MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_012804	TCT	3	9	1809460	1809468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103938
33002	NC_012804	GTA	2	6	1809491	1809496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103938
33003	NC_012804	TC	3	6	1809499	1809504	0 %	50 %	0 %	50 %	240103938
33004	NC_012804	AGA	2	6	1809550	1809555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103938
33005	NC_012804	T	6	6	1809570	1809575	0 %	100 %	0 %	0 %	240103938
33006	NC_012804	GTC	2	6	1809578	1809583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103938
33007	NC_012804	ACATCC	2	12	1809747	1809758	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	240103938
33008	NC_012804	CCT	2	6	1809814	1809819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103938
33009	NC_012804	CTT	2	6	1809824	1809829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103938
33010	NC_012804	TCCT	2	8	1809986	1809993	0 %	50 %	0 %	50 %	240103939
33011	NC_012804	CTTGAG	2	12	1810072	1810083	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	240103939
33012	NC_012804	GAGG	2	8	1810105	1810112	25 %	0 %	75 %	0 %	240103939
33013	NC_012804	TCCC	2	8	1810121	1810128	0 %	25 %	0 %	75 %	240103939
33014	NC_012804	AAAG	2	8	1810308	1810315	75 %	0 %	25 %	0 %	240103939
33015	NC_012804	GGA	2	6	1810392	1810397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103939
33016	NC_012804	GCC	2	6	1810400	1810405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103939
33017	NC_012804	TGCA	2	8	1810448	1810455	25 %	25 %	25 %	25 %	240103939
33018	NC_012804	TCCC	2	8	1810495	1810502	0 %	25 %	0 %	75 %	240103939
33019	NC_012804	AAG	2	6	1810508	1810513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103939
33020	NC_012804	CG	3	6	1810527	1810532	0 %	0 %	50 %	50 %	240103939
33021	NC_012804	CTC	2	6	1810573	1810578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103939
33022	NC_012804	T	6	6	1810647	1810652	0 %	100 %	0 %	0 %	240103940
33023	NC_012804	CCA	2	6	1810685	1810690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103940
33024	NC_012804	AGG	2	6	1810775	1810780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103940
33025	NC_012804	TTC	2	6	1810781	1810786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103940
33026	NC_012804	AAG	2	6	1810866	1810871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103940
33027	NC_012804	GTG	2	6	1810907	1810912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103940
33028	NC_012804	GAG	3	9	1810918	1810926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103940
33029	NC_012804	GGA	2	6	1810998	1811003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103940
33030	NC_012804	AG	3	6	1811050	1811055	50 %	0 %	50 %	0 %	240103940
33031	NC_012804	TC	3	6	1811098	1811103	0 %	50 %	0 %	50 %	240103940
33032	NC_012804	TCT	2	6	1811117	1811122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103940
33033	NC_012804	AGG	2	6	1811193	1811198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103940
33034	NC_012804	CTT	2	6	1811212	1811217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103940
33035	NC_012804	GAG	2	6	1811227	1811232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103940
33036	NC_012804	ATCA	2	8	1811251	1811258	50 %	25 %	0 %	25 %	240103940
33037	NC_012804	ACC	2	6	1811291	1811296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103940
33038	NC_012804	CGC	2	6	1811543	1811548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103941
33039	NC_012804	TGCC	2	8	1811579	1811586	0 %	25 %	25 %	50 %	240103941
33040	NC_012804	TAA	2	6	1811645	1811650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103941
33041	NC_012804	CTT	2	6	1811761	1811766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103942
33042	NC_012804	CTT	2	6	1811818	1811823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103942
33043	NC_012804	TTG	2	6	1811879	1811884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103942
33044	NC_012804	CT	3	6	1811906	1811911	0 %	50 %	0 %	50 %	240103942
33045	NC_012804	CTC	2	6	1811998	1812003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103942
33046	NC_012804	CAT	2	6	1812004	1812009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103942
33047	NC_012804	CTC	2	6	1812022	1812027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103942
33048	NC_012804	TTAT	2	8	1812095	1812102	25 %	75 %	0 %	0 %	240103942
33049	NC_012804	TCAT	2	8	1812128	1812135	25 %	50 %	0 %	25 %	240103942
33050	NC_012804	CAT	2	6	1812157	1812162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103942
33051	NC_012804	GGA	2	6	1812615	1812620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103943
33052	NC_012804	GTT	2	6	1812647	1812652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103943
33053	NC_012804	ACTC	2	8	1812880	1812887	25 %	25 %	0 %	50 %	240103943
33054	NC_012804	CAA	2	6	1812926	1812931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103943
33055	NC_012804	ATT	2	6	1813096	1813101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103944
33056	NC_012804	GAC	2	6	1813122	1813127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103944
33057	NC_012804	TC	4	8	1813129	1813136	0 %	50 %	0 %	50 %	240103944
33058	NC_012804	AGG	2	6	1813150	1813155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103944
33059	NC_012804	CCG	2	6	1813214	1813219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103944
33060	NC_012804	GAC	2	6	1813281	1813286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103944
33061	NC_012804	AGT	2	6	1813472	1813477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103944
33062	NC_012804	GCC	2	6	1813563	1813568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103944
33063	NC_012804	G	6	6	1813605	1813610	0 %	0 %	100 %	0 %	240103944
33064	NC_012804	G	6	6	1813635	1813640	0 %	0 %	100 %	0 %	240103944
33065	NC_012804	CCT	2	6	1813725	1813730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103944
