	1843488	1843493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103975
33608	NC_012804	TCA	2	6	1843532	1843537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103975
33609	NC_012804	TC	3	6	1843551	1843556	0 %	50 %	0 %	50 %	240103975
33610	NC_012804	TC	3	6	1843564	1843569	0 %	50 %	0 %	50 %	240103975
33611	NC_012804	CTC	2	6	1843584	1843589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103975
33612	NC_012804	ATA	2	6	1843605	1843610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103975
33613	NC_012804	GTA	2	6	1843727	1843732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103976
33614	NC_012804	T	7	7	1843741	1843747	0 %	100 %	0 %	0 %	240103976
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33732	NC_012804	CTGT	2	8	1848459	1848466	0 %	50 %	25 %	25 %	240103982
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