33066	NC_012804	GA	3	6	1813747	1813752	50 %	0 %	50 %	0 %	240103944
33067	NC_012804	TTC	2	6	1813796	1813801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103944
33068	NC_012804	ACG	2	6	1813812	1813817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103945
33069	NC_012804	CCT	2	6	1813843	1813848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103945
33070	NC_012804	CCA	2	6	1813856	1813861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103945
33071	NC_012804	TTC	2	6	1813925	1813930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103945
33072	NC_012804	AC	3	6	1813942	1813947	50 %	0 %	0 %	50 %	240103945
33073	NC_012804	ACC	2	6	1813977	1813982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103946
33074	NC_012804	CGC	2	6	1814044	1814049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103946
33075	NC_012804	TTC	2	6	1814085	1814090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103946
33076	NC_012804	CCG	2	6	1814091	1814096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103946
33077	NC_012804	CCA	2	6	1814122	1814127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103946
33078	NC_012804	GGA	2	6	1814170	1814175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103946
33079	NC_012804	CGT	2	6	1814206	1814211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103946
33080	NC_012804	CTC	2	6	1814312	1814317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103946
33081	NC_012804	CAG	2	6	1814381	1814386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103946
33082	NC_012804	GAA	3	9	1814420	1814428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103946
33083	NC_012804	CCT	2	6	1814456	1814461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103946
33084	NC_012804	TTTC	2	8	1814483	1814490	0 %	75 %	0 %	25 %	240103946
33085	NC_012804	CCT	3	9	1814494	1814502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103946
33086	NC_012804	T	7	7	1814516	1814522	0 %	100 %	0 %	0 %	240103946
33087	NC_012804	TCT	2	6	1814527	1814532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103946
33088	NC_012804	GGAA	2	8	1814544	1814551	50 %	0 %	50 %	0 %	240103946
33089	NC_012804	GAT	2	6	1814697	1814702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103947
33090	NC_012804	CTT	2	6	1814706	1814711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103947
33091	NC_012804	CGT	2	6	1814765	1814770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103947
33092	NC_012804	ATG	2	6	1814785	1814790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103947
33093	NC_012804	TTA	2	6	1814846	1814851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103947
33094	NC_012804	C	7	7	1814863	1814869	0 %	0 %	0 %	100 %	240103947
33095	NC_012804	ACC	2	6	1814872	1814877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103947
33096	NC_012804	TGAG	2	8	1814933	1814940	25 %	25 %	50 %	0 %	240103947
33097	NC_012804	GAT	2	6	1815138	1815143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103947
33098	NC_012804	TCC	2	6	1815175	1815180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103947
33099	NC_012804	GAA	2	6	1815219	1815224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103947
33100	NC_012804	CTC	2	6	1815246	1815251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103947
33101	NC_012804	ACC	2	6	1815316	1815321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103947
33102	NC_012804	CAA	2	6	1815344	1815349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103947
33103	NC_012804	GT	3	6	1815354	1815359	0 %	50 %	50 %	0 %	240103947
33104	NC_012804	CTC	2	6	1815374	1815379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103947
33105	NC_012804	TCT	2	6	1815452	1815457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103948
33106	NC_012804	AGG	2	6	1815472	1815477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103948
33107	NC_012804	TAT	2	6	1815480	1815485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103948
33108	NC_012804	CGTC	2	8	1815587	1815594	0 %	25 %	25 %	50 %	240103948
33109	NC_012804	ACG	2	6	1815616	1815621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103948
33110	NC_012804	GAGTT	2	10	1815641	1815650	20 %	40 %	40 %	0 %	240103948
33111	NC_012804	CGC	2	6	1815666	1815671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103948
33112	NC_012804	C	6	6	1815679	1815684	0 %	0 %	0 %	100 %	240103948
33113	NC_012804	GGC	2	6	1815702	1815707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103948
33114	NC_012804	CTA	2	6	1815710	1815715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103948
33115	NC_012804	CGA	2	6	1815791	1815796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103948
33116	NC_012804	TTG	2	6	1815883	1815888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103948
33117	NC_012804	CGA	2	6	1815905	1815910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103948
33118	NC_012804	CTTT	2	8	1815980	1815987	0 %	75 %	0 %	25 %	240103948
33119	NC_012804	TCA	2	6	1815992	1815997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103948
33120	NC_012804	AGA	2	6	1816010	1816015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103948
33121	NC_012804	TAT	3	9	1816077	1816085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103948
33122	NC_012804	GT	3	6	1816225	1816230	0 %	50 %	50 %	0 %	240103948
33123	NC_012804	TCT	2	6	1816253	1816258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103948
33124	NC_012804	CT	3	6	1816271	1816276	0 %	50 %	0 %	50 %	240103948
33125	NC_012804	GTC	2	6	1816362	1816367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103948
33126	NC_012804	AAC	2	6	1816386	1816391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103948
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33128	NC_012804	TTCC	2	8	1816508	1816515	0 %	50 %	0 %	50 %	240103948
33129	NC_012804	TGA	2	6	1816520	1816525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103948
33130	NC_012804	GTG	2	6	1816526	1816531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103948
33131	NC_012804	CCG	2	6	1816555	1816560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103948
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33137	NC_012804	GGT	2	6	1817037	1817042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103949
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33144	NC_012804	TGC	2	6	1817489	1817494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103949
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33188	NC_012804	GAT	2	6	1819920	1819925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103951
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33220	NC_012804	CCCGC	2	10	1821301	1821310	0 %	0 %	20 %	80 %	240103952
33221	NC_012804	CTT	2	6	1821385	1821390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103952
33222	NC_012804	CTT	2	6	1821422	1821427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103952
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33230	NC_012804	TTTA	2	8	1821758	1821765	25 %	75 %	0 %	0 %	240103952
33231	NC_012804	GCC	2	6	1821818	1821823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103952
33232	NC_012804	GGA	2	6	1822060	1822065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103953
33233	NC_012804	GCG	2	6	1822074	1822079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103953
33234	NC_012804	G	6	6	1822128	1822133	0 %	0 %	100 %	0 %	240103953
33235	NC_012804	GGCG	2	8	1822181	1822188	0 %	0 %	75 %	25 %	240103953
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33238	NC_012804	GAA	2	6	1822235	1822240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103953
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33243	NC_012804	CAT	2	6	1822520	1822525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103953
33244	NC_012804	GAG	2	6	1822548	1822553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103953
33245	NC_012804	GGA	2	6	1822727	1822732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103953
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33254	NC_012804	CTC	2	6	1823224	1823229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103954
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33347	NC_012804	TCCC	2	8	1828684	1828691	0 %	25 %	0 %	75 %	240103961
33348	NC_012804	G	6	6	1828740	1828745	0 %	0 %	100 %	0 %	240103961
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33350	NC_012804	TCA	2	6	1828902	1828907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103961
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33464	NC_012804	TCCT	2	8	1835143	1835150	0 %	50 %	0 %	50 %	240103967
33465	NC_012804	TCT	2	6	1835206	1835211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103967
33466	NC_012804	GAG	2	6	1835252	1835257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103967
33467	NC_012804	GA	3	6	1835310	1835315	50 %	0 %	50 %	0 %	240103967
33468	NC_012804	AGG	2	6	1835332	1835337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103967
33469	NC_012804	ACT	2	6	1835413	1835418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103967
33470	NC_012804	AG	3	6	1835479	1835484	50 %	0 %	50 %	0 %	240103967
33471	NC_012804	TGAG	2	8	1835575	1835582	25 %	25 %	50 %	0 %	240103967
33472	NC_012804	GGAA	2	8	1835640	1835647	50 %	0 %	50 %	0 %	240103967
33473	NC_012804	CTA	2	6	1835885	1835890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103968
33474	NC_012804	TCC	2	6	1835935	1835940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103968
33475	NC_012804	GCTCG	2	10	1835963	1835972	0 %	20 %	40 %	40 %	240103968
33476	NC_012804	CAAT	2	8	1835982	1835989	50 %	25 %	0 %	25 %	240103968
33477	NC_012804	GTT	2	6	1835994	1835999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103968
33478	NC_012804	CGA	2	6	1836019	1836024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103968
33479	NC_012804	TTC	2	6	1836057	1836062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103968
33480	NC_012804	TCT	2	6	1836154	1836159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103968
33481	NC_012804	GTA	2	6	1836179	1836184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103968
33482	NC_012804	GGA	2	6	1836190	1836195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103968
33483	NC_012804	GTT	2	6	1836242	1836247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103968
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33485	NC_012804	GAG	2	6	1836404	1836409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103968
33486	NC_012804	ACG	2	6	1836492	1836497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103968
33487	NC_012804	TCC	2	6	1836534	1836539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103968
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33489	NC_012804	TC	3	6	1836670	1836675	0 %	50 %	0 %	50 %	240103968
33490	NC_012804	CAG	2	6	1836692	1836697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103968
33491	NC_012804	CTC	2	6	1836732	1836737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103968
33492	NC_012804	CTC	2	6	1836824	1836829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103968
33493	NC_012804	CGT	2	6	1836832	1836837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103968
33494	NC_012804	CTG	2	6	1836927	1836932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103968
33495	NC_012804	CTTC	2	8	1837021	1837028	0 %	50 %	0 %	50 %	240103968
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33497	NC_012804	CCG	2	6	1837176	1837181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103969
33498	NC_012804	CAA	2	6	1837194	1837199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103969
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33500	NC_012804	CGG	2	6	1837393	1837398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103970

